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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1.0E+57 | ||||||
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タイトル | PHYSALIS MOTTLE VIRUS: EMPTY CAPSID | ||||||
![]() | PHYSALIS MOTTLE VIRUS | ||||||
![]() | VIRUS / COAT PROTEIN (VIRAL) / ICOSAHEDRAL VIRUS | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Krishna, S.S. / Sastri, M. / Savithri, H.S. / Murthy, M.R.N. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural Studies on the Empty Capsids of Physalis Mottle Virus 著者: Krishna, S.S. / Sastri, M. / Savithri, H.S. / Murthy, M.R.N. #1: ![]() タイトル: Three Dimensional Structure of Physalis Movirus: Implications for the Viral Assembly 著者: Krishna, S.S. / Hiremath, C.N. / Munshi, S.K. / Prahadeeswaran, D. / Sastri, M. / Savithri, H.S. / Murthy, M.R.N. #2: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1999 タイトル: Identification of a Discrete Intermediate in the Assembly/Disassembly of Physalis Mottle Tymovirus Through Mutational Analysis 著者: Sastri, M. / Reddy, S. / Krishna, S.S. / Murthy, M.R.N. / Savithri, H.S. #3: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1997 タイトル: Assembly of Physalis Mottle Virus Capsid Protein in Escherichia Coli and the Role of Amino and Carboxy Termini in the Formation of the Icosahedral Particles 著者: Sastri, M. / Kekuda, R. / Gopinath, K. / Kumar, C.T.R. / Jagath, J.R. / Savithri, H.S. #4: ジャーナル: Virology / 年: 1993 タイトル: Architecture of Physalis Mottle Tymovirus as Probed by Monoclonal Antibodies and Cross-Linking Studies 著者: Kekuda, R. / Karande, A.A. / Jacob, A.N.K. / Savithri, H.S. #5: ![]() タイトル: Structure of Belladonna Mottle Virus: Cross-Rotation Function Studies with Southern Bean Mosaic Virus 著者: Hiremath, C.N. / Munshi, S.K. / Murthy, M.R.N. #6: ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 1989 タイトル: Primary Structure of Belladonna Mottle Virus Coat Protein 著者: Suryanarayana, S. / Rao, N.A. / Murthy, M.R.N. / Savithri, H.S. #7: ![]() タイトル: Stability of Belladonna Mottle Virus Particles: The Role of Polyamines and Calcium 著者: Savithri, H.S. / Munshi, S.K. / Suryanarayana, S. / Divakar, S. / Murthy, M.R.N. #8: ![]() タイトル: Symmetry of Belladonna Mottle Virus: Rotation Function Studies 著者: Munshi, S.K. / Hiremath, C.N. / Murthy, M.R.N. / Savithri, H.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 95.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 70.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 407.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 448.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 17.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 24.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1qjzS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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3 | ![]()
| x 5||||||||
4 | ![]()
| x 6||||||||
5 | ![]()
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6 | ![]()
| x 60||||||||
単位格子 |
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対称性 | 点対称性: (シェーンフリース記号: I (正20面体型対称)) |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 19989.924 Da / 分子数: 3 / 断片: EMPTY CAPSID / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶化 | pH: 5.6 / 詳細: PH 5.6 SODIUM ACETATE; WITH 20% PEG AS PRECIPITANT. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 295 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 詳細: MIRRORS |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.2→30 Å / Num. obs: 605968 / % possible obs: 36 % / Observed criterion σ(I): 2 / Rmerge(I) obs: 0.149 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1QJZ 解像度: 3.2→10 Å / Data cutoff high absF: 10000000 / σ(F): 4
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.2→10 Å
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拘束条件 |
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Refine LS restraints NCS | NCS model details: STRICT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ソフトウェア | *PLUS 名称: CNS / バージョン: 0.4 / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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