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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1h4x | ||||||
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タイトル | Structure of the Bacillus Cell Fate Determinant SpoIIAA in the Phosphorylated Form | ||||||
![]() | ANTI-SIGMA F FACTOR ANTAGONIST | ||||||
![]() | CELL DIFFERENTIATION / PHOSPHORYLATION / SIGMA FACTOR / SPORULATION | ||||||
機能・相同性 | ![]() anti-sigma factor antagonist activity / antisigma factor binding / sporulation resulting in formation of a cellular spore 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Seavers, P.R. / Lewis, R.J. / Brannigan, J.A. / Verschueren, K.H.G. / Murshudov, G.N. / Wilkinson, A.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the Bacillus Cell Fate Determinant Spoiiaa in Phosphorylated and Unphosphorylated Forms 著者: Seavers, P.R. / Lewis, R.J. / Brannigan, J.A. / Verschueren, K.H.G. / Murshudov, G.N. / Wilkinson, A.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 64.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 52.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 440.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 447.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 9.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13205.202 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: ATCC14577 / プラスミド: PET28A / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | 構成要素の詳細 | IN THE PHOSPHORYL | 配列の詳細 | THE SEQUENCE SPOIIA FROM BACILLUS SPHAERICUSS STRAIN ATCC14577, IS SIMILAR TO THE SWISSPROT ENTRY ...THE SEQUENCE SPOIIA FROM BACILLUS SPHAERICUS | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.96 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.35 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6.5 / 詳細: 30% PEG 5K MME, 200MM (NH4)2SO4, 100MM MES (PH 6.5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 291 K / pH: 8.5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: Seavers, P.R., (2001) Acta Crystallogr., D57, 292. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.934 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.16→20 Å / Num. obs: 72227 / % possible obs: 97.9 % / 冗長度: 3.8 % / Rmerge(I) obs: 0.068 / Net I/σ(I): 18.9 |
反射 シェル | 解像度: 1.16→1.2 Å / 冗長度: 2.5 % / Rmerge(I) obs: 0.3 / Mean I/σ(I) obs: 3.72 / % possible all: 85.4 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 277544 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 85.4 % / Rmerge(I) obs: 0.3 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL PLUS MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.16→19.61 Å
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拘束条件 |
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