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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1b09 | ||||||
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タイトル | HUMAN C-REACTIVE PROTEIN COMPLEXED WITH PHOSPHOCHOLINE | ||||||
![]() | PROTEIN (C-REACTIVE PROTEIN) | ||||||
![]() | IMMUNE SYSTEM / PENTRAXIN / ACUTE-PHASE REACTANT / PHOSPHOCHOLINE | ||||||
機能・相同性 | ![]() regulation of interleukin-8 production / opsonization / complement component C1q complex binding / low-density lipoprotein particle binding / negative regulation of mononuclear cell proliferation / vasoconstriction / choline binding / Classical antibody-mediated complement activation / low-density lipoprotein particle receptor binding / negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation ...regulation of interleukin-8 production / opsonization / complement component C1q complex binding / low-density lipoprotein particle binding / negative regulation of mononuclear cell proliferation / vasoconstriction / choline binding / Classical antibody-mediated complement activation / low-density lipoprotein particle receptor binding / negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation / negative regulation of lipid storage / positive regulation of superoxide anion generation / acute-phase response / defense response to Gram-positive bacterium / inflammatory response / innate immune response / calcium ion binding / positive regulation of gene expression / extracellular space / extracellular region / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Thompson, D. / Pepys, M.B. / Wood, S.P. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The physiological structure of human C-reactive protein and its complex with phosphocholine. 著者: Thompson, D. / Pepys, M.B. / Wood, S.P. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 214 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 173 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 417.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 463 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 27.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 38 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1sacS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 23068.039 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() #2: 化合物 | ChemComp-CA / #3: 化合物 | ChemComp-PC / |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | 溶媒含有率: 76 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 7.6 / 詳細: pH 7.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: drop is made up of a 1:1 ratio of protein and reservoir solution | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARRESEARCH / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 1995年3月1日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.87 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→20 Å / Num. obs: 86545 / % possible obs: 97.6 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 4.3 % / Rmerge(I) obs: 0.068 / Net I/σ(I): 10.1 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 94.5 % |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1SAC 解像度: 2.5→20 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 3
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→20 Å
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拘束条件 |
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