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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lic | ||||||
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タイトル | X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURES OF ADIPOCYTE LIPID BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH PALMITATE AND HEXADECANESULFONIC ACID. PROPERTIES OF CAVITY BINDING SITES. | ||||||
![]() | ADIPOCYTE LIPID-BINDING PROTEIN | ||||||
![]() | LIPID BINDING PROTEIN / LIPID-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() Triglyceride catabolism / hormone receptor binding / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / cellular response to lithium ion / long-chain fatty acid binding / white fat cell differentiation / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / brown fat cell differentiation / fatty acid metabolic process ...Triglyceride catabolism / hormone receptor binding / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / cellular response to lithium ion / long-chain fatty acid binding / white fat cell differentiation / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / brown fat cell differentiation / fatty acid metabolic process / cholesterol homeostasis / fatty acid binding / response to bacterium / positive regulation of inflammatory response / cellular response to tumor necrosis factor / positive regulation of cold-induced thermogenesis / negative regulation of DNA-templated transcription / positive regulation of cell population proliferation / nucleoplasm / nucleus / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Lalonde, J.M. / Bernlohr, D.A. / Banaszak, L.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: X-ray crystallographic structures of adipocyte lipid-binding protein complexed with palmitate and hexadecanesulfonic acid. Properties of cavity binding sites. 著者: LaLonde, J.M. / Bernlohr, D.A. / Banaszak, L.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 34.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 27 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 420.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 421.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14587.687 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 化合物 | ChemComp-HDS / |
#3: 化合物 | ChemComp-PPI / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.24 Å3/Da / 溶媒含有率: 45.12 % |
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結晶化 | *PLUS 手法: batch method / PH range low: 7.2 / PH range high: 6.6 |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 2.1-3.0 M / 化学式: NaH2PO4-K2HPO4 |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.6 Å / Num. obs: 17182 / % possible obs: 96 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 4.2 % / Num. measured all: 63130 / Rmerge(I) obs: 0.0292 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.6→10 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.6→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.195 / Rfactor Rfree: 0.225 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS Biso mean: 16.9 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 1.47 |