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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1btc | |||||||||
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タイトル | THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF SOYBEAN BETA-AMYLASE DETERMINED AT 3.0 ANGSTROMS RESOLUTION: PRELIMINARY CHAIN TRACING OF THE COMPLEX WITH ALPHA-CYCLODEXTRIN | |||||||||
![]() | BETA-AMYLASE | |||||||||
![]() | HYDROLASE(O-GLYCOSYL) | |||||||||
機能・相同性 | ![]() beta-amylase / beta-amylase activity / amylopectin maltohydrolase activity / polysaccharide catabolic process 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() | |||||||||
![]() | Mikami, B. / Hehre, E.J. / Sato, M. / Katsube, Y. / Hirose, M. / Morita, Y. / Sacchettini, J.C. | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: The 2.0-A resolution structure of soybean beta-amylase complexed with alpha-cyclodextrin. 著者: Mikami, B. / Hehre, E.J. / Sato, M. / Katsube, Y. / Hirose, M. / Morita, Y. / Sacchettini, J.C. #1: ジャーナル: J.Biochem.(Tokyo) / 年: 1992 タイトル: Three-dimensional structure of soybean beta-amylase determined at 3.0 A resolution: preliminary chain tracing of the complex with alpha-cyclodextrin. 著者: Mikami, B. / Sato, M. / Shibata, T. / Hirose, M. / Aibara, S. / Katsube, Y. / Morita, Y. #2: ![]() タイトル: X-Ray Crystal Structure of Soybean Beta-Amylase 著者: Mikami, B. / Shibata, T. / Hirose, M. / Aibara, S. / Sato, M. / Katsube, Y. / Morita, Y. #3: ![]() タイトル: Crystallization and Preliminary X-Ray Investigation of Soybean Beta-Amylase 著者: Morita, Y. / Aibara, S. / Yamashita, H. / Yagi, F. / Suganuma, T. / Hiromi, K. | |||||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE SHEET PRESENTED AS *S1* ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN EIGHT-STRANDED BETA-BARREL. ...SHEET THE SHEET PRESENTED AS *S1* ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN EIGHT-STRANDED BETA-BARREL. THIS IS REPRESENTED BY A NINE-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL. |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 115 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 90.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 499.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 517.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 20.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO 201 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 55696.969 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() | ||
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#2: 多糖 | Cyclohexakis-(1-4)-(alpha-D-glucopyranose) / alpha-cyclodextrin | ||
#3: 化合物 | ChemComp-SO4 / | ||
#4: 化合物 | ChemComp-BME / #5: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.77 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.61 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 5.4 / 手法: microdialysis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / Num. obs: 15187 / Num. measured all: 20136 / Rmerge(I) obs: 0.037 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2→9 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→9 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2 Å / 最低解像度: 9 Å / σ(F): 0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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