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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1bc4 | |||||||||
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タイトル | THE SOLUTION STRUCTURE OF A CYTOTOXIC RIBONUCLEASE FROM THE OOCYTES OF RANA CATESBEIANA (BULLFROG), NMR, 15 STRUCTURES | |||||||||
要素 | RIBONUCLEASEリボヌクレアーゼ | |||||||||
キーワード | HYDROLASE (加水分解酵素) / PHOSPHORIC DIESTER / RC-RNASE / CYTOTOXIC PROTEIN (細胞毒性) / SIALIC ACID BINDING LECTIN | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 3'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / carbohydrate binding / endonuclease activity / nucleic acid binding / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Rana catesbeiana (ウシガエル) | |||||||||
手法 | 溶液NMR / DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING | |||||||||
データ登録者 | Chang, C.-F. / Chen, C. / Chen, Y.-C. / Hom, K. / Huang, R.-F. / Huang, T. | |||||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1998 タイトル: The solution structure of a cytotoxic ribonuclease from the oocytes of Rana catesbeiana (bullfrog). 著者: Chang, C.F. / Chen, C. / Chen, Y.C. / Hom, K. / Huang, R.F. / Huang, T.H. #1: ジャーナル: J.Biomol.NMR / 年: 1996 タイトル: The Secondary Structure of a Pyrimidine-Guanine Sequence-Specific Ribonuclease Possessing Cytotoxic Activity from the Oocytes of Rana Catesbeiana 著者: Chen, C. / Hom, K. / Huang, R.F. / Chou, P.J. / Liao, Y.D. / Huang, T. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1bc4.cif.gz | 509 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1bc4.ent.gz | 437.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1bc4.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bc/1bc4 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bc/1bc4 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 12459.343 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Rana catesbeiana (ウシガエル) / 参照: UniProt: P11916, EC: 3.1.27.5 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: THE STRUCTURE WAS DETERMINED USING TWO-DIMENSIONAL 1H NMR. |
-試料調製
詳細 | 内容: H2O |
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試料状態 | イオン強度: 50mM PHOSPHATE BUFFER / pH: 3.5 / 圧: 1 atm / 温度: 305 K |
結晶化 | *PLUS 手法: その他 / 詳細: NMR |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AMX600 / 製造業者: Bruker / モデル: AMX600 / 磁場強度: 600 MHz |
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-解析
ソフトウェア |
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NMR software |
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精密化 | 手法: DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING / ソフトェア番号: 1 詳細: REFINEMENT DETAILS CAN BE FOUND IN THE JRNL CITATION ABOVE | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: LEAST RESTRAINT VIOLATION 計算したコンフォーマーの数: 150 / 登録したコンフォーマーの数: 15 |