+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ifb | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | REFINED APOPROTEIN STRUCTURE OF RAT INTESTINAL FATTY ACID BINDING PROTEIN PRODUCED IN ESCHERICHIA COLI | ||||||
要素 | INTESTINAL FATTY ACID BINDING PROTEIN | ||||||
キーワード | FATTY ACID-BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Triglyceride catabolism / intestinal lipid absorption / apical cortex / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / long-chain fatty acid binding / 微絨毛 / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid metabolic process ...Triglyceride catabolism / intestinal lipid absorption / apical cortex / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / long-chain fatty acid binding / 微絨毛 / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid metabolic process / fatty acid binding / 細胞核 / 細胞質基質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Rattus rattus (エジプトネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.96 Å | ||||||
データ登録者 | Sacchettini, J.C. / Gordon, J.I. / Banaszak, L.J. | ||||||
引用 | ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 1989 タイトル: Refined apoprotein structure of rat intestinal fatty acid binding protein produced in Escherichia coli. 著者: Sacchettini, J.C. / Gordon, J.I. / Banaszak, L.J. | ||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ifb.cif.gz | 37.7 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1ifb.ent.gz | 26.2 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ifb.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/if/1ifb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/if/1ifb | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15015.015 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Rattus rattus (エジプトネズミ) 参照: UniProt: P02693 |
---|---|
#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.63 % | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS pH: 7.3 / 手法: free interface diffusion | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 10 Å / Rmerge(I) obs: 0.082 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 2.5 Å / Rmerge(I) obs: 0.162 |
-解析
ソフトウェア | 名称: X-PLOR / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | Rfactor Rwork: 0.188 / 最高解像度: 1.96 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.96 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.96 Å / 最低解像度: 7 Å / Num. reflection obs: 5990 / σ(F): 1.5 / Rfactor obs: 0.188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_angle_d |