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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1aor | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF A HYPERTHERMOPHILIC TUNGSTOPTERIN ENZYME, ALDEHYDE FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE | ||||||
要素 | ALDEHYDE FERREDOXIN OXIDOREDUCTASE | ||||||
キーワード | OXIDOREDUCTASE | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 aldehyde ferredoxin oxidoreductase activity / aldehyde ferredoxin oxidoreductase / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / electron transfer activity / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Pyrococcus furiosus (古細菌) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.3 Å | ||||||
データ登録者 | Chan, M.K. / Mukund, S. / Kletzin, A. / Adams, M.W.W. / Rees, D.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: Science / 年: 1995 タイトル: Structure of a hyperthermophilic tungstopterin enzyme, aldehyde ferredoxin oxidoreductase. 著者: Chan, M.K. / Mukund, S. / Kletzin, A. / Adams, M.W. / Rees, D.C. #1: ジャーナル: To be Published タイトル: Molecular Characterization of the Genes Encoding Two Tungsten-Containing Enzymes from Hyperthermophilic Archaea: Aldehyde Ferredoxin Oxidoreductase from Pyrococcus Furiosus and ...タイトル: Molecular Characterization of the Genes Encoding Two Tungsten-Containing Enzymes from Hyperthermophilic Archaea: Aldehyde Ferredoxin Oxidoreductase from Pyrococcus Furiosus and Formaldehyde Ferredoxin Oxidoreductase from Thermococcus Litoralis 著者: Kletzin, A. / Mukund, S. / Kelley-Crouse, T.L. / Chan, M.K. / Rees, D.C. / Adams, M.W.W. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET HELIX AND SHEET ENTRIES HAVE BEEN AUTOMATICALLY GENERATED BY THE PDB USING A PROGRAM BASED ON ...SHEET HELIX AND SHEET ENTRIES HAVE BEEN AUTOMATICALLY GENERATED BY THE PDB USING A PROGRAM BASED ON DSSP OF W. KABSCH AND C. SANDER |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1aor.cif.gz | 252.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1aor.ent.gz | 201.5 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1aor.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1aor_validation.pdf.gz | 539.2 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1aor_full_validation.pdf.gz | 555.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1aor_validation.xml.gz | 25.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1aor_validation.cif.gz | 40.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ao/1aor ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ao/1aor | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: CIS PROLINE - PRO A 310 / 2: CIS PROLINE - PRO A 462 / 3: CIS PROLINE - PRO B 310 / 4: CIS PROLINE - PRO B 462 |
-要素
-タンパク質 , 1種, 2分子 AB
#1: タンパク質 | 分子量: 66715.008 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Pyrococcus furiosus (古細菌) / 参照: UniProt: Q51739 |
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-非ポリマー , 5種, 386分子
#2: 化合物 | ChemComp-FE / | ||||||
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#3: 化合物 | #4: 化合物 | #5: 化合物 | #6: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.62 Å3/Da / 溶媒含有率: 53.12 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 8 / 手法: capillary method | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 56373 / % possible obs: 92.4 % / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.32 Å / Num. measured all: 237105 / Rmerge(I) obs: 0.049 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.3→10 Å / σ(F): 0 詳細: PLEASE NOTE THAT ALL RESIDUES WERE BUILT TO FIT THE BEST POSSIBLE OBSERVED DENSITY. THOSE SIDE CHAIN ATOMS WHICH SEEMED UNRELIABLE HAD THEIR OCCUPANCIES FIXED AT 0.0.
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→10 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 3 Å / 最低解像度: 22 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |