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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1byu | ||||||
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タイトル | CANINE GDP-RAN | ||||||
![]() | PROTEIN (GTP-BINDING PROTEIN RAN) | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / GTPASE / NUCLEAR TRANSPORT | ||||||
機能・相同性 | ![]() RISC complex binding / pre-miRNA binding / pre-miRNA export from nucleus / nuclear export signal receptor activity / snRNA import into nucleus / RISC complex / GTP metabolic process / mitotic sister chromatid segregation / ribosomal subunit export from nucleus / protein export from nucleus ...RISC complex binding / pre-miRNA binding / pre-miRNA export from nucleus / nuclear export signal receptor activity / snRNA import into nucleus / RISC complex / GTP metabolic process / mitotic sister chromatid segregation / ribosomal subunit export from nucleus / protein export from nucleus / positive regulation of protein export from nucleus / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / protein import into nucleus / melanosome / nuclear envelope / cell division / GTPase activity / GTP binding / magnesium ion binding / protein-containing complex / nucleus / cytosol / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Stewart, M. / Kent, H.M. / Mccoy, A.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The structure of the Q69L mutant of GDP-Ran shows a major conformational change in the switch II loop that accounts for its failure to bind nuclear transport factor 2 (NTF2). 著者: Stewart, M. / Kent, H.M. / McCoy, A.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 100.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 77.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper: (Code: given Matrix: (-0.18639, -0.0947, 0.9779), ベクター: |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24482.143 Da / 分子数: 2 / 断片: ALL / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.25 Å3/Da / 溶媒含有率: 32 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7.2 / 詳細: SEE PUBLICATION, pH 7.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 18 ℃ / pH: 8 / 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1998年1月29日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: CRYSTAL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.0378 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.15→21.3 Å / Num. obs: 22596 / % possible obs: 94.7 % / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.03 / Net I/σ(I): 20.9 |
反射 シェル | 解像度: 2.15→2.27 Å / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.097 / Mean I/σ(I) obs: 7.6 / % possible all: 92.2 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 45779 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 92.2 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: SCHEFFZEK ET AL 解像度: 2.15→6 Å / σ(F): 0 / ESU R: 0.3 / ESU R Free: 0.23
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原子変位パラメータ | Biso mean: 32.95 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.15→6 Å
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拘束条件 |
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