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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-7440 | |||||||||
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タイトル | 70s ribosome. grids prepared with blot-less method | |||||||||
![]() | structure of 70S bacterial ribosome obtained through single particle analyses. The sample has been sprayed on the grid using Surface acoustic waves atomisation | |||||||||
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生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å | |||||||||
![]() | de Marco A / Ashtiani D / Neild A / Mak J / Venugopal H | |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Blot-free grid preparation for cryo-EM: delivery of femtolitre droplets using surface acoustic waves based atomization 著者: Ashtiani D / Venugopal H / Mak J / Spicer B / Neild A / de Marco A | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 19.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 7.2 KB 7.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 115.6 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | structure of 70S bacterial ribosome obtained through single particle analyses. The sample has been sprayed on the grid using Surface acoustic waves atomisation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.3 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : 70S ribosome from S. aureus
全体 | 名称: 70S ribosome from S. aureus |
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要素 |
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-超分子 #1: 70S ribosome from S. aureus
超分子 | 名称: 70S ribosome from S. aureus / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 40 % / チャンバー内温度: 294 K / 装置: HOMEMADE PLUNGER 詳細: prototype for blotless sample preparation usign SAW atomisation. |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 27409 |
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初期 角度割当 | タイプ: PROJECTION MATCHING |
最終 角度割当 | タイプ: RANDOM ASSIGNMENT |