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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bu9 | ||||||
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タイトル | SOLUTION STRUCTURE OF P18-INK4C, 21 STRUCTURES | ||||||
要素 | PROTEIN (CYCLIN-DEPENDENT KINASE 6 INHIBITOR) | ||||||
キーワード | HORMONE/GROWTH FACTOR / CELL CYCLE INHIBITOR / P18INK4C / TUMOR / SUPPRESSOR / CYCLIN-DEPENDENT KINASE (サイクリン依存性キナーゼ) / HORMONE-GROWTH FACTOR COMPLEX | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 negative regulation of phosphorylation / cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity / oligodendrocyte differentiation / regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity / regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle / negative regulation of stem cell proliferation / stem cell proliferation / Oncogene Induced Senescence / negative regulation of cell growth / Cyclin D associated events in G1 ...negative regulation of phosphorylation / cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity / oligodendrocyte differentiation / regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity / regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle / negative regulation of stem cell proliferation / stem cell proliferation / Oncogene Induced Senescence / negative regulation of cell growth / Cyclin D associated events in G1 / Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) / Oxidative Stress Induced Senescence / 細胞周期 / negative regulation of cell population proliferation / protein kinase binding / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Byeon, I.-J.L. / Li, J. / Tsai, M.-D. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1999 タイトル: Tumor suppressor INK4: determination of the solution structure of p18INK4C and demonstration of the functional significance of loops in p18INK4C and p16INK4A. 著者: Li, J. / Byeon, I.J. / Ericson, K. / Poi, M.J. / O'Maille, P. / Selby, T. / Tsai, M.D. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bu9.cif.gz | 1 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bu9.ent.gz | 861.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bu9.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bu/1bu9 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bu/1bu9 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18149.357 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / プラスミド: DL21(DE3) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): DL21(DE3) / 参照: UniProt: P42773 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE SOLUTION STRUCTURE OF P18-INK4C HAS BEEN DETERMINED BY MULTI-DIMENSIONAL HETERONUCLEAR NMR. THE STRUCTURES WERE CALCULATED USING THE SIMULATED ANNEALING PROTOCOL OF NILGES ET AL. (1988) ...Text: THE SOLUTION STRUCTURE OF P18-INK4C HAS BEEN DETERMINED BY MULTI-DIMENSIONAL HETERONUCLEAR NMR. THE STRUCTURES WERE CALCULATED USING THE SIMULATED ANNEALING PROTOCOL OF NILGES ET AL. (1988) FEBS LETT. 229, 129-136 USING THE PROGRAM X-PLOR 3.1 (BRUNGER). THE CALCULATION IS BASED ON 3175 EXPERIMENTAL NMR RESTRAINTS (3062 DISTANCE AND 113 TORSION ANGLE RESTRAINTS). |
-試料調製
試料状態 | pH: 7.5 / 温度: 293 K |
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結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター |
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-解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | |||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: CLOSEST TO MEAN STRUCTURE WHICH SHOWS GOOD AGREEMENT WITH THE CONSTRAINTS 計算したコンフォーマーの数: 50 / 登録したコンフォーマーの数: 21 |