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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1lgr | ||||||
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タイトル | INTERACTIONS OF NUCLEOTIDES WITH FULLY UNADENYLYLATED GLUTAMINE SYNTHETASE FROM SALMONELLA TYPHIMURIUM | ||||||
![]() | GLUTAMINE SYNTHETASE | ||||||
![]() | LIGASE(AMIDE SYNTHETASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() nitrogen utilization / glutamine synthetase / glutamine biosynthetic process / glutamine synthetase activity / protein homooligomerization / manganese ion binding / ATP binding / membrane / metal ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Liaw, S.-H. / Eisenberg, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Interactions of nucleotides with fully unadenylylated glutamine synthetase from Salmonella typhimurium. 著者: Liaw, S.H. / Jun, G. / Eisenberg, D. #1: ![]() タイトル: Refined Atomic Model of Glutamine Synthetase at 3.5 Angstroms Resolution 著者: Yamashita, M.M. / Almassy, R.J. / Janson, C.A. / Cascio, D. / Eisenberg, D. #2: ![]() タイトル: Novel Subunit-Subunit Interactions in the Structure of Glutamine Synthetase 著者: Almassy, R.J. / Janson, C.A. / Hamlin, R. / Xuong, N.-H. / Eisenberg, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 910.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 763.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 965 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 116.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 167.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 184 2: SER 350 - PRO 351 OMEGA = 218.02 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 51744.418 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P06201, UniProt: P0A1P6*PLUS, glutamine synthetase #2: 化合物 | ChemComp-MN / #3: 化合物 | ChemComp-AMP / |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.49 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.54 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 22 ℃ / pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.8 Å / Num. obs: 99219 / Num. measured all: 146242 / Rmerge(I) obs: 0.066 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.79→8 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.79→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Num. reflection all: 99220 / Rfactor all: 0.233 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 3 |