+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-7440 | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | 70s ribosome. grids prepared with blot-less method | |||||||||
![]() | structure of 70S bacterial ribosome obtained through single particle analyses. The sample has been sprayed on the grid using Surface acoustic waves atomisation | |||||||||
![]() |
| |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å | |||||||||
![]() | de Marco A / Ashtiani D / Neild A / Mak J / Venugopal H | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Blot-free grid preparation for cryo-EM: delivery of femtolitre droplets using surface acoustic waves based atomization 著者: Ashtiani D / Venugopal H / Mak J / Spicer B / Neild A / de Marco A | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
ムービー |
![]() |
---|---|
構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 19.8 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 7.2 KB 7.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 115.6 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 78.1 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 77.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 493 B | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | structure of 70S bacterial ribosome obtained through single particle analyses. The sample has been sprayed on the grid using Surface acoustic waves atomisation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.3 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
|
-添付データ
-
試料の構成要素
-全体 : 70S ribosome from S. aureus
全体 | 名称: 70S ribosome from S. aureus |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: 70S ribosome from S. aureus
超分子 | 名称: 70S ribosome from S. aureus / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 40 % / チャンバー内温度: 294 K / 装置: HOMEMADE PLUNGER 詳細: prototype for blotless sample preparation usign SAW atomisation. |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 27409 |
---|---|
初期 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING |
最終 角度割当 | タイプ: RANDOM ASSIGNMENT |