+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ilr | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE INTERLEUKIN-1 RECEPTOR ANTAGONIST | ||||||
![]() | INTERLEUKIN-1 RECEPTOR ANTAGONIST PROTEIN | ||||||
![]() | BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() interleukin-1 type I receptor antagonist activity / interleukin-1 type II receptor antagonist activity / interleukin-1, type I receptor binding / interleukin-1 receptor antagonist activity / interleukin-1, type II receptor binding / negative regulation of interleukin-1-mediated signaling pathway / negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion / interleukin-1 receptor binding / inflammatory response to antigenic stimulus / insulin secretion ...interleukin-1 type I receptor antagonist activity / interleukin-1 type II receptor antagonist activity / interleukin-1, type I receptor binding / interleukin-1 receptor antagonist activity / interleukin-1, type II receptor binding / negative regulation of interleukin-1-mediated signaling pathway / negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion / interleukin-1 receptor binding / inflammatory response to antigenic stimulus / insulin secretion / Interleukin-10 signaling / response to glucocorticoid / cytokine activity / acute-phase response / lipid metabolic process / Interleukin-1 signaling / immune response / centrosome / extracellular space / extracellular exosome / nucleoplasm / plasma membrane / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Schreuder, H.A. / Rondeau, J.-M. / Tardif, C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Refined crystal structure of the interleukin-1 receptor antagonist. Presence of a disulfide link and a cis-proline. 著者: Schreuder, H.A. / Rondeau, J.M. / Tardif, C. / Soffientini, A. / Sarubbi, E. / Akeson, A. / Bowlin, T.L. / Yanofsky, S. / Barrett, R.W. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 65.4 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 53 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 420.5 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 424.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 19.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
| ||||||||
Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 1 53 / 2: CIS PROLINE - PRO 2 53 | ||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (0.342973, 0.714236, -0.61011), ベクター: |
-
要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17145.406 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.39 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / Num. obs: 16972 / % possible obs: 92.7 % |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / 最低解像度: 2.2 Å / % possible obs: 60.1 % |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 2.1→8 Å / σ(F): 0 /
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→8 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.197 / Rfactor Rwork: 0.197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d / Dev ideal: 1.5 |