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万見
- EMDB-61622: Structure of native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in ... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-61622
タイトルStructure of native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus
マップデータ
試料
  • 組織: Native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus
    • 複合体: NMDA receptor
      • タンパク質・ペプチド: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
      • タンパク質・ペプチド: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B
    • 複合体: Fab
      • 複合体: Fab 4F11
        • タンパク質・ペプチド: Heavy Chain of GluN1 Fab, 4F11
        • タンパク質・ペプチド: Light Chain of GluN1 Fab, 4F11
      • 複合体: Fab2
        • タンパク質・ペプチド: Heavy Chain of GluN2B Fab2
        • タンパク質・ペプチド: Light Chain of GluN2B Fab2
  • リガンド: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
  • リガンド: (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid
キーワードMEMBRANE PROTEIN / native NMDA receptor / adult rat cartex & hippocampus / GluN2A / GluN2B / MEMBRANE PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex
機能・相同性
機能・相同性情報


cellular response to curcumin / cellular response to corticosterone stimulus / cellular response to magnesium starvation / sensory organ development / pons maturation / positive regulation of Schwann cell migration / regulation of cell communication / sensitization / regulation of cAMP/PKA signal transduction / EPHB-mediated forward signaling ...cellular response to curcumin / cellular response to corticosterone stimulus / cellular response to magnesium starvation / sensory organ development / pons maturation / positive regulation of Schwann cell migration / regulation of cell communication / sensitization / regulation of cAMP/PKA signal transduction / EPHB-mediated forward signaling / auditory behavior / Assembly and cell surface presentation of NMDA receptors / olfactory learning / conditioned taste aversion / dendritic branch / response to hydrogen sulfide / regulation of respiratory gaseous exchange / response to other organism / positive regulation of inhibitory postsynaptic potential / protein localization to postsynaptic membrane / apical dendrite / regulation of ARF protein signal transduction / response to methylmercury / fear response / transmitter-gated monoatomic ion channel activity / response to glycine / propylene metabolic process / response to carbohydrate / cellular response to dsRNA / interleukin-1 receptor binding / negative regulation of dendritic spine maintenance / cellular response to lipid / positive regulation of glutamate secretion / response to growth hormone / Synaptic adhesion-like molecules / regulation of monoatomic cation transmembrane transport / NMDA glutamate receptor activity / RAF/MAP kinase cascade / voltage-gated monoatomic cation channel activity / response to manganese ion / neurotransmitter receptor complex / NMDA selective glutamate receptor complex / ligand-gated sodium channel activity / response to morphine / calcium ion transmembrane import into cytosol / glutamate binding / regulation of axonogenesis / neuromuscular process / regulation of dendrite morphogenesis / protein heterotetramerization / regulation of synapse assembly / male mating behavior / heterocyclic compound binding / glycine binding / positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process / receptor clustering / parallel fiber to Purkinje cell synapse / positive regulation of calcium ion transport into cytosol / suckling behavior / regulation of postsynaptic membrane potential / response to amine / small molecule binding / startle response / social behavior / monoatomic cation transmembrane transport / associative learning / : / behavioral response to pain / response to magnesium ion / regulation of MAPK cascade / regulation of neuronal synaptic plasticity / action potential / cellular response to glycine / extracellularly glutamate-gated ion channel activity / monoatomic cation transport / excitatory synapse / positive regulation of excitatory postsynaptic potential / positive regulation of dendritic spine maintenance / monoatomic ion channel complex / Unblocking of NMDA receptors, glutamate binding and activation / long-term memory / cellular response to manganese ion / behavioral fear response / postsynaptic density, intracellular component / glutamate receptor binding / neuron development / synaptic cleft / prepulse inhibition / multicellular organismal response to stress / detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain / phosphatase binding / response to electrical stimulus / monoatomic cation channel activity / glutamate-gated receptor activity / response to mechanical stimulus / calcium ion homeostasis / response to fungicide / D2 dopamine receptor binding / cell adhesion molecule binding / regulation of neuron apoptotic process
類似検索 - 分子機能
Glutamate [NMDA] receptor, epsilon subunit, C-terminal / N-methyl D-aspartate receptor 2B3 C-terminus / : / : / Ionotropic glutamate receptor, metazoa / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ionotropic glutamate receptor, L-glutamate and glycine-binding domain / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ligand-gated ion channel / : ...Glutamate [NMDA] receptor, epsilon subunit, C-terminal / N-methyl D-aspartate receptor 2B3 C-terminus / : / : / Ionotropic glutamate receptor, metazoa / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ionotropic glutamate receptor, L-glutamate and glycine-binding domain / Ligated ion channel L-glutamate- and glycine-binding site / Ligand-gated ion channel / : / Ionotropic glutamate receptor / Eukaryotic homologues of bacterial periplasmic substrate binding proteins. / Receptor, ligand binding region / Receptor family ligand binding region / Periplasmic binding protein-like I
類似検索 - ドメイン・相同性
Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1 / Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B
類似検索 - 構成要素
生物種Rattus norvegicus (ドブネズミ) / Mus musculus (ハツカネズミ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 5.4 Å
データ登録者Zhang M / Feng J / Li Y / Zhu S
資金援助 中国, 1件
OrganizationGrant number国
Chinese Academy of Sciences 中国
引用ジャーナル: Cell / 年: 2025
タイトル: Assembly and architecture of endogenous NMDA receptors in adult cerebral cortex and hippocampus.
著者: Ming Zhang / Juan Feng / Chun Xie / Nan Song / Chaozhi Jin / Jian Wang / Qun Zhao / Lihua Zhang / Boshuang Wang / Yidi Sun / Fei Guo / Yang Li / Shujia Zhu /
要旨: The cerebral cortex and hippocampus are crucial brain regions for learning and memory, which depend on activity-induced synaptic plasticity involving N-methyl-ᴅ-aspartate receptors (NMDARs). ...The cerebral cortex and hippocampus are crucial brain regions for learning and memory, which depend on activity-induced synaptic plasticity involving N-methyl-ᴅ-aspartate receptors (NMDARs). However, subunit assembly and molecular architecture of endogenous NMDARs (eNMDARs) in the brain remain elusive. Using conformation- and subunit-dependent antibodies, we purified eNMDARs from adult rat cerebral cortex and hippocampus. Three major subtypes of GluN1-N2A-N2B, GluN1-N2B, and GluN1-N2A eNMDARs were resolved by cryoelectron microscopy (cryo-EM) at the resolution up to 4.2 Å. The particle ratio of these three subtypes was 9:7:4, indicating that about half of GluN2A and GluN2B subunits are incorporated into the tri-heterotetramers. Structural analysis revealed the asymmetric architecture of the GluN1-N2A-N2B receptor throughout the extracellular to the transmembrane layers. Moreover, the conformational variations between GluN1-N2B and GluN1-N2A-N2B receptors revealed the distinct biophysical properties across different eNMDAR subtypes. Our findings imply the structural and functional complexity of eNMDARs and shed light on structure-based therapeutic design targeting these eNMDARs in vivo.
履歴
登録2024年9月23日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年2月5日-
マップ公開2025年2月5日-
更新2025年3月19日-
現状2025年3月19日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_61622.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_61622.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

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コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.07 Å/pix.
x 320 pix.
= 342.72 Å		1.07 Å/pix.
x 320 pix.
= 342.72 Å		1.07 Å/pix.
x 320 pix.
= 342.72 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

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ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.071 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.052
最小 - 最大-0.2295606 - 0.36516988
平均 (標準偏差)0.0010037747 (±0.013296957)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 342.72 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_61622_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_61622_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_61622_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex an...

全体名称: Native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus
要素
  • 組織: Native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus
    • 複合体: NMDA receptor
      • タンパク質・ペプチド: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1
      • タンパク質・ペプチド: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B
    • 複合体: Fab
      • 複合体: Fab 4F11
        • タンパク質・ペプチド: Heavy Chain of GluN1 Fab, 4F11
        • タンパク質・ペプチド: Light Chain of GluN1 Fab, 4F11
      • 複合体: Fab2
        • タンパク質・ペプチド: Heavy Chain of GluN2B Fab2
        • タンパク質・ペプチド: Light Chain of GluN2B Fab2
  • リガンド: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
  • リガンド: (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid

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超分子 #1: Native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex an...

超分子名称: Native di-heteromeric GluN1-GluN2B NMDA receptor in rat cortex and hippocampus
タイプ: tissue / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#6

+
超分子 #2: NMDA receptor

超分子名称: NMDA receptor / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#2
由来(天然)生物種: Rattus norvegicus (ドブネズミ)

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超分子 #3: Fab 4F11

超分子名称: Fab 4F11 / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 5 / 含まれる分子: #3-#4

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超分子 #4: Fab2

超分子名称: Fab2 / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 5 / 含まれる分子: #5-#6

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超分子 #5: Fab

超分子名称: Fab / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #3-#6
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)

+
分子 #1: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1

分子名称: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rattus norvegicus (ドブネズミ)
分子量理論値: 91.996172 KDa
配列文字列: KIVNIGAVLS TRKHEQMFRE AVNQANKRHG SWKIQLNATS VTHKPNAIQM ALSVCEDLIS SQVYAILVSH PPTPNDHFTP TPVSYTAGF YRIPVLGLTT RMSIYSDKSI HLSFLRTVPP YSHQSSVWFE MMRVYNWNHI ILLVSDDHEG RAAQKRLETL L EERESKAE ...文字列:
KIVNIGAVLS TRKHEQMFRE AVNQANKRHG SWKIQLNATS VTHKPNAIQM ALSVCEDLIS SQVYAILVSH PPTPNDHFTP TPVSYTAGF YRIPVLGLTT RMSIYSDKSI HLSFLRTVPP YSHQSSVWFE MMRVYNWNHI ILLVSDDHEG RAAQKRLETL L EERESKAE KVLQFDPGTK NVTALLMEAR ELEARVIILS ASEDDAATVY RAAAMLNMTG SGYVWLVGER EISGNALRYA PD GIIGLQL INGKNESAHI SDAVGVVAQA VHELLEKENI TDPPRGCVGN TNIWKTGPLF KRVLMSSKYA DGVTGRVEFN EDG DRKFAN YSIMNLQNRK LVQVGIYNGT HVIPNDRKII WPGGETEKPR GYQMSTRLKI VTIHQEPFVY VKPTMSDGTC KEEF TVNGD PVKKVICTGP NDTSPGSPRH TVPQCCYGFC IDLLIKLART MNFTYEVHLV ADGKFGTQER VNNSNKKEWN GMMGE LLSG QADMIVAPLT INNERAQYIE FSKPFKYQGL TILVKKEIPR STLDSFMQPF QSTLWLLVGL SVHVVAVMLY LLDRFS PFG RFKVNSEEEE EDALTLSSAM WFSWGVLLNS GIGEGAPRSF SARILGMVWA GFAMIIVASY TANLAAFLVL DRPEERI TG INDPRLRNPS DKFIYATVKQ SSVDIYFRRQ VELSTMYRHM EKHNYESAAE AIQAVRDNKL HAFIWDSAVL EFEASQKC D LVTTGELFFR SGFGIGMRKD SPWKQNVSLS ILKSHENGFM EDLDKTWVRY QECDSRSNAP ATLTFENMAG VFMLVAGGI VAGIFLIFIE IAYKRHK

UniProtKB: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1

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分子 #2: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B

分子名称: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Rattus norvegicus (ドブネズミ)
分子量理論値: 91.182109 KDa
配列文字列: IGIAVILVGT SDEVAIKDAH EKDDFHHLSV VPRVELVAMN ETDPKSIITR ICDLMSDRKI QGVVFADDTD QEAIAQILDF ISAQTLTPI LGIHGGSSMI MADKDESSMF FQFGPSIEQQ ASVMLNIMEE YDWYIFSIVT TYFPGYQDFV NKIRSTIENS F VGWELEEV ...文字列:
IGIAVILVGT SDEVAIKDAH EKDDFHHLSV VPRVELVAMN ETDPKSIITR ICDLMSDRKI QGVVFADDTD QEAIAQILDF ISAQTLTPI LGIHGGSSMI MADKDESSMF FQFGPSIEQQ ASVMLNIMEE YDWYIFSIVT TYFPGYQDFV NKIRSTIENS F VGWELEEV LLLDMSLDDG DSKIQNQLKK LQSPIILLYC TKEEATYIFE VANSVGLTGY GYTWIVPSLV AGDTDTVPSE FP TGLISVS YDEWDYGLPA RVRDGIAIIT TAASDMLSEH SFIPEPKSSC YNTHEKRIYQ SNMLNRYLIN VTFEGRNLSF SED GYQMHP KLVIILLNKE RKWERVGKWK DKSLQMKYYV WPRMCPETEE QEDDHLSIVT LEEAPFVIVE SVDPLSGTCM RNTV PCQKR IISENKTDEE PGYIKKCCKG FCIDILKKIS KSVKFTYDLY LVTNGKHGKK INGTWNGMIG EVVMKRAYMA VGSLT INEE RSEVVDFSVP FIETGISVMV SRSNGTVSPS AFLEPFSADV WVMMFVMLLI VSAVAVFVFE YFSPVGYNRC LADGRE PGG PSFTIGKAIW LLWGLVFNNS VPVQNPKGTT SKIMVSVWAF FAVIFLASYT ANLAAFMIQE EYVDQVSGLS DKKFQRP ND FSPPFRFGTV PNGSTERNIR NNYAEMHAYM GKFNQRGVDD ALLSLKTGKL DAFIYDAAVL NYMAGRDEGC KLVTIGSG K VFASTGYGIA IQKDSGWKRQ VDLAILQLFG DGEMEELEAL WLTGICHNEK NEVMSSQLDI DNMAGVFYML GAAMALSLI TFICEHLFYW Q

UniProtKB: Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B

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分子 #3: Heavy Chain of GluN1 Fab, 4F11

分子名称: Heavy Chain of GluN1 Fab, 4F11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 13.306682 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
DVQLQESGPG LVKPSQSLSL TCTVTGYSIT SDYAWNWIRQ FPGNKLEWMG YISYSGSTGY NPSLKSRISI TRDTSKNQFF LQLNSVTTE DTATYYCARL YYGFYGMDYW GQGTSVTVS

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分子 #4: Light Chain of GluN1 Fab, 4F11

分子名称: Light Chain of GluN1 Fab, 4F11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 11.78395 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
IVLTQSPASL AVSLGQRATI SCKASQSVDY DGNSYMNWYQ QKPGQPPKLL IYAASNLESG IPARFSGSGS GTDFTLNIHP VEEEDAATY YCQQGNEDPP TFGGGTKLEI K

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分子 #5: Heavy Chain of GluN2B Fab2

分子名称: Heavy Chain of GluN2B Fab2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 12.994521 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
VKLQESGGGL VQPGGSLKLS CAASGFTFSS YTMSWVRQTP EKRLEWVAYI SNGGGGTYYP DTVKGRFTIS RDNAKNTLYL QMNSLKEDT AMYYCARPSR GGSSYWYFDV WGAGTTVTV

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分子 #6: Light Chain of GluN2B Fab2

分子名称: Light Chain of GluN2B Fab2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Mus musculus (ハツカネズミ)
分子量理論値: 11.659048 KDa
組換発現生物種: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ)
配列文字列:
DIQMTQSPSS LSASLGGKVT ITCKASQDIN KYIAWYQHKP GKGPRLLIHY TSSLQPGIPS RFSGSGSGRD YSFSISNLEP EDIATYYCL QYDNLYTFGG GTKLEIK

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分子 #9: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

分子名称: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / タイプ: ligand / ID: 9 / コピー数: 14 / 式: NAG
分子量理論値: 221.208 Da
Chemical component information

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

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分子 #10: (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid

分子名称: (2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid
タイプ: ligand / ID: 10 / コピー数: 2 / 式: 7RC
分子量理論値: 252.205 Da
Chemical component information

ChemComp-7RC:
(2R)-4-(3-phosphonopropyl)piperazine-2-carboxylic acid / (-)-CPP

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態tissue

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試料調製

緩衝液pH: 8
凍結凍結剤: ETHANE

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TALOS ARCTICA
撮影フィルム・検出器のモデル: DIRECT ELECTRON DE-10 (5k x 4k)
平均電子線量: 60.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 2.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.0 µm
実験機器
モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: OTHER
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 5.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 36786
初期 角度割当タイプ: OTHER
最終 角度割当タイプ: OTHER
FSC曲線 (解像度の算出)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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