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データを開く
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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
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タイトル | AgamOR28 structure without ligand | |||||||||
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![]() | Mosquitoes / ![]() ![]() ![]() | |||||||||
機能・相同性 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Zhao J / del Marmol J | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis of odor sensing by insect heteromeric odorant receptors 著者: Zhao J / Chen AQ / Ryu J / del Marmol J | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 27.4 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 15.5 KB 15.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 7.9 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 155 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 5.8 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 48.9 MB 48.9 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ |
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密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-ハーフマップ: #2
ファイル | emd_42945_half_map_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: #1
ファイル | emd_42945_half_map_2.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
-全体 : AgamOR28 heterotetramer without ligand
全体 | 名称: AgamOR28 heterotetramer without ligand |
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要素 |
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-超分子 #1: AgamOR28 heterotetramer without ligand
超分子 | 名称: AgamOR28 heterotetramer without ligand / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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-超分子 #2: Anopheles gambiae OR28
超分子 | 名称: Anopheles gambiae OR28 / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
-超分子 #3: Apocrypta bakeri Orco
超分子 | 名称: Apocrypta bakeri Orco / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-分子 #1: OR28
分子 | 名称: OR28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 45.826898 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MARLVLHEVR YVLMAMLYIS RGMAKQIQNS TIDLYVYWFL TFIPIASLCV PQFTYLVVDT KSLIDFISVL VPITEILLTN GKMIICNVK RGKIINLINQ VQVAWDECAK SEHLEIQTLI TATAKKTKIF VIIYTTSFLL ICVEYSSMPL FKLIYHSAVY G KQSNYTIA ...文字列: MARLVLHEVR YVLMAMLYIS RGMAKQIQNS TIDLYVYWFL TFIPIASLCV PQFTYLVVDT KSLIDFISVL VPITEILLTN GKMIICNVK RGKIINLINQ VQVAWDECAK SEHLEIQTLI TATAKKTKIF VIIYTTSFLL ICVEYSSMPL FKLIYHSAVY G KQSNYTIA LPYLSRFAYS TESTTSFAWT YFFILLGVYL LALTLSGFDS LFATLVMHVK MMFKVLKFEI EQLGLDLSAG KS HVELQAK LKQIILKHKT NLSLIEQLED GFSFFLMAQF LTSSILVCVV LYELTMVFGW NEDTFKTVTY LPGAILQLFL FCW YAQQIT EEARLVSDHI YNIPWYLADP KLQKDILTFM VKAQKPTGVT ASKFYMVTLQ TFQRISSTSY SYFTLLQTIN QQ UniProtKB: Uncharacterized protein |
-分子 #2: Odorant receptor Orco
分子 | 名称: Odorant receptor Orco / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 3 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 53.204953 KDa |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
配列 | 文字列: MKFKHQGLVA DLLPNIRVMQ GVGHFMFNYY SEGKKFPHRI YCIVTLLLLL LQYGMMAVNL MMESDDVDDL TANTITMLFF LHPIVKMIY FPVRSKIFYK TLAIWNNPNS HPLFAESNAR FHALAITKMR RLLFCVAGAT IFSVISWTGI TFIEDSVKRI T DPETNETT ...文字列: MKFKHQGLVA DLLPNIRVMQ GVGHFMFNYY SEGKKFPHRI YCIVTLLLLL LQYGMMAVNL MMESDDVDDL TANTITMLFF LHPIVKMIY FPVRSKIFYK TLAIWNNPNS HPLFAESNAR FHALAITKMR RLLFCVAGAT IFSVISWTGI TFIEDSVKRI T DPETNETT IIPIPRLMIR TFYPFNAMSG AGHVFALIYQ FYYLVISMAV SNSLDVLFCS WLLFACEQLQ HLKAIMKPLM EL SATLDTV VPNSGELFKA GSADHLRESQ GVQPSGNGDN VLDVDLRGIY SNRQDFTATF RPTAGTTFNG GVGPNGLTKK QEM LVRSAI KYWVERHKHV VRLVTAVGDA YGVALLLHML TTTITLTLLA YQATKVNGVN VYAATVIGYL LYTLGQVFLF CIFG NRLIE ESSSVMEAAY SCHWYDGSEE AKTFVQIVCQ QCQKAMSISG AKFFTVSLDL FASVLGAVVT YFMVLVQLK UniProtKB: Odorant receptor |
-実験情報
-構造解析
手法 | ![]() |
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![]() | ![]() |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD![]() |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |