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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ahr | ||||||
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タイトル | CALMODULIN MUTANT WITH A TWO RESIDUE DELETION IN THE CENTRAL HELIX | ||||||
![]() | CALMODULIN | ||||||
![]() | CALCIUM-BINDING PROTEIN / CALMODULIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() CH domain binding / myosin binding / disordered domain specific binding / myelin sheath / calcium ion binding / centrosome / protein-containing complex / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Tabernero, L. / Sack, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: The structure of a calmodulin mutant with a deletion in the central helix: implications for molecular recognition and protein binding. 著者: Tabernero, L. / Taylor, D.A. / Chandross, R.J. / VanBerkum, M.F. / Means, A.R. / Quiocho, F.A. / Sack, J.S. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 44.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 30.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 364.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 369.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.1 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 7.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 16478.133 Da / 分子数: 1 / 変異: DEL(T79), DEL(D80) / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||
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#2: 化合物 | ChemComp-CA / #3: 水 | ChemComp-HOH / | 配列の詳細 | SEQUENCE AND NUMBERING IS AS IN WILD TYPE CALMODULIN | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.32 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.56 % / 解説: SEPARATE ROTATION SEARCH FOR EACH DOMAIN | ||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | pH: 4.25 詳細: 28-33% MPD, 15% ETHANOL, 5MM CACL, 20MM NA ACETATE, PH 4.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 300 K |
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放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1988年12月1日 / 詳細: COLLIMATOR |
放射 | モノクロメーター: GRAPHITE(002) / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 1.8 Å / Num. obs: 14407 / % possible obs: 67.3 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 2.4 % / Rsym value: 0.501 / Net I/σ(I): 8.68 |
反射 | *PLUS Num. measured all: 27799 / Rmerge(I) obs: 0.0501 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 4CLN 解像度: 1.8→8 Å / Rfactor Rwork: 0.211 / Rfactor obs: 0.211 / σ(F): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 1.8→8 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS Num. reflection obs: 9845 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS タイプ: x_bond_d / Dev ideal: 0.015 |