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- EMDB-4935: Evolutionary compaction and adaptation visualized by the structur... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4935
タイトルEvolutionary compaction and adaptation visualized by the structure of the dormant microsporidian ribosome
マップデータOverall map, state1
試料
  • 複合体: Microsporidian Ribosome
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 75種
  • リガンド: x 2種
生物種Vairimorpha necatrix (菌類)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å
データ登録者Barandun J / Hunziker M / Vossbrinck CR / Klinge S
資金援助 米国, スイス, 2件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)1DP2GM123459 米国
Swiss National Science Foundation155515 スイス
引用ジャーナル: Nat Microbiol / 年: 2019
タイトル: Evolutionary compaction and adaptation visualized by the structure of the dormant microsporidian ribosome.
著者: Jonas Barandun / Mirjam Hunziker / Charles R Vossbrinck / Sebastian Klinge /
要旨: Microsporidia are eukaryotic parasites that infect essentially all animal species, including many of agricultural importance, and are significant opportunistic parasites of humans. They are ...Microsporidia are eukaryotic parasites that infect essentially all animal species, including many of agricultural importance, and are significant opportunistic parasites of humans. They are characterized by having a specialized infection apparatus, an obligate intracellular lifestyle, rudimentary mitochondria and the smallest known eukaryotic genomes. Extreme genome compaction led to minimal gene sizes affecting even conserved ancient complexes such as the ribosome. In the present study, the cryo-electron microscopy structure of the ribosome from the microsporidium Vairimorpha necatrix is presented, which illustrates how genome compaction has resulted in the smallest known eukaryotic cytoplasmic ribosome. Selection pressure led to the loss of two ribosomal proteins and removal of essentially all eukaryote-specific ribosomal RNA (rRNA) expansion segments, reducing the rRNA to a functionally conserved core. The structure highlights how one microsporidia-specific and several repurposed existing ribosomal proteins compensate for the extensive rRNA reduction. The microsporidian ribosome is kept in an inactive state by two previously uncharacterized dormancy factors that specifically target the functionally important E-site, P-site and polypeptide exit tunnel. The present study illustrates the distinct effects of evolutionary pressure on RNA and protein-coding genes, provides a mechanism for ribosome inhibition and can serve as a structural basis for the development of inhibitors against microsporidian parasites.
履歴
登録2019年5月5日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年7月10日-
マップ公開2019年7月10日-
更新2022年3月30日-
現状2022年3月30日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0199
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.0199
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6rm3
  • 表面レベル: 0.0199
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4935.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4935.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 149.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Overall map, state1
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.2 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.0199 / ムービー #1: 0.0199
最小 - 最大-0.07164885 - 0.12570506
平均 (標準偏差)1.7274553e-05 (±0.005440261)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ340340340
Spacing340340340
セルA=B=C: 408.00003 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.21.21.2
M x/y/z340340340
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z408.000408.000408.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ480480480
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS340340340
D min/max/mean-0.0720.1260.000

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添付データ

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追加マップ: Additional map, state2

ファイルemd_4935_additional.map
注釈Additional map, state2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Microsporidian Ribosome

全体名称: Microsporidian Ribosome
要素
  • 複合体: Microsporidian Ribosome
    • RNA: 16S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: uL2
    • タンパク質・ペプチド: uS2
    • タンパク質・ペプチド: uL15
    • タンパク質・ペプチド: eS26
    • タンパク質・ペプチド: uL3
    • タンパク質・ペプチド: eS1
    • タンパク質・ペプチド: eL29
    • タンパク質・ペプチド: eS27
    • タンパク質・ペプチド: uL4
    • タンパク質・ペプチド: uS5
    • タンパク質・ペプチド: eL30
    • タンパク質・ペプチド: eS28
    • タンパク質・ペプチド: uL18
    • タンパク質・ペプチド: uS3
    • タンパク質・ペプチド: eL31
    • タンパク質・ペプチド: uS14
    • タンパク質・ペプチド: eL6
    • タンパク質・ペプチド: eS4
    • タンパク質・ペプチド: eL32
    • タンパク質・ペプチド: eS30
    • タンパク質・ペプチド: uL30
    • タンパク質・ペプチド: uS7
    • タンパク質・ペプチド: eL33
    • タンパク質・ペプチド: eS31
    • タンパク質・ペプチド: eL8
    • タンパク質・ペプチド: eS6
    • タンパク質・ペプチド: eL34
    • タンパク質・ペプチド: RACK1
    • タンパク質・ペプチド: uL6
    • タンパク質・ペプチド: eS7
    • タンパク質・ペプチド: uL29
    • タンパク質・ペプチド: uL16
    • タンパク質・ペプチド: eS8
    • タンパク質・ペプチド: eL36
    • タンパク質・ペプチド: uL5
    • タンパク質・ペプチド: uS4
    • タンパク質・ペプチド: eL37
    • タンパク質・ペプチド: eL13
    • タンパク質・ペプチド: uS17
    • タンパク質・ペプチド: eL39
    • タンパク質・ペプチド: eL14
    • タンパク質・ペプチド: eL40
    • タンパク質・ペプチド: eS12
    • タンパク質・ペプチド: eL15
    • タンパク質・ペプチド: uS15
    • タンパク質・ペプチド: MDF2
    • タンパク質・ペプチド: MDF1
    • タンパク質・ペプチド: uL13
    • タンパク質・ペプチド: uS11
    • タンパク質・ペプチド: eL42
    • タンパク質・ペプチド: uL22
    • タンパク質・ペプチド: uS19
    • タンパク質・ペプチド: eL43
    • タンパク質・ペプチド: eL18
    • タンパク質・ペプチド: uS9
    • タンパク質・ペプチド: eL19
    • タンパク質・ペプチド: eS17
    • タンパク質・ペプチド: eL20
    • タンパク質・ペプチド: uS13
    • タンパク質・ペプチド: eL21
    • タンパク質・ペプチド: eS19
    • タンパク質・ペプチド: eL22
    • タンパク質・ペプチド: uS10
    • タンパク質・ペプチド: uL14
    • タンパク質・ペプチド: eS21
    • タンパク質・ペプチド: eL24
    • タンパク質・ペプチド: uS8
    • タンパク質・ペプチド: uL23
    • タンパク質・ペプチド: uS12
    • タンパク質・ペプチド: msL1
    • タンパク質・ペプチド: uL24
    • タンパク質・ペプチド: eS24
    • タンパク質・ペプチド: eL27
    • タンパク質・ペプチド: eS25
    • タンパク質・ペプチド: eS10
    • RNA: 23S rRNA
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: Microsporidian Ribosome

超分子名称: Microsporidian Ribosome / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#78
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)

+
分子 #1: 16S rRNA

分子名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 401.303719 KDa
配列文字列: ACCAGGUUGA UUCUGCCUGA CGUAGACGCU AUUCCCUAAG AUUAACCCAU GCAUGUUUUU GAUAUGGAAA AAUGGACUGC UCAGUAAUA CUCACUUUAU UUAAUGUAUU AAAUUAGUAU AACUGCGUUA AAGUGUAGCA UAAGACAUAU ACAGUAAGAG U GAGACCUA ...文字列:
ACCAGGUUGA UUCUGCCUGA CGUAGACGCU AUUCCCUAAG AUUAACCCAU GCAUGUUUUU GAUAUGGAAA AAUGGACUGC UCAGUAAUA CUCACUUUAU UUAAUGUAUU AAAUUAGUAU AACUGCGUUA AAGUGUAGCA UAAGACAUAU ACAGUAAGAG U GAGACCUA UCAGCUAGUU GUUAAGGUAA UGGCUUAACA AGGCAAUGAC GGGUAACGGU AUUACUUUGU AAUAUUCCGG AG AAGGAGC CUGAGAGACG GCUACUAAGU CUAAGGAUUG CAGCAGGGGC GAAACUUGAC CUAUGGAUUU UAUCUGAGGC AGU UAUGGG AAGUAAUAUU CUAUUGUUUC AUAUUGUAAA AGUAUAUGAG GUGAUUAAUU GGAGGGCAAA UCAAGUGCCA GCAG CCGCG GUAAUACUUG UUCCAAGAGU GUGUAUGAUG AUUGAUGCAG UUAAAAAGUC CGUAGUUUAU AUUUAAGAAG CAAUA UGAG GUGUACUGUA UAGUUGGGAG AGAGAUGAAA UGUGACGACC CUGACUGGAC GAACAGAAGC GAAAGCUGUA CACUUG UAU GUAUUUUUUG AACAAGGACG UAAGCUGGAG GAGCGAAGAU GAUUAGAUAC CAUUGUAGUU CCAGCAGUAA ACUAUGC CG ACGAUGUGAU AUGAUAUUAA UUGUAUUAGA UGAUAGAAAU UUGAGUUUUU UGGCUCUGGG GAUAGUAUGA UCGCAAGA U UGAAAAUUAA AGAAAUUGAC GGAAGAAUAC CACAAGGAGU GGAUUGUGCG GCUUAAUUUG ACUCAACGCG AGGUAACUU ACCAAUAUUU UAUUAUUCAG AGAAGAUUUU AAUCUGAGAA UGAUAAUAGU GGUGCAUGGC CGUUUUCAAU GGAUGCUGUG AAGUUUUGA UUAAUUUCAA CAAGACGUGA GACCCUUUUA UUAAUAGACA GACACAAUCA GUGUAGGAAG GAAAGGAUUA A AACAGGUC CGUUAUGCCC UCAGACAUUU UGGGCUGCAC GCGCAAUACA AUAGAUAUAU AAUCUUUAUG GGAUAAUAUU UU GUAAGAG AUAUUUGAAC UUGGAAUUGC UAGUAAAUUU UAUUAAAUAA GUAGAAUUGA AUGUGUCCCU GUUCUUUGUA CAC ACCGCC CGUCGCUAUC UAAGAUGAUA UGUGUUGUGA AAUUAGUGAA AACUACUUGA ACAAUAUGUA UUAGAUCUGA UAUA AGUCG UAACAUGGUU GCUGUUGGAG AACCAUUAGC AGGAUCAUA

+
分子 #2: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 38.379844 KDa
配列文字列:
AGUUACGGCC AUAUCUACUG UAAAACACCG GAACUCGUCA GCUCUCCGAA GUUAAGCCAG UAAGAGCCUU GUGAGUACUG AGAUGGGAG ACCGCUCGGA AAAGCAAGGU GCUGUAAUUU

+
分子 #78: 23S rRNA

分子名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 78 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 799.4875 KDa
配列文字列: AUUUACCCAC ACAUGGGAUC AAUAGGAUAC CAUAACGAUG AAGGUCGUAA UAGAAUACGA AAGUAUAUUA UUUACCUAAU UAAUAUAUU UAUAAUGUAU UGAUAACCCU UUGAACUUAA GCAUAUCAUU AAAAGGAGGA AAAGAAACUA ACUAGGAUUU C UUUAGUAG ...文字列:
AUUUACCCAC ACAUGGGAUC AAUAGGAUAC CAUAACGAUG AAGGUCGUAA UAGAAUACGA AAGUAUAUUA UUUACCUAAU UAAUAUAUU UAUAAUGUAU UGAUAACCCU UUGAACUUAA GCAUAUCAUU AAAAGGAGGA AAAGAAACUA ACUAGGAUUU C UUUAGUAG CAGCGAGUGA ACAAGAAAUA ACCCUCCAUU GUAAUCCUUA AUUGGAGUUG UAAAUGGUUU AUUCUAUUAA UU AUAUUUA UAGAGAAUAU UAUAUUCGUU AUUAAUAGAA UAGAAUAAUG UACUUGAGUA GAGCUGCUUG GUAGUGCAGU UUG AAUAAA GGUAGAAUGA AAUAUCUAAG GUUAAAUAUA AUGGUAUACC GAUAGAAAAU AAGUACUGCG AAGGAACUUG UGAA AAUGU GUGGAGUUUA GCCUUAUUUU UAAGGACCCG UCUUGAAACA CGGACCAAGG AGAUUAUAAU UAUAGCAAGA UAAAA AUUA AAUUUUUUAA UCUUUAUUAA CUUGAUUAGU UAUAAUUAUA AGACCCGAAA CACAGUGAAC UAUACAUGUU CUGGUU GAA GAUAAGCAAC AGUUUAUUGG AAGACCAUAA UCAUUCUGAC GUGCAAAUCG AUGAUUUAAG AUGUGUAUAG UGGCGAA AG ACCAAUCGAA CUGUGUGGUA GCUGGUUCAC AGCGAAAUGU CUCUCAGGAC AGCAGUUAUU AUUAUAUAGG ACAUAGAU G UAGGACACUG UUAUAGUUUU UUAACUAUGA GAAAUCUUUA AUUCUAUGGA AUUAUAUAAA UUAAAUUUAU AUAAUGAAU CUAUUGUAUA ACUAGUGGGC ACAUGAUUGU AAGAAUGAUG UGCAAAAAGG GAUGAACCUU AUGAAACAUU AAAUAUUCUA AAUAGUAGA UAUUAUACCA UAAAUAUGAU GAAUACAUUG AGACAGUAGG GCGGUUGUUA UGGAAGUAGA AAUCCGCUAA G AAACGUGU UACAACGUAC CUACCGAAUG UAUUAUUGUA UAAAAUGGAA GAAGAUUACU ACUUUUAUGA GAUGUUUCUA AU AAAUAUU UAGGUAGCUG UGCAAUUUGU UUGUAUUGAA GUAUAUAUGU GAGUAUAUAU AGAAGAAACA AAUGAGCCGA UCU UGGAGG CAGUAACAAU AUAUUUGUAU AGAUAUAGAC UAGGGUUUUC AAUUAUUAUU GAAGUGAAUC GGUGUUAUUU AUAA AAACA AAAAAGAUUA AUAAUUCUUU AUUAAAUUAU UAUAAGGUAA CUUGAUAAUG ACAGUAUAUU UCAAUAAAUU UAAGA UAAA UGAAUUAAAU UUAAUUUUAA CUAUGGAUUG UCAUGAUAAG AAAUAGUUAA UUAUAUAUAC UUGAUAAAAA UAAAAU AAU UUUAACCGUA CCUAUACCGC AUCAGGUGUC UUUGUAUCAU AACAAAUAUU UUAAAUUAAA GUAAGUAAGG GAAUUCG GC AAAUUAGAUC UGUAACUUUG GGAUAAAGAU UGGCUCUAGC AUGCUAGAAC UUUUACUAUG UAAGGAAUCU GACUGUUU A UUAAAAACAU AGCUUUUUGU AUUUACAAGA AGUGAAUUCU GCCCAGUGCA UUUAUUGUUA AAGUUGUGUA AGCGAAUGU AAACGGCGGG AGUAACUAUG ACUCUCUUAA GGUAGCCAAA UGCCUCGUCA UUUAAUUGGU GACGCGCAUG AAUGGAGCAA CGAGAUUCC UACUGUCCCU ACUUACAAUU UUGUGAAACC ACGAGACAAG GGAACGGGCU UGUUAUUUAU CAGCGGGGAA A GAAGACCC UGUUGAGCUU GACUUUAGUA UGUUUUAAUA AAUAUUCGGU AUAUUGUAGA GAGGUGGGAG AAGUAUUGUG AA ACCACUA GUAUGUUUGA AUAUUUAUUU AUUAGAAUAU AUGGGGAGUU UGGCUGGGGC GGUACAGCUG UUAAAAAGUA ACA CAGCUG UCCUAAGGUA GAUGAAUGAU GGAUGGUAAC CAUCAGUUUA UUAUAAGGGA AUAAAUCUGC UUUACUUUAU GCAU AUGAC UGUAUUUAGU AGGGAAACCU UGGCCUAGCG AUCCCAAUUA CAUUCAUUAU GUAUUGGGUG AUUGAAAAGU UACCA CAGG GAUAACUGGC UUGUAGCAGG CAAGCGAUCA UAGCGACUCU GCUUUUUGAU UCUUCGAUGU CGUCUCUUCU GAUCAU CGU AGUGUAUAUG UUACGAAGUG UUGGAUUGUU CACCCGGUAA UGAGGAACGU GAGAUGGGUU UAGACCGUCG UGAGACA GG UUAGUUUUAC CCUACUGUAA GUAUUUUUGA GUGAACUUUG AUAGUACGAG AGGAACUCUA AGUGAUGACC ACUGGUAG U GCGAUUAACU AUUAAGUUAU GUUGCUUAGC UACGUCGUUU CGAUUAAGGC UGAAAGCCUC UUAAGCCUGA AGCGUAGCU CAAAGAUACA UUUAGGAGAA UACUACUCUU UUAAGCAGAA CUGUAAGAAU GAAGGUGUAU GCCGACAUUU UGAGGUUACU GCUU

+
分子 #3: uL2

分子名称: uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 26.019059 KDa
配列文字列: MGKVTRKIRE ETKKLRNPRK LSSPKYPNFP ETTQGTVVDL VHERGRGVPL AHVKFNDEIY SLIATEGLYT GQTIFIGDNA PISIGNITK LKNVPGGMAV HSIEYDYEDG GCVGMTGGAY STVVTHREET NETVLGLPSG QKKIFSSEVR CIVGVPSAGG I KEKPFLKA ...文字列:
MGKVTRKIRE ETKKLRNPRK LSSPKYPNFP ETTQGTVVDL VHERGRGVPL AHVKFNDEIY SLIATEGLYT GQTIFIGDNA PISIGNITK LKNVPGGMAV HSIEYDYEDG GCVGMTGGAY STVVTHREET NETVLGLPSG QKKIFSSEVR CIVGVPSAGG I KEKPFLKA SVAHYFNKAH CKKWPRVRCV AMNPVDHKFG GGNHQHVGRP TTISKRRPHA QLMGLIGARR TGRVKGSKK

+
分子 #4: uS2

分子名称: uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 29.692846 KDa
配列文字列: MAKVNIPIPE DFVKLILISQ GHLGGIKTSK HMGRYVYGTR KPENIKVIDI EKTWEKFILA SRMFCSLQNP SEAVVVSTKT FGRKGVLKF CEATNATPVI GRFIPGTFCN NQVKRPLEPR VLIVSDPFAD KQALDESSYV NLQTVAFCNT DNDVSFVDVV I PMNNRSPV ...文字列:
MAKVNIPIPE DFVKLILISQ GHLGGIKTSK HMGRYVYGTR KPENIKVIDI EKTWEKFILA SRMFCSLQNP SEAVVVSTKT FGRKGVLKF CEATNATPVI GRFIPGTFCN NQVKRPLEPR VLIVSDPFAD KQALDESSYV NLQTVAFCNT DNDVSFVDVV I PMNNRSPV SISTGLFILS RLVRFMKTGE PLDENMKEIE LFIYRDPVEL ERLVEEQKAI DSANINIGNQ EFSDPEDYST VN NWASDMT NISVETTRSG AERGWGN

+
分子 #5: uL15

分子名称: uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 17.300244 KDa
配列文字列:
MLKHVKKTRK LRGHVSHGHG RVGKHRKHSG GRGICGGLKH MKTWFQKYHP DYFGKRGHRI YHRKKNDEWA RWISAAKLWS LIPKETRYE LIDKQQEGVP VINCRDFGYH VVVGGELSLD RPVVVKARKF TEDAKEQIEK VGGKWIICP

+
分子 #6: eS26

分子名称: eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 12.11346 KDa
配列文字列:
MPVKRKNHGK NRKNRGSCKP VQCDKCGRCV PKDKAIKRFK IVPLVEAGSM DDVKVASIYD IFEVPRISYK NQYCISCACH ARIVRVRSR QGRKIRYDGE RRMIK

+
分子 #7: uL3

分子名称: uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 43.234254 KDa
配列文字列: MSCRKFNAPR HGSLAFCPRK RSKTIRPPIR AFPKDDPSSK IHLTGFIGYK AGMTHVVRTK TVQTKNKQSL KEILDAVTIV ETPANVIYG VTGYEQTGRG LKRVATVFSN HIDQGVLRRR YGLKWEEISG KLSGLSIEDT ETKISEIKKR SCVIRVLVHS Q PSKIPVLN ...文字列:
MSCRKFNAPR HGSLAFCPRK RSKTIRPPIR AFPKDDPSSK IHLTGFIGYK AGMTHVVRTK TVQTKNKQSL KEILDAVTIV ETPANVIYG VTGYEQTGRG LKRVATVFSN HIDQGVLRRR YGLKWEEISG KLSGLSIEDT ETKISEIKKR SCVIRVLVHS Q PSKIPVLN LKKSHTAEIQ VNGGSIEEKV DWALEHFEKE FNVQDIFGVD ENLDVIGVTK GKGFTGVIKR FGVTKQPRKS RK GIRKVAC IGAWHPSRVM TTVARAGGKG FHRRTEINKK VYMIGHGNEK IKTEYDLTKK FITPMGGFPH YGQIKNEFIM LKG AIVGPS KRVVTLRKSL LKNQKKNEDL VIKFVDTSSK IGNGRFQTTE EKRAFYGIKK SEVVNSTD

+
分子 #8: eS1

分子名称: eS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 26.982486 KDa
配列文字列: MAIQPPGSYA KANKKGSKKN QKIDNFTKKE WYNLKAPSVF PNNVCGKTMA TRTSNKQDLS TLLIGRKFEV NQADLTGNLE EHARKFSFR VNEVRGKDCI GVFDGMHMTS DKIKGIVRKW HTLIEAEKDI VTKDGAILRV FVNAVTKKTP ACTSKRVYCK S SDEKRIRK ...文字列:
MAIQPPGSYA KANKKGSKKN QKIDNFTKKE WYNLKAPSVF PNNVCGKTMA TRTSNKQDLS TLLIGRKFEV NQADLTGNLE EHARKFSFR VNEVRGKDCI GVFDGMHMTS DKIKGIVRKW HTLIEAEKDI VTKDGAILRV FVNAVTKKTP ACTSKRVYCK S SDEKRIRK VMFDIIEEEL KDQDISKIMK KLSQEVIGKN IEKAGSAIYP LQNCCVIKVK TVKKAREERH PMTVEAETY

+
分子 #9: eL29

分子名称: eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 6.374493 KDa
配列文字列:
MAKKKNGTLA NKNYKDHRNG IKRQKIGKLL ELPGVNQKFL RNMKYAREGL KSSNE

+
分子 #10: eS27

分子名称: eS27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 10.610259 KDa
配列文字列:
MVSKNLHNFQ NFDLAFPTEE QIKKTHKTKN LYAVPTGYFM QVLCDGCKGV TLCYSHSQRD MNCKGCGETI LKSTGGKARL IGECAFKKV DYSFE

+
分子 #11: uL4

分子名称: uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 37.979027 KDa
配列文字列: MDSKINIYEL DGNTVKSTVN LPDVFSVDIR SDIIEQVHSL ERLNLRQPYA VSPNAGMQHS AVSWGTGRAI ARCPRIGGGG SRRSGQGAF ANFCRKGRMA HPTTTMRRWC RKIVLNTRRI ALAMSIAASA KTSFVESRGH KIENLKNIPL VVSDDLKKFE K TKDAFELL ...文字列:
MDSKINIYEL DGNTVKSTVN LPDVFSVDIR SDIIEQVHSL ERLNLRQPYA VSPNAGMQHS AVSWGTGRAI ARCPRIGGGG SRRSGQGAF ANFCRKGRMA HPTTTMRRWC RKIVLNTRRI ALAMSIAASA KTSFVESRGH KIENLKNIPL VVSDDLKKFE K TKDAFELL KNFNLTEEVE RVKNSKTLRG TKGKMRNRRF RMRKGLLLIH DSPVELKAFR NIPGVDQLSI NKLNIFELAP GG HAGRLVM WTESAFKKLE KLFGKFNEES RILKKFTLPK KMITTDSLEE LFLSKEVQAV LNEPAYIPEF SPRKTEEEIA EGE KFISMF DSERILSK

+
分子 #12: uS5

分子名称: uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 25.904898 KDa
配列文字列: MQNKKFNRNA KEEEWVPKTK LGKLVKDRKI QSLDTIFTHS LQIREAGIVD FLLGQNIRDE VLAIKSVQKQ TRAGQKTSIK AVVAIGDGK GYVGIGTFSS KDAATAIKTA ASKAKCNIRP VRLGLWQGEM GQVHTVTTRA SGKCGSSVVK IIPAPKGTGI S ASSVPKTI ...文字列:
MQNKKFNRNA KEEEWVPKTK LGKLVKDRKI QSLDTIFTHS LQIREAGIVD FLLGQNIRDE VLAIKSVQKQ TRAGQKTSIK AVVAIGDGK GYVGIGTFSS KDAATAIKTA ASKAKCNIRP VRLGLWQGEM GQVHTVTTRA SGKCGSSVVK IIPAPKGTGI S ASSVPKTI LELAGVKDAY TQCFGATYTT ENFAKATIEA LEKSSSLFLP SQWTEPIKQL NPLMEFSNHL NKQEKIQFN

+
分子 #13: eL30

分子名称: eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.874985 KDa
配列文字列:
MSRRYSKAVG LAASLPLVVK TGKYDIGFKS ALRNVITKKA KCIVVSSSLP SVKRKQLEYY CVLAGGIPLK FYEGTNNALA NLCELKYRT GVMSVLHEGE SDLLTEKIN

+
分子 #14: eS28

分子名称: eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 7.639914 KDa
配列文字列:
MEANLQQQFY CKVLKTADRA GSAGALVLVR VELLNNGRKM NRLIKGSVRE GDIIALLECE REHRRSR

+
分子 #15: uL18

分子名称: uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 34.483754 KDa
配列文字列: MARKAGRRNK KAKSAATKRS RFQVKRRRRR ECKTNYRHRI NLIKQDYNKQ GALKFRLVVR RTNTKVICQI TRSYIDGDRV FAFADSTEL KNYGVDFGLK NHFAFYATGF LAARRALAKL EMDDLYKAKE TDGTYTVTED IDEERRALKV FLDIGLSRST K GGNTFIAM ...文字列:
MARKAGRRNK KAKSAATKRS RFQVKRRRRR ECKTNYRHRI NLIKQDYNKQ GALKFRLVVR RTNTKVICQI TRSYIDGDRV FAFADSTEL KNYGVDFGLK NHFAFYATGF LAARRALAKL EMDDLYKAKE TDGTYTVTED IDEERRALKV FLDIGLSRST K GGNTFIAM KGCSDAGVYI PHSESKFIGY EKNKPFKADE LRDRIFCKHV SEYMKTLKEN DEEKFKIQFS DYIKKNIEPD NI AGIYQNA LDGIIKNPSR QEKEKKDYSG FKKFKVEKLS LEERKKRIQE KLSALKAN

+
分子 #16: uS3

分子名称: uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 23.717256 KDa
配列文字列: MGNDNKILKK FIADGMIFAE LKELFEKCLI NEGFSSLELR LEESPVKVIL KVVKPHDLIG DKKWKVNQIQ HLVASRLSLP DSNVVVIID KVVEKGLCPI YQANLIKEKM LANIPHKRAA NLVLKNTKFA GATGCLVTIS GKLKGLRACT KKFLEGVVIK S GQPSRDYV ...文字列:
MGNDNKILKK FIADGMIFAE LKELFEKCLI NEGFSSLELR LEESPVKVIL KVVKPHDLIG DKKWKVNQIQ HLVASRLSLP DSNVVVIID KVVEKGLCPI YQANLIKEKM LANIPHKRAA NLVLKNTKFA GATGCLVTIS GKLKGLRACT KKFLEGVVIK S GQPSRDYV KKHITTVNTK QGVIGIQVSI MLPHDPEGII GPSTLLPDKI VVLDAKE

+
分子 #17: eL31

分子名称: eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 12.757264 KDa
配列文字列:
MNTALENNKM MEITVNLGKL TKGCNWTKKA SIAIKKFRSH LKKMLKTDEK ITIQKDLNKY IFSKGLTKVP RRVRIKVERI ADKDNAELN VIKCSHVLVG NFKGLKTEII SE

+
分子 #18: uS14

分子名称: uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 7.877136 KDa
配列文字列:
MNLADILDVP IKQNEPKGPF SHKVATNEEA KKCRACSGFR GIIFKYDMTI CRRCFREYAK DIGFNVYD

+
分子 #19: eL6

分子名称: eL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 20.199307 KDa
配列文字列:
AIKDIQIRLQ ETAKYQSEDV PKYIEKYMKK LNKQNERKRR TDLECGMIVV VCEGIYEAKR VFYLKGLDKN LVLCAVLKDG NNVSFFKID ESYLLATSTK ININVNEIHI SEDEVPLITK DKSIEIMDIE NSEKMTKIEK SIMDEVRKVD YLKTYLNTPF E IDSSVEFY SQKY

+
分子 #20: eS4

分子名称: eS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 29.931486 KDa
配列文字列: TGGPRKHLNR KVAPTSWKLD KSIGTYAIRP HSGPHKKDLC IPLAYVLEKF LEYANNRKEI QIILKSKNIK INGKIIEKRK YPVGFGDVL SIIKTDEHYR VFYGVDKNFT FIKIDKEEAN FKLAKVTNKK VMYENVPYIF TNDGACFKYC DPAININDTV K IDLETRLV ...文字列:
TGGPRKHLNR KVAPTSWKLD KSIGTYAIRP HSGPHKKDLC IPLAYVLEKF LEYANNRKEI QIILKSKNIK INGKIIEKRK YPVGFGDVL SIIKTDEHYR VFYGVDKNFT FIKIDKEEAN FKLAKVTNKK VMYENVPYIF TNDGACFKYC DPAININDTV K IDLETRLV VDYVSFKEGD VVFVMRGEDT GRVGIIKKIQ NTTVICEDLS NKEFETSIDS MIVIGDNEES LLISLPEEKG IR LTALEES NLKFGEIVEN EVEVN

+
分子 #21: eL32

分子名称: eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 16.177029 KDa
配列文字列:
MEEQFTAPNP LIAIKEEFRK KIKFVRHHSD RYNRVKPSWR KPRGIDSNVR KGLHGQRKMP KIGYKKPDVV RYLLPNGLRK FIIHNADDL EPLICLNRTY CAEIAHSVGA KKRIAIVNRA KELGIHVTNE KARLVEAIPE

+
分子 #22: eS30

分子名称: eS30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 6.917247 KDa
配列文字列:
MATQINIKKA GKVKNQTPKV AKQEKQRAKT GRCANRRKYE ARLEMGYFEC NGKMKLNLKA

+
分子 #23: uL30

分子名称: uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 27.664209 KDa
配列文字列: MSSSVAPNSF KSLQEYEKKQ ALIIDAKKSE YEQRVLRNKE YALETTEKLL NKYYDSVKEL EKTKSDYKSK NMLYIPKEPN FLVVVKIKS SIGAAPRQRS ILKLLRLNKT NSAVLVKNNK SMKRMLQLAK DYISYGSISY ELLRKLVYKH GVIKVNDKHR K LNNENIED ...文字列:
MSSSVAPNSF KSLQEYEKKQ ALIIDAKKSE YEQRVLRNKE YALETTEKLL NKYYDSVKEL EKTKSDYKSK NMLYIPKEPN FLVVVKIKS SIGAAPRQRS ILKLLRLNKT NSAVLVKNNK SMKRMLQLAK DYISYGSISY ELLRKLVYKH GVIKVNDKHR K LNNENIED AFRGELKCIE EIIHNIYFGT EYFKVCANTL IPFRLKSPQG GFKGKKSKGF TEGGNLGNHY DLIGELVERM L

+
分子 #24: uS7

分子名称: uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 20.970084 KDa
配列文字列: MADIKLFEKY SYDDVNCSDE SISSYINLSR RFIIPHEGSR AIIKSKTKAN LSIINRFVNS LMRNGRNSGK KRLANVCVED AFVIINCLT KKNPLQVLVD AIINAGPRED TARVGRGGSM KRTAVDVSPS KRVSLAIQLL SNGIRSSAFK SRKSLAECIA D ELNNAAAN ...文字列:
MADIKLFEKY SYDDVNCSDE SISSYINLSR RFIIPHEGSR AIIKSKTKAN LSIINRFVNS LMRNGRNSGK KRLANVCVED AFVIINCLT KKNPLQVLVD AIINAGPRED TARVGRGGSM KRTAVDVSPS KRVSLAIQLL SNGIRSSAFK SRKSLAECIA D ELNNAAAN SQNSYAVKKR EEIERIAKSN R

+
分子 #25: eL33

分子名称: eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.214232 KDa
配列文字列:
MFIPGIFVSH RRALRRIRHT QALIKINNVV NKEQAKNYIG HVVVSKRLND DKTPRDVEGV VIGVHGNKGL VRVKFERNMP AKSVTNVVE VRLVKKEIN

+
分子 #26: eS31

分子名称: eS31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 17.086039 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DSIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGNKKK KAFKTPKIV KPAVVKEKMG WLKNFRIGTD GSVQVIGKMC EKCDDCSFMR NMKFNYKCGK CGLSENKQEI SA

+
分子 #27: eL8

分子名称: eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 23.081318 KDa
配列文字列: MALGKPKQKK SFVPKLTKDQ KDEKERLITK KIYKLAYAIK RPPAIQQFKT ILESEDCKRA LALFSKYKPE THEERLERLK KSNPQEGPK PILAKQGLRH VTRLIETKKA KFVLVAADVN PAELVLFIPT LCKKMNIPYA IVESQNMLGS VVNMKKTTIL A LCDVKGED ...文字列:
MALGKPKQKK SFVPKLTKDQ KDEKERLITK KIYKLAYAIK RPPAIQQFKT ILESEDCKRA LALFSKYKPE THEERLERLK KSNPQEGPK PILAKQGLRH VTRLIETKKA KFVLVAADVN PAELVLFIPT LCKKMNIPYA IVESQNMLGS VVNMKKTTIL A LCDVKGED KKELEEIIKI SNEMFSEQYE QHMTRWGGLR TN

+
分子 #28: eS6

分子名称: eS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 24.946812 KDa
配列文字列: MKLNIADPVN GTQKMYEIEH KAQLKLYNKK IGDQFNGDIL DEKFNGYVFE ITGGDDAQGF PMSKKYLTPN RIRPLLSKGD VGYRCRRKG VRMRKSVRGA IVSEETNVLA IIVIKKGDNE LEGLTDRSNP RTHLPKKDKK LRSMFNIPEG EDIVTYLKDL L SKNLPEGA ...文字列:
MKLNIADPVN GTQKMYEIEH KAQLKLYNKK IGDQFNGDIL DEKFNGYVFE ITGGDDAQGF PMSKKYLTPN RIRPLLSKGD VGYRCRRKG VRMRKSVRGA IVSEETNVLA IIVIKKGDNE LEGLTDRSNP RTHLPKKDKK LRSMFNIPEG EDIVTYLKDL L SKNLPEGA KLPNIKPTGH IHERKRAQKE ASKKAHAERK ARNEAQRQQW LKTYNIKQD

+
分子 #29: eL34

分子名称: eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 12.299665 KDa
配列文字列:
MHKIIIHKGR TYKTRSNVRK VVKTPSGKLV ARRQKKHAKF HRCHECNTKL LSIARMRPAE FSRQKVSARK VNRPLGSTTC GKCVKEKII EAFLNDEERI VREKATA

+
分子 #30: RACK1

分子名称: RACK1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 36.890562 KDa
配列文字列: MSSSDLRVLE PLLAHKQSVT CIQKLRNGSS NVLISASKDK SIFYWSLDSE IESDFGKLLK EYAGKHSKNV NGVAISPNGD MLVSVGSDK MGYIWDVTSK NITASLKGHD RDILSVAINK EGTKIVTGSV DCSIKLWNTK GILINTFGPG LENCHKNWVT C LEFDSRDE ...文字列:
MSSSDLRVLE PLLAHKQSVT CIQKLRNGSS NVLISASKDK SIFYWSLDSE IESDFGKLLK EYAGKHSKNV NGVAISPNGD MLVSVGSDK MGYIWDVTSK NITASLKGHD RDILSVAINK EGTKIVTGSV DCSIKLWNTK GILINTFGPG LENCHKNWVT C LEFDSRDE NILYSGSKDG SVKIWNIEDG TLLKTFVEGN VLDYQNYEKE TGEKPKDNEL ALSVTCLTFC EGGNFLIYGG KN NKVYIVN LDTNECVASV AVENTVRSVT SFESFAGIAI GTDDAIYIYD VCSKSIVATH SLLEMGKGIS CNSLVSQGNI LYC GLSNGQ IYTLEYSKRS E

+
分子 #31: uL6

分子名称: uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 21.038893 KDa
配列文字列:
MTRILTERKI SIPGECQVDL TKKCFTFTGP KGKLVHDCSK YLMYFTVEDS EIVIRLWHAK RKQIALATTV TSLLRNSITA VTKGFSYVM KAVHKHFSIN FEIKENGKVL LIKNFMGEKA PREFRMKGQA VVKMLPERKG CISIEGPSLP DVSQTAGDIT N ACRAKKLD ARLFLDGIYV VEKTTMVE

+
分子 #32: eS7

分子名称: eS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 18.695664 KDa
配列文字列:
MSAQTETEKQ ISEIIKKFVT DIDEKKLQEI NIQTFIRDNK RKVMTVKVPV EIISKSQINF GSIIKNIKQK FQDYYIILVE NIKNEEKTS WNDCKKIFKG ACYPFNINGI RTDVISPEEE IVNVLLEKKC TFNEDEFKMI ETAIKGLVGM NVVVSTNFHS L N

+
分子 #33: uL29

分子名称: uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 14.798472 KDa
配列文字列:
MKMDCQSFRE KNISELEEEI INLKNDLLQL RQKKVSSTVE PDEIKTARKN IAKALRVRHE KLLEEQCKKY ENMPLNKIPK ELRPKKTRA ERRKLTKKQA NRKVPKVWRR ELKNPKIYFA YTE

+
分子 #34: uL16

分子名称: uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 24.989234 KDa
配列文字列: MARRPGRCYR YLSKKAYHKS RFCKSVPDLK IKIWDSGRRK AEVLDFPICI NLISHARENI SEQALDAARI AAHHYMVKTA GRDNFHLRV NVYPFHVLRI NKMLSCAGAD RLQTGMRQSF GKPEGRVARI FFDQIVMSIR TKKGNEAAAM EALRRSRHKF P GKYEVQVS ...文字列:
MARRPGRCYR YLSKKAYHKS RFCKSVPDLK IKIWDSGRRK AEVLDFPICI NLISHARENI SEQALDAARI AAHHYMVKTA GRDNFHLRV NVYPFHVLRI NKMLSCAGAD RLQTGMRQSF GKPEGRVARI FFDQIVMSIR TKKGNEAAAM EALRRSRHKF P GKYEVQVS SKFGFTGLYT EEFNKLREEG CLLANGNTVA VLKQKGPISQ YMKKLEKQL

+
分子 #35: eS8

分子名称: eS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 18.885768 KDa
配列文字列:
NLLIIFLGIN HRGEHKRKKS GGKSVLHRKK RNNRRGSQMA ATKVGSTKVV EKRARGGNKK YKALRLNEGE FLYKSGNIIN SSKIIEVMY HPTNNDYVRT NTITKSSVVK ISSEGIKIQD EEDLKEMYEK GYLYAVINSR PGQVGKAEGE ILQGSKLEFY T NLFKKN

+
分子 #36: eL36

分子名称: eL36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.134361 KDa
配列文字列:
MRRGLKKTQV HHQVTKIDIP KIMPKYKKNS KRIEEKKFAR SLVREISGYA PYESKAISIL KLKDIARATI FLKRRLGSNK RTQKKIKEL QIAASE

+
分子 #37: uL5

分子名称: uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 19.628955 KDa
配列文字列:
MKINPMREIK IKKLSIVINV GGGSSTRLNN AAKVLKQLTS QDCLFSKARY TLRNFGIRRN EKISVHVNVS GDKAMEILKK ALKVREYEL SKDCFNQTGC FGLGINEHID LGMKYDPDIG IYGMNFYVDL KRPGDRVSKR KRFRSKIGNK QKISKEDAQK W FVDTFEGI LLE

+
分子 #38: uS4

分子名称: uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 21.724033 KDa
配列文字列: MANQFSKRLV HKPRNPFEKD RLIKEMQIVG KFGLKNKHEL RLVEKNFSND KKEARLLLTS NKVEDISINS RNLLDKLCTA GILNGIDLT SKEEILNGLN SILDLTIDSY LERTLQYKVY SSGLAKSVHH SRWLITKGQI SIQGVVIKRP NYVVKAEEEA F IELTPYSW ...文字列:
MANQFSKRLV HKPRNPFEKD RLIKEMQIVG KFGLKNKHEL RLVEKNFSND KKEARLLLTS NKVEDISINS RNLLDKLCTA GILNGIDLT SKEEILNGLN SILDLTIDSY LERTLQYKVY SSGLAKSVHH SRWLITKGQI SIQGVVIKRP NYVVKAEEEA F IELTPYSW SNNTKITKSQ KKKAAKTDEE E

+
分子 #39: eL37

分子名称: eL37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 10.699863 KDa
配列文字列:
MSKGTASFGK KNKRNHTLCK RCGKMSYHKQ LRKCASCAYP QPKMRTPGSI KARRRNALGT GRMRHLKKVI HEHVHGKKVN PILAAFWKT IKQD

+
分子 #40: eL13

分子名称: eL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 18.980395 KDa
配列文字列:
MKNNHILPNN HRNAMKRVKE WHNQPSRAQR RAKTRSSKAK VLYPAPLKKL CPIVRCPTIR YNKKQRLGKG FTPEELKEAG LEVNYARRI GIRVDNRRRN MNKETLDLNA QRLKEYLSKI TIFKNGKEAK ESGVKQHLGR IMPVHKMTPK VEIIKKAEVA S YE

+
分子 #41: uS17

分子名称: uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 18.230209 KDa
配列文字列:
MIDTTLKYKI FPEQKGVSLD PYATAEELKA SRRINEMREG FTVPKTAIDA TYIDKKCPFT GDVKVTGKIF EGVVYKMKAD KTIVVRINR LVYNKKYRRY GRRHTNVSTH MSPCFEGLIH VGDTVICGET RRLSKTKSSV VLDFRKKSTE GNFKRLEDF

+
分子 #42: eL39

分子名称: eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 6.462759 KDa
配列文字列:
MGSRKTEIIK TRLVRARRSN RAIPAWKSEL PEFKDKYNMK RRHWRAKKLK IY

+
分子 #43: eL14

分子名称: eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.99107 KDa
配列文字列:
MKFIELGRLV APIIKKERNI KAIIIGIIDS TFVVLKKSNG ENEVCPVSSL ILLDEVYDIK NLSSEEIVKL IENKKEEGGA SNDFERFKN KLREEVKKNI LREKGI

+
分子 #44: eL40

分子名称: eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 14.23956 KDa
配列文字列:
MSIICRFNNK SSFYAQETAA DLKQEISTRN ALSYDSILLS SGCRILEDTF QLSSLNGLEI NATVKCLGGG NMLDENDREL ANKRNKKLI CRRCNVRLSV NATNCRKKGC GSKDLRPKKQ LKPKALKK

+
分子 #45: eS12

分子名称: eS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 14.73195 KDa
配列文字列:
MSDEEYKPIV EQQYTLRDAL TQACRAARIS NNLAKGGREC VKKICANNAK FVLLAEDCEP KIKTVATFFA QKNKIPIISI EDRKELGRI LNFEKTNLAG KVRNNGCGIA LISEFNEKTK ASEFILNELE TN

+
分子 #46: eL15

分子名称: eL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 24.032008 KDa
配列文字列: MAAADYIREI QKAKQSDIMR YLLRLRVCEY RQRGEVFRVE RPTFLQRART LGYRNKEGVL CYIARVKKGN RKREYNNGNT RGKCKNARI HQITPAVRHQ ATAEQIVGKR HPNLRVLNSY WVNQDLVYKY FEVIMVDPFH NAIRNDPKLN WICKGVMKHR E CRGLTSAS ...文字列:
MAAADYIREI QKAKQSDIMR YLLRLRVCEY RQRGEVFRVE RPTFLQRART LGYRNKEGVL CYIARVKKGN RKREYNNGNT RGKCKNARI HQITPAVRHQ ATAEQIVGKR HPNLRVLNSY WVNQDLVYKY FEVIMVDPFH NAIRNDPKLN WICKGVMKHR E CRGLTSAS KKSRGLGHGI KYNNTIGGSV RACWKRNVTT SLRRFR

+
分子 #47: uS15

分子名称: uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 17.069088 KDa
配列文字列:
MAKMHSSGRG ISTSMKPFST MFPTWIDVSV DEIKADVLKM NTKGVSSAEI GNKLRDVYGV GDCKTIFDGL SLSRFLEKEG NFIEIPEDV KDLVKRANIL RKHINTHSRD KDSKYRLGLI ISRLNRCVKH YKKKLRIPST WKPKLVELIK

+
分子 #48: MDF2

分子名称: MDF2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 19.306686 KDa
配列文字列:
MEKQQNEKKL NEEETEKLAL TEEHPKKKVN EEDNLDTLPE KREEDIVFKK VNVEKNKEKE EDHNFSSNYA DHKIDLLSVE NKDFPKKQK KVKDSLHLLK ENRDRDFGRS KRGHVRNKKQ GRETGTRRIK IRKNNYESND INNYNIKTIS KKSRRKEAER Q

+
分子 #49: MDF1

分子名称: MDF1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 19.264152 KDa
配列文字列:
MKYELIAKAD FDNIKGLSCD QTYPAILSCT ACSFVHPKVV ILTSESTIKE PNVYKCNWEM KCHSCKNDIK VSIYKSPSLS TVNIKDRYE DDVLVSYNPV NKNECLLSIL ECSGGEIREI KNVPLNILTD DLRLFNEKVV DEKRSLAEVY GNNKTYSIIN Y ELEIRRVK

+
分子 #50: uL13

分子名称: uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 22.335594 KDa
配列文字列: MHKHIVVDAS NHVAGKLASK IAKFLLEGHK VTVLCTERSI LTGPLDRSIL KFKSFMNKRC RVNPRKGPFH HVLPSMRFKR IIRGMIPYK FHKGKEALKN LECHEGIPSE FINSERVMFP ECLLKYCNKP GKKYCLLGEL LVKFGWKHSK IVKELTDSIL E KEKSRETT ...文字列:
MHKHIVVDAS NHVAGKLASK IAKFLLEGHK VTVLCTERSI LTGPLDRSIL KFKSFMNKRC RVNPRKGPFH HVLPSMRFKR IIRGMIPYK FHKGKEALKN LECHEGIPSE FINSERVMFP ECLLKYCNKP GKKYCLLGEL LVKFGWKHSK IVKELTDSIL E KEKSRETT SEIEKIVESK EFQDELEKRL LSLK

+
分子 #51: uS11

分子名称: uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 14.468902 KDa
配列文字列:
MTEAIETSNE YTAICHIKAT KNNTIIHVTD ITGSETICRI SGGMRVKSKR DEGSPYAAMI AAQDVAAIIA KRGVKTVHFM LRGAGGVKP KALGAGAQVA VRSIIRSGIK MGRIEDVTPE PTDKVRMKGG HRGRRV

+
分子 #52: eL42

分子名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 12.015686 KDa
配列文字列:
MVNLPKVRRT HCAHCNAHTV HKVSLYKKSK DSEIVSGARR YRLKQKTIGQ TKPILKRKAK LTKKIMLKLE CPKCKKIQQK VCKRAKHVV MGGEKKRKNE ALEY

+
分子 #53: uL22

分子名称: uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 19.434643 KDa
配列文字列:
MAINFAYDVV DPTKVIKSQI DSARVSFKKT RETANTLRKR SLLNAISYLN NVVVKKECVP MRRYARGCGH TRQARAFNQR KGRWPKKSA LALLQVLENI KEQAVEKGLE VEKLDLDHVQ ICRAPKVFGR IFRAHGRVNP FNKSPCHILV AAKVRDLEVN E ENDIMKQE E

+
分子 #54: uS19

分子名称: uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 16.041918 KDa
配列文字列:
MAPTEKKSFR KFSYRGVDFD IIKNMKFSEY AELLPSRLRR RVKRGLSGRE VELIKSCIAS KEAMTNAHEK PEIVKTHARS AIIWPCMVG SIVGVHVGNG YLPIEIRPEM LGCLLSDFAP TRVHPKHGKP GIADHAGSKF VPLK

+
分子 #55: eL43

分子名称: eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 9.826513 KDa
配列文字列:
MSNGTKKVGI SGRFGARYGS TLRKRMKKVL ETQKKTYECR ACGKTSVKRD VVGIWTCRSC KIKFAGGAYA YVTPAGTTFN NMLKQSNAN

+
分子 #56: eL18

分子名称: eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 21.878799 KDa
配列文字列: MAITFAKKII PKSTVIKRKT VKSPNPLLQS LADFYIKVAK NCSNDDIKRI AKRLTMSNKD RPVVRVSEIV KSLNEDSDKV AVVVGKVLD DERLVTLPPM RIVALDWSKS VQEKVERSSG KFFTLDQLFK ICSDLNNMVL IQGDRMKRKS AKYWGKSPGQ K GSTTLPRA ...文字列:
MAITFAKKII PKSTVIKRKT VKSPNPLLQS LADFYIKVAK NCSNDDIKRI AKRLTMSNKD RPVVRVSEIV KSLNEDSDKV AVVVGKVLD DERLVTLPPM RIVALDWSKS VQEKVERSSG KFFTLDQLFK ICSDLNNMVL IQGDRMKRKS AKYWGKSPGQ K GSTTLPRA NKKQRGGEKR IRMKGRKASN KKSEN

+
分子 #57: uS9

分子名称: uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 17.545838 KDa
配列文字列:
MTGTIKSVIT QGKRKTALAT CKCSESEEMS ILVDKVPYKI LSNKLMLSKI KEIICVVDDV NLKNLSFQIT TKIKEGVVTH KKGNGEVAL AYAVRMAFAK AIVAYYGTYC DEWKKQEIKK VLMSFDRYCL VGDIRKKEPK KFGGPGARAR YQKSYR

+
分子 #58: eL19

分子名称: eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 20.38517 KDa
配列文字列:
MESEKKINKS EKARSMAAKV LNCGKNKIWL DPSGKEQINQ VSTREQIRQL IDDNVIIKKL DKYNSKGRSR IYKEAVAKGR HMGLGKRLG TANARLNKKT LWIKKIRVMR KELKDMKAEG KINAEEYQLF RKRAKGNLFK NRVTMKEHIA KKQAAELRIK E LEEQAKAL KMKKNSN

+
分子 #59: eS17

分子名称: eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 13.964234 KDa
配列文字列:
GNIRNRVIKR AARQIVEKHF LSLDKSFDDN LLVVQDVALV QSKRVRNQIA GYVTHLYKCI LKGTAKKLYI KSHEDEREKK ENIMPKDSI MDTEVVEVDP MTLEMLNKNE YRGNFKLITY

+
分子 #60: eL20

分子名称: eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 20.986186 KDa
配列文字列:
MDFAKRNYTV PPFKEYKLSA CLTPTSKNPQ PQIYESTIYA QNHVFARSKF FKLLNDKYKL KPSKLVLLGA EEIKEQVTGE VKNYGISFV FRCKKGLQNS YREFRAISRV SALDFLFREA AIRIRCKRND IFVIDIKELE DEEIKTGKVA EFNQPDLKFP V FGKYANTR DLYVPVNTNL SD

+
分子 #61: uS13

分子名称: uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 18.051969 KDa
配列文字列:
MSAENEVRSY TSDPQELQHI IRIFNTNVDG TKRIAHALCA ITGVGKRISN AICKRVGVDV LRRAGDLNSD ELEKIQKAIA DPTSVGIPT SFFNFKRNPV DGNDVHLVST RMDAEYRMML EKGKKMRHVR LCRVACGLKV HGQRSKSNGR HIRAGMVFRR K

+
分子 #62: eL21

分子名称: eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 18.675842 KDa
配列文字列:
MSAGGYRRKT RQLLKQPFRK HGTPGLSVYL ATYRIGDYVT ISINPSIHKG MPFKYYHGRT GRVFTVNPKS VGVVLHKKVN GRLSVKTIF VRVEHLKKYK GRDAFLERVN KNNEILKEAR EKGIKLEYIR QKEEGPREEF ILNLDENKPV KVGYEPFIKV Y

+
分子 #63: eS19

分子名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 15.276587 KDa
配列文字列:
MDEIYTVKTT DFVNILKKSL QSNTDITLPK DHDILKTSTG KENCPVSDDW YYARMAAILN LIAKKGNMTV EEACVEFGNY KNRGRRPSM FVKADEMFMK SIFENLEKIG YLKENKLTSN AKEIIMDVIQ SLSE

+
分子 #64: eL22

分子名称: eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 12.327101 KDa
配列文字列:
MSKDNSQKKE YSIDCTHPAS DNLLSPSDLQ SHLEEKIKTY TGKKEKLLEV SVNDTTVVVK VNEDIINKQG LKNVIRRFLH AKRLSAFIK VYGDKKNGFE FRYMNVAE

+
分子 #65: uS10

分子名称: uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.507375 KDa
配列文字列:
MKVHIDISTT NKSAITLACE KFEAFAENFI ESLEKEVLPK QVGLVPTLKT PCGQGTKTWA KYKIIVHQVR YVITSSHDQL EKVIQFLKN FPEININLGI YN

+
分子 #66: uL14

分子名称: uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 16.046837 KDa
配列文字列:
MAAEKKVDSG EKKVARKPHR RMTKGCQMET LLKCADNSGA KLLKVIGVRG YKGRLNRYPA AAPGDIVVVS CKKGKPDLRK KVHYAILVR QKKVWRREDG THIGFEDNAA VLITAKGDMR GGQISGSLPK EVAECWPKIS NSGNSIN

+
分子 #67: eS21

分子名称: eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 7.575512 KDa
配列文字列:
MFERRICSFT KRPIASSDKS SVQITLADID ENGRLLNTIS TYDVCGVVRR NGLSDGYLTD KIFGEEY

+
分子 #68: eL24

分子名称: eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 10.363153 KDa
配列文字列:
MIDGISIYSG RAIPKGSSTV RITNDGKQQL TANKKERSLI SRKINPKLVK WTIPSRVVRK KHELFTSSQK NIPRPARIER GFRNISADL LK

+
分子 #69: uS8

分子名称: uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 14.515831 KDa
配列文字列:
MKQLSNLCKA INNASRAGKR QLLLHESNSV TRDFLKQMLK HGYITKYSYV DDKRKGKTIV WLNGRLNKCG AICPNYKVSL DHIENYRSR LLPARQFGHL LFSTEKGIID HNECIGSNLG GSILGFFY

+
分子 #70: uL23

分子名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.569789 KDa
配列文字列:
METVKKETKR IIPKPDIVPQ DIIKNIHTSE KAMRNVEMHN TLVLIVDKKF NKRQIRNAVT KLYGCPCIKV NTLIDFKGRK KAYAKLKND GDAIKIAGQS GAI

+
分子 #71: uS12

分子名称: uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 15.494265 KDa
配列文字列:
MNGLFAANDL IKSRKVKRRS DPYYRKKILG TKYKHSKIGN GPQAKGIVLE KTGVEAKQPN SAVRKIVKIQ LIKTGKKISA FVPHDGSLN YIELNDEVVV EGFGKKGHSC GDIPGISYKV VKVQNVSLLA LFKGKKEKPS R

+
分子 #72: msL1

分子名称: msL1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 8.746567 KDa
配列文字列:
MASKLKKSWK DEKKKSKTAI FSLEKQKVMK QERLQKAKIL REKIKGLKEK KKQYYLDLAR QKADKLEADK LLN

+
分子 #73: uL24

分子名称: uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 16.133752 KDa
配列文字列:
MLAGRKTKSS LRKKQRKALF TAVGKDRLKR MSSHLSEELR SQYGFRSFPV AVGDIVKVHS GPYKGKEGQI LEVFLKDYRI TVEGCLEEN EEKENVPAKL HPCNVTFVKF NMDNGREKQL EEKKIARVQH IEREQKKIVQ

+
分子 #74: eS24

分子名称: eS24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 15.526099 KDa
配列文字列:
MAANCELEIL LQKSNSLLSR KELSLKIHHE ESPVPQKKVI TDKLSKLFQT KNDNIVVYDI TNTPGTHTSI GRVNIYSNQD DMKRVEKSY MVARKTGETS IRKPRRTRKD ERKKAYKRFG TVKRAMKKAE RKNK

+
分子 #75: eL27

分子名称: eL27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 14.489164 KDa
配列文字列:
MLFIPNMIVI PTAGKFAGKK AVVVKNLDNR NVLIAGVQRL PKESEDYMSK VEKRKNDRFL SFVKKVNVRH LMATRYKADI GLGEADYSK IDDLNIKKEV RNKVVEIMKK AQESGKAKFL FTELKFQ

+
分子 #76: eS25

分子名称: eS25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 13.935506 KDa
配列文字列:
MAKKVQETKE KKALKAASTS KKEKKKWTEI KKKDEARKVF TVSDELLQKV EKEVKKMKIV TIFSLGSKMN LTLSVSKNLL RHCVNKGII SLIHKSQQTS IYGQPIEVQA PVESVVPVEE VVTE

+
分子 #77: eS10

分子名称: eS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Vairimorpha necatrix (菌類)
分子量理論値: 11.795443 KDa
配列文字列:
MSLTNSQKVA VMKHFKNKGS LLVYDRKLEK NEILDINNKK LRSYIQSLKD QGYIEEHYVW QQLYCFATES GMKYFNDQLE IPDVIEEGI RMEAVQQKEE

+
分子 #79: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 79 / コピー数: 174 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #80: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 80 / コピー数: 9 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度11 mg/mL
緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度名称
30.0 mMTris-HCL
5.0 mMMgOAc
25.0 mMKCl
1.0 mMDTT
1.0 mMEDTA
グリッド材質: COPPER / メッシュ: 400 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2.0 nm / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 雰囲気: AIR / 詳細: 50 mA
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 295 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TALOS ARCTICA
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 撮影したグリッド数: 2 / 実像数: 3284 / 平均露光時間: 0.25 sec. / 平均電子線量: 5.55 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系最小 デフォーカス（補正後）: 4.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 最小 デフォーカス（公称値）: 0.5 µm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 471121
CTF補正ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3)
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL / In silico モデル: cryoSPARC generated initial model
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3) / 使用した粒子像数: 185445
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3)
最終 3次元分類クラス数: 2 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

4v88

精密化空間: REAL / プロトコル: OTHER
得られたモデル

PDB-6rm3:
Evolutionary compaction and adaptation visualized by the structure of the dormant microsporidian ribosome

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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