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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bhu | ||||||
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タイトル | THE 3D STRUCTURE OF THE STREPTOMYCES METALLOPROTEINASE INHIBITOR, SMPI, ISOLATED FROM STREPTOMYCES NIGRESCENS TK-23, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE | ||||||
要素 | METALLOPROTEINASE INHIBITOR | ||||||
キーワード | METALLOPROTEINASE INHIBITOR | ||||||
機能・相同性 | Antimicrobial/protein inhibitor, gamma-crystallin-like / Gamma-B Crystallin; domain 1 - #30 / Gamma-B Crystallin; domain 1 / metalloendopeptidase inhibitor activity / Gamma-crystallin-like / Sandwich / Mainly Beta / Metalloproteinase inhibitor 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Streptomyces nigrescens (バクテリア) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
データ登録者 | Tate, S. / Ohno, A. / Seeram, S.S. / Hiraga, K. / Oda, K. / Kainosho, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1998 タイトル: NMR structure of the Streptomyces metalloproteinase inhibitor, SMPI, isolated from Streptomyces nigrescens TK-23: another example of an ancestral beta gamma-crystallin precursor structure. 著者: Ohno, A. / Tate, S. / Seeram, S.S. / Hiraga, K. / Swindells, M.B. / Oda, K. / Kainosho, M. #1: ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1998 タイトル: Elucidation of the Mode of Interaction of Thermolysin with a Proteinaceous Metalloproteinase Inhibitor, Smpi, Based on a Model Complex Structure and a Structural Dynamics Analysis 著者: Tate, S. / Ohno, A. / Seeram, S.S. / Hiraga, K. / Oda, K. / Kainosho, M. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bhu.cif.gz | 39.1 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bhu.ent.gz | 30.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bhu.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1bhu_validation.pdf.gz | 243.8 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1bhu_full_validation.pdf.gz | 243.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1bhu_validation.xml.gz | 5.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1bhu_validation.cif.gz | 6.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bh/1bhu ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bh/1bhu | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 10374.746 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Streptomyces nigrescens (バクテリア) 株: TK-23 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P01077 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR |
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NMR実験 | タイプ: HETERONUCLEAR MULTI-DIMENSIONAL EXPERIMENT |
NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETEMINED ON THE BASIS OF THE HETERO-NUCLEAR MUTLIDIMENSIONAL NMR TECHNIQUES USING 13C, 15N ENRICHED PROTEINS. |
-試料調製
詳細 | 内容: WATER |
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試料状態 | イオン強度: NO SALT / pH: 3.3 / 圧: 1 atm / 温度: 310 K |
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker DMX500 / 製造業者: Bruker / モデル: DMX500 / 磁場強度: 500 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE. | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST VIOLATION / 計算したコンフォーマーの数: 60 / 登録したコンフォーマーの数: 1 |