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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1imw | ||||||
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タイトル | Peptide Antagonist of IGFBP-1 | ||||||
![]() | IGFBP-1 antagonist | ||||||
![]() | ANTAGONIST / loop-turn-helix / DE NOVO PROTEIN | ||||||
手法 | 溶液NMR / restrained molecular dynamics | ||||||
![]() | Lowman, H.B. / Chen, Y.M. / Skelton, N.J. / Mortensen, D.L. / Tomlinson, E.E. / Sadick, M.D. / Robinson, I.C. / Clark, R.G. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure-function analysis of a phage display-derived peptide that binds to insulin-like growth factor binding protein 1. 著者: Skelton, N.J. / Chen, Y.M. / Dubree, N. / Quan, C. / Jackson, D.Y. / Cochran, A. / Zobel, K. / Deshayes, K. / Baca, M. / Pisabarro, M.T. / Lowman, H.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 85.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 66.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 338.1 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 420.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 9.4 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 1771.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 詳細: The peptide was chemically synthesized. It is a novel sequence derived from phage-display selection. |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: This structure was determined using standard 2D homonuclear techniques. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX / 製造業者: Bruker / モデル: AMX / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: restrained molecular dynamics / ソフトェア番号: 1 詳細: The structures were detemined on the basis of 149 NOE distance restraints and 15 dihedral angle restraints. The resulting ensemble had no restraint violations greater than 0.07 Angstroms or 1. ...詳細: The structures were detemined on the basis of 149 NOE distance restraints and 15 dihedral angle restraints. The resulting ensemble had no restraint violations greater than 0.07 Angstroms or 1.4 deg. The mean restraint violation energy was 0.17+/- 0.06 kcal/mol. | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: fewest violations | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the least restraint violations 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |