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- EMDB-51527: NDH-PSI-LHCI supercomplex from S. oleracea: composite map -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-51527
タイトルNDH-PSI-LHCI supercomplex from S. oleracea: composite map
マップデータComposite map
試料
  • 複合体: NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea
    • タンパク質・ペプチド: x 42種
  • リガンド: x 13種
キーワードNDH / PSI / Supercomplex / photosynthesis / electron transport chain / lipids / proton translocation / plastoquinone / ELECTRON TRANSPORT
機能・相同性
機能・相同性情報


glucose-6-phosphate 1-epimerase activity / NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone) / P450-containing electron transport chain / photosynthesis, light harvesting in photosystem I / トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う / thylakoid / NADH dehydrogenase complex / chloroplast thylakoid lumen / photosystem II oxygen evolving complex / photosystem I reaction center ...glucose-6-phosphate 1-epimerase activity / NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone) / P450-containing electron transport chain / photosynthesis, light harvesting in photosystem I / トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う / thylakoid / NADH dehydrogenase complex / chloroplast thylakoid lumen / photosystem II oxygen evolving complex / photosystem I reaction center / photosystem I / photosynthetic electron transport in photosystem I / photosynthetic electron transport chain / photosystem I / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor / photosystem II / extrinsic component of membrane / cyclosporin A binding / chlorophyll binding / photosynthesis, light reaction / chloroplast thylakoid membrane / ubiquinone binding / : / electron transport coupled proton transport / NADH dehydrogenase activity / response to light stimulus / respiratory chain complex I / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / photosynthesis / aerobic respiration / peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity / chloroplast / peptidylprolyl isomerase / phosphoprotein binding / electron transport chain / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / protein folding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / carbohydrate binding / molecular adaptor activity / response to oxidative stress / carbohydrate metabolic process / electron transfer activity / oxidoreductase activity / iron ion binding / calcium ion binding / magnesium ion binding / metal ion binding / membrane / plasma membrane / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 4-like / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic / : / PsbP, C-terminal / PsbP / : / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chloroplast chain 5, C-terminal ...NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 4-like / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic / : / PsbP, C-terminal / PsbP / : / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chloroplast chain 5, C-terminal / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O / NADH-dehyrogenase subunit F, TMs, (complex I) C-terminus / Cyanobacterial and plant NDH-1 subunit O / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N / NADH-quinone oxidoreductase chain 4 / Cyanobacterial and plastid NDH-1 subunit M / NADH dehydrogenase transmembrane subunit / NADH-quinone oxidoreductase cyanobacterial subunit N / NADH-plastoquinone oxidoreductase, subunit I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2, N-terminal / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 N-terminal / Mog1/PsbP, alpha/beta/alpha sandwich / Oxygen-evolving enhancer protein 3 / Oxygen evolving enhancer protein 3 / PsbQ-like domain superfamily / Photosystem I PsaH, reaction centre subunit VI / Photosystem I reaction centre subunit VI / Photosystem I reaction center subunit V / 4Fe-4S dicluster domain / Photosystem I reaction center subunit psaK, plant / Adrenodoxin / Photosystem I reaction center subunit V/PsaK, plant / Photosystem I PsaG/PsaK domain, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, bacterial/plastid / NAD(P)H-quinone oxidoreductase, subunit N/subunit 2 / Photosystem I reaction centre subunit PsaK superfamily / Photosystem I psaG and psaK proteins signature. / Photosystem I reaction center subunit V/PsaK / Photosystem I psaG / psaK / Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI / Photosystem I, reaction centre subunit XI / Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily / Photosystem I reaction centre subunit XI / Photosystem I reaction centre subunit VIII / Photosystem I reaction centre subunit VIII / Photosystem I reaction centre subunit VIII superfamily / Photosystem I PsaF, reaction centre subunit III / Photosystem I PsaF, reaction centre subunit III superfamily / Photosystem I reaction centre subunit III / Photosystem I PsaD / Photosystem I, reaction centre subunit PsaD superfamily / PsaD / Photosystem I PsaE, reaction centre subunit IV / Photosystem I PsaJ, reaction centre subunit IX superfamily / Photosystem I reaction centre subunit IV / PsaE / Chlorophyll A-B binding protein, plant and chromista / Photosystem I PsaJ, reaction centre subunit IX / Photosystem I reaction centre subunit IX / PsaJ / Chlorophyll A-B binding protein / Chlorophyll A-B binding protein / Photosystem I protein PsaC / Photosystem I PsaB / Photosystem I PsaA / Photosystem I PsaA/PsaB, conserved site / Photosystem I psaA and psaB proteins signature. / : / Photosystem I PsaA/PsaB / Photosystem I PsaA/PsaB superfamily / Photosystem I psaA/psaB protein / Electron transport accessory-like domain superfamily / Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding / Chaperone J-domain superfamily / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / Galactose mutarotase-like domain superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / NADH dehydrogenase, subunit C / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, conserved site / Cyclophilin-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase signature. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature.
類似検索 - ドメイン・相同性
Photosystem I reaction center subunit IX / Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 2, chloroplastic / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic / peptidylprolyl isomerase / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic ...Photosystem I reaction center subunit IX / Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 2, chloroplastic / Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic / peptidylprolyl isomerase / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic / Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 1, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic / Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic / Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 / Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic / Photosystem I iron-sulfur center / Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit VIII / Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic / Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
類似検索 - 構成要素
生物種Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.19 Å
データ登録者Introini B / Hahn A / Kuehlbrandt W
資金援助 ドイツ, 1件
OrganizationGrant number国
Other private ドイツ
引用ジャーナル: Nat Struct Mol Biol / 年: 2025
タイトル: Cryo-EM structure of the NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea.
著者: Bianca Introini / Alexander Hahn / Werner Kühlbrandt /
要旨: The nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) dehydrogenase (NDH) complex is crucial for photosynthetic cyclic electron flow and respiration, transferring electrons from ferredoxin to ...The nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) dehydrogenase (NDH) complex is crucial for photosynthetic cyclic electron flow and respiration, transferring electrons from ferredoxin to plastoquinone while transporting H across the chloroplast membrane. This process boosts adenosine triphosphate production, regardless of NADPH levels. In flowering plants, NDH forms a supercomplex with photosystem I, enhancing its stability under high light. We report the cryo-electron microscopy structure of the NDH supercomplex in Spinacia oleracea at a resolution of 3.0-3.3 Å. The supercomplex consists of 41 protein subunits, 154 chlorophylls and 38 carotenoids. Subunit interactions are reinforced by 46 distinct lipids. The structure of NDH resembles that of mitochondrial complex I closely, including the quinol-binding site and an extensive internal aqueous passage for proton translocation. A well-resolved catalytic plastoquinone (PQ) occupies the PQ channel. The pronounced structural similarity to complex I sheds light on electron transfer and proton translocation within the NDH supercomplex.
履歴
登録2024年9月13日-
ヘッダ(付随情報) 公開2025年2月12日-
マップ公開2025年2月12日-
更新2025年6月25日-
現状2025年6月25日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_51527.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_51527.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 512 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite map
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.84 Å/pix.
x 512 pix.
= 428.544 Å		0.84 Å/pix.
x 512 pix.
= 428.544 Å		0.84 Å/pix.
x 512 pix.
= 428.544 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.837 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.3
最小 - 最大-0.38743252 - 3.7443235
平均 (標準偏差)0.043397125 (±0.08007511)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ512512512
Spacing512512512
セルA=B=C: 428.544 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea

全体名称: NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea
要素
  • 複合体: NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 1, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 2, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: peptidylprolyl isomerase
    • タンパク質・ペプチド: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I iron-sulfur center
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit VIII
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit IX
    • タンパク質・ペプチド: PSI-K
    • タンパク質・ペプチド: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
    • タンパク質・ペプチド: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
  • リガンド: BETA-CAROTENE
  • リガンド: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
  • リガンド: 4-trans-(4-trans-Propylcyclohexyl)-cyclohexyl alpha-maltoside
  • リガンド: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
  • リガンド: 5-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E)-3,7,11,15,19,23,27-HEPTAMETHYLOCTACOSA-2,6,10,14,18,22,26-HEPTAENYL]-2,3-DIMETHYLBENZO-1,4-QUINONE
  • リガンド: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: CHLOROPHYLL A
  • リガンド: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
  • リガンド: CHLOROPHYLL A ISOMER
  • リガンド: PHYLLOQUINONE
  • リガンド: CHLOROPHYLL B
  • リガンド: (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL

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超分子 #1: NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea

超分子名称: NDH-PSI-LHCI supercomplex from Spinacia oleracea / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#42
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)

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分子 #1: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 1, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 1, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 18.606793 KDa
配列文字列:
KETPERYTAF VDKADGYSYV YPSDWREFDF RAHDSAFKDR YLQLQNVRLS FIPTDKNDVH DLGPMEDVIQ TLVKNILAAP NQMTDIREI QERSVDGKNY WTFEYNLTSP NFSVTHFTTL AIANGRYYTL TVSANERRWK RYRNKLKVVA DSFKVFEI

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 1, chloroplastic

+
分子 #2: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 44.622605 KDa
配列文字列: NPWLDLFYDG EDEPETEYGS MFSDGKQDED PYPRDNPENP YGFLKFPQGY AVEMASLGSK VRGDVRRCCC VVSGGVYDNL LFFPAIQLI KDRYPGVQID IITSARGKQT YEMNKNVRWA TVYDLDDNFP DPAEYTDMLG LLKNRYYDMV LSTKLAGLGH A AFLFMTTA ...文字列:
NPWLDLFYDG EDEPETEYGS MFSDGKQDED PYPRDNPENP YGFLKFPQGY AVEMASLGSK VRGDVRRCCC VVSGGVYDNL LFFPAIQLI KDRYPGVQID IITSARGKQT YEMNKNVRWA TVYDLDDNFP DPAEYTDMLG LLKNRYYDMV LSTKLAGLGH A AFLFMTTA RDRVSYVYPN VNAAGAGLLL SETFTPDSMN LSEGGYNMYH QMIEWLGRPV KDIPQHLASP LKVSISRKLK EA VEAKYKE AGAEKGKYVV IHGIKCDSKA SMQSEGDTDS LLPIEIWAEI SQAIRGVTPI FVIPHEKLRE DVEEIVGEET SIV FITTPG QLAALINDSV GVIATNTAAI QLALAREKPS IALFCSEEKG KCFVPDAEGK KCTVIASKTG NLADIDVAVV KDTL KVF

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 1, chloroplastic

+
分子 #3: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 40.259473 KDa
配列文字列: MASLLPFSLL KPTTICKASS TAAPPAALVE SLNDQFARKG INFLESTDTS TNISSPIVEL SVRNGSSLKL QLSNAHVTSY KPKVYWKDD GFEEVLYTLP LSKGGIGLVL NDVTQPVTTT KKPDPFRRSE PAAAAAAKGS LLAGAEWSVR DVDSDSFDAV Q VELSCTSG ...文字列:
MASLLPFSLL KPTTICKASS TAAPPAALVE SLNDQFARKG INFLESTDTS TNISSPIVEL SVRNGSSLKL QLSNAHVTSY KPKVYWKDD GFEEVLYTLP LSKGGIGLVL NDVTQPVTTT KKPDPFRRSE PAAAAAAKGS LLAGAEWSVR DVDSDSFDAV Q VELSCTSG SLEITYVVSL YPESMASAVL VKNNGNKAIG LTSAILSHIQ FKKRSGSGIQ GLQGCSYCSH PPLSSPFEIV SP AEAMKAE DPGMFSFSSE SPSKLGEWTT QEVPITILKN KLSRVYTAPP SERSKKFYRT TPSKYETVDQ GRELVFRVIR MGY DDILVS SPGSLSEKYG RDYFICTGPA SILVPVTVNP GEEWRGAQVI EHDNLT

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 2, chloroplastic

+
分子 #4: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 15.61484 KDa
配列文字列:
EEEELEPPYV GFAFVSSVLL PDGTPDMHLR SATGGQKLRD IMLDNDIDLY GPYARPLLNC AGGGTCASCM VEVIEGKELL NPRTEKEKE HLKKKPKNWR LACQITVGTP ESRGMVVIQQ LPEWKAHEWK YEKDGPIVSE

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 3, chloroplastic

+
分子 #5: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 10.763025 KDa
配列文字列:
MAVLVEHVEG QRDLITHKSI WHLSDAAIKN VYLFYMMFTC WGCCVFGAAK DPYYDSEQYR GDGGDGTGHW VYEKQEDIEE AGRAALWRE ELIE

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic

+
分子 #6: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 17.77267 KDa
配列文字列:
GLTDIEPDLN EDPRDRWATN GVAPEDFVYG KYDEHHTFYE SSEKGSFWGA VAEEYNSMDP PTGFQGLISW LFLPAVAAGM YFNVPGDYL FIGAGLFVII FCIIEMDKPD QPHNFEPQIY NMERGARDKL IADYNTMDIW DFNEKYGDLW DFTLK

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 5, chloroplastic

+
分子 #7: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 2, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 2, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 14.875953 KDa
配列文字列:
EFKWGTRSFI WERFFEPGLS PEDAVSRIKN TAEGLHSLRH MLETMSWRYV IFYIRLKQAY LKQDMKSAMI MVPEGRRDDY SNAANELVD NMAEFDYYVR TPKVYESYVS YEKTLKSIDN LLGFLA

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 2, chloroplastic

+
分子 #8: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic

分子名称: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 16.451979 KDa
配列文字列:
QLWLDGPLPG LRPAENKIGN EETGTRTFLK KGIYMANIGT KGSALRLRKY AFDLLAMEDL IGQDTLNYVR RYLRFKGTFM YYDFDKVIS AAPVADKPPL TNLANRLFDN FEKLQEAVKL KDVPLTRSCY DDTAVTLQEV MNRMA

UniProtKB: Photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic

+
分子 #9: peptidylprolyl isomerase

分子名称: peptidylprolyl isomerase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: peptidylprolyl isomerase
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 15.352496 KDa
配列文字列:
LRVEYYATTA EPSCELNLVR SGLGYCDLVV GSGVPAPYNT LINVHYTARF SDETVFDSSY KRGRPLTMRI GVGKVIKGLD QGIFGGDGV PPMQVGGKRK LRIPPHLGYG PEPAGCFSGD CNVPANATLL YDVTFMGVYS GNRA

UniProtKB: peptidylprolyl isomerase

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分子 #10: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

分子名称: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: peptidylprolyl isomerase
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 18.900408 KDa
配列文字列:
PLQSKVTNKV YFDISIGNPV GKLVGRVVIG LFGDDVPQTA ENFRALCTGE KGFGYKGSAF HRVIKDFMIQ GGDFDKGNGT GGKSIYGRT FKDENFNLTH TGPGTVSMAN AGPNTNGSQF FICTVKTPWL DNRHVVFGQV LEGMDIVKLI ESSETDRGDR P KKRVVISE CGELPA

UniProtKB: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase

+
分子 #11: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 38.985613 KDa
配列文字列: FSRLEFLKEV YETIWMLFPI LILVLGITIG VLVIVWLERE ISASIQQRIG PEYAGPLGIL QALADGTKLL FKENLLPSRG DTYLFSIGP SIAVISILLG YLIIPFGSRL VLADLSIGVF LWIAVSSIAP IGLLMSGYGS NNKYSFLGGL RAAAQSISYE I PLTLCVLS ...文字列:
FSRLEFLKEV YETIWMLFPI LILVLGITIG VLVIVWLERE ISASIQQRIG PEYAGPLGIL QALADGTKLL FKENLLPSRG DTYLFSIGP SIAVISILLG YLIIPFGSRL VLADLSIGVF LWIAVSSIAP IGLLMSGYGS NNKYSFLGGL RAAAQSISYE I PLTLCVLS ISLLSNSSST VDIVEAQSKY GFWGWNLWRQ PIGFIVFIIS SLAECERLPF DLPEAEEELV AGYQTEYSGI KF GLFYVAS YLNLLISSLF VTVLYLGGWN LSIPYIFISE FFEINKIDGV FGTTIGIFIT LAKTFLFLFI PITTRWTLPR LRM DQLLNL GWKFLLPISL GNLLLTTSSQ LFSL

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic

+
分子 #12: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 54.026148 KDa
配列文字列: KAFHLLLFDG SLIFPECILI FGLILLLMID STSDQKDIPW LYFISSTSLV MSITALLFRW REEPMISFSG NFQTNNFNEI FQFLILLCS TLCIPLSVEY IECTEMALTE FLLFILTATL GGMFLCGAND LITIFVAPEC FSLCSYLLSG YTKKDVRSNE A TTKYLLMG ...文字列:
KAFHLLLFDG SLIFPECILI FGLILLLMID STSDQKDIPW LYFISSTSLV MSITALLFRW REEPMISFSG NFQTNNFNEI FQFLILLCS TLCIPLSVEY IECTEMALTE FLLFILTATL GGMFLCGAND LITIFVAPEC FSLCSYLLSG YTKKDVRSNE A TTKYLLMG GASSSILVHG FSWLYGSSGG EIELQEIVNG LINTQMYNSP GISIALIFIT VGIGFKLSPA PSHQWTPDVY EG SPTPVVA FLSVTSKVAA SASATRIFDI PFYFSSNEWH LLLEILAILS MILGNLIAIT QTSMKRMLAY SSIGQIGYVI IGI IVGDSN DGYASMITYM LFYISMNLGT FACIVLFGLR TGTDNIRDYA GLYTKDPFLA LSLALCLLSL GGLPPLAGFF GKIY LFWCG WQAGLYFLVL IGLLTSVLSI YYYLKIIKLL MTGRNQEITP HVRNYRRSPL RSKNSIEFSM IVCVIASTIP GISMN PIIT IAQD

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2 A, chloroplastic

+
分子 #13: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 13.270651 KDa
配列文字列:
YEYDIFWAFL IISSVIPILA FLFSGILAPI SKGPEKLSSY ESGIEPMGDA WLQFRIRYYM FALVFVVFDV ETVFLYPWAM SFDILGVSV FIEALIFVLI LIVGLVYAWR KGALEW

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 3, chloroplastic

+
分子 #14: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 55.980191 KDa
配列文字列: SFPWLTTIVV LPIFAGSLIF LFPHRGNKVI RWYTICISMI ELLLMTYVFF YHFQPDDPLI QLVEDYKWIN FFDFHWRLGI DGLSIGPIL LTGFITTLAT LAAWPVTRNS QLFHFLMLAM YSAQIGLFSS RDLLLFFIMW ELELIPVYLL LSMWGGKKRL Y SATKFILY ...文字列:
SFPWLTTIVV LPIFAGSLIF LFPHRGNKVI RWYTICISMI ELLLMTYVFF YHFQPDDPLI QLVEDYKWIN FFDFHWRLGI DGLSIGPIL LTGFITTLAT LAAWPVTRNS QLFHFLMLAM YSAQIGLFSS RDLLLFFIMW ELELIPVYLL LSMWGGKKRL Y SATKFILY TAGGSIFLLM GVLGVGLYGS NEPTLNLETL VNQSYPVALE IIFYIGFFIA FAVKLPIIPL HTWLPDTHGE AH YSTCMLL AGILLKMGAY GLVRINMELL PHAHSIFSPW LMIIGTMQII YAASTSPGQR NLKKRIAYSS VSHMGFIIIG ISS ITDTGL NGAILQIISH GFIGAALFFL AGTSYDRIRL VYLDEMGGIA IPMPKIFTLF SSFSMASLAL PGMSGFIAEL IVFF GLITS QKYLLIPKLL ITFGMAIGMI LTPIYLLSMS RQMFYGYKLF NISNSSFFDS GPRELFVSTS IFLPVIGIGV YPDLV LSLS VEKVEAILSN YFYR

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase chain 4, chloroplastic

+
分子 #15: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 11.085047 KDa
配列文字列:
MILEHVLVLS AFLFSIGIYG LVTSRNLVRA LMCLELILNA VNLNFVTFSD FFDSRQLKGN IFSIFVIAIA AAEAAIGPAI VSSIYRNRK SIRINQSNLL N

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 4L, chloroplastic

+
分子 #16: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 84.590094 KDa
配列文字列: MEHIYQYAWI IPFLPLPVPL LIGAGLLFFP TATKNLRRIW AFSSISLLSI VMIFSMKLAI QQINSNSIYQ YLWSWTINND FSLEFGYLM DPLTSIMSML ITTVAILVLI YSDNYMSHDQ GYLRFFAYMS FFNTSMLGLV TSSNLIQIYI FWELVGMCSY L LIGFWFTR ...文字列:
MEHIYQYAWI IPFLPLPVPL LIGAGLLFFP TATKNLRRIW AFSSISLLSI VMIFSMKLAI QQINSNSIYQ YLWSWTINND FSLEFGYLM DPLTSIMSML ITTVAILVLI YSDNYMSHDQ GYLRFFAYMS FFNTSMLGLV TSSNLIQIYI FWELVGMCSY L LIGFWFTR PIAANACQKA FVTNRVGDFG LLLGILGLYW ITGSFEFRDL FEIFNNLIKN NEVNSLFCIL CAFLLFAGAV AK SAQFPLH VWLPDAMEGP TPISALIHAA TMVAAGIFLV ARLLPLFVVI PYIMYVISFI GIITVLLGAT LALAQKDIKR SLA YYTMSQ LGYMMLALGM GSYRTALFHL ITHAYSKALL FLASGSLIHS MGTIVGYSPD KSQNMVLMGG LTKHVPITKT SFLI GTLSL CGIPPLACFW SKDEILNDSW VYSPIFAIIA YFTAGLTAFY MFRIYLLTFE GHLNFFCKNY SGKKSSSFYS ISLWG KKEL KTINQKISLL NLLTMNNKER ASFFSKKPYE INVKLTKLLR SFITITYFEN KNISLYPYES DNTMLFPLII LIMFTL FVG FIGIPFNQEG MDLDILTKWL TPSINLLHSN SENFVDWYEF VINAIFSISI AFFGIFIAFF FYKPIYSSLK NFDLINS FD KRGQKRILGD NIITIIYNWS ANRGYIDAFY STFLIKGIRS LSELVSFFDR RIIDGIPNGF GVTSFFVGEG IKYVGGGR I SSYLFWYLLY VSIFLFIFTF T

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 5, chloroplastic

+
分子 #17: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 19.193654 KDa
配列文字列:
MDLPGPIHDF LLVFLGSGLI LGALGVVLFT NPIFSAFSLG LVLVCISLFY ILANSHFVAS AQLLIYVGAI NVLIIFSVMF MSGPEYDKK FQLWTVGDGV TSLVCISLFV SLISTILNTS WYGIIWTTKS NQILEQDLIN ASQQIGIHLS TDFFLPFELI S IILLVSLI GAIAVARQ

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 6, chloroplastic

+
分子 #18: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 45.172309 KDa
配列文字列: TTRKDLMIVN MGPHHPSMHG VLRLIVTLDG EDVIDCEPIV GYLHRGMEKI AENRTIIQYL PYVTRWDYLA TMFTEAITVN GPEQLGNIQ VPKRASYIRV IMLELSRIAS HLLWLGPFMA DIGAQTPFFY ILRERELIYD LFEAATGMRM MHNYFRIGGV A ADLPYGWI ...文字列:
TTRKDLMIVN MGPHHPSMHG VLRLIVTLDG EDVIDCEPIV GYLHRGMEKI AENRTIIQYL PYVTRWDYLA TMFTEAITVN GPEQLGNIQ VPKRASYIRV IMLELSRIAS HLLWLGPFMA DIGAQTPFFY ILRERELIYD LFEAATGMRM MHNYFRIGGV A ADLPYGWI DKCLDFCDYF LIGLTEYQKL ITRNPIFLER VENVGIIGGE EAINWGLSGP MLRASGIQWD LRKVDHYECY DE FDWEVQW QKEGDSLARY LIRIGEMAES VKIIQQALEG IPGGPYENLE IRRFNRIKYP EWNDFEYRFI SKKPSPAFEL SKQ ELYVRV EAPKGELGIF LIGDQSVFPW RWKIRPPGFI NLQILPQLVK KMKLADIMTI LGSIDIIMGE VDR

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H, chloroplastic

+
分子 #19: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 19.004875 KDa
配列文字列:
MVTGFINYGQ QTIRAARYIG QSFMITLSHA NRLPVTIQYP YEKLITSERF RGRIHFEFDK CIACEVCVRA CPIDLPVVDW KLETDIRKK RLLNYSIDFG ICIFCGNCVE YCPTNCLSMT EEYELSTYDR HELNYNQIAL GRLPISITDD YTIRTILNSP Q TKE

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit I, chloroplastic

+
分子 #20: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 18.687322 KDa
配列文字列:
MQGRLSAWLV KHGLVHRSLG FDYQGIETLQ IKPEDWHSIA VILYVYGYNY LRSQCAYDVA PGGLLASVYH LTRIEYGVDQ PEEVCIKVF APRRNPRIPS VFWVWKSADF QERESYDMFG ISYDNHPRLK RILMPESWIG WPLRKDYIVP NFYEIQDAY

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit J, chloroplastic

+
分子 #21: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: トランスロカーゼ; ヒドロンの輸送の触媒; 酸化還元酵素反応を伴う
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 22.789359 KDa
配列文字列: MNSIEFPLLD QIAQNSVIST TSNDLSNWSR LSSLWPLLYG TSCCFIEFAS LIGSRFDFDR YGLVPRASPR QADLILTAGT VTMKMAPSL LRLYEQMPEP KYVIAMGACT ITGGMFSTDS YSTVRGVDKL IPVDVYLPGC PPKPEAVIDA ITKLRKKISR E IYEDRIKS ...文字列:
MNSIEFPLLD QIAQNSVIST TSNDLSNWSR LSSLWPLLYG TSCCFIEFAS LIGSRFDFDR YGLVPRASPR QADLILTAGT VTMKMAPSL LRLYEQMPEP KYVIAMGACT ITGGMFSTDS YSTVRGVDKL IPVDVYLPGC PPKPEAVIDA ITKLRKKISR E IYEDRIKS QPKNRCFTIN HKFRVGRSIH TGNYDQALLY KYKS

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit K, chloroplastic

+
分子 #22: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 13.194599 KDa
配列文字列:
AVTGVNNQED LIWVLLKAGV VGFCYFLIMP PIIMNWLRIR WYRRNLLEMY FQFMFVFIFF PGILVWAPFL NFRKFPRDPT MKYPWSKPE NPSEVKGGFL KYPWATIEDY

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit L, chloroplastic

+
分子 #23: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 16.702113 KDa
配列文字列:
EMKEVLKRAT PIEAQVNVKS RNLEREYGGQ WLSSVTRHVR IYAAYIDPVT CAMDQTQMDK LTLMIDPTDE FLWNDETLNK VYVYFEELV DHYEGAPLTE YTLRLIGSDI EHYIRKMLYE GEIKYNMNSR VLNFSMGKPR MK

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit M, chloroplastic

+
分子 #24: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 18.727768 KDa
配列文字列:
IGIRDFIGGD LVKFDLGTWL SDVEEHKAIA MYSPHEGGYE GRYLNRLRYQ GYHFLDVSAR GLGDPETTLT KVHPVCPPHV GKQPIARWW FPPEVDYRLE ALPSDAKGLV VWVIEAKVLS KAELQFLAML PSLRPKVRVI AECGNWRKVM WKPLKEIAGL V PLQEA

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit N, chloroplastic

+
分子 #25: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 11.127798 KDa
配列文字列:
PPPKKPPKPV YSMKKGQIVR VEREKYLDSV NYLSVGHPKY YKGLDYIYED RGEVLDLRFF ETGEYALVSW VGIPTSPAWL PTDMLIKSD KLNYER

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit O, chloroplastic

+
分子 #26: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic

分子名称: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 27.127314 KDa
配列文字列: MAVSSTCMPH RELMPTLVKS TNTSTLFWLN NNTNNNVNVN VITTNNYVTL TRKAPCSRFL ARSTEDASEM TATSTDQSWE GEGENSPME MPKGPPSIIS ALNVEKALRG IGITDVDHYA RLGLRRGCTY DQVGAAYEIQ VKELSSQGMD EEQFNKERDL L KESYNILS ...文字列:
MAVSSTCMPH RELMPTLVKS TNTSTLFWLN NNTNNNVNVN VITTNNYVTL TRKAPCSRFL ARSTEDASEM TATSTDQSWE GEGENSPME MPKGPPSIIS ALNVEKALRG IGITDVDHYA RLGLRRGCTY DQVGAAYEIQ VKELSSQGMD EEQFNKERDL L KESYNILS SEQERRLYDW SLARNSAPER YMWPFEADIT QTPRWGTPPP QEPEDVGPTT AVGYFLLAWF VFSFILSIAL NR

UniProtKB: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit U, chloroplastic

+
分子 #27: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

分子名称: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: photosystem I
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 82.144953 KDa
配列文字列: EVKILVDRDP VKTSFEAWAK PGHFSRTIAK GPETTTWIWN LHADAHDFDS HTSDLEEISR KIFSAHFGQL SIIFLWLSGM YFHGARFSN YEAWLSDPTH IGPSAQVVWP IVGQEILNGD VGGGFRGIQI TSGFFQIWRA SGITSELQLY CTAIGALVFA A LMLFAGWF ...文字列:
EVKILVDRDP VKTSFEAWAK PGHFSRTIAK GPETTTWIWN LHADAHDFDS HTSDLEEISR KIFSAHFGQL SIIFLWLSGM YFHGARFSN YEAWLSDPTH IGPSAQVVWP IVGQEILNGD VGGGFRGIQI TSGFFQIWRA SGITSELQLY CTAIGALVFA A LMLFAGWF HYHKAAPKLA WFQDVESMLN HHLAGLLGLG SLSWAGHQIH VSLPINQFLN AGVDPKEIPL PHELILNRDL LA QLYPSFA EGATPFFTLN WSKYADFLTF RGGLDPVTGG LWLTDTAHHH LAIAILFLIA GHMYRTNWGI GHGLKDILEA HKG PFTGQG HKGLYEILTT SWHAQLALNL AMLGSLTIVV AHHMYAMPPY PYLATDYGTQ LSLFTHHMWI GGFLIVGAAA HAAI FMVRD YDPTTRYNDL LDRVLRHRDA IISHLNWACI FLGFHSFGLY IHNDTMSALG RPQDMFSDTA IQLQPVFAQW IQNTH ALAP SATAPGATAS TSLTWGGSDL VAVGGKVALL PIPLGTADFL VHHIHAFTIH VTVLILLKGV LFARSSRLIP DKANLG FRF PCDGPGRGGT CQVSAWDHVF LGLFWMYNSI SVVIFHFSWK MQSDVWGSIS DQGVVTHITG GNFAQSSITI NGWLRDF LW AQASQVIQSY GSSLSAYGLF FLGAHFVWAF SLMFLFSGRG YWQELIESIV WAHNKLKVAP ATQPRALSIV QGRAVGVT H YLLGGIATTW AFFLARIIAV G

UniProtKB: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

+
分子 #28: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

分子名称: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: photosystem I
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 82.377547 KDa
配列文字列: ALRFPRFSQG LAQDPTTRRI WFGIATAHDF ESHDDITEER LYQNIFASHF GQLAIIFLWT SGNLFHVAWQ GNFESWVQDP LHVRPIAHA IWDPHFGQPA VEAFTRGGAL GPVNIAYSGV YQWWYTIGLR TNEDLYTGAL FLLFLSVISL LGGWLHLQPK W KPSVSWFK ...文字列:
ALRFPRFSQG LAQDPTTRRI WFGIATAHDF ESHDDITEER LYQNIFASHF GQLAIIFLWT SGNLFHVAWQ GNFESWVQDP LHVRPIAHA IWDPHFGQPA VEAFTRGGAL GPVNIAYSGV YQWWYTIGLR TNEDLYTGAL FLLFLSVISL LGGWLHLQPK W KPSVSWFK NAESRLNHHL SGLFGVSSLA WTGHLVHVAI PGSRGEYVRW NNFLDVLPHP QGLGPLFTGQ WNLYAQNPDS SS HLFGTSQ GAGTAILTLL GGFHPQTQSL WLTDMAHHHL AIAFVFLVAG HMYRTNFGIG HSMKDLLEAH IPPGGRLGRG HKG LYDTIN NSLHFQLGLA LASLGVITSL VAQHMYSLPA YAFIAQDFTT QAALYTHHQY IAGFIMTGAF AHGAIFFIRD YNPE QNEDN VLARMLDHKE AIISHLSWAS LFLGFHTLGL YVHNDVMLAF GTPEKQILIE PIFAQWIQSA HGKTSYGFDV LLSST SGPA FNAGRSIWLP GWLNAVNENS NSLFLTIGPG DFLVHHAIAL GLHTTTLILV KGALDARGSK LMPDKKDFGY SFPCDG PGR GGTCDISAWD AFYLAVFWML NTIGWVTFYW HWKHITLWQG NVSQFNESST YLMGWLRDYL WLNSSQLING YNPFGMN SL SVWAWMFLFG HLVWATGFMF LISWRGYWQE LIETLAWAHE RTPLANLIRW RDKPVALSIV QARLVGLAHF SVGYIFTY A AFLIASTSGK FG

UniProtKB: Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

+
分子 #29: Photosystem I iron-sulfur center

分子名称: Photosystem I iron-sulfur center / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: photosystem I
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 9.035483 KDa
配列文字列:
MSHSVKIYDT CIGCTQCVRA CPTDVLEMIP WDGCKAKQIA SAPRTEDCVG CKRCESACPT DFLSVRVYLW HETTRSMGLG Y

UniProtKB: Photosystem I iron-sulfur center

+
分子 #30: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 16.05348 KDa
配列文字列:
GFTPPELDPN TPSPIFAGST GGLLRKAQVE EFYVITWESP KEQIFEMPTG GAAIMREGPN LLKLARKEQC LALGTRLRSK YKIKYQFYR VFPSGEVQYL HPKDGVYPEK VNPGRQGVGL NMRSIGKNVS PIEVKFTGKQ PYDL

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic

+
分子 #31: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 7.736863 KDa
配列文字列:
KPPPIGPKRG SKVRIMRKES YWYKGVGSVV AVDQDPKTRY PVVVRFNKVN YANVSTNNYA LDEIQEVA

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic

+
分子 #32: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 17.151859 KDa
配列文字列:
DIAGLTPCKE SKQFAKREKQ ALKKLQASLK LYADDSAPAL AIKATMEKTK KRFDNYGKYG LLCGSDGLPH LIVSGDQRHW GEFITPGIL FLYIAGWIGW VGRSYLIAIR DEKKPTQKEI IIDVPLASSL LFRGFSWPVA AYRELLNGEL VDNN

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

+
分子 #33: Photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 10.719099 KDa
配列文字列:
LSPSLVISLS TGLSLFLGRF VFFNFQRENM AKQVPEQNGM SHFEAGDTRA KEYVSLLKSN DPVGFNIVDV LAWGSIGHIV AYYILATAS NGYDPSFF

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit V, chloroplastic

+
分子 #34: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 10.391756 KDa
配列文字列:
KYGDKSVYFD LEDIANTTGQ WDVYGSDAPS PYNSLQSKFF ETFAAPFTKR GLLLKFLILG GGSLLTYVSA NAPQDVLPIT RGPQQPPKL GPRGKI

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit VI, chloroplastic

+
分子 #35: Photosystem I reaction center subunit VIII

分子名称: Photosystem I reaction center subunit VIII / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 3.458225 KDa
配列文字列:
MNFPSIFVPL VGLVFPAIAM ASLFLYVQKN K

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit VIII

+
分子 #36: Photosystem I reaction center subunit IX

分子名称: Photosystem I reaction center subunit IX / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 4.845679 KDa
配列文字列:
MRDFKTYLSV APVLSTLWFG SLAGLLIEIN RFFPDALTFP FF

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit IX

+
分子 #37: PSI-K

分子名称: PSI-K / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 13.229404 KDa
配列文字列:
MASVMMTSLP QFTGLRSQQA SFPVKSLSAG LPLRGKGKGA LGARCGDFIG SSTNLIMVTS TTLMLFAGRF GLAPSANRKS TAGLRLEVR DSGLQTGDPA GFTLADTLAC GSFGHIIGVG VVLGLKNIGA I

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit psaK, chloroplastic

+
分子 #38: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic

分子名称: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 16.988656 KDa
配列文字列:
QVIQPLNGDP FIGGLETPVT SSPLIAWYLS NLPAYRTAVN PLLRGVEVGL AHGFLLVGPF VKAGPLRNTE YAGAAGSLAA AGLVVILSM CLTMYGIASF KEGEPSIAPA LTLTGRKKQP DQLQSADGWA KFTGGFFFGG VSGVTWACFL MYVLDLPYYF K

UniProtKB: Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic

+
分子 #39: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 23.94734 KDa
配列文字列: GGISSVCEPL PPDRPLWFPG STPPQWLDGS LPGDFGFDPL GLGSDPETLR WFAQAELMHS RWAMLAVAGI LIPEWLESIG LMENFNWYD AGSREYFADP TTLFVVQLAL MGWVEGRRWA DYVNPGCVDI EPKLPNRKNP KPDVGYPGGL WFDFMMWGRG S PEPVMVLR ...文字列:
GGISSVCEPL PPDRPLWFPG STPPQWLDGS LPGDFGFDPL GLGSDPETLR WFAQAELMHS RWAMLAVAGI LIPEWLESIG LMENFNWYD AGSREYFADP TTLFVVQLAL MGWVEGRRWA DYVNPGCVDI EPKLPNRKNP KPDVGYPGGL WFDFMMWGRG S PEPVMVLR TKEIKNGRLA MLAFVGLCFQ AVYTGEGPLE NLSRHVADPG HCNIFSA

UniProtKB: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

+
分子 #40: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 22.135113 KDa
配列文字列: KKGEWLPGLA SPGYLTGSLP GDNGFDPLAL AEDPENLRWF VQAELVNGRW AMLGVAGMLL PEVFTSIGII DVPKWYDAGK SEYFASSST LFVIEFILFH YVEIRRWQDI KNPGCVNQDP IFKQYSLPPN ECGYPGGIFN PLNFAPTTEA KEKELANGRL A MLAFLGFI ...文字列:
KKGEWLPGLA SPGYLTGSLP GDNGFDPLAL AEDPENLRWF VQAELVNGRW AMLGVAGMLL PEVFTSIGII DVPKWYDAGK SEYFASSST LFVIEFILFH YVEIRRWQDI KNPGCVNQDP IFKQYSLPPN ECGYPGGIFN PLNFAPTTEA KEKELANGRL A MLAFLGFI VQHNVTGKGP FDNLQQHLSD PWHNTIIQTF

UniProtKB: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

+
分子 #41: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 24.168625 KDa
配列文字列: RPLWFASKQS LSYLDGSLPG DFGFDPLGLS DPEGTGGFIE PRWLAYGEII NGRYAMLGAV GAIAPEILGK AGLIPQETAL PWFQTGVIP PAGTYNYWAD PFTLFVFEMA LMGFAEHRRL QDWYNPGSMG KQYFLGLEKG FAGSGEPAYP GGPIFNPLGF G KDEKSLKE ...文字列:
RPLWFASKQS LSYLDGSLPG DFGFDPLGLS DPEGTGGFIE PRWLAYGEII NGRYAMLGAV GAIAPEILGK AGLIPQETAL PWFQTGVIP PAGTYNYWAD PFTLFVFEMA LMGFAEHRRL QDWYNPGSMG KQYFLGLEKG FAGSGEPAYP GGPIFNPLGF G KDEKSLKE LKLKEVKNGR LAMLAILGYF IQGLVTGVGP YQNLLDHLAD PVNNNILTSL KFH

UniProtKB: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

+
分子 #42: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

分子名称: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Spinacia oleracea (ホウレンソウ)
分子量理論値: 21.184209 KDa
配列文字列: EWMPGQPRPA HLDGSAPGDF GFDPLGLGEV PENLERFKES ELIHCRWAML AVPGILVPEA LGLGNWVKAQ EWAALPGGQA TYLGNPVPW GNLPTILAIE FLAIAFVEHQ RSMEKDSEKK KYPGGAFDPL GYSKDPKKFE ELKLKEIKNG RLALLAFVGF C IQQSAYPG ...文字列:
EWMPGQPRPA HLDGSAPGDF GFDPLGLGEV PENLERFKES ELIHCRWAML AVPGILVPEA LGLGNWVKAQ EWAALPGGQA TYLGNPVPW GNLPTILAIE FLAIAFVEHQ RSMEKDSEKK KYPGGAFDPL GYSKDPKKFE ELKLKEIKNG RLALLAFVGF C IQQSAYPG TGPLENLATH LADPWHNNIG DIVIP

UniProtKB: Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

+
分子 #43: BETA-CAROTENE

分子名称: BETA-CAROTENE / タイプ: ligand / ID: 43 / コピー数: 29 / 式: BCR
分子量理論値: 536.873 Da
Chemical component information

ChemComp-BCR:
BETA-CAROTENE / 9,13-cis-β-カロテン

+
分子 #44: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-...

分子名称: (1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE
タイプ: ligand / ID: 44 / コピー数: 24 / 式: PGT
分子量理論値: 751.023 Da
Chemical component information

ChemComp-PGT:
(1S)-2-{[{[(2R)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE / リン脂質*YM

+
分子 #45: 4-trans-(4-trans-Propylcyclohexyl)-cyclohexyl alpha-maltoside

分子名称: 4-trans-(4-trans-Propylcyclohexyl)-cyclohexyl alpha-maltoside
タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 2 / 式: A1H1M
分子量理論値: 548.663 Da

+
分子 #46: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

分子名称: 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 12 / 式: LMG
分子量理論値: 787.158 Da
Chemical component information

ChemComp-LMG:
1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE

+
分子 #47: 5-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E)-3,7,11,15,19,23,27-HEPTAMETHYLOCTACOSA...

分子名称: 5-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E)-3,7,11,15,19,23,27-HEPTAMETHYLOCTACOSA-2,6,10,14,18,22,26-HEPTAENYL]-2,3-DIMETHYLBENZO-1,4-QUINONE
タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 1 / 式: PQ9
分子量理論値: 612.967 Da
Chemical component information

ChemComp-PQ9:
5-[(2E,6E,10E,14E,18E,22E)-3,7,11,15,19,23,27-HEPTAMETHYLOCTACOSA-2,6,10,14,18,22,26-HEPTAENYL]-2,3-DIMETHYLBENZO-1,4-QUINONE

+
分子 #48: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL

分子名称: 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 7 / 式: SQD
分子量理論値: 795.116 Da
Chemical component information

ChemComp-SQD:
1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL / (2S)-1-O,2-O-ジパルミトイル-3-O-(6-スルホ-6-デオキシ-α-D-グルコピラノシル)グリセロ-ル

+
分子 #49: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

+
分子 #50: CHLOROPHYLL A

分子名称: CHLOROPHYLL A / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 144 / 式: CLA
分子量理論値: 893.489 Da
Chemical component information

ChemComp-CLA:
CHLOROPHYLL A

+
分子 #51: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

分子名称: DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 3 / 式: DGD
分子量理論値: 949.299 Da
Chemical component information

ChemComp-DGD:
DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)

+
分子 #52: CHLOROPHYLL A ISOMER

分子名称: CHLOROPHYLL A ISOMER / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 1 / 式: CL0
分子量理論値: 893.489 Da
Chemical component information

ChemComp-CL0:
CHLOROPHYLL A ISOMER

+
分子 #53: PHYLLOQUINONE

分子名称: PHYLLOQUINONE / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 2 / 式: PQN
分子量理論値: 450.696 Da
Chemical component information

ChemComp-PQN:
PHYLLOQUINONE / フィロキノン

+
分子 #54: CHLOROPHYLL B

分子名称: CHLOROPHYLL B / タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 9 / 式: CHL
分子量理論値: 907.472 Da
Chemical component information

ChemComp-CHL:
CHLOROPHYLL B

+
分子 #55: (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL

分子名称: (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL
タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 8 / 式: LUT
分子量理論値: 568.871 Da
Chemical component information

ChemComp-LUT:
(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.8
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡TFS KRIOS
詳細Titan Krios G3i microscope at 300 kV, equipped with a K3 (Gatan) detector operating in electron counting mode, Bioquantum energy filter (Gatan)
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 40.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス（公称値）: 1.7 µm
最小 デフォーカス（公称値）: 0.7000000000000001 µm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.19 Å / 解像度の算出法: OTHER / 詳細: This is a composite map / 使用した粒子像数: 38385
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

-
原子モデル構築 1

初期モデル
ChainPDB ID
source_name: AlphaFold, initial_model_type: in silico model
source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

4y28

source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

6khj

精密化空間: REAL / プロトコル: AB INITIO MODEL
得られたモデル

PDB-9grx:
NDH-PSI-LHCI supercomplex from S. oleracea

+
万見について

-
お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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