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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1byc | |||||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURES OF SOYBEAN BETA-AMYLASE REACTED WITH BETA-MALTOSE AND MALTAL: ACTIVE SITE COMPONENTS AND THEIR APPARENT ROLE IN CATALYSIS | |||||||||
![]() | BETA-AMYLASE | |||||||||
![]() | HYDROLASE(O-GLYCOSYL) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() beta-amylase / beta-amylase activity / amylopectin maltohydrolase activity / polysaccharide catabolic process 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Mikami, B. / Degano, M. / Hehre, E.J. / Sacchettini, J.C. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structures of soybean beta-amylase reacted with beta-maltose and maltal: active site components and their apparent roles in catalysis. 著者: Mikami, B. / Degano, M. / Hehre, E.J. / Sacchettini, J.C. #1: ![]() タイトル: The 2.0-Angstroms Resolution Structure of Soybean Beta-Amylase Complexed with Alpha-Cyclodextrin 著者: Mikami, B. / Hehre, E.J. / Sato, M. / Katsube, Y. / Hirose, M. / Morita, Y. / Sacchettini, J.C. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 118 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 89.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 455.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 480.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 14.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 23.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: LEU 419 - ARG 420 OMEGA = 6.90 PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 56071.316 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
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#2: 多糖 | alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose |
#3: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.76 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.38 % | |||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: unknown / 詳細: Morita, Y., (1975) J. Biochem., 77, 343. | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS Num. obs: 42972 / Num. measured all: 180801 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.2→9 Å / σ(F): 2 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→9 Å
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拘束条件 |
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