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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1g15 | ||||||
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タイトル | CO-CRYSTAL OF E. COLI RNASE HI WITH TWO MN2+ IONS BOUND IN THE THE ACTIVE SITE | ||||||
![]() | RIBONUCLEASE HI | ||||||
![]() | HYDROLASE / ribonuclease H / RNase H / nuclease / divalent metal binding / activation/attenuation mechanism | ||||||
機能・相同性 | ![]() DNA replication, removal of RNA primer / ribonuclease H / RNA-DNA hybrid ribonuclease activity / endonuclease activity / nucleic acid binding / magnesium ion binding / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Goedken, E.R. / Marqusee, S. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Co-crystal of Escherichia coli RNase HI with Mn2+ ions reveals two divalent metals bound in the active site. 著者: Goedken, E.R. / Marqusee, S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 43.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 30 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 367 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 368.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 17468.701 Da / 分子数: 1 / 変異: C13A, C63A, K87A, C133A / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.74 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 294 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8 詳細: 1 mM MnCl2, 16 % PEG-3350, 20 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: CCD / 日付: 2000年7月2日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.9→20 Å / Num. all: 11201 / Num. obs: 11149 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 4.95 % / Biso Wilson estimate: 24.03 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.083 / Net I/σ(I): 4.2 |
反射 シェル | 解像度: 1.9→2.05 Å / 冗長度: 3.9 % / Rmerge(I) obs: 0.42 / % possible all: 99.3 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 99.3 % / Mean I/σ(I) obs: 0.7 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 1.9→20 Å
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.9→20 Å
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ソフトウェア | *PLUS 名称: CNS / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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