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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ih9 | ||||||
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タイトル | NMR Structure of Zervamicin IIB (peptaibol antibiotic) Bound to DPC Micelles | ||||||
要素 | ZERVAMICIN IIB | ||||||
キーワード | ANTIBIOTIC / ZREVAMICIN / PEPTAIBOL ANTIBACTERIAL / ANTIFUNGAL / ANTIBIOTIC BENT HELIX | ||||||
機能・相同性 | Zervamicin IIB / : 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | EMERICELLOPSIS SALMOSYNNEMATA (菌類) | ||||||
手法 | 溶液NMR / SIMULATED ANNELING. ENERGY MINIMISATION. | ||||||
データ登録者 | Shenkarev, Z.O. / Balasheva, T.A. / Efremov, R.G. / Yakimenko, Z.A. / Ovchinnikova, T.V. / Raap, J. / Arseniev, A.S. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biophys.J. / 年: 2002 タイトル: Spatial Structure of Zervamicin Iib Bound to Dpc Micelles: Implications for Voltage-Gating. 著者: Shenkarev, Z.O. / Balashova, T.A. / Efremov, R.G. / Yakimenko, Z.A. / Ovchinnikova, T.V. / Raap, J. / Arseniev, A.S. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ih9.cif.gz | 89.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ih9.ent.gz | 72.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ih9.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ih9_validation.pdf.gz | 356.4 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ih9_full_validation.pdf.gz | 438.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ih9_validation.xml.gz | 7.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ih9_validation.cif.gz | 11 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ih/1ih9 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ih/1ih9 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質・ペプチド | |
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構成要素の詳細 | ZERVAMICIN IIB IS LINEAR PEPTIDE, A MEMBER OF THE PEPTAIBOL FAMILY OF MEMBRANE CHANNEL FORMING ...ZERVAMICIN |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THIS STRUCTURE WAS DETERMINED USING STANDARD 2D HOMONUCLEAR TECHNIQUES. |
-試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 6.8 / 圧: 1ATM ATM / 温度: 303 K | ||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITY / 製造業者: Varian / モデル: UNITY / 磁場強度: 600 MHz |
-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: SIMULATED ANNELING. ENERGY MINIMISATION. / ソフトェア番号: 1 詳細: 536 NOESY PEAKS, 174 UPPER CONSTRAINTS 29 ADDITIONAL LOWER CONSTRAINTS 60 ADDITIONAL CONSTRAINTS FOR HYDROGEN BONDS 11 ANGLE CONSTRAINTS | |||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: target function / 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |