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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aov | ||||||
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タイトル | APO DUCK OVOTRANSFERRIN | ||||||
![]() | APO-OVOTRANSFERRIN | ||||||
![]() | TRANSFERRIN / IRON UPTAKE / PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY / MOLECULAR REPLACEMENT | ||||||
機能・相同性 | ![]() recycling endosome / iron ion transport / antibacterial humoral response / early endosome / extracellular space / metal ion binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Rawas, A. / Muirhead, H. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Preliminary crystallographic studies on duck ovotransferrin. 著者: Rawas, A. / Moreton, K. / Muirhead, H. / Williams, J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 138.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 112.1 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 373.4 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 415.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 19.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 27.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1dotS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 75731.805 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.07 Å3/Da / 溶媒含有率: 60 % / 解説: DATA WERE COLLECTED USING ROTATION CAMERA. | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 6 詳細: PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 15 - 30% PEG 6000, PH 6., pH 6.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 277 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: FILM / 検出器: FILM / 日付: 1989年5月1日 / 詳細: MIRRORS |
放射 | モノクロメーター: SI(111) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.488 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 4→15 Å / Num. obs: 7487 / % possible obs: 92.8 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 4.1 % / Rmerge(I) obs: 0.09 / Rsym value: 0.05 / Net I/σ(I): 10.2 |
反射 シェル | 解像度: 4→4.2 Å / 冗長度: 2 % / Rmerge(I) obs: 0.11 / Mean I/σ(I) obs: 3 / Rsym value: 0.18 / % possible all: 50 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 1DOT 解像度: 4→10 Å / Rfactor Rfree error: 0.02 / Data cutoff high absF: 10000000 / Data cutoff low absF: 0.001 / Isotropic thermal model: N / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1
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原子変位パラメータ | Biso mean: 38 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 4→10 Å
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拘束条件 |
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Xplor file |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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