+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1dwm | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Solution structure of Linum usitatissinum trypsin inhibitor (LUTI) | ||||||
要素 | LINUM USITATISSINUM TRYPSIN INHIBITOR | ||||||
キーワード | SERINE PROTEINASE INHIBITOR / TRYPSIN INHIBITOR | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | LINUM USITATISSIMUM (アマ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Cierpicki, T. / Otlewski, J. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2000 タイトル: Determination of a High Precision Structure of a Novel Protein, Linum Usitatissimum Trypsin Inhibitor (Luti), Using Computer-Aided Assignment of Noesy Cross-Peaks 著者: Cierpicki, T. / Otlewski, J. | ||||||
履歴 |
| ||||||
Remark 650 | HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. | ||||||
Remark 700 | SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR PROVIDED. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1dwm.cif.gz | 412.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1dwm.ent.gz | 345.4 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1dwm.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1dwm_validation.pdf.gz | 343.7 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 1dwm_full_validation.pdf.gz | 481.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1dwm_validation.xml.gz | 26.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1dwm_validation.cif.gz | 42.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dw/1dwm ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dw/1dwm | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 7651.771 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) LINUM USITATISSIMUM (アマ) / 器官: SEED / 参照: UniProt: P82381*PLUS |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
| ||||||||||||||||||||
NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED BASING ON 1760 EXPERIMENTAL RESTRAINTS DERIVED FROM TWO DIMENSIONAL 1H NMR EXPERIMENTS. NOESY CROSSPEAKS WERE ASSIGNED AUTOMATICALY USING NOAH/DYANA PROGRAM. ...Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED BASING ON 1760 EXPERIMENTAL RESTRAINTS DERIVED FROM TWO DIMENSIONAL 1H NMR EXPERIMENTS. NOESY CROSSPEAKS WERE ASSIGNED AUTOMATICALY USING NOAH/DYANA PROGRAM. STRUCTURE REFINEMENT WAS ACCOMPLISHED IN CNS. |
-試料調製
詳細 | 内容: 10% H2O/90% D2O |
---|---|
試料状態 | pH: 4.3 / 温度: 293 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian UNITYPLUS / 製造業者: Varian / モデル: UNITYPLUS / 磁場強度: 500 MHz |
---|
-解析
NMR software |
| ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION AND LOWEST ENERGY 計算したコンフォーマーの数: 40 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |