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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1hh0 | ||||||
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タイトル | Filamentous Bacteriophage PH75 | ||||||
![]() | PH75 INOVIRUS MAJOR COAT PROTEIN | ||||||
![]() | VIRUS / VIRUS COAT PROTEIN / HELICAL VIRUS COAT PROTEIN / SSDNA VIRUSES / INOVIRUS / FILAMENTOUS BACTERIOPHAGE / THERMOPHILES / MEMBRANE PROTEINS / HELICAL VIRUS | ||||||
機能・相同性 | Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #80 / Bacteriophage M13, G8P, capsid domain superfamily / helical viral capsid / host cell membrane / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Up-down Bundle / Mainly Alpha / membrane / Capsid protein G8P![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Pederson, D.M. / Welsh, L.C. / Marvin, D.A. / Sampson, M. / Perham, R.N. / Yu, M. / Slater, M.R. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The Protein Capsid of Filamentous Bacteriophage Ph75 from Thermus Thermophilus 著者: Pederson, D.M. / Welsh, L.C. / Marvin, D.A. / Sampson, M. / Perham, R.N. / Yu, M. / Slater, M.R. #1: ![]() タイトル: The Molecular Structure and Structural Transition of the Alpha-Helical Capsid in Filamentous Bacteriophage Pf1 著者: Welsh, L.C. / Symmons, M.F. / Marvin, D.A. #2: ![]() タイトル: Structure of the Capsid of Pf3 Filamentous Phage Determined from X-Ray Fibre Diffraction Data at 3.1 A Resolution 著者: Welsh, L.C. / Symmons, M.F. / Sturtevant, J.M. / Marvin, D.A. / Perham, R.N. #3: ![]() タイトル: Pf1 Filamentous Bacteriophage: Refinement of a Molecular Model by Simulated Annealing Using 3.3 Angstroms Resolution X-Ray Fibre Diffraction Data 著者: Gonzalez, A. / Nave, C. / Marvin, D.A. #4: ![]() タイトル: Model-Building Studies of Inovirus: Genetic Variations on a Geometric Theme 著者: Marvin, D.A. | ||||||
履歴 |
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Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 26.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 17.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 331.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 337 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
| x 35||||||||
2 |
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3 | ![]()
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単位格子 |
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対称性 | らせん対称: (回転対称性: 1 / Dyad axis: no / N subunits divisor: 1 / Num. of operations: 35 / Rise per n subunits: 2.9 Å / Rotation per n subunits: 66.667 °) |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4816.578 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: MAJOR COAT PROTEIN ASSEMBLY / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | 解説: THE DATA IS DERIVED FROM CONTINUOUS TRANSFORM DATA AND THEREFORE THE NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS IS A MEANINGLESS NUMBER. THE STRUCTURE WAS REFINED AGAI THE SAME STRUCTURE FACTORS AS PDB ...解説: THE DATA IS DERIVED FROM CONTINUOUS TRANSFORM DATA AND THEREFORE THE NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS IS A MEANINGLESS NUMBER. THE STRUCTURE WAS REFINED AGAI THE SAME STRUCTURE FACTORS AS PDB ENTRY 1HGV, USING DIFFERENT REFINEMENT PROTOCOL. THEREFORE, THE STRUCT FACTORS FOR 1HHO, CAN BE TAKEN FROM R1HGVSF |
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結晶化 | pH: 7.5 / 詳細: pH 7.50 |
結晶化 | *PLUS 手法: unknown |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 300 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1999年2月15日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: GE CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.488 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→50 Å / % possible obs: 100 % |
反射 | *PLUS % possible obs: 100 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1IFN 解像度: 2.4→50 Å / σ(F): 0 詳細: THE MODEL WAS DERIVED FROM PDB ENTRY 1IFN, REFERENCE 1, BY MOLECULAR REPLACEMENT
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→50 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: FXPLOR / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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