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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1kax | ||||||
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タイトル | 70KD HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN ATPASE DOMAIN, K71M MUTANT | ||||||
要素 | 70KD HEAT SHOCK COGNATE PROTEIN | ||||||
キーワード | HYDROLASE / ATP-BINDING / HEAT SHOCK | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Regulation of HSF1-mediated heat shock response / Attenuation phase / HSF1-dependent transactivation / Protein methylation / GABA synthesis, release, reuptake and degradation / PKR-mediated signaling / mRNA Splicing - Major Pathway / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / protein targeting to lysosome involved in chaperone-mediated autophagy / synaptic vesicle uncoating ...Regulation of HSF1-mediated heat shock response / Attenuation phase / HSF1-dependent transactivation / Protein methylation / GABA synthesis, release, reuptake and degradation / PKR-mediated signaling / mRNA Splicing - Major Pathway / HSP90 chaperone cycle for steroid hormone receptors (SHR) in the presence of ligand / protein targeting to lysosome involved in chaperone-mediated autophagy / synaptic vesicle uncoating / AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA / clathrin coat disassembly / Clathrin-mediated endocytosis / Prp19 complex / Neutrophil degranulation / non-chaperonin molecular chaperone ATPase / chaperone cofactor-dependent protein refolding / protein folding chaperone / heat shock protein binding / RNA splicing / ATP-dependent protein folding chaperone / spliceosomal complex / mRNA processing / melanosome / presynapse / protein-macromolecule adaptor activity / protein refolding / ribonucleoprotein complex / lysosomal membrane / negative regulation of DNA-templated transcription / nucleolus / ATP hydrolysis activity / ATP binding / nucleus / plasma membrane / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Bos taurus (ウシ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.7 Å | ||||||
データ登録者 | O'Brien, M.C. / Flaherty, K.M. / Mckay, D.B. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1996 タイトル: Lysine 71 of the chaperone protein Hsc70 Is essential for ATP hydrolysis. 著者: O'Brien, M.C. / Flaherty, K.M. / McKay, D.B. #1: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1995 タイトル: How Potassium Affects the Activity of the Molecular Chaperone Hsc70. II. Potassium Binds Specifically in the ATPase Active Site 著者: Wilbanks, S.M. / Mckay, D.B. #2: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1994 タイトル: Structural Basis of the 70-Kilodalton Heat Shock Cognate Protein ATP Hydrolytic Activity. II. Structure of the Active Site with Adp or ATP Bound to Wild Type and Mutant ATPase Fragment 著者: Flaherty, K.M. / Wilbanks, S.M. / Deluca-Flaherty, C. / Mckay, D.B. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1kax.cif.gz | 99.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1kax.ent.gz | 72.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1kax.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ka/1kax ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ka/1kax | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
-タンパク質 , 1種, 1分子 A
#1: タンパク質 | 分子量: 41997.539 Da / 分子数: 1 / 断片: ATPASE DOMAIN / 変異: K71M / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: P19120, EC: 3.6.1.3 |
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-非ポリマー , 5種, 445分子
#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-MG / | #4: 化合物 | #5: 化合物 | ChemComp-ATP / | #6: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.56 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.87 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / PH range low: 10 / PH range high: 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: RIGAKU / 検出器: IMAGE PLATE |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 38288 / % possible obs: 81 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3 % / Rmerge(I) obs: 0.033 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / Num. measured all: 116095 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.7→6 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.7→6 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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