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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1j0r | ||||||
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タイトル | Crystal structure of the replication termination protein mutant C110S | ||||||
![]() | replication termination protein | ||||||
![]() | REPLICATION / winged-helix / DNA-binding protein | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Vivian, J.P. / Hastings, A.F. / Duggin, I.G. / Wake, R.G. / Wilce, M.C.J. / Wilce, J.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The impact of single cysteine residue mutations on the replication terminator protein 著者: Vivian, J.P. / Hastings, A.F. / Duggin, I.G. / Wake, R.G. / Wilce, M.C.J. / Wilce, J.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 59.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 431.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 439.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 11.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1bm9S S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14531.099 Da / 分子数: 2 / 変異: C110S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.45 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.32 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6 詳細: 22% PEG 2000, 150mM MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 22 ℃ / pH: 6.7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2001年6月7日 / 詳細: mirrors |
放射 | モノクロメーター: mirrors / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→69 Å / Num. all: 9541 / Num. obs: 9541 / % possible obs: 88 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 5.7 % / Rsym value: 0.045 |
反射 シェル | 解像度: 2.5→2.59 Å / Rsym value: 0.471 / % possible all: 92.2 |
反射 | *PLUS % possible obs: 88 % / Num. measured all: 54110 / Rmerge(I) obs: 0.045 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 2.66 Å / % possible obs: 92.2 % / Rmerge(I) obs: 0.471 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB entry 1BM9 解像度: 2.5→50 Å / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→50 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | 解像度: 2.5→2.59 Å
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拘束条件 | *PLUS
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LS精密化 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 2.66 Å |