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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1jxd | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF REDUCED CU(I) PLASTOCYANIN FROM SYNECHOCYSTIS PCC6803 | ||||||
要素 | PLASTOCYANINプラストシアニン | ||||||
キーワード | ELECTRON TRANSPORT (電子伝達系) / COPPER PROTEIN BETA BARREL ELECTRON TRANSFER (銅) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 plasma membrane-derived thylakoid membrane / electron transfer activity / copper ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Synechocystis sp. PCC 6803 (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / ENERGY MINIMIZATION | ||||||
データ登録者 | Bertini, I. / Bryant, D.A. / Ciurli, S. / Dikiy, A. / Fernandez, C.O. / Luchinat, C. / Safarov, N. / Vila, A.J. / Zhao, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2001 タイトル: Backbone dynamics of plastocyanin in both oxidation states. Solution structure of the reduced form and comparison with the oxidized state. 著者: Bertini, I. / Bryant, D.A. / Ciurli, S. / Dikiy, A. / Fernandez, C.O. / Luchinat, C. / Safarov, N. / Vila, A.J. / Zhao, J. #1: ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2001 タイトル: THE FIRST SOLUTION STRUCTURE OF A PARAMAGNETIC COPPER(II) PROTEIN: THE CASE OF OXIDIZED PLASTOCYANIN FROM THE CYANOBACTERIUM SYNECHOCYSTIS PCC6803 著者: Bertini, I. / Ciurli, S. / Dikiy, A. / Fernandez, C.O. / Luchinat, C. / Safarov, N. / Shumilin, S. / Vila, A.J. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1jxd.cif.gz | 39.6 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1jxd.ent.gz | 26.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1jxd.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jx/1jxd ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/jx/1jxd | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10249.430 Da / 分子数: 1 / 変異: D98E / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Synechocystis sp. PCC 6803 (バクテリア) 株: PCC6803 / プラスミド: PET3D / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BLR(DE3) / 参照: UniProt: P21697 |
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#2: 化合物 | ChemComp-CU / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
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NMR実験 |
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-試料調製
詳細 | 内容: 3 MM PLASTOCYANIN U-15N / 溶媒系: 50 MM PHOSPHATE BUFFER |
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試料状態 | イオン強度: 50 mM PHOSPHATE / pH: 5.2 / 圧: AMBIENT / 温度: 295 K |
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: ENERGY MINIMIZATION / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||
NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 1 |