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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bvj | ||||||||||||||||||||
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タイトル | HIV-1 RNA A-RICH HAIRPIN LOOP | ||||||||||||||||||||
![]() | RNA (5'-R(P*![]() RNA / HIV-1 GENOMIC RNA / REVERSE TRANSCRIPTASE INITIATION / RNA HAIRPIN LOOP | 機能・相同性 | : / RNA / RNA (> 10) | ![]() 生物種 | ![]() ![]() 手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ![]() Puglisi, E.V. / Puglisi, J.D. | ![]() ![]() タイトル: HIV-1 A-rich RNA loop mimics the tRNA anticodon structure. 著者: Puglisi, E.V. / Puglisi, J.D. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 296.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 248.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 323.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 443.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 14.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: RNA鎖 | 分子量: 7402.472 Da / 分子数: 1 / 断片: A-RICH HAIRPIN LOOP / 由来タイプ: 天然 由来: (天然) ![]() 属: Lentivirus / 生物種: Human immunodeficiency virus 1 / 株: MAL ISOLATE / 参照: GenBank: AF096656 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TRIPLE RESONANCE HCN AND HCP EXPERIMENTS ON 15N,13C-LABELED RNA. |
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試料調製
試料状態 | イオン強度: 10mM NA PHOSPHATE / pH: 6.4 / 温度: 283 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Varian INOVA / 製造業者: Varian / モデル: INOVA / 磁場強度: 500 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 / 詳細: SEE REFERENCE ABOVE | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LOWEST TOTAL AND RESTRAINT VIOLATION ENERGIES 計算したコンフォーマーの数: 160 / 登録したコンフォーマーの数: 21 |