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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hsn | ||||||
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タイトル | THE STRUCTURE OF THE HMG BOX AND ITS INTERACTION WITH DNA | ||||||
要素 | HIGH MOBILITY GROUP PROTEIN 1 | ||||||
キーワード | DNA-BINDING | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 regulation of T cell mediated immune response to tumor cell / negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly / positive regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway / neutrophil clearance / positive regulation of DNA ligation / apoptotic cell clearance / DNA binding, bending / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / condensed chromosome / autophagy ...regulation of T cell mediated immune response to tumor cell / negative regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly / positive regulation of toll-like receptor 9 signaling pathway / neutrophil clearance / positive regulation of DNA ligation / apoptotic cell clearance / DNA binding, bending / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment / condensed chromosome / autophagy / chemotaxis / DNA recombination / adaptive immune response / endosome / inflammatory response / innate immune response / DNA repair / extracellular region / nucleus / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Cricetulus griseus (モンゴルキヌゲネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR | ||||||
データ登録者 | Read, C.M. / Cary, P.D. / Crane-Robinson, C. / Driscoll, P.C. / Carillo, M.O.M. / Norman, D.G. | ||||||
引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: The Structure of the Hmg Box and its Interaction with DNA 著者: Read, C.M. / Cary, P.D. / Crane-Robinson, C. / Driscoll, P.C. / Carillo, M.O.M. / Norman, D.G. #1: ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 1993 タイトル: Solution Structure of a DNA-Binding Domain from Hmg1 著者: Read, C.M. / Cary, P.D. / Crane-Robinson, C. / Driscoll, P.C. / Norman, D.G. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1hsn.cif.gz | 1.2 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1hsn.ent.gz | 1 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1hsn.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1hsn_validation.pdf.gz | 373 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1hsn_full_validation.pdf.gz | 724.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1hsn_validation.xml.gz | 63.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1hsn_validation.cif.gz | 105.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hs/1hsn ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hs/1hsn | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 8843.149 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Cricetulus griseus (モンゴルキヌゲネズミ) 遺伝子: INSERT DERIVED BY PCR / プラスミド: PGEX-2T GENE: INSERT DERIVED BY PCR / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): DH5 ALPHA / 参照: UniProt: P07156 |
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#2: 化合物 | ChemComp-BME / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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-試料調製
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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NMRアンサンブル | 登録したコンフォーマーの数: 49 |