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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1crb | ||||||
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タイトル | CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES ON A FAMILY OF CELLULAR LIPOPHILIC TRANSPORT PROTEINS. REFINEMENT OF P2 MYELIN PROTEIN AND THE STRUCTURE DETERMINATION AND REFINEMENT OF CELLULAR RETINOL-BINDING PROTEIN IN COMPLEX WITH ALL-TRANS-RETINOL | ||||||
![]() | CELLULAR RETINOL BINDING PROTEIN | ||||||
![]() | CELLULAR LIPOPHILIC TRANSPORT PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of granulocyte differentiation / response to benzoic acid / The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision) / Retinoid metabolism and transport / all-trans-retinol binding / retinoic acid biosynthetic process / vitamin A metabolic process / retinal binding / response to vitamin A / retinol metabolic process ...regulation of granulocyte differentiation / response to benzoic acid / The canonical retinoid cycle in rods (twilight vision) / Retinoid metabolism and transport / all-trans-retinol binding / retinoic acid biosynthetic process / vitamin A metabolic process / retinal binding / response to vitamin A / retinol metabolic process / retinoic acid metabolic process / retinol binding / lipid homeostasis / fatty acid transport / response to retinoic acid / lipid droplet / fatty acid binding / cell body / nucleoplasm / nucleus / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Cowan, S.W. / Jones, T.A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystallographic studies on a family of cellular lipophilic transport proteins. Refinement of P2 myelin protein and the structure determination and refinement of cellular retinol- ...タイトル: Crystallographic studies on a family of cellular lipophilic transport proteins. Refinement of P2 myelin protein and the structure determination and refinement of cellular retinol-binding protein in complex with all-trans-retinol. 著者: Cowan, S.W. / Newcomer, M.E. / Jones, T.A. #1: ![]() タイトル: Lipid-Binding Proteins: A Family of Fatty Acid and Retinoid Transport Proteins 著者: Banaszak, L. / Winter, N. / Xu, Z. / Bernlohr, D.A. / Cowan, S. / Jones, T.A. #2: ![]() タイトル: The Primary Structure of Piscine (Oncorhynchus Mykiss) Retinol-Binding Protein and a Comparison with the Three-Dimensional Structure of Mammalian Retinol-Binding Protein 著者: Zapponi, M.C. / Zanotti, G. / Stoppini, M. / Berni, R. #3: ![]() タイトル: Crystallographic Refinement of Human Serum Retinol Binding Protein at 2 Angstroms Resolution 著者: Cowan, S.W. / Newcomer, M.E. / Jones, T.A. #4: ![]() タイトル: Crystallization of and Preliminary X-Ray Data for an Intracellular Vitamin A-Binding Protein from Rat Liver 著者: Newcomer, M.E. / Liljas, A. / Eriksson, V. / Sundelin, J. / Rask, L. / Peterson, P.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 41.7 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 28.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 597.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 598 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 15724.871 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: P02696 | ||||
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#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-RTL / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.09 Å3/Da / 溶媒含有率: 41.26 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.1 Å / % possible obs: 80 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.1→8 Å / Rfactor Rfree: 0.248 / Rfactor Rwork: 0.188 / Rfactor obs: 0.188 / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.1→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Rfactor obs: 0.188 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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