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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fpz | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF KINASE ASSOCIATED PHOSPHATASE (KAP) WITH A SUBSTITUTION OF THE CATALYTIC SITE CYSTEINE (CYS140) TO A SERINE | ||||||
![]() | CYCLIN-DEPENDENT KINASE INHIBITOR 3 | ||||||
![]() | HYDROLASE / alpha-beta sandwich | ||||||
機能・相同性 | ![]() protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity / myosin phosphatase activity / protein serine/threonine phosphatase activity / regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity / protein-serine/threonine phosphatase / protein-tyrosine-phosphatase / protein tyrosine phosphatase activity / G1/S transition of mitotic cell cycle / regulation of cell cycle / negative regulation of cell population proliferation ...protein tyrosine/serine/threonine phosphatase activity / myosin phosphatase activity / protein serine/threonine phosphatase activity / regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity / protein-serine/threonine phosphatase / protein-tyrosine-phosphatase / protein tyrosine phosphatase activity / G1/S transition of mitotic cell cycle / regulation of cell cycle / negative regulation of cell population proliferation / perinuclear region of cytoplasm / nucleus / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Song, H. / Hanlon, N. / Brown, N.R. / Noble, M.E.M. / Johnson, L.N. / Barford, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Phosphoprotein-protein interactions revealed by the crystal structure of kinase-associated phosphatase in complex with phosphoCDK2. 著者: Song, H. / Hanlon, N. / Brown, N.R. / Noble, M.E. / Johnson, L.N. / Barford, D. #1: ![]() タイトル: Cdi1, a human G1 and S phase protein phosphatase that associates with Cdk2 著者: Gyruris, J. / Golemis, E. / Chertkov, H. / Brent, R. #2: ![]() タイトル: The p21Cdk-interacting protein Cip1 is a potent inhibitor of G1 cyclin-dependent kinases 著者: Harper, J.W. / Adami, G.R. / Wei, N. / Keyomarsi, K. / Elledge, S.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 230.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 186.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 23819.057 Da / 分子数: 6 / 変異: C140S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.46 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.09 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5 詳細: PEG 8000, ammonium sulphate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / 詳細: Hanlon, N., (1998) Protein Sci., 7, 508. | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC / 検出器: CCD / 日付: 2000年1月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.87 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2→50 Å / Num. obs: 90055 / % possible obs: 96.7 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 3.6 % / Biso Wilson estimate: 23.6 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.06 / Net I/σ(I): 9.3 |
反射 シェル | 解像度: 2→2.12 Å / Rmerge(I) obs: 0.38 / % possible all: 91.6 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 319770 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 91.6 % / Mean I/σ(I) obs: 1.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→20 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / σ(I): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→20 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: CNS / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 20 Å / σ(F): 0 / % reflection Rfree: 10 % / Rfactor obs: 0.202 | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |