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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1htl | ||||||
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タイトル | MUTATION OF A BURIED RESIDUE CAUSES LACK OF ACTIVITY BUT NO CONFORMATIONAL CHANGE: CRYSTAL STRUCTURE OF E. COLI HEAT-LABILE ENTEROTOXIN MUTANT VAL 97--> LYS | ||||||
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![]() | ENTEROTOXIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() toxin activity / killing of cells of another organism / extracellular space / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Merritt, E.A. / Hol, W.G.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Mutation of a buried residue causes loss of activity but no conformational change in the heat-labile enterotoxin of Escherichia coli. 著者: Merritt, E.A. / Sarfaty, S. / Pizza, M. / Domenighini, M. / Rappuoli, R. / Hol, W.G. #1: ![]() タイトル: Refined Structure of Escherichia Coli Heat-Labile Enterotoxin, a Close Relative of Cholera Toxin 著者: Sixma, T.K. / Kalk, K.H. / Van Zanten, B.A.M. / Dauter, Z. / Kingma, J. / Witholt, B. / Hol, W.G.J. #2: ![]() タイトル: Crystal Structure of a Cholera Toxin-Related Heat-Labile Enterotoxin from E. Coli 著者: Sixma, T.K. / Pronk, S.E. / Kalk, K.H. / Wartna, E.S. / Van Zanten, B.A.M. / Witholt, B. / Hol, W.G.J. #3: ![]() タイトル: Probing the Structure-Activity Relationship of Escherichia Coli Lt-A by Site-Directed Mutagenesis 著者: Pizza, M. / Domenighini, M. / Hol, W. / Giannelli, V. / Fontana, M.R. / Giuliani, M.M. / Magagnoli, C. / Peppoloni, S. / Manetti, R. / Rappuoli, R. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET IN THE PENTAMER THE BETA SHEETS FROM ADJACENT MONOMERS COMBINE TO FORM A CONTINUOUS SIX- ...SHEET IN THE PENTAMER THE BETA SHEETS FROM ADJACENT MONOMERS COMBINE TO FORM A CONTINUOUS SIX-STRANDED ANTI-PARALLEL SHEET ACROSS EACH MONOMER-MONOMER INTERFACE. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 156 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 125.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 457.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 473.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 29.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 40.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO D 93 / 2: CIS PROLINE - PRO E 93 / 3: CIS PROLINE - PRO F 93 / 4: CIS PROLINE - PRO G 93 / 5: CIS PROLINE - PRO H 93 / 6: CIS PROLINE - PRO A 178 | ||||||||
詳細 | ASYMMETRIC UNIT CONTAINS ONE AB5 TOXIN HEXAMER. THE A SUBUNIT CONTAINS TWO FRAGMENTS, CONVENTIONALLY REFERRED TO AS A1 AND A2, WHICH ARE LABELED AS CHAINS A AND C IN THIS COORDINATE SET. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11807.539 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: タンパク質 | | 分子量: 21959.148 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #3: タンパク質・ペプチド | | 分子量: 5940.504 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.29 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 10.1 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 19608 / % possible obs: 75 % / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / Rmerge(I) obs: 0.113 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.5→15 Å / σ(F): 1 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 21.7 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→15 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |