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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1gmr | ||||||
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タイトル | COMPLEX OF RIBONUCLEASE FROM STREPTOMYCES AUREOFACIENS WITH 2'-GMP AT 1.7 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE SA | ||||||
![]() | HYDROLASE(GUANYLORIBONUCLEASE) | ||||||
機能・相同性 | ![]() ribonuclease T1 activity / ribonuclease T1 / RNA endonuclease activity / lyase activity / RNA binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Sevcik, J. / Hill, C. / Dauter, Z. / Wilson, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Complex of ribonuclease from Streptomyces aureofaciens with 2'-GMP at 1.7 A resolution. 著者: Sevcik, J. / Hill, C.P. / Dauter, Z. / Wilson, K.S. #1: ![]() タイトル: Continuation of the Rnase Sa Work After 1Sar and 2Sar Structures 著者: Sevcik, J. / Dodson, E.J. / Dodson, G.G. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 56 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 44.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 16.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO A 27 AND PRO B 27 ARE CIS PROLINES. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10584.531 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P05798, EC: 3.1.27.3 #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | 非ポリマーの詳細 | THERE TOO MANY WATER MOLECULES AT BONDING DISTANCE FROM ATOMS OF 2GP B. | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.72 % | ||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 7.2 / 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: referred to Acta Cryst.B47.240-253 1991 | ||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.77 Å / Num. obs: 19476 / % possible obs: 96.3 % / Num. measured all: 56410 / Rmerge(I) obs: 0.042 |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 1.77→10 Å /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.77→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.77 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection obs: 19319 / Rfactor obs: 0.146 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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