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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fdh | |||||||||
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タイトル | STRUCTURE OF HUMAN FOETAL DEOXYHAEMOGLOBIN | |||||||||
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![]() | OXYGEN TRANSPORT | |||||||||
機能・相同性 | ![]() nitric oxide transport / hemoglobin alpha binding / haptoglobin binding / haptoglobin-hemoglobin complex / organic acid binding / hemoglobin complex / oxygen transport / Scavenging of heme from plasma / endocytic vesicle lumen / hydrogen peroxide catabolic process ...nitric oxide transport / hemoglobin alpha binding / haptoglobin binding / haptoglobin-hemoglobin complex / organic acid binding / hemoglobin complex / oxygen transport / Scavenging of heme from plasma / endocytic vesicle lumen / hydrogen peroxide catabolic process / oxygen carrier activity / Heme signaling / carbon dioxide transport / response to hydrogen peroxide / Erythrocytes take up oxygen and release carbon dioxide / Erythrocytes take up carbon dioxide and release oxygen / Cytoprotection by HMOX1 / oxygen binding / peroxidase activity / Factors involved in megakaryocyte development and platelet production / blood microparticle / iron ion binding / heme binding / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / membrane / metal ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Frierjunior, J.A. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of human foetal deoxyhaemoglobin. 著者: Frier, J.A. / Perutz, M.F. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 111.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 82.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 686.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 744 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 21.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 27.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.956478, 0.282472, 0.073934), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15150.353 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 16043.268 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() #3: 化合物 | ChemComp-HEM / |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.44 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.65 % |
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結晶化 | *PLUS pH: 6.3 / 手法: unknown |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 2.9 M / 一般名: ammonium sulfate |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / Num. obs: 18180 |
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解析
精密化 | 最高解像度: 2.5 Å | ||||||||||||
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.343 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |