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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1jbv | ||||||
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タイトル | FPGS-AMPPCP complex | ||||||
![]() | FOLYLPOLYGLUTAMATE SYNTHASE | ||||||
![]() | LIGASE / FPGS AMPPCP complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() tetrahydrofolate synthase / dihydrofolate synthase activity / tetrahydrofolylpolyglutamate synthase activity / one-carbon metabolic process / ATP binding / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Sun, X. / Cross, J.A. / Bognar, A.L. / Baker, E.N. / Smith, C.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Folate-binding triggers the activation of folylpolyglutamate synthetase. 著者: Sun, X. / Cross, J.A. / Bognar, A.L. / Baker, E.N. / Smith, C.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 100.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 73.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 452.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 462.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 17.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 46697.016 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() プラスミド: pCYB / 生物種 (発現宿主): Escherichia coli / 発現宿主: ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-ACP / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.31 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5.3 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: Sun, X., (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 95, 6647. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 113 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2000年1月10日 / 詳細: mirrors |
放射 | モノクロメーター: Mar mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→100 Å / Num. all: 28314 / Num. obs: 28314 / % possible obs: 94 % / 冗長度: 6.9 % / Rmerge(I) obs: 0.051 / Net I/σ(I): 23.4 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→1.97 Å / Rmerge(I) obs: 0.295 / Mean I/σ(I) obs: 3.2 / % possible all: 86.1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / 最低解像度: 100 Å / % possible obs: 94 % / Num. measured all: 195787 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.9 Å / % possible obs: 86.1 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1FGS 解像度: 1.95→100 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.95→100 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: CNS / バージョン: 1 / 分類: refinement | |||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 100 Å / % reflection Rfree: 5 % / Rfactor obs: 0.194 | |||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | |||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |