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- EMDB-9539: Cryo-EM structure of mammalian respiratory supercomplex I1III2IV1 -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-9539
タイトルCryo-EM structure of mammalian respiratory supercomplex I1III2IV1
マップデータ
試料
  • 複合体: Respiratory supercomplex I1III2IV1
    • タンパク質・ペプチド: x 67種
  • リガンド: x 14種
機能・相同性
機能・相同性情報


Complex IV assembly / Cytoprotection by HMOX1 / TP53 Regulates Metabolic Genes / Complex III assembly / subthalamus development / pons development / pyramidal neuron development / cerebellar Purkinje cell layer development / Mitochondrial protein import / mitochondrial respiratory chain complex III assembly ...Complex IV assembly / Cytoprotection by HMOX1 / TP53 Regulates Metabolic Genes / Complex III assembly / subthalamus development / pons development / pyramidal neuron development / cerebellar Purkinje cell layer development / Mitochondrial protein import / mitochondrial respiratory chain complex III assembly / thalamus development / Complex I biogenesis / Respiratory electron transport / ubiquinone-6 biosynthetic process / cellular response to oxygen levels / : / anterograde axonal transport / Mitochondrial protein degradation / : / gliogenesis / neural precursor cell proliferation / ubiquinol-cytochrome-c reductase activity / oxygen sensor activity / mitochondrial electron transport, cytochrome c to oxygen / midbrain development / hypothalamus development / mitochondrial electron transport, ubiquinol to cytochrome c / ubiquinone binding / NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / NADH dehydrogenase activity / respiratory chain complex I / : / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / electron transport coupled proton transport / acyl binding / acyl carrier activity / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / ATP synthesis coupled electron transport / quinone binding / : / axon cytoplasm / aerobic respiration / reactive oxygen species metabolic process / hippocampus development / electron transport chain / mitochondrial intermembrane space / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / nuclear speck / mitochondrial matrix / ubiquitin protein ligase binding / protein-containing complex binding / endoplasmic reticulum / mitochondrion / nucleoplasm / membrane / metal ion binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Protein MGARP / Protein MGARP, N-terminal / Mitochondria Localisation Sequence / Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Single alpha-helix domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex, 6.4kD protein / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8kDa, N-terminal / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8 kDa, N-terminal / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI superfamily ...Protein MGARP / Protein MGARP, N-terminal / Mitochondria Localisation Sequence / Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / Single alpha-helix domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase complex, 6.4kD protein / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8kDa, N-terminal / Ubiquinol-cytochrome c reductase 8 kDa, N-terminal / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI / Cytochrome c oxidase, subunit Va/VI superfamily / Cytochrome c oxidase subunit Va / Cytochrome b-c1 complex, subunit 6 / Globular protein, non-globular alpha/beta subunit / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / UcrQ family / Cytochrome bc1 complex subunit Rieske, transmembrane domain superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 superfamily / Cytochrome b-c1 complex subunit 9 superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase, UQCRX/QCR9 like / Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, transmembrane domain / Ubiquinol cytochrome reductase transmembrane region / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain superfamily / Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein / : / Cytochrome b / : / Ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulphur subunit / : / Cytochrome b/b6, C-terminal / Cytochrome b(C-terminal)/b6/petD / Cytochrome b/b6 C-terminal region profile. / : / Cytochrome b/b6, C-terminal domain superfamily / Cytochrome b/b6/petB / Rieske iron-sulphur protein, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / Cytochrome b/b6, N-terminal / Cytochrome b/b6-like domain superfamily / Cytochrome b/b6 N-terminal region profile. / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / Di-haem cytochrome, transmembrane / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / Rieske iron-sulphur protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / : / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / : / Peptidase M16, C-terminal / Peptidase M16 inactive domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / Peptidase M16, N-terminal / Insulinase (Peptidase family M16) / NADH-ubiquinone oxidoreductase NDSU1/NuoG-like, 4Fe-4S domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 3 / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / GRIM-19 / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / Deoxynucleoside kinase domain / Deoxynucleoside kinase / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 / Mitochondria localized glutamic acid rich protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / Ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 / Mitochondria localized glutamic acid rich protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / Cytochrome b-c1 complex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / Uncharacterized protein / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial / Ubiquinol-cytochrome c reductase core protein 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / : / Complex I-AGGG / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / Cytochrome b / Complex III subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
類似検索 - 構成要素
生物種Sus scrofa (ブタ) / Pig (ブタ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.0 Å
データ登録者Gu J / Wu M / Guo R / Yang M
資金援助 中国, 3件
OrganizationGrant number国
Ministry of Science and Technology of China2016YFA0501100 and 2012CB911101 中国
National Natural Science Foundation of China3162500065, 31030020 and 31170679 中国
National Outstanding Young Scholar Science Foundation 中国
引用ジャーナル: Cell / 年: 2016
タイトル: Structure of Mammalian Respiratory Supercomplex IIIIIV.
著者: Meng Wu / Jinke Gu / Runyu Guo / Yushen Huang / Maojun Yang /
要旨: The mammalian respiratory chain complexes assemble into supercomplexes (SCs) and reside in the inner mitochondrial membrane to transfer electrons and establish the proton gradient for complex V to ...The mammalian respiratory chain complexes assemble into supercomplexes (SCs) and reside in the inner mitochondrial membrane to transfer electrons and establish the proton gradient for complex V to synthesize ATP. The precise arrangement of SCs is largely unknown. Here, we report a 4.0-Å cryo-electron microscopy (cryo-EM) structure of the major SC in porcine heart, the 1.7-MDa SCIIIIIV. The complex III (CIII) dimer and complex IV (CIV) bind at the same side of the L-shaped complex I (CI). Several accessory or supernumerary subunits of CI, such as NDUFA11, NDUFB4, NDUFB8, and NDUFB9, directly contribute to the oligomerization of CI, CIII, and CIV. COX7C and COX7A of CIV attach CIV to the concave surface formed by CIII and the distal end of membrane arm of CI. The structure suggests a possible mechanism by which electrons are transferred from NADH to cytochrome c and provides a platform for future functional dissection of respiration.
履歴
登録2016年8月30日-
ヘッダ(付随情報) 公開2017年3月29日-
マップ公開2017年3月29日-
更新2019年11月6日-
現状2019年11月6日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0504
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 表面レベル: 0.0504
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  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-5gup
  • 表面レベル: 0.0504
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_9539.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_9539.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 421.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.08 Å/pix.
x 480 pix.
= 518.4 Å		1.08 Å/pix.
x 480 pix.
= 518.4 Å		1.08 Å/pix.
x 480 pix.
= 518.4 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.08 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0504 / ムービー #1: 0.0504
最小 - 最大-0.12587553 - 0.51883394
平均 (標準偏差)0.0008468492 (±0.0067121573)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ480480480
Spacing480480480
セルA=B=C: 518.4 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.081.081.08
M x/y/z480480480
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z518.400518.400518.400
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ399399399
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS480480480
D min/max/mean-0.1260.5190.001

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Respiratory supercomplex I1III2IV1

全体名称: Respiratory supercomplex I1III2IV1
要素
  • 複合体: Respiratory supercomplex I1III2IV1
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 6C
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske transit peptide, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 6A, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Cytochrome c oxidase subunit 6B1
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
  • リガンド: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
  • リガンド: HEME C
  • リガンド: HEME-A
  • リガンド: COPPER (II) ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: Respiratory supercomplex I1III2IV1

超分子名称: Respiratory supercomplex I1III2IV1 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#67 / 詳細: Supercomplex generated by complex I, III and IV.
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量実験値: 1.7 MDa

+
分子 #1: Cytochrome c oxidase subunit 6C

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 6C / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 8.494982 KDa
配列文字列:
STALAKPQMR GLLARRLRFH IVGAFMVSLG FATFYKFAVA EKRKKAYADF YRNYDSMKDF EEMRKAGIFQ SAK

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 50.637766 KDa
配列文字列: MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN ...文字列:
MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG SGYDFDVFVV RGAGAYICGE ETALIESIEG KQGKPRLKPP FPADVGVFGC PT TVANVET VAVSPTICRR GGAWFASFGR ERNSGTKLFN ISGHVNHPCT VEEEMSVPLK ELIEKHAGGV IGGWDNLLAV IPG GSSTPL IPKSVCETVL MDFDALVQAQ TGLGTAAVIV MDRSTDIVKA IARLIEFYKH ESCGQCTPCR EGVDWMNKVM ARFV KGDAR PAEIDSLWEI SKQIEGHTIC ALGDGAAWPV QGLIRHFRPE LEERMQQFAL QHQARQAAS

+
分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 52.552301 KDa
配列文字列: MAALRALCSL RGVAAQVLRP GAGARLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQFGGA VMYPTKETAH WKPPPWNDVD PPKDTLVSNL TLNFGPQHP AAHGVLRLVM ELSGEMVRKC DPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSLAVEKLL N IQPPPRAQ ...文字列:
MAALRALCSL RGVAAQVLRP GAGARLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQFGGA VMYPTKETAH WKPPPWNDVD PPKDTLVSNL TLNFGPQHP AAHGVLRLVM ELSGEMVRKC DPHIGLLHRG TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSLAVEKLL N IQPPPRAQ WIRVLFGEIT RLLNHIMAVT THALDIGAMT PFFWMFEERE KMFEFYERVS GARMHAAYIR PGGVHQDLPL GL LDDIYEF SKNFSFRIDE LEEMLTNNRI WRNRTVDIGV VTAEDALNYG FSGVMLRGSG IQWDLRKTQP YDVYDQVEFD VPI GSRGDC YDRYLCRVEE MRQSLRIISQ CLNKMPPGEI KVDDAKVSPP KRAEMKTSME SLIHHFKLYT EGYQVPPGAT YTAI EAPKG EFGVYLVSDG SSRPYRCKIK APGFAHLAGL DKMSKGHMLA DVVAIIGTQD IVFGEVDR

+
分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 30.241416 KDa
配列文字列: MAAAAAARGC WRGLVGPAAV ARVSGRPSVL LLPVRKESAA ADTRPTIRPR NDVVHKQLSA FGQYVAEILP KYVQQVQVSC FNELEIFIH PDGVIPVLTF LRDHTNAQFK SLADLTAVDV PTRQNRFEIV YNLLSLRFNS RIRVKTYTDE LTPIESSVTV Y KAANWYER ...文字列:
MAAAAAARGC WRGLVGPAAV ARVSGRPSVL LLPVRKESAA ADTRPTIRPR NDVVHKQLSA FGQYVAEILP KYVQQVQVSC FNELEIFIH PDGVIPVLTF LRDHTNAQFK SLADLTAVDV PTRQNRFEIV YNLLSLRFNS RIRVKTYTDE LTPIESSVTV Y KAANWYER EIWDMFGVFF ANHPDLRRIL TDYGFEGHPF RKDFPLSGYV ELRYDDEVKR VVAEPVELAQ EFRKFDLNSP WE AFPAYRQ PPEDLKLEAG DKKPETK

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分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 26.301637 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)N PDTP FDFTP ENYKRIEAIV KNYPEGHKAA AVLPVLDLAQ RQNGWLPISA MNKVAEILQV PPMRVYEVAT FYTMYNRKPV GKYHI QVCT TTPCMLRNSD SILEAIQKKL GIKVGETTPD KLFTLIEVEC LGACVNAPMV QINDNYYEDL TPKDIEEIID ELKAGK IPK PGPRSGRFSC EPAGGLTSLT EPPKGPGFGV QAGL

+
分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 13.34895 KDa
配列文字列:
MAAVTFLRLL GRSGAGARNL LGGSRCFGVR TSPTGEKVTH TGQAYDDGDY RRVRFSDRQK EVNENFAIDL IAEQPVSEVG SRVISCDGG GGALGHPRVY INLDKETKTG TCGYCGLQFR QPHH

+
分子 #7: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 79.627398 KDa
配列文字列: MLRIPVTRAL IGLSKSPKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKS KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL ...文字列:
MLRIPVTRAL IGLSKSPKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKS KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL VKTIMTRCIQ CTRCIRFASE IAGVDDLGTT GRGNDMQVGT YIEKMFMSEL SGNIIDICPV GALTSKPYAF TA RPWETRK TESIDVMDAV GSNIVVSTRT GEVMRILPRM HEDINEEWIS DKTRFAYDGL KRQRLTQPMI RNEKGLLTYT TWE DALSRV AGMLQSFQGN DVAAIAGGLV DAEALVALKD LLNRVDSDSL CTEEVFPTAG AGTDLRSNYL LNTTIAGVEE ADVI LLVGT NPRFEAPLFN ARIRKSWLHN DLKVALIGSP VDLTYRYDHL GDSPKILQDI ASGNHPFSQI LKEAKKPMVV LGSSA LQRS DGTAILAAVS NIAQNIRLSS GVTGDWKVMN ILHRIASQVA ALDLGYKPGV EAIRKNPPKV LFLLGADGGC ITRQDL PKD CFIIYQGHHG DVGAPMADVI LPGAAYTEKS ATYVNTEGRA QQTKVAVTPP GLAREDWKII RALSEIAGMT LPYDTLD QV RSRLEEVSPN LVRYDDVEGA NYFQQANELS KLVNQQLLAD PLVPPQLTIK DFYMTDSISR ASQTMAKCVK AVTEGIQA V EEPSIC

+
分子 #8: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 23.893281 KDa
配列文字列: MRCLSTPMLL RALAQAQAAH AGHPSARTLH SSAVAATYKF VNMREPSMDM KSVTDRAAQT LLWTELVRGL GMTLSYLFRE PATINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEPRADGS RRTTRYDIDM TKCIYCGFCQ E ACPVDAIV ...文字列:
MRCLSTPMLL RALAQAQAAH AGHPSARTLH SSAVAATYKF VNMREPSMDM KSVTDRAAQT LLWTELVRGL GMTLSYLFRE PATINYPFE KGPLSPRFRG EHALRRYPSG EERCIACKLC EAVCPAQAIT IEAEPRADGS RRTTRYDIDM TKCIYCGFCQ E ACPVDAIV EGPNFEFSTE THEELLYNKE KLLNNGDKWE AEIAANIQAD YLYR

+
分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 23.777742 KDa
配列文字列: MAALAASGLL RPILALRSSM GAAVQVRFVH PSAATDSPSS SQPAVSQAGA VVSKPTTLPS SRGEYVVAKL DDLVNWARRS SLWPMTFGL ACCAVEMMHM AAPRYDMDRF GVVFRASPRQ SDVMIVAGTL TNKMAPALRK VYDQMPEPRY VVSMGSCANG G GYYHYSYS ...文字列:
MAALAASGLL RPILALRSSM GAAVQVRFVH PSAATDSPSS SQPAVSQAGA VVSKPTTLPS SRGEYVVAKL DDLVNWARRS SLWPMTFGL ACCAVEMMHM AAPRYDMDRF GVVFRASPRQ SDVMIVAGTL TNKMAPALRK VYDQMPEPRY VVSMGSCANG G GYYHYSYS VVRGCDRIVP VDIYVPGCPP TAEALLYGIL QLQRKIKREK RLRIWYRR

+
分子 #10: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 19.7185 KDa
配列文字列:
MAAVSMSVAL KQALWGRRAA AVGAVSVSKV PTRLLSTSTW KLAQDQTQDT QLIAVDEKLD ITTLTGVPEE HIKTRKVRIF VPARNNMQS GVNNTKKWKM EFDTRERWEN PLMGWSSTAD PLSNLVLTFS TKEDAVAFAE KNGWSFDVEE RKVPKPKSKS Y GANFSWNK RTRVSTK

+
分子 #11: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 17.162439 KDa
配列文字列:
MELVQVLRRG LQQVSGHGGL RGYLRVLFRA NDVRVGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG RDTFWDVDGS MVPPEWHRW LHCMTDDPPT TKPPTARKYI WTNHKFNVSG TPQQYVPYST TRKKIQEWVP PSTPYK

+
分子 #12: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 42.606324 KDa
配列文字列: MAAAVHPRVV RAVPMSRSCL AAVATSVSYG PPQRQLHHAL IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IVPYRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMEWN GKDKDSIRKV VEHSNVVINL VGREWETKNF DFEDVFVKIP HAIAQVSKEA G VEKLIHIS ...文字列:
MAAAVHPRVV RAVPMSRSCL AAVATSVSYG PPQRQLHHAL IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IVPYRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMEWN GKDKDSIRKV VEHSNVVINL VGREWETKNF DFEDVFVKIP HAIAQVSKEA G VEKLIHIS HLNADIKSPS RYLRSKAVGE KEVRAAFPEA TIIKPSDIFG REDRFLNYFA SMRWFGGVPL ISLGKETVKQ PV YIVDVSK GIINAIKDPD AKGKTFAFVG PNRYLLFDLV QYIFAVAYRP FLPYPLPHFA YRWVGRLFEV SPFEPWTTRD KVE RVHMSD MTLPHLPGLE DLGIQATPLE LKAIEVLRRH RTYRWLTSEM EDVKPAKTVN I

+
分子 #13: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 12.64859 KDa
配列文字列:
MASATRVIQL LRNWASGRDL QAKLQLRYQE ISKRTQPPPK LPVGPSHKLS NNYYCTRDGR REAMPPSIVM SSQKVLASGK PAESSAVAE TEKKAVTPAP PIKRWELSKD QPYL

+
分子 #14: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 13.32159 KDa
配列文字列:
MAGLLKKTTG LVGLAVCETP HERLKILYTK ILDVLGQIPK NAAYRKYTEQ ITNEKLGMVK AEPDVKKLEE QLQGGQIEEV ILQAENELS LARKMLRWKP WEPLVEEPPA NQWKWPI

+
分子 #15: Acyl carrier protein, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 17.326223 KDa
配列文字列:
MAARVLCACV RRLPAAFAPL PRIPTVVAAR PLSTTLFPTG AQARSRALQP ALVLAQAPGG VTQMCRRYSD APPLTLEAIK DRVLYVLKL YDKIDPEKLS VNSHFMKDLG LDSLDQVEII MAMEDEFGFE IPDIDAEKLM CPQEIVDYIA DKKDVYE

+
分子 #16: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 11.099798 KDa
配列文字列:
MAAAAASRGI RAKLGLREIR IHLCQRSPGS QGVRDFIEKR YVELKKANPD LPILIRECSD VQPKLWARYA FGQEKNVSLN NFSADQVTR TLENVLSGKA

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 14.953313 KDa
配列文字列:
MAASGLPRAA AAAGTSVKPI FSRDMNEAKR RVRELYRAWY REVPNTVHLF QLDISVKQGR DKVREMFMKN AHVTDPRVVD LLVIKGKME LEETINVWKQ RTHIMRFFHE TEAPRPTDFL SKFYVGHDP

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 8.088424 KDa
配列文字列:
MWFEILPGIA VMAACLFIPG MATAHIHKFT NGGKEKRVAH FSYQWNLMER DRRISGVNRY HVTKGLENID

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 9.225567 KDa
配列文字列:
MAGRIASFLK NAWAKEPVLV ASFAIGGLAI ILPSLSPYTN YAIRINRATP YNYPVPLRDD GNMPDVPSHP QDPQGPSLEW LKNL

+
分子 #20: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 40.476082 KDa
配列文字列: MALRLLRLAP ASASAVPRGL GAVAQRVGGI HTGAPCRLQY GPLAFVLGER TTRKLTETSK VITVDGNICS GKGRLAREIA EKLGLRHFP EAGIHYADST TGDGKPLDVQ LSGNCSLEKF YDDPKSNDGN SYRLQSWLYA SRLLQYADAL EHLLSTGQGV V LERSIYSD ...文字列:
MALRLLRLAP ASASAVPRGL GAVAQRVGGI HTGAPCRLQY GPLAFVLGER TTRKLTETSK VITVDGNICS GKGRLAREIA EKLGLRHFP EAGIHYADST TGDGKPLDVQ LSGNCSLEKF YDDPKSNDGN SYRLQSWLYA SRLLQYADAL EHLLSTGQGV V LERSIYSD FVFLEAMYRQ GFIRKQCVEH YNEVKKVTAC EYLPPHVVVY VDVPVPEIQS RIQKKGNPHE MKITAAYLQD IE NAYKKTF LPEMSEKCEV LQYSAREAED AEKVVEDIEY LKCDKGPWPD QDDRTFHRLR MLVQNKLEVL NYTTIPVYLP EIT IGAHQS DRVFQKFTEL PGRKYSPGYN EDVGDKWIWL K

+
分子 #21: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 14.686894 KDa
配列文字列:
MAKTLLHKYS DIPEGTECHR KAYASTSIGG ATGLIVSAYS IALKPPASFL EGVARTGRYT FTSAAIGAIF GLTSCISAQV REKPDDPLN YFIGGCAGGL TLGARTRSYG IGAAACAYMG LTAALVKMGQ LEGWQVFAEP KV

+
分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 16.911611 KDa
配列文字列:
MAASKVKQDM PPPGGYGPID YKRNLPRRGL SGYSMFAVGI GTLLFGYWSM MKWNRERRRL QIEDFEARIA LMPLFQAEKD RRVLQMLRE NLEEEAIIMK DVPDWKVGES VFHTTRWVTP MMGELYGLRT NEEILSATYG FIWYT

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 11.939366 KDa
配列文字列:
MSPLQRLAPF TRVGGRFLRG RGAGVAGGGG VRHAGGGVHI EPRYRQFPQL TRSQLIQAEF FSATMWFWIL WRFWHDSDAV LGHFPYPDP SQWTDEELGI LPDDED

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 11.128515 KDa
配列文字列:
MAHGHGHEHG HSKMELPDYK QWKIEGTPLE TVQEKLAARG LRDPWGRNEA WRYSGGFANN VSFVGALLKG FKWGFAAFVV AVGAEYYLE SQNKDKKHH

+
分子 #25: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 21.587006 KDa
配列文字列: MAAMSLLQRA SVTAVATLSR SRLGTRFGFG GFLTHGFPKT GAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDRRFLKL MRFYILLTGI PVAIGITLV NVFIGEAELA DIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFYDGP EKNYEKTMAI LQIEAEKAEL RLKELEVRRL M RARGDGPW ...文字列:
MAAMSLLQRA SVTAVATLSR SRLGTRFGFG GFLTHGFPKT GAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDRRFLKL MRFYILLTGI PVAIGITLV NVFIGEAELA DIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFYDGP EKNYEKTMAI LQIEAEKAEL RLKELEVRRL M RARGDGPW YQYPTIDKAL IDHSPKTTPD N

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 15.603177 KDa
配列文字列:
MSGYTPDEKL RLQQLRELRR RWLKDQELSP REPVLPPRRV WPMEQFWNKF LQDGAPWKNV IYKTYRHSIF AVTHVLIPVW IIHYYLKYH VTAKPYTVVE RKPRIFPGDT ILETGEVIPL MKEFPDQHH

+
分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 21.702543 KDa
配列文字列:
MAAAKAGVLG VRWLQRAARK VVPLGARTAS HVTKDMFPGP YPKTPEERAA AAKKYNMRVE DYEPYPDDGM GYGDYPKLPD RSQQERDPW YDWDHPDLRL NWGEPIHWDL DMYIRNRVDT SPTPVSWNTM CKHLFGFVAF MLFMFWVGEI YPSYQPVGPK Q YPYNDLYL ERGGDPTKEP EPVVHYEI

+
分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 20.944768 KDa
配列文字列:
MPDSWDKDVY PEPPRRTPAP APQTSLPNPV TYLTKIFDLL VDRPVTLARE FIEQQHAKNR YYYYHREFRR VPDITECEEK DILCMFEAE MQWRRDYKVD QEIVNIIQER LKACQQREGE SYRQNCAKEL EQFTQVSKAF QDRYSDLGAH YSARKCLAKQ K QRMLAERK AAKEAAAA

+
分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 17.384729 KDa
配列文字列:
MAAGVLGLCA RRLLAAAATR GLPAARVRWE SGSSRAVIAP SALVGKRPPE PTIRLQEDPD PEDENLYEKN PDSHGYDKDP IVDLWNMRV VFFFGFSIVL VLGSTFVAYL PDYRMQEWAR REAERLVKYR EANGLPLMES NCFDPNKIQL PEDED

+
分子 #30: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 8.630037 KDa
配列文字列:
MAASALLRPF SKLLSSARLP SGSSARSKFY IREPPHGSPD WLKVGLTLGT SVFLWIYLIK QHKEDVLEYK RRNGLE

+
分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 14.327655 KDa
配列文字列:
MTMMSGRPGR VPLQFLPNEA RSLPPPKLTD PRLVYMGFLG YCSGLIDNAI RRRPVVSAGL HRQLLYVTSF VFFGYYLLKR QDYMYALRD HDMFAYVKSH PEDFPEKDKK TYGEILEEFH PVR

+
分子 #32: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 12.506591 KDa
配列文字列:
MPFFDVQKRL GLDLDRWMTI QSAEQPHKIP GRCHAFEKEW IECAHGIGGI RAEKECKIEF DDFVECLLRQ KTMKRLSAIK RQRDKLIKE GKYTPPPHHL GKEDPRP

+
分子 #33: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 39.077504 KDa
配列文字列: MNPIIYTTLI MTVMSGTMLV MISSHWLLIW IGFEMNLLAM IPVLMKNFNP RATEAATKYF LTQATASMML MMAIIINLLY SGQWTITKM FNPVAMTMMT MALAMKLGLS PFHFWVPEVT QGISLQAGLL LLTWQKLAPL SVLCQISQSI NPNLMLTMAM L SILIGGWG ...文字列:
MNPIIYTTLI MTVMSGTMLV MISSHWLLIW IGFEMNLLAM IPVLMKNFNP RATEAATKYF LTQATASMML MMAIIINLLY SGQWTITKM FNPVAMTMMT MALAMKLGLS PFHFWVPEVT QGISLQAGLL LLTWQKLAPL SVLCQISQSI NPNLMLTMAM L SILIGGWG GLNQTQLRKI MAYSSIAHMG WMTAVLPYNT TMTILNLLIY ITMTLAMFML LIHSSATTTL SLSHTWNKMP VI TSLMMVT LLSMGGLPPL SGFMPKWMII QEMTKNESII MPTLMAMTAL LNLYFYMRLA YSSSLTMFPS TNNMKMKWQF EHT KQMKLL PTMIVLSTLV LPMTPALSSL N

+
分子 #34: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 12.998448 KDa
配列文字列:
MNIMLTLLTN VTLASLLVLI AFWLPQLNAY SEKTSPYECG FDPMGSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLPWASQ TNNLKTMLT MALFLLILLA ASLAYEWTQK GLEWAE

+
分子 #35: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 10.827253 KDa
配列文字列:
MPLVYMNIIM AFAIALAGLL MYRSHLMSSL LCLEGMMLSL FIMSTLIILN THFTLANMMP IILLVFAACE AALGLSLLVM VSNTYGTDY VQNLNLLQC

+
分子 #36: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 68.6955 KDa
配列文字列: MNPFASLTLT TLIILTIPIM MSNSNIYKTN LYPNYVKTTV SYAFTLSLVP LLMFMHTGQE MIISNWHWMT LQTVELSLSF KMDYFSVMF IPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPFINRFFK YLVLFLITMM ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIGWWH G RTDANTAA ...文字列:
MNPFASLTLT TLIILTIPIM MSNSNIYKTN LYPNYVKTTV SYAFTLSLVP LLMFMHTGQE MIISNWHWMT LQTVELSLSF KMDYFSVMF IPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPFINRFFK YLVLFLITMM ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIGWWH G RTDANTAA LQAILYNRIG DIGFVLSMAW FLTHSNAWDL QQIFMLNNEC PNMPLIGLLL AAAGKSAQFG LHPWLPSAME GP TPVSALL HSSTMVVAGV FLLIRFYPLM ETNKLVQTMT LCLGAITTLF TALCAITQND IKKIVAFSTS SQLGLMMVTI GIN QPHLAF LHICMHAFFK AMLFMCSGSI IHSLNDEQDI RKMGGLYKAM PFTTTALIIG SLALTGMPYL TGFYSKDLII EAVN MSYTN AWALLMTLIA TSLTAAYSTR IIFFAFLGKP RFPPLVLINE NNPLLINSIK RLLIGSIFAG FIISNNIPPM TVPNT TMPL YMKMTALIVT IMGFMLALEL NNTTYYLKFK YPSQTYKFSN MLGYYPSIMH RLPTYHNLSM SQKSASSLLD LIWLET ILP KTTSFIQMKM SIMVSNQKGL IKLYFLSFLI TIMISMTLFN YHE

+
分子 #37: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 19.021332 KDa
配列文字列:
MTMYIAFILS TIFVIGFVGF SSKPSPIYGG LGLIVSGGVG CGIVLNFGGS FLGLMVFLIY LGGMLVVFGY TTAMATEMYP EVWVSNKTV FGAFVSGLMM EFCMVYYALK EEEVEIIFKF NGLGDWVIYD TGDSGFFSEE AMGIAALYSY GTWLVIVTGW S LLIGVVVI MEITRGN

+
分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 7.044278 KDa
配列文字列:
MMNVLQIVRD HWVHILVPVG FVFGCYLDRR SDEKLTAFRN KSLLFKRELR PNEEVTWK

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 15.11735 KDa
配列文字列:
MSFPKYKPSR LATLPATLDP AEYDISPETR KAQAERLAIR SRLKREYLLQ YNDPNRLGVI EDPALIRWTY ARSANIYPNF RPTPKTSLL GALFGIGPLF FWYYVFKTDR DKKEKLIQEG KLDQTFNISY

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 21.864906 KDa
配列文字列:
MAFSAPAAYL THQQKVLRLY KRALRHLESW CVHRDKYRYF ACLMRARFDE HKNEKDMVKA TQLLRQAEEE FWYGQHPQPY IFPESPGGT SYERYECYKV PEWCLDDWHP SEKAMYPDYF AKREQWKRLR RESWEREVKQ LQEETPPGGP RTEALPPARK E GDLPPLWW HIVTRPRERP M

+
分子 #41: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 51.859387 KDa
配列文字列: MLKIIIPTTM LLPMTWMSKH NMIWINATVH SLLISLISLS LLNQLGENSL NFSLTFFSDS LSAPLLVLTT WLLPLMLMAS QSHLSKETT TRKKLYITML ILLQLFLIMT FTATELILFY ILFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAGSLP L LVALVYIQ ...文字列:
MLKIIIPTTM LLPMTWMSKH NMIWINATVH SLLISLISLS LLNQLGENSL NFSLTFFSDS LSAPLLVLTT WLLPLMLMAS QSHLSKETT TRKKLYITML ILLQLFLIMT FTATELILFY ILFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAGSLP L LVALVYIQ NTTGSLNFLI IHYWSHPLSN SWSNIFMWLA CIMAFMVKMP LYGLHLWLPK AHVEAPIAGS MVLAAVLLKL GG YGMMRIT TILNPLTNYM AYPFLMLSMW GMIMTSSICL RQTDLKSLIA YSSVSHMALV IVAIMIQTPW SFMGATALMI AHG LTSSML FCLANTNYER VHSRTMILAR GLQTLLPLMA TWWLMASLTN LALPPSINLI GELFIITASF SWSNITIILM GMNM MITAL YSLYMLITTQ RGKYTHHINN IKASFTRENA LMALHILPLL LLTLNPKMIL GPLY

+
分子 #42: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 35.66752 KDa
配列文字列: MFMINILSLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQLRKGPNVV GPYGLLQPIA DALKLFTKEP LRPATSSISM FIIAPILALS LALTMWVPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLMNGS Y TLSTLITT ...文字列:
MFMINILSLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQLRKGPNVV GPYGLLQPIA DALKLFTKEP LRPATSSISM FIIAPILALS LALTMWVPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLMNGS Y TLSTLITT QEHIWMIFTS WPLAMMWFIS TLAETNRAPF DLTEGESELV SGFNVEYAAG PFAMFFMAEY ANIIMMNAFT AI LFLGASH DPHTPELYTI NFVLKTLALT ITFLWIRASY PRFRYDQLMH LLWKSFLPLT LALCMWHISL PIMTASIPPQ S

+
分子 #43: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 20.064096 KDa
配列文字列:
MPGIVELPTL EDLKVQEVKV SSSVLKAAAH HYGAQCDKPN KEFMLCRWEE KDPRRCLEEG KLVNQCALDF FRQIKRHCAE PFTEYWTCI DYSGLQLFRH CRKQQAKFDE CVLDKLGWVR PDLGELSKVT KVKTDRPLPE NPYHSRARPE PNPEAEGDLK P AKHGSRLF FWTM

+
分子 #44: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 16.487887 KDa
配列文字列:
MGAHLARRYL GDASKEPDPL RMPTFPPDYG FPERKEREMV ATQQEMNDAQ LMLQQRDYCA HYLIQLLKCK RDSFPNFLAC KHEQHDWDY CEHLDYVKRM KEFERERRLL QRKKRREQRE AEMARGQGPG EVAPEMAL

+
分子 #45: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 52.75632 KDa
配列文字列: MAASAVCRVA GTGSRVLLRT CRSPALLRSP ALRGTATYAQ ALQSVPETQV SQLDNGLRVA SEQSSQPTCT VGVWIDAGSR YENEKNNGA GYFVEHLAFK GTKNRPGSAL EKEVESMGAH LNAYSTREHT AYYIKALSKD LPKAVELLAD IVQNCSLEDS Q IEKERDVI ...文字列:
MAASAVCRVA GTGSRVLLRT CRSPALLRSP ALRGTATYAQ ALQSVPETQV SQLDNGLRVA SEQSSQPTCT VGVWIDAGSR YENEKNNGA GYFVEHLAFK GTKNRPGSAL EKEVESMGAH LNAYSTREHT AYYIKALSKD LPKAVELLAD IVQNCSLEDS Q IEKERDVI LQELQENDSS MRDVVFDYLH ATAFQGTPLA QSVEGPSENV RKLSRADLTE YVSQHYKAPR MVLAAAGGVE HR QLLDLAQ KHFSSLSGTY VEDAVPAFTP CRFTGSEIRH RDDALPLAHV AIAVEGPGWA NPDNVPLQVA NAIIGHYDST YGG GTHMSS TLASVAATRK LCQSFQTFNI CYAETGLLGA HFVCDNMSID DMMFFLQGQW MRLCTSATES EVVRGKNILR NALV SHLDG TTPVCEDIGR SLLTYGRRIP LAEWESRIAE VDASVVREVC SKYFYDQCPA VAGLGPIEQL PDYNRIRSGM FWLRF

+
分子 #46: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 48.264477 KDa
配列文字列: MKLITRAGSF SRFYSLKVAP KALASAAPAG VPLQPQDLEF TRLPNGLVIA SLENYAPASR IGLFIKAGSR YEDSNNLGTS HLLRLASSL TTKGASSFKI TRGIEAVGGK LSVTSTRESM AYTVECLRDD IEILMEFLLN VTAAPEFRRW EVAALQSQLR I DKAVAFQN ...文字列:
MKLITRAGSF SRFYSLKVAP KALASAAPAG VPLQPQDLEF TRLPNGLVIA SLENYAPASR IGLFIKAGSR YEDSNNLGTS HLLRLASSL TTKGASSFKI TRGIEAVGGK LSVTSTRESM AYTVECLRDD IEILMEFLLN VTAAPEFRRW EVAALQSQLR I DKAVAFQN PQAQVLENLH AAAYRNALAN SLYCPDYRIG KVTPDQLHYY VQNHFTSARM ALIGLGVSHP VLKQVAERFL NM RGGLGLS GAKAKYRGGE IRDQNGDSLV HAALVAESAA TGSAEANAFS VLQHVLGAGP HVKRGSNATS SLYQAVAKGV HQP FDVSAF NASYSDSGLF GIYTISQAAS AGDVIKSAYD QVKAIAQGNL SNTDVQAAKN KLKAGYLMSV ESSEGFLDEV GSQA LVAGS YMQPSTVLQQ IDSVADADVI NAAKKFVSGR KSMAASGNLG HTPFVDEL

+
分子 #47: Cytochrome b

分子名称: Cytochrome b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 42.840715 KDa
配列文字列: MTNIRKSHPL MKIINNAFID LPAPSNISSW WNFGSLLGIC LILQILTGLF LAMHYTSDTT TAFSSVTHIC RDVNYGWVIR YLHANGASM FFICLFIHVG RGLYYGSYMF LETWNIGVVL LFTVMATAFM GYVLPWGQMS FWGATVITNL LSAIPYIGTD L VEWIWGGF ...文字列:
MTNIRKSHPL MKIINNAFID LPAPSNISSW WNFGSLLGIC LILQILTGLF LAMHYTSDTT TAFSSVTHIC RDVNYGWVIR YLHANGASM FFICLFIHVG RGLYYGSYMF LETWNIGVVL LFTVMATAFM GYVLPWGQMS FWGATVITNL LSAIPYIGTD L VEWIWGGF SVDKATLTRF FAFHFILPFI ITALAAVHLL FLHETGSNNP TGISSDMDKI PFHPYYTIKD ILGALFMMLI LL ILVLFSP DLLGDPDNYT PANPLNTPPH IKPEWYFLFA YAILRSIPNK LGGVLALVAS ILILILMPML HTSKQRSMMF RPL SQCLFW MLVADLITLT WIGGQPVEHP FIIIGQLASI LYFLIILVLM PITSIIENNL LKW

+
分子 #48: Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 35.48893 KDa
配列文字列: MSAAAAASLR GAVLGPRGAG LPGARARGLL CGPRPGQLPL RTPQALSLSS KSGLSRGRKV ILSALGMLAA GGAGLAVALH SAVSATDLE LHAPSYPWSH RGLLSSLDHT SIRRGFQVYK QVCSSCHSMD YVAYRHLVGV CYTEEEAKAL AEEVEVQDGP N EDGEMFMR ...文字列:
MSAAAAASLR GAVLGPRGAG LPGARARGLL CGPRPGQLPL RTPQALSLSS KSGLSRGRKV ILSALGMLAA GGAGLAVALH SAVSATDLE LHAPSYPWSH RGLLSSLDHT SIRRGFQVYK QVCSSCHSMD YVAYRHLVGV CYTEEEAKAL AEEVEVQDGP N EDGEMFMR PGKLSDYFPK PYPNPEAARA ANNGALPPDL SYIVRARHGG EDYVFSLLTG YCEPPTGVSL REGLYFNPYF PG QAIAMAP PIYNEVLEFD DGTPATMSQV AKDVCTFLRW ASEPEHDHRK RMGLKMLMMM GLLLPLVYAM KRHKWSVLKS RKL AYRPPK

+
分子 #49: Cytochrome b-c1 complex subunit 7

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 13.587549 KDa
配列文字列:
MASRPAVAAS SKWLEGIRKW YYNAAGFNKL GLMRDDTIYE DDDVKEAIRR LPENLYNDRV FRIKRALDLT MRQQILPKEQ WTKYEEDKF YLEPYLKEVI RERKEREEWA KK

+
分子 #50: Cytochrome b-c1 complex subunit 8

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 9.784339 KDa
配列文字列:
MGREFGHLTR MRHVITYSLS PFEQRAFPHY FTKGIPNVLR RTRACILRVA PPFVVFYLVY TWGTQEFEKS KRKNPAAYEN DK

+
分子 #51: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 10.685803 KDa
配列文字列:
MGLEDEQRML TGSGDPKEEE EEEEELVDPL TTVREQCEQI EKCIKARERL ELCDQRVSSR SQTEEDCTEE LFDFLHARDH CVAHKLFNS LK

+
分子 #52: Cytochrome b-c1 complex subunit 9

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 7.41253 KDa
配列文字列:
MAAPTLTARL YSLLFRRTST FALTIAVGAL FFERAFDQGA DAIYEHINQG KLWKHIKHKY ENKE

+
分子 #53: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 29.4926 KDa
配列文字列: MLSVASRSGP FAPVLSATSR GVAGALRPLV QAALPATSES PVLDAKRSFL CRESLSGQAA GRPLVASVGL NVPASVRYSH TDIRVPDFS DYRRAEVLDS TKSSKESSDA RKGFSYLITA TTTVGVAYAA KNAVSQFVSS MSASADVLAM SKIEIKLSDI P EGKNMAFK ...文字列:
MLSVASRSGP FAPVLSATSR GVAGALRPLV QAALPATSES PVLDAKRSFL CRESLSGQAA GRPLVASVGL NVPASVRYSH TDIRVPDFS DYRRAEVLDS TKSSKESSDA RKGFSYLITA TTTVGVAYAA KNAVSQFVSS MSASADVLAM SKIEIKLSDI P EGKNMAFK WRGKPLFVRH RTKKEIDQEA AVEVSQLRDP QHDLERVKKP EWVILIGVCT HLGCVPIANA GDFGGYYCPC HG SHYDASG RIRKGPAPLN LEVPTYEFTS DDLVIVG

+
分子 #54: Cytochrome b-c1 complex subunit 10

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit 10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 6.560654 KDa
配列文字列:
MLSRFLGPRY RELARNWIPT ASMWGAVGAV GLVWATDWRL ILDWVPYING KFKKED

+
分子 #55: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske transit peptide, mitochondrial

分子名称: Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske transit peptide, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 7.900107 KDa
配列文字列:
MLSVASRSGP FAPVLSATSR GVAGALRPLV QAALPATSES PVLDAKRSFL CRESLSGQAA GRPLVASVGL NVPASVRY

+
分子 #56: Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 4.967756 KDa
配列文字列:
ITAKPAKTPT SPKEQAIGLS VTFLSFLLPA GWVLYHLDNY KKSSAA

+
分子 #57: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 7A1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 6.682726 KDa
配列文字列:
FENRVAEKQK LFQEDNGLPV HLKGGATDNI LYRVTMTLCL GGTLYSLYCL GWASFPHKK

+
分子 #58: Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 6.365217 KDa
配列文字列:
IHQKRAPDFH DKYGNAVLAS GATFCVAVWV YMATQIGIEW NPSPVGRVTP KEWREQ

+
分子 #59: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 7C, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 5.449396 KDa
配列文字列:
SHYEEGPGKN IPFSVENKWR LLAMMTLFFG SGFAAPFFIV RHQLLKK

+
分子 #60: Cytochrome c oxidase subunit 1

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 57.065844 KDa
配列文字列: MFINRWLFST NHKDIGTLYL LFGAWAGMVG TALSLLIRAE LGQPGTLLGD DQIYNVVVTA HAFVMIFFMV MPIMIGGFGN WLVPLMIGA PDMAFPRMNN MSFWLLPPSF LLLLASSMVE AGAGTGWTVY PPLAGNLAHA GASVDLTIFS LHLAGVSSIL G AINFITTI ...文字列:
MFINRWLFST NHKDIGTLYL LFGAWAGMVG TALSLLIRAE LGQPGTLLGD DQIYNVVVTA HAFVMIFFMV MPIMIGGFGN WLVPLMIGA PDMAFPRMNN MSFWLLPPSF LLLLASSMVE AGAGTGWTVY PPLAGNLAHA GASVDLTIFS LHLAGVSSIL G AINFITTI INMKPPAMSQ YQTPLFVWSV MITAVLLLLS LPVLAAGITM LLTDRNLNTT FFDPAGGGDP ILYQHLFWFF GH PEVYILI LPGFGMISHI VTYYSGKKEP FGYMGMVWAM MSIGFLGFIV WAHHMFTVGM DVDTRAYFTS ATMIIAIPTG VKV FSWLAT LHGGNIKWSP AMMWALGFIF LFTVGGLTGI VLANSSLDIV LHDTYYVVAH FHYVLSMGAV FAIMGGFVHW FPLF SGYTL NDTWAKIHFA IMFVGVNMTF FPQHFLGLSG MPRRYSDYPD AYTMWNTISS MGSFISLTAV MLMVFIIWEA FASKR EVLT VDLTTTNLEW LNGCPPPYHT FEEPTYVNLK

+
分子 #61: Cytochrome c oxidase subunit 2

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 26.040393 KDa
配列文字列: MAYPMQLGFQ DATSPIMEEL LHFHDHTLMI VFLISSLVLY IISLMLTTKL THTSTMDAQE VETIWTILPA IILILIALPS LRILYMMDE INNPSLTVKT MGHQWYWSYE YTDYEDLSFD SYMIPTSELK PGELRLLEVD NRVVLPMEMT IRMLVSSEDV L HSWAVPSL ...文字列:
MAYPMQLGFQ DATSPIMEEL LHFHDHTLMI VFLISSLVLY IISLMLTTKL THTSTMDAQE VETIWTILPA IILILIALPS LRILYMMDE INNPSLTVKT MGHQWYWSYE YTDYEDLSFD SYMIPTSELK PGELRLLEVD NRVVLPMEMT IRMLVSSEDV L HSWAVPSL GLKTDAIPGR LNQTTLMSSR PGLYYGQCSE ICGSNHSFMP IVLELVPLKY FEKWSASML

+
分子 #62: Cytochrome c oxidase subunit 3

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 29.9436 KDa
配列文字列: MTHQTHAYHM VNPSPWPLTG ALSALLMTSG LTMWFHFNSM TLLMIGLTTN MLTMYQWWRD VIRESTFQGH HTPAVQKGLR YGMILFIIS EVLFFTGFFW AFYHSSLAPT PELGGCWPPT GIHPLNPLEV PLLNTSVLLA SGVSITWAHH SLMEGDRKHM L QALFITIT ...文字列:
MTHQTHAYHM VNPSPWPLTG ALSALLMTSG LTMWFHFNSM TLLMIGLTTN MLTMYQWWRD VIRESTFQGH HTPAVQKGLR YGMILFIIS EVLFFTGFFW AFYHSSLAPT PELGGCWPPT GIHPLNPLEV PLLNTSVLLA SGVSITWAHH SLMEGDRKHM L QALFITIT LGVYFTLLQA SEYYEAPFTI SDGVYGSTFF VATGFHGLHV IIGSTFLIVC FFRQLKFHFT SNHHFGFEAG AW YWHFVDV VWLFLYVSIY WWGS

+
分子 #63: Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 17.179646 KDa
配列文字列:
AHGSVVKSED YALPSYVDRR DYPLPDVAHV KNLSASQKAL KEKEKASWSS LSIDEKVELY RLKFKESFAE MNRSTNEWKT VVGAAMFFI GFTALLLIWE KHYVYGPIPH TFEEEWVAKQ TKRMLDMKVA PIQGFSAKWD YDKNEWKK

+
分子 #64: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 12.453081 KDa
配列文字列:
SHGSHETDEE FDARWVTYFN KPDIDAWELR KGMNTLVGYD LVPEPKIIDA ALRACRRLND FASAVRILEV VKDKAGPHKE IYPYVIQEL RPTLNELGIS TPEELGLDKV

+
分子 #65: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 10.684038 KDa
配列文字列:
ASGGGVPTDE EQATGLEREV MLAARKGQDP YNILAPKATS GTKEDPNLVP SITNKRIVGC ICEEDNSTVI WFWLHKGEAQ RCPSCGTHY KLVPHQLAH

+
分子 #66: Cytochrome c oxidase subunit 6A, mitochondrial

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 6A, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 9.452687 KDa
配列文字列:
ASAAKGDHGG TGARTWRFLT FGLALPSVAL CTLNSWLHSG HRERPAFIPY HHLRIRTKPF SWGDGNHTFF HNPRVNPLPT GYEK

+
分子 #67: Cytochrome c oxidase subunit 6B1

分子名称: Cytochrome c oxidase subunit 6B1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Pig (ブタ)
分子量理論値: 10.039244 KDa
配列文字列:
AEDIQAKIKN YQTAPFDSRF PNQNQTRNCW QNYLDFHRCE KAMTAKGGDV SVCEWYRRVY KSLCPISWVS TWDDRRAEGT FPGKI

+
分子 #68: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 68 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

+
分子 #69: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 69 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN

+
分子 #70: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 70 / コピー数: 4 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #71: (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,...

分子名称: (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL
タイプ: ligand / ID: 71 / コピー数: 5 / 式: PLX
分子量理論値: 767.132 Da
Chemical component information

ChemComp-PLX:
(9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL / リン脂質*YM

+
分子 #72: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 72 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH

+
分子 #73: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 73 / コピー数: 2 / 式: ZMP
分子量理論値: 568.704 Da
Chemical component information

ChemComp-ZMP:
S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate

+
分子 #74: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 74 / コピー数: 10 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #75: 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 75 / コピー数: 10 / 式: PEE
分子量理論値: 749.073 Da
Chemical component information

ChemComp-PEE:
1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine / DOPE, リン脂質*YM

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分子 #76: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

分子名称: PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE / タイプ: ligand / ID: 76 / コピー数: 4 / 式: HEM
分子量理論値: 616.487 Da
Chemical component information

ChemComp-HEM:
PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE

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分子 #77: HEME C

分子名称: HEME C / タイプ: ligand / ID: 77 / コピー数: 2 / 式: HEC
分子量理論値: 618.503 Da
Chemical component information

ChemComp-HEC:
HEME C

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分子 #78: HEME-A

分子名称: HEME-A / タイプ: ligand / ID: 78 / コピー数: 2 / 式: HEA
分子量理論値: 852.837 Da
Chemical component information

ChemComp-HEA:
HEME-A

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分子 #79: COPPER (II) ION

分子名称: COPPER (II) ION / タイプ: ligand / ID: 79 / コピー数: 3 / 式: CU
分子量理論値: 63.546 Da
Chemical component information

ChemComp-CU:
COPPER (II) ION

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分子 #80: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 80 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #81: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 81 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 %

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
平均電子線量: 1.25 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: CTFFIND (ver. 3.0)
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4) / 使用した粒子像数: 161912
初期 角度割当タイプ: RANDOM ASSIGNMENT / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 角度割当タイプ: RANDOM ASSIGNMENT / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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