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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1elf | ||||||
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タイトル | NATURE OF THE INACTIVATION OF ELASTASE BY N-PEPTIDYL-O-AROYL HYDROXYLAMINE AS A FUNCTION OF PH | ||||||
![]() | PORCINE PANCREATIC ELASTASE | ||||||
![]() | COMPLEX (HYDROLASE/INHIBITOR) / COMPLEX (HYDROLASE-INHIBITOR) / COMPLEX (HYDROLASE-INHIBITOR) complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic elastase / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular space / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Ding, X. / Rasmussen, B. / Demuth, H.-U. / Ringe, D. / Steinmetz, A.C.U. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Nature of the inactivation of elastase by N-peptidyl-O-aroyl hydroxylamine as a function of pH. 著者: Ding, X. / Rasmussen, B.F. / Demuth, H.U. / Ringe, D. / Steinmetz, A.C. #1: ![]() タイトル: Direct Structural Observation of an Acyl-Enzyme Intermediate in the Hydrolysis of an Ester Substrate by Elastase 著者: Ding, X. / Rasmussen, B.F. / Petsko, G.A. / Ringe, D. #2: ![]() タイトル: Inhibition of Proteases with Enkephalin-Analogue Inhibitors 著者: Demuth, H.-U. / Silberring, J. / Nyberg, F. #3: ![]() タイトル: Competing Redox and Inactivation Processes in the Inhibition of Cysteine Proteinases by Peptidyl O-Acylhydroxamates. 13C and 15N NMR Evidence for a Novel Sulfenamide Enzyme Adduct 著者: Robinson, V.J. / Coles, P.J. / Smith, R.A. / Krantz, A. #4: ![]() タイトル: N-O Bond Fission as the Rate-Determining Step in the Aqueous Conversion of N-Peptidyl-O-(P-Nitrobenzoyl)Hydroxylamines to P-Nitrobenzoic Acid and Peptidylhydroxamic Acids 著者: Demuth, H.-U. / Fischer, G. / Barth, A. / Schowen, R.L. #5: ![]() タイトル: Crystal Structure of the Covalent Complex Formed by a Peptidyl Difluoro Keto Amide with Porcine Pancreatic Elastase at 1.78 Angstroms Resolution 著者: Takahashi, L.H. / Radhakrishnan, R. / Rosenfield Junior, R.E. / Meyer Junior, E.F. / Trainor, D.A. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE TWO SEVEN-STRANDED SHEETS IN THIS STRUCTURE ARE REALLY SIX-STRANDED BETA BARRELS. THIS IS ...SHEET THE TWO SEVEN-STRANDED SHEETS IN THIS STRUCTURE ARE REALLY SIX-STRANDED BETA BARRELS. THIS IS DENOTED BY THE FIRST STRAND RECURRING AS THE LAST STRAND. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 63.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 46.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 445.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 451 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 11.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25928.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / | ||||
#3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-BAF / ( | #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.2 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.21 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.7→10 Å / Num. obs: 21705 / % possible obs: 84 % / Observed criterion σ(I): 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.68 Å / 最低解像度: 22.36 Å / Num. obs: 23713 / % possible obs: 91 % / Observed criterion σ(I): 0 / Rmerge(I) obs: 0.1 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor Rwork: 0.18 / Rfactor obs: 0.18 / 最高解像度: 1.7 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.7 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 10 Å / Num. reflection all: 21705 / σ(I): 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |