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- EMDB-61959: EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-61959
タイトルEF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis
マップデータ
試料
  • 複合体: EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis
    • RNA: x 5種
    • タンパク質・ペプチド: x 53種
  • リガンド: x 4種
キーワードMycobacterium 70S ribosome / stationary phase / elongation factor G2 / non-canonical factor / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


ribosome disassembly / translation elongation factor activity / large ribosomal subunit / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit ...ribosome disassembly / translation elongation factor activity / large ribosomal subunit / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / GTPase activity / mRNA binding / GTP binding / RNA binding / zinc ion binding / metal ion binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
: / Elongation factor G, domain III / EFG, domain V / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like ...: / Elongation factor G, domain III / EFG, domain V / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like / Elongation Factor G, domain II / Elongation Factor G, domain III / Ribosomal protein L10, eubacterial, conserved site / Ribosomal protein L10 signature. / Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G, domain IV / Elongation factor G C-terminus / Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Ribosomal protein L10 / Elongation factor EFG, domain V-like / Elongation factor G C-terminus / EF-G domain III/V-like / : / : / Ribosomal protein S14, type Z / Translation elongation factor EFTu-like, domain 2 / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Elongation factor Tu domain 2 / Ribosomal protein L31 type A / Ribosomal protein S16, conserved site / Ribosomal protein S16 signature. / Translational (tr)-type GTP-binding domain / Elongation factor Tu GTP binding domain / Translational (tr)-type guanine nucleotide-binding (G) domain profile. / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L11, conserved site / Ribosomal protein L11 signature. / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / : / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / : / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / : / Ribosomal protein L18, bacterial-type / : / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S11, bacterial-type
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein bS6 / Large ribosomal subunit protein bL33A / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein bL12 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 ...Small ribosomal subunit protein bS6 / Large ribosomal subunit protein bL33A / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein bL12 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein uS14B / Small ribosomal subunit protein uS8 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Uncharacterized protein / Small ribosomal subunit protein bS16 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Elongation factor G-like protein / Large ribosomal subunit protein bL9 / Small ribosomal subunit protein bS18B / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL25
類似検索 - 構成要素
生物種Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.7 Å
データ登録者Sengupta J / Baid P
資金援助 インド, 3件
OrganizationGrant number国
Science and Engineering Research Board (SERB)SPF/2021/000141 インド
Science and Engineering Research Board (SERB)CRG/2019/001788 インド
Council of Scientific & Industrial Research (CSIR)MLP-139 インド
引用ジャーナル: FEBS J / 年: 2025
タイトル: Cryo-EM structural analyses reveal a unique role for elongation factor G2 (EF-G2) in Mycobacteria.
著者: Priya Baid / Jayati Sengupta /
要旨: The gene-encoding translation elongation factor G (EF-G) has undergone gene duplication across various bacterial species including Mycobacteria, and in mammalian mitochondria, leading to the ...The gene-encoding translation elongation factor G (EF-G) has undergone gene duplication across various bacterial species including Mycobacteria, and in mammalian mitochondria, leading to the emergence of the paralogue elongation factor G2 (EF-G2). Our study reveals that mycobacterial EF-G2, unlike EF-G1, neither participates in ribosome-recycling nor significantly contributes to overall translation, suggesting that it plays an alternative role in Mycobacteria. Remarkably, our investigation found a significant overexpression of mycobacterial EF-G2 during the stationary growth phase. Moreover, EF-G2 lacks ribosome-dependent GTPase activity, an observation consistent with previous reports. Cryo-EM analysis of the M. smegmatis 70S ribosome purified from the nutrient-starved (stationary) phase and complexed with EF-G2 unveiled the structural basis for its inability to hydrolyse GTP in a ribosome-dependent manner. Furthermore, we report an unprecedented binding mode of two EF-G2 copies on the 50S ribosomal subunit that impedes subunit association, thereby preventing the formation of active 70S ribosomes. Thus, instead of performing canonical functions, mycobacterial EF-G2 acts as a translation repressor during nutrient starvation. Altogether, our findings shed light on the multifaceted mechanisms by which EF-G2 modulates protein synthesis under nutrient-limited conditions, providing insights into adaptive strategies employed by Mycobacteria to survive in hostile environments.
履歴
登録2024年10月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年7月9日-
マップ公開2025年7月9日-
更新2025年7月9日-
現状2025年7月9日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_61959.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_61959.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 163.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.38 Å/pix.
x 350 pix.
= 483. Å		1.38 Å/pix.
x 350 pix.
= 483. Å		1.38 Å/pix.
x 350 pix.
= 483. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.38 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.00715
最小 - 最大-0.02739546 - 0.09018755
平均 (標準偏差)0.00024104731 (±0.006317157)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ350350350
Spacing350350350
セルA=B=C: 483.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_61959_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_61959_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis

全体名称: EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis
要素
  • 複合体: EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis
    • RNA: P/P-site Phe-tRNA(Phe)
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein bL37
    • RNA: mRNA fragment
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL12
    • タンパク質・ペプチド: Translation elongation factor EF-G
    • RNA: 16S ribosomal RNA
    • RNA: 5S ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS3
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS4
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS5
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS6
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS7
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS8
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS9
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS10
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS11
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS12
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS13
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS14B
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS15
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS16
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS17
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS18B
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS19
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein bS20
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL23
    • タンパク質・ペプチド: Small ribosomal subunit protein uS2
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL25
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL27
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL28
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL29
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL30
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL32
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL33A
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL34
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL35
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL31
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL2
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL3
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL4
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL5
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL6
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL10
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL11
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL15
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL16
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL17
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL18
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL20
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein bL21
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL22
    • タンパク質・ペプチド: Large ribosomal subunit protein uL24
    • RNA: 23S ribosomal RNA
  • リガンド: PHENYLALANINE
  • リガンド: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis

超分子名称: EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 2.7 MDa

+
分子 #1: P/P-site Phe-tRNA(Phe)

分子名称: P/P-site Phe-tRNA(Phe) / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 24.420508 KDa
配列文字列:
GCCCGGAUAG CUCAGUCGGU AGAGCAGGGG ACUCAUAACC CCCGUGUCCU UGGUUCGAUU CCGAGUCCGG GCACCA

+
分子 #3: mRNA fragment

分子名称: mRNA fragment / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 5.866619 KDa
配列文字列:
AGGAGGUAAA AAUGCCAA

+
分子 #6: 16S ribosomal RNA

分子名称: 16S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 6 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 490.111719 KDa
配列文字列: UUUGGAGAGU UUGAUCCUGG CUCAGGACGA ACGCUGGCGG CGUGCUUAAC ACAUGCAAGU CGAACGGAAA GGCCCUUUCG GGGGUACUC GAGUGGCGAA CGGGUGAGUA ACACGUGGGU GAUCUGCCCU GCACUUUGGG AUAAGCCUGG GAAACUGGGU C UAAUACCG ...文字列:
UUUGGAGAGU UUGAUCCUGG CUCAGGACGA ACGCUGGCGG CGUGCUUAAC ACAUGCAAGU CGAACGGAAA GGCCCUUUCG GGGGUACUC GAGUGGCGAA CGGGUGAGUA ACACGUGGGU GAUCUGCCCU GCACUUUGGG AUAAGCCUGG GAAACUGGGU C UAAUACCG AAUACACCCU GCUGGUCGCA UGGCCUGGUA GGGGAAAGCU UUUGCGGUGU GGGAUGGGCC CGCGGCCUAU CA GCUUGUU GGUGGGGUGA UGGCCUACCA AGGCGACGAC GGGUAGCCGG CCUGAGAGGG UGACCGGCCA CACUGGGACU GAG AUACGG CCCAGACUCC UACGGGAGGC AGCAGUGGGG AAUAUUGCAC AAUGGGCGCA AGCCUGAUGC AGCGACGCCG CGUG AGGGA UGACGGCCUU CGGGUUGUAA ACCUCUUUCA GCACAGACGA AGCGCAAGUG ACGGUAUGUG CAGAAGAAGG ACCGG CCAA CUACGUGCCA GCAGCCGCGG UAAUACGUAG GGUCCGAGCG UUGUCCGGAA UUACUGGGCG UAAAGAGCUC GUAGGU GGU UUGUCGCGUU GUUCGUGAAA ACUCACAGCU UAACUGUGGG CGUGCGGGCG AUACGGGCAG ACUAGAGUAC UGCAGGG GA GACUGGAAUU CCUGGUGUAG CGGUGGAAUG CGCAGAUAUC AGGAGGAACA CCGGUGGCGA AGGCGGGUCU CUGGGCAG U AACUGACGCU GAGGAGCGAA AGCGUGGGGA GCGAACAGGA UUAGAUACCC UGGUAGUCCA CGCCGUAAAC GGUGGGUAC UAGGUGUGGG UUUCCUUCCU UGGGAUCCGU GCCGUAGCUA ACGCAUUAAG UACCCCGCCU GGGGAGUACG GCCGCAAGGC UAAAACUCA AAGGAAUUGA CGGGGGCCCG CACAAGCGGC GGAGCAUGUG GAUUAAUUCG AUGCAACGCG AAGAACCUUA C CUGGGUUU GACAUGCACA GGACGCCGGC AGAGAUGUCG GUUCCCUUGU GGCCUGUGUG CAGGUGGUGC AUGGCUGUCG UC AGCUCGU GUCGUGAGAU GUUGGGUUAA GUCCCGCAAC GAGCGCAACC CUUGUCUCAU GUUGCCAGCA CGUUAUGGUG GGG ACUCGU GAGAGACUGC CGGGGUCAAC UCGGAGGAAG GUGGGGAUGA CGUCAAGUCA UCAUGCCCCU UAUGUCCAGG GCUU CACAC AUGCUACAAU GGCCGGUACA AAGGGCUGCG AUGCCGUGAG GUGGAGCGAA UCCUUUCAAA GCCGGUCUCA GUUCG GAUC GGGGUCUGCA ACUCGACCCC GUGAAGUCGG AGUCGCUAGU AAUCGCAGAU CAGCAACGCU GCGGUGAAUA CGUUCC CGG GCCUUGUACA CACCGCCCGU CACGUCAUGA AAGUCGGUAA CACCCGAAGC CGGUGGCCUA ACCCUUGUGG AGGGAGC CG UCGAAGGUGG GAUCGGCGAU UGGGACGAAG UCGUAACAAG GUAGCCGUAC CGGAAGGUGC GGCUGGAUC

GENBANK: GENBANK: CP000480.1

+
分子 #7: 5S ribosomal RNA

分子名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 7 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 38.061816 KDa
配列文字列:
GUUACGGCGG UCCAUAGCGG CAGGGAAACG CCCGGUCCCA UCCCGAACCC GGAAGCUAAG CCUGCCAGCG CCGAUGAUAC UACCCAUCC GGGUGGAAAA GUAGGACACC GCCGAACAC

GENBANK: GENBANK: CP000480.1

+
分子 #58: 23S ribosomal RNA

分子名称: 23S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 58 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 1.014391625 MDa
配列文字列: UUGUAAGUGU UUAAGGGCGC AUGGUGGAUG CCUUGGCACU GGGAGCCGAU GAAGGACGUA GGAGGCUGCG AUAAGCCUCG GGGAGCUGU CAACCGAGCG UUGAUCCGAG GAUGUCCGAA UGGGGAAACC CGGCACGAGU GAUGUCGUGU CACCAGGCGC U GAAUAUAU ...文字列:
UUGUAAGUGU UUAAGGGCGC AUGGUGGAUG CCUUGGCACU GGGAGCCGAU GAAGGACGUA GGAGGCUGCG AUAAGCCUCG GGGAGCUGU CAACCGAGCG UUGAUCCGAG GAUGUCCGAA UGGGGAAACC CGGCACGAGU GAUGUCGUGU CACCAGGCGC U GAAUAUAU AGGCGUCUGG GGGGAACGCG GGGAAGUGAA ACAUCUCAGU ACCCGUAGGA AGAGAAAACA AAAUGUGAUU CC GUGAGUA GUGGCGAGCG AAAGCGGAGG AUGGCUAAAC CGUAUGCAUG UGAUACCGGG UAGGGGUUGU GUGUGCGGGG UUG UGGGAC CUAUCUUUCC GGCUCUACCU GGCUGGAGGG CAGUGAGAAA AUGUUGUGGU UAGCGGAAAU GGCUUGGGAU GGCC UGCCG UAGACGGUGA GAGCCCGGUA CGUGAAAACC CGACGUCUGU CUUGAUGGUG UUCCCGAGUA GCAGCGGGCC CGUGG AAUC UGCUGUGAAU CUGCCGGGAC CACCCGGUAA GCCUGAAUAC UUCCCAGUGA CCGAUAGCGG AUUAGUACCG UGAGGG AAU GGUGAAAAGU ACCCCGGGAG GGGAGUGAAA GAGUACCUGA AACCGUGCGC UUACAAUCCG UCAGAGCCCU CGACGUG UC GUGGGGUGAU GGCGUGCCUU UUGAAGAAUG AGCCUGCGAG UCAGGGACAU GUCGCGAGGU UAACCCGGGU GGGGUAGC C GCAGCGAAAG CGAGUCUGAA UAGGGCGUAU CCACACAAGA GUGUGUGGUG UAGUGGUGUG UUCUGGACCC GAAGCGGAG UGAUCUACCC AUGGCCAGGG UGAAGCGCGG GUAAGACCGC GUGGAGGCCC GAACCCACUU AGGUUGAAGA CUGAGGGGAU GAGCUGUGG GUAGGGGUGA AAGGCCAAUC AAACUCCGUG AUAGCUGGUU CUCCCCGAAA UGCAUUUAGG UGCAGCGUCG C AUGUUUCU UGCCGGAGGU AGAGCUACUG GAUGGCCGAU GGGCCCCACA GGGUUACUGA CGUCAGCCAA ACUCCGAAUG CC GGUAAGU CCAAGAGUGC GGCAGUGAGA CGGCGGGGGA UAAGCUCCGU GCGUCGAGAG GGAAACAGCC CAGAUCGCCG GCU AAGGCC CCUAAGCGUG UGCUAAGUGG AAAAGGAUGU GCAGUCGCGA AGACAACCAG GAGGUUGGCU UAGAAGCAGC CACC CUUGA AAGAGUGCGU AAUAGCUCAC UGGUCAAGUG AUUGUGCGCC GAUAAUGUAG CGGGGCUCAA GCACACCGCC GAAGC CGCG GCAGCCAACG UGUUGGCUGG GUAGGGGAGC GUCCUGCAUC CGGUGAAGCC GCCGAGUGAU CGAGUGGUGG AGGGUG UGG GAGUGAGAAU GCAGGCAUGA GUAGCGAUUA GGCAAGUGAG AACCUUGCCC GCCGAAAGAC CAAGGGUUCC UGGGCCA GG CCAGUCCGCC CAGGGUGAGU CGGGACCUAA GGCGAGGCCG ACAGGCGUAG UCGAUGGACA ACGGGUUGAU AUUCCCGU A CCCGUGUAUG UGCGUCCAUG AUGAAUCAGC GGUACUAACC AUCCAAAACC ACCGUGACCG CACCUUUCGG GGUGUGGCG UUGGUGGGGC UGCAUGGGAC CUUCGUUGGU AGUAGUCAAG CGAUGGGGUG ACGCAGGAAG GUAGCCGUAC CGGUCAGUGG UAAUACCGG GGUAAGCCUG UAGGGAGUCA GAUAGGUAAA UCCGUCUGGC AUAUAUCCUG AGAGGUGAUG CAUAGCCGAG U GAGGCGAA UUCGGUGAUC CUAUGCUGCC GAGAAAAGCC UCUAGCGAGG ACAUACACGG CCCGUACCCC AAACCAACAC AG GUGGUCA GGUAGAGAAU ACUAAGGCGU ACGAGUGAAC UAUGGUUAAG GAACUCGGCA AAAUGCCCCC GUAACUUCGG GAG AAGGGG GACCCACAUG GCGUGUAAGC CUUUACGGCC CAAGCGUGAG UGGGUGGCAC AAACCAGUGA GAAGCGACUG UUUA CUAAA AACACAGGUC CGUGCGAAGU CGCAAGACGA UGUAUACGGA CUGACGCCUG CCCGGUGCUG GAAGGUUAAG AGGAC CCGU UAACUCCCUU UGGGGGUGAA GCGGAGAAUU UAAGCCCCAG UAAACGGCGG UGGUAACUAU AACCAUCCUA AGGUAG CGA AAUUCCUUGU CGGGUAAGUU CCGACCUGCA CGAAUGGCGU AACGACUUCU CAACUGUCUC AACCAUAGAC UCGGCGA AA UUGCACUACG AGUAAAGAUG CUCGUUACGC GCGGCAGGAC GAAAAGACCC CGGGACCUUC ACUACAACUU GGUAUUGG U GCUCGAUACG GUUUGUGUAG GAUAGGUGGG AGACUGUGAA GCUCACACGC CAGUGUGGGU GGAGUCGUUG UUGAAAUAC CACUCUGAUC GUAUUGGGCC UCUAACCUCG GACCGUAUAU CCGGUUCAGG GACAGUGCCU GGUGGGUAGU UUAACUGGGG CGGUUGCCU CCUAAAAUGU AACGGAGGCG CCCAAAGGUU CCCUCAACCU GGACGGCAAU CAGGUGUUGA GUGUAAGUGC A CAAGGGAG CUUGACUGCG AGACGGACAU GUCGAGCAGG GACGAAAGUC GGGACUAGUG AUCCGGCACC UCUGAGUGGA AG GGGUGUC GCUCAACGGA UAAAAGGUAC CCCGGGGAUA ACAGGCUGAU CUUCCCCAAG AGUCCAUAUC GACGGGAUGG UUU GGCACC UCGAUGUCGG CUCGUCGCAU CCUGGGGCUG GAGCAGGUCC CAAGGGUUGG GCUGUUCGCC CAUUAAAGCG GCAC GCGAG CUGGGUUUAG AACGUCGUGA GACAGUUCGG UCUCUAUCCG CCGCGCGCGU CAGAAGCUUG AGGAAACCUG UCCCU AGUA CGAGAGGACC GGGACGGACG AACCUCUGGU AUACCAGUUG UCCCACCAGG GGCACGGCUG GAUAGCCACG UUCGGA CAG GAUAACCGCU GAAAGCAUCU AAGCGGGAAA CCUCUUCCAA GACCAGGCUU CUCACCCUCU AGGAGGGAUA AGGCCCC CC GCAGACCACG GGAUUGAUAG ACCAGACCUG GAAGCCUAGU AAUAGGUGCA GGGAACUGGC ACUAACCGGC CGAAAACU U ACAACA

+
分子 #2: 50S ribosomal protein bL37

分子名称: 50S ribosomal protein bL37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 2.710179 KDa
配列文字列:
AKRGRKKRDR KHSKANHGKR PNA

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #4: Large ribosomal subunit protein bL12

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 7.199378 KDa
配列文字列:
EFDVILEGAG EKKIGVIKVV REIVSGLGLK EAKDLVDSAP KPLLEKVTKE AADDAKAKLE AAGASVTVK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL12

+
分子 #5: Translation elongation factor EF-G

分子名称: Translation elongation factor EF-G / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 75.420797 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列: GSVPTAERPA AIRNVALVGP SGGGKTTLVE ALLVAGGVLT RPGSVADGST VCDFDEAEIA QQRSVSLALA SLSHNGIKVN LIDTPGYAD FVGELRAGLR AADCALFVIA ANETIDEPTK TLWQECNEVQ MPRAVVITKL DHPRANYDAA LTAAQEAFGD K VAPLYFPV ...文字列:
GSVPTAERPA AIRNVALVGP SGGGKTTLVE ALLVAGGVLT RPGSVADGST VCDFDEAEIA QQRSVSLALA SLSHNGIKVN LIDTPGYAD FVGELRAGLR AADCALFVIA ANETIDEPTK TLWQECNEVQ MPRAVVITKL DHPRANYDAA LTAAQEAFGD K VAPLYFPV GDGESCKGVV GLLTRTYYDY SGGTHTARPP DGSHDAAIAE LRGSLIEGVI EESEDETLME RYLGGEEIDE AV LIADLEK AVARASFFPV IPVCSQSGVG TLELLDIISR GFPAPPEHQL PEVFTPQGAP RKPLSCDPDG PLLAEVVKTT SDP YVGRVS LVRVFSGTIR PDATVHVSGH FSAFTDTSGS HGAAAAADGS THSHADHDED ERIGTLSFPL GKQQRPAPTV VAGD ICAIG RLSRAETGDT LSDKTDPLVL RPWTMPDPLL PIAVAPRAKT DEDKLSVGLQ RLAAEDPTLR IEQNPETHQI VLWCM GEAH AAVVLDALSR RYGVSVDTVE LRVPLRETFA GKATGHGRHV KQSGGHGQYA VCDIEVEPLP EGSGFEFVDK VVGGAV PRQ FIPSVEKGVR AQMEKGVTGE SGYPVVDIRV TLFDGKAHSV DSSDFAFQMA GALALRDAAA ATKINLLEPV DDVTIVV PD DLVGTIMGDL SGRRGRVLGT DKHDADRTVI KAEIPEVELV RYAIDLRSMS HGAGQFRRSF ARYEPMP

UniProtKB: Elongation factor G-like protein

+
分子 #8: Small ribosomal subunit protein uS3

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 23.61715 KDa
配列文字列: GQKINPHGFR LGITTEWKSR WYADKQYKDY VKEDVAIRKL LATGLERAGI ADVEIERTRD RVRVDIHTAR PGIVIGRRGT EADRIRADL EKLTGKQVQL NILEVKNPES QAQLVAQGVA EQLSNRVAFR RAMRKAIQSA MRQPNVKGIR VQCSGRLGGA E MSRSEFYR ...文字列:
GQKINPHGFR LGITTEWKSR WYADKQYKDY VKEDVAIRKL LATGLERAGI ADVEIERTRD RVRVDIHTAR PGIVIGRRGT EADRIRADL EKLTGKQVQL NILEVKNPES QAQLVAQGVA EQLSNRVAFR RAMRKAIQSA MRQPNVKGIR VQCSGRLGGA E MSRSEFYR EGRVPLHTLR ADIDYGLYEA KTTFGRIGVK VWIYKGDIVG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #9: Small ribosomal subunit protein uS4

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 23.28459 KDa
配列文字列: ARYTGPATRK SRRLGVDLVG GDQSFEKRPY PPGQHGRARI KESEYRQQLQ EKQKARFSYG VMEKQFRRYY EEANRQPGKT GDNLLRILE SRLDNVVYRA GLARTRRMAR QLVSHGHFLV NGVKVDIPSY RVSQYDIIDV KEKSLNTLPF QIARETAGER P IPSWLQVV ...文字列:
ARYTGPATRK SRRLGVDLVG GDQSFEKRPY PPGQHGRARI KESEYRQQLQ EKQKARFSYG VMEKQFRRYY EEANRQPGKT GDNLLRILE SRLDNVVYRA GLARTRRMAR QLVSHGHFLV NGVKVDIPSY RVSQYDIIDV KEKSLNTLPF QIARETAGER P IPSWLQVV GERQRILVHQ LPERAQIDVP LTEQLIVELY SK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #10: Small ribosomal subunit protein uS5

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 18.481439 KDa
配列文字列:
NYIERVVSIN RVSKVVKGGR RFSFTALVIV GDGKGMVGVG YGKAKEVPAA IAKGVEEARK NFFRVPLIGS TITHPVQGEA AAGVVMLRP ASPGTGVIAG GAARAVLECA GVHDILAKSL GSDNAINVVH ATVAALKLLQ RPEEVAARRG LPIEDVAPAG M LKARRESE ALAAAAAREG SA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #11: Small ribosomal subunit protein bS6

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 10.991637 KDa
配列文字列:
MRPYEIMVIL DPTLDERTVA PSLETFLNVI RKDGGTVDKV DIWGRRRLAY EIAKHAEGIY AVIDVKAEPA TVSELDRQLN LNESVLRTK VLRTDKH

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #12: Small ribosomal subunit protein uS7

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 17.52918 KDa
配列文字列:
PRKGPAPKRP LVNDPVYGSQ LVTQLVNKVL LEGKKSLAER IVYGALEQAR EKTGTDPVVT LKRALDNVKP ALEVRSRRVG GATYQVPVE VRPDRSTTLA LRWLVNFSRQ RREKTMVERL ANEILDASNG LGASVKRRED THKMAEANRA FAHYRW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #13: Small ribosomal subunit protein uS8

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 14.361442 KDa
配列文字列:
TMTDPIADFL TRLRNANSAY HDEVTLPHSK LKANIAEILK REGYISDYRT EDARVGKSLV VQLKYGPSRE RSIAGLRRVS KPGLRVYAK STNLPRVLGG LGVAIISTSS GLLTDRQAAR QGVGGEVLAY VW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #14: Small ribosomal subunit protein uS9

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 14.093392 KDa
配列文字列:
PIQTVGRRKE AVVRVRLVPG TGQFNLDGRT LENYFPNKVH QQLIKAPLVT VDRVDQFDIY AHLDGGGPSG QAGALRLAIA RALILVQPE DRPALKKAGF LTRDPRAIER KKYGLKKARK APQYSKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #15: Small ribosomal subunit protein uS10

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 11.252039 KDa
配列文字列:
GQKIRIRLKA YDHEAIDASA RKIVETVTRT GASVVGPVPL PTEKNVYCVI RSPHKYKDSR EHFEMRTHKR LIDILDPTPK TVDALMRID LPASVDVNIQ

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #16: Small ribosomal subunit protein uS11

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 12.151729 KDa
配列文字列:
KNVPHGAAHI KSTFNNTIVS ITDPQGNVIA WASSGHVGFK GSRKSTPFAA QLAAENAARK AQEHGVKKVD VFVKGPGSGR ETAIRSLQA AGLEVGTISD VTPQPHNGCR PPKRRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #17: Small ribosomal subunit protein uS12

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 13.678093 KDa
配列文字列:
PTIQQLVRKG RRDKIAKVKT AALKGSPQRR GVCTRVYTTT PKKPNSALRK VARVKLTSQV EVTAYIPGEG HNLQEHSMVL VRGGRVKDL PGVRYKIIRG SLDTQGVKNR KQARSRYGAK KEK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #18: Small ribosomal subunit protein uS13

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 13.374481 KDa
配列文字列:
ARLVGVDLPR DKRMEIALTY IYGIGRTRSN EILAATGIDK NMRTKDLTDD QVTVLRDYIE GNLKVEGDLR REVQADIRRK IEIGCYQGL RHRRGLPVRG QRTKTNARTR KGPKRTI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #19: Small ribosomal subunit protein uS14B

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS14B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 6.845213 KDa
配列文字列:
AKKALVHKAN KKPKFAVRAY TRCNKCGRPH SVYRKFGLCR ICLREMAHAG ELPGVQKSSW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14B

+
分子 #20: Small ribosomal subunit protein uS15

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 10.2369 KDa
配列文字列:
ALTAEQKKEI LGQYGLHDTD TGSPEAQVAL LTKRIQDLTE HLKVHKHDHH SRRGLLLLVG RRRRLLKYVA QVDVARYRSL IERLGLRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #21: Small ribosomal subunit protein bS16

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 12.635652 KDa
配列文字列:
AVKIKLTRLG KIRNPQYRII VADARTRRDG RAIEVIGRYH PKEEPSLIQI DSERAQYWLG VGAQPTEPVL ALLKITGDWQ KFKGLPGAE GTLKVKEPKP SKLDLFNAAL AEAE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16

+
分子 #22: Small ribosomal subunit protein uS17

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 10.680461 KDa
配列文字列:
QKGPKYTPAA EKPRGRRKTA IGYVVSDKMQ KTIVVELEDR KSHPLYGKII RTTKKVKAHD ENGEAGIGDR VSLMETRPLS ATKRWRLVE ILEKA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #23: Small ribosomal subunit protein bS18B

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS18B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 7.353585 KDa
配列文字列:
TRKCVFCSKK GQTIDYKDTA LLRTYISERG KIRARRVTGN CVQHQRDIAV AVKNAREVAL LPFGS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18B

+
分子 #24: Small ribosomal subunit protein uS19

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 9.379874 KDa
配列文字列:
PRSLKKGPFV DDHLLKKVDV QNEKNTKQVI KTWSRRSTII PDFIGHTFAV HDGRKHVPVF VTEAMVGHKL GEFAPTRTFK GH

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #25: Small ribosomal subunit protein bS20

分子名称: Small ribosomal subunit protein bS20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 9.424908 KDa
配列文字列:
ANIKSQIKRI RTNERRRLRN QSVKSSLRTA IRGFREAVDA GDKDKASELL HATSRKLDKA ASKGVIHPNQ AANKKSALAL ALNKL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #26: Large ribosomal subunit protein uL23

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 10.748448 KDa
配列文字列:
ATITDPRDII LAPVISEKSY GLIEDNVYTF VVHPDSNKTQ IKIAIEKIFD VKVDSVNTAN RQGKRKRTRT GFGKRKSTKR AIVKLAAGS KPIDLFGA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #27: Small ribosomal subunit protein uS2

分子名称: Small ribosomal subunit protein uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 25.576547 KDa
配列文字列: MAVVTMKQLL DSGAHFGHQT RRWNPKMKRF IFTDRNGIYI IDLQQTLTYI DKAYEFVKET VAHGGTVLFV GTKKQAQESI AEEATRVGM PYVNQRWLGG MLTNFSTVHK RLQRLKELEA MEQTGGFEGR TKKEILMLTR EKNKLERSLG GIRDMQKVPS A VWVVDTNK ...文字列:
MAVVTMKQLL DSGAHFGHQT RRWNPKMKRF IFTDRNGIYI IDLQQTLTYI DKAYEFVKET VAHGGTVLFV GTKKQAQESI AEEATRVGM PYVNQRWLGG MLTNFSTVHK RLQRLKELEA MEQTGGFEGR TKKEILMLTR EKNKLERSLG GIRDMQKVPS A VWVVDTNK EHIAVGEARK LGIPVIAILD TNCDPDVVDY PIPGNDDAIR SAALLTKVIA SAVAEGLQAR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #28: Large ribosomal subunit protein bL25

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 20.331725 KDa
配列文字列: TANIPNKLTA NVRTRTGKGA SRQARRDGKV PAVLYGHGTD PQHLELNARD FAAVLRSHGT NAILTLDIEG TEQLALTKAL DVHPIRRNI QHADLLVVQR GEKVTVEVTV LVEGDATPGT LVTQDANTIE IEAEALSIPE QLTVSVEGVE AGTQITAGQI S LPEGVNLI ...文字列:
TANIPNKLTA NVRTRTGKGA SRQARRDGKV PAVLYGHGTD PQHLELNARD FAAVLRSHGT NAILTLDIEG TEQLALTKAL DVHPIRRNI QHADLLVVQR GEKVTVEVTV LVEGDATPGT LVTQDANTIE IEAEALSIPE QLTVSVEGVE AGTQITAGQI S LPEGVNLI SDPELLVVNV VEAPSAEALE EEGA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #29: Large ribosomal subunit protein bL27

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 8.322479 KDa
配列文字列:
SSSRNGRDSA AQRLGVKRFG GQVVKAGEIL VRQRGTHFHP GVNVGRGGDD TLFALAPGAV EFGAKRGRKT VNIVPVARP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #30: Large ribosomal subunit protein bL28

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 6.75982 KDa
配列文字列:
AAVCDICGKG PGFGKSVSHS HRRTSRRWNP NIQPVRAVTR PGGNKQRINA CTSCIKAGKV SRA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #31: Large ribosomal subunit protein uL29

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 7.590576 KDa
配列文字列:
GTTPGELREL TDDELKDKLR ESKEELFNLR FQMATGQLSN NRRLRTVRQE IARVYTVLRE RELG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #32: Large ribosomal subunit protein uL30

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 6.761772 KDa
配列文字列:
AELKITQVRS TIGARWKQRE SLRTLGLKKI RQSVVREDNA QTRGLINTVH HLVEVEEVG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #33: Large ribosomal subunit protein bL32

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 6.050149 KDa
配列文字列:
AVPKRRMSRA NTRSRRAQWK AEAPGLVTVS VAGQQRKVPR RLLKAARLGL VDLD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #34: Large ribosomal subunit protein bL33A

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL33A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 5.833775 KDa
配列文字列:
DVRPKITLAC EVCKHRNYIT KKNRRNDPDR LEIKKFCPNC GTHQPHKES

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33A

+
分子 #35: Large ribosomal subunit protein bL34

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 5.391384 KDa
配列文字列:
AKGKRTFQPN NRRRARVHGF RLRMRTRAGR AIVANRRSKG RRALTA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #36: Large ribosomal subunit protein bL35

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 7.16731 KDa
配列文字列:
PKAKTHSGAS KRFRRTGTGK IVRQKANRRH LLEHKPTKRT RRLDGRTTVS AADNSRINKL LNG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #37: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 4.341277 KDa
配列文字列:
MKVNPSVKPI CDKCRVIRRH GRVMVICSDP RHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #38: Large ribosomal subunit protein bL31

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 5.257952 KDa
配列文字列:
MKTGIHPEYV DTTVQCGCGH SFTTRSTKQS GTIVVEVCSQ CHPFYTGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31

+
分子 #39: Large ribosomal subunit protein uL2

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 30.008379 KDa
配列文字列: GIRKYKPTTP GRRGASVSDF AEITRSTPEK SLVRPLHGKG GRNAHGRITT RHKGGGHKRA YRVIDFRRHD KDGVNAKVAH IEYDPNRTA NIALLHYLDG EKRYIIAPQG LKQGDVIESG ANADIKPGNN LPLRNIPAGT VIHAVELRPG GGAKLARSAG V SIQLLGKE ...文字列:
GIRKYKPTTP GRRGASVSDF AEITRSTPEK SLVRPLHGKG GRNAHGRITT RHKGGGHKRA YRVIDFRRHD KDGVNAKVAH IEYDPNRTA NIALLHYLDG EKRYIIAPQG LKQGDVIESG ANADIKPGNN LPLRNIPAGT VIHAVELRPG GGAKLARSAG V SIQLLGKE GTYAALRMPS GEIRRVDVRC RATVGEVGNA EQSNINWGKA GRMRWKGKRP TVRGVVMNPV DHPHGGGEGK TS GGRHPVS PWGKPEGRTR KPNKPSDKLI VRRRRTGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #40: Large ribosomal subunit protein uL3

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 22.621902 KDa
配列文字列: ARKGILGTKL GMTQVFDENN KVVPVTVVKA GPNVVTRIRT TERDGYSAVQ LAYGEISPRK VIKPVAGQFA AAGVNPRRHV AELRLDDEA AVAEYEVGQE LTAEIFSDGA YVDVTGTSKG KGFAGTMKRH GFRGQGAAHG AQAVHRRPGS IGGCATPGRV F KGTRMSGR ...文字列:
ARKGILGTKL GMTQVFDENN KVVPVTVVKA GPNVVTRIRT TERDGYSAVQ LAYGEISPRK VIKPVAGQFA AAGVNPRRHV AELRLDDEA AVAEYEVGQE LTAEIFSDGA YVDVTGTSKG KGFAGTMKRH GFRGQGAAHG AQAVHRRPGS IGGCATPGRV F KGTRMSGR MGNDRVTTQN LKVHKVDAEN GVLLIKGAIP GRNGGLVVVR SAIKRG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #41: Large ribosomal subunit protein uL4

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 22.346301 KDa
配列文字列: TLKVDVKTPA GKTDGSVELP AELFDVEPNI ALMHQVVTAQ LAAKRQGTHS TKTRGEVSGG GKKPYRQKGT GRARQGSTRA PQFTGGGTV HGPKPRDYSQ RTPKKMIAAA LRGALSDRAR NDRIHAVTEL VEGQTPSTKS AKTFLGTLTE NKKVLVVIGR T DEVGAKSV ...文字列:
TLKVDVKTPA GKTDGSVELP AELFDVEPNI ALMHQVVTAQ LAAKRQGTHS TKTRGEVSGG GKKPYRQKGT GRARQGSTRA PQFTGGGTV HGPKPRDYSQ RTPKKMIAAA LRGALSDRAR NDRIHAVTEL VEGQTPSTKS AKTFLGTLTE NKKVLVVIGR T DEVGAKSV RNLPGVHVIS PDQLNTYDVL NADDVVFSVE ALNAYISANS K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #42: Large ribosomal subunit protein uL5

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 20.588701 KDa
配列文字列:
KALPRLKQRY REEIREALQQ EFNYANVMQI PGVVKVVVNM GVGDAARDAK LINGAINDLA LITGQKPEVR RARKSIAQFK LREGMPIGA RVTLRGDRMW EFLDRLISIA LPRIRDFRGL SPKQFDGTGN YTFGLNEQSM FHEIDVDSID RPRGMDITVV T TATNDAEG RALLRALGFP FKEN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #43: Large ribosomal subunit protein uL6

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 19.165934 KDa
配列文字列:
SRIGKQPVPV PSGVDVTING QNLSVKGPKG TLTLDVAEPI SVSRAEDGAI VVTRPDDERR SRSLHGLSRT LIANLVTGVT EGYTQKMEI FGVGYRVQLK GQNLEFALGY SHPVLIEAPE GITFAVESPT KFSVSGIDKQ KVGQISAVIR RLRRPDPYKG K GVRYEGEQ IRRKVGKT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #44: 50S ribosomal protein L9

分子名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 15.949253 KDa
配列文字列:
MKLILTAEVE HLGAAGDTVE VKDGYGRNYL LPRGLAIVAS RGAERQAEEI RRARESKVIR DIEHANELKT ALEGLGDVTL SVNAAGDTG KLFGSVTAAD VVNAIKKAGG PNLDKRTVQL AKAHIKSVGT HPVTVKLHTG VEAKVSLNVV AQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #45: Large ribosomal subunit protein uL10

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 13.095021 KDa
配列文字列:
MAKADKATAV ADIAEQFKAS TATVVTEYRG LTVANLAELR RALGDSATYT VAKNTLVKRA ASEAGIEGLD ELFAGPTAIA FVKGEAVDA AKAIKKFAKD NKALVIKGGY MDGKALSVAD VEKIADL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10

+
分子 #46: Large ribosomal subunit protein uL11

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 14.109185 KDa
配列文字列:
LIKLQIQAGQ ANPAPPVGPA LGQHGVNIME FCKAYNAATE SQRGNVIPVE ITVYEDRSFT FALKTPPAAK LLLKAAGVQK GSGEPHKTK VAKVTWDQVR EIAETKKADL NANDIDAAAK IIAGTARSMG ITVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11

+
分子 #47: Large ribosomal subunit protein uL13

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 16.015493 KDa
配列文字列:
PTYTPKAGDT TRSWYVIDAS DVVLGRLASA AATLLRGKHK PTFTPNVDGG DFVIVINADK IAVSGDKLTK KFAYRHSGYP GGLRKRTIG ELLEKHPTRV VENAIIGMLP HNKLGRQIQK KLKVYAGPDH PHAAQQPIPF EIKQVAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #48: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 13.400625 KDa
配列文字列:
MIQQESRLKV ADNTGAKEIL CIRVLGGSSR RYAGIGDVIV ATVKDAIPGG NVKRGDVVKA VVVRTVKERR RADGSYIKFD ENAAVIIKN DNDPRGTRIF GPVGRELREK KFMKIVSLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #49: Large ribosomal subunit protein uL15

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 15.383968 KDa
配列文字列:
VIKLHDLKPA PGEKKAKTRV GRGEGSKGKT AGRGTKGTKA RKNVPVMFEG GQMPIHMRLP KLKGFKNRFR TEYQVVNVGD INKAFPQGG TVGVDELVAK GLVRKNSLVK VLGDGKLTVK VDVTANKFSG SAREAITAAG GSATEL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #50: Large ribosomal subunit protein uL16

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 15.498937 KDa
配列文字列:
MLIPRKVKHR KQHHPEQRGI ASGGTSVSFG DYGIQALEHA YITNRQIESA RIAINRHIKR GGKVWINIFP DRPLTKKPAE TRMGSGKGS PEWWVANVKP GRVLFELSYP DEKTARDALT RAIHKLPIKA RIVTREE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #51: Large ribosomal subunit protein bL17

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 13.210346 KDa
配列文字列:
PKPTKGPRLG GSSSHQSALL ANLATSLFEH GRIKTTEPKA RALRPYAEKL ITHAKKGALH NRREVMKKIR DKDVVHTLFA EIGPFYADR NGGYTRIIKV ENRKGDNAPM AVIELVREK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #52: Large ribosomal subunit protein uL18

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 13.580531 KDa
配列文字列:
AHKPVGQNIS EVRRNARLRR HARLRKKVAG TAEVPRLVVN RSARHIHVQL VNDLNGTTLA AASSIEADVR AIDGDKKAHS VRVGQLIAE RAKAAGVETV VFDRGGYTYG GRIAALADAA REAGLKF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #53: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 12.892806 KDa
配列文字列:
MNTLDFVDQA SLRDDIPTFS PGDTVNVHVK VIEGSKERIQ VFKGVVIRRQ GGGISETFTV RKESYGVGVE RTFPVHSPNI DHIDVLTRG DVRRAKLYYL RELRGKKAKI KEKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #54: Large ribosomal subunit protein bL20

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 14.035175 KDa
配列文字列:
ARVKRALNAQ KKRRTVLKAS KGYRGQRSRL YRKAKEQQLH SLTYAYRDRR ARKGEFRKLW ISRINAAARA NDITYNRLIQ GLKAAGVEV DRKNLAELAV SDPAAFTALV DVARAALPED VNAPS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #55: Large ribosomal subunit protein bL21

分子名称: Large ribosomal subunit protein bL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 10.72444 KDa
配列文字列:
TYAIVKTGGK QYKVAAGDVV KVEKLDSEPG ASVSLPVALV VDGANVTSKA DDLAKVAVTA EVLEHTKGPK IRIHKFKNKT GYHKRQGHR QQLTVLKVTG I

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #56: Large ribosomal subunit protein uL22

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 12.408192 KDa
配列文字列:
EFPSATAKAR YVRVSATKAR RVIDLVRGKS VEEALDILRW APQAASEPVA KVIASAAANA QNNEGLDPST LVVATVYADE GPTAKRIRP RAQGRAFRIR KRTSHITVIV ESRPP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #57: Large ribosomal subunit protein uL24

分子名称: Large ribosomal subunit protein uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mycolicibacterium smegmatis MC2 155 (バクテリア)
分子量理論値: 11.228946 KDa
配列文字列:
MKVHKGDTVL VISGKDKGAK GKVLVAYPDR NKVLVEGVNR IKKHTAVSAN ERGASSGGIV TQEAPIHVSN VMVVDSDGKP TRVGYRIDD ETGKKVRIAK TNGKDI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #59: PHENYLALANINE

分子名称: PHENYLALANINE / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 1 / 式: PHE
分子量理論値: 165.189 Da
Chemical component information

ChemComp-PHE:
PHENYLALANINE / フェニルアラニン

+
分子 #60: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 1 / 式: GNP
分子量理論値: 522.196 Da
Chemical component information

ChemComp-GNP:
PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER / Gpp(NH)p / GppNHp, GMPPNP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

+
分子 #61: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 12 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #62: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 6 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.8
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY ARRAY / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 30 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
平均電子線量: 54.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
最大 デフォーカス（公称値）: 3.3000000000000003 µm
最小 デフォーカス（公称値）: 1.8 µm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

5o61

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 19431
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

5o61


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
精密化空間: REAL / プロトコル: FLEXIBLE FIT
得られたモデル

PDB-9k0z:
EF-G2 bound 70S ribosome complex of M. smegmatis

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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