+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 168d | ||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | STABILIZING EFFECTS OF THE RNA 2'-SUBSTITUENT: CRYSTAL STRUCTURE OF AN OLIGODEOXYNUCLEOTIDE DUPLEX CONTAINING 2'-O-METHYLATED ADENOSINES | ||||||||||||||||||
![]() | DNA/RNA (5'-D(*![]() DNA-RNA HYBRID / A-DNA/RNA / DOUBLE HELIX / MODIFIED / DNA-RNA HYBRID COMPLEX | 機能・相同性 | DNA/RNA hybrid | ![]() 手法 | ![]() ![]() Lubini, P. / Zuercher, W. / Egli, M. | ![]() ![]() タイトル: Stabilizing effects of the RNA 2'-substituent: crystal structure of an oligodeoxynucleotide duplex containing 2'-O-methylated adenosines. 著者: Lubini, P. / Zurcher, W. / Egli, M. 履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 23.6 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 14.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 325.2 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 343.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 3.7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
#1: DNA/RNAハイブリッド | 分子量: 3075.031 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.22 Å3/Da / 溶媒含有率: 44.53 % | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP / Temp details: ROOM TEMPERATURE | ||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
|
-データ収集
回折 | Ambient temp details: ROOM TEMPERATURE |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() |
検出器 | タイプ: SIEMENS-NICOLET / 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 最高解像度: 2 Å / Num. all: 9702 / Num. obs: 3576 |
-
解析
ソフトウェア |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 解像度: 2→10 Å / σ(F): 2 /
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Refine Biso |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2→10 Å
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
|