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- EMDB-42168: In-situ complex I with Q10 (State-gamma) -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-42168
タイトルIn-situ complex I with Q10 (State-gamma)
マップデータIn-situ complex I with Q10intermediate-II
試料
  • 複合体: In-situ cryo-EM structure of respiratory supercomplex by directly imaging mitochondria
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
  • リガンド: x 14種
キーワードin-situ cryo-EM structure / mammalian (哺乳類) / mitochondria (ミトコンドリア) / respiratory supercomplex / proton pumping / membrane protein (膜タンパク質) / electron transport (電子伝達系)
機能・相同性
機能・相同性情報


RHOG GTPase cycle / deoxynucleoside kinase activity / Complex I biogenesis / Respiratory electron transport / Neutrophil degranulation / Mitochondrial protein degradation / cardiac muscle tissue development / ubiquinone-6 biosynthetic process / 細胞呼吸 / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H ...RHOG GTPase cycle / deoxynucleoside kinase activity / Complex I biogenesis / Respiratory electron transport / Neutrophil degranulation / Mitochondrial protein degradation / cardiac muscle tissue development / ubiquinone-6 biosynthetic process / 細胞呼吸 / oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H / NADH dehydrogenase activity / NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型) / mitochondrial ATP synthesis coupled electron transport / mitochondrial respiratory chain complex I / ubiquinone binding / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / acyl binding / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / acyl carrier activity / electron transport coupled proton transport / quinone binding / ATP synthesis coupled electron transport / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway / 細胞呼吸 / response to cAMP / respiratory electron transport chain / reactive oxygen species metabolic process / 電子伝達系 / regulation of protein phosphorylation / brain development / ミトコンドリア / negative regulation of cell growth / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / NAD binding / positive regulation of fibroblast proliferation / FMN binding / nervous system development / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / ミトコンドリア内膜 / nuclear body / ミトコンドリアマトリックス / protein-containing complex binding / ミトコンドリア / 核質 / metal ion binding / 細胞質基質 / 細胞質
類似検索 - 分子機能
NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family ...NADH-ubiquinone oxidoreductase 1 subunit C1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase flavoprotein 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, NDUB1 / MNLL subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / Tim17/Tim22/Tim23/Pmp24 family / NADH-ubiquinone oxidoreductase, subunit 10 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex subunit 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase MWFE subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / Zinc finger, CHCC-type / Zinc-finger domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NDUC2 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit NDUFB4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit b14.5b (NDUFC2) / NADH-ubiquinone oxidoreductase B15 subunit (NDUFB4) / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / GRIM-19 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / GRIM-19 protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / NDUFB9, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / ETC complex I subunit conserved region / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / Deoxynucleoside kinase domain / デオキシヌクレオシドキナーゼ / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 20 Kd subunit signature. / NADH-ubiquinone oxidoreductase, 20 Kd subunit / NADH-quinone oxidoreductase, chain I / NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit D/H / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 49kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 49 Kd subunit signature. / NADH-quinone oxidoreductase, subunit D / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 49 Kd subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6, subunit NuoJ / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / 2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain / Complex 1 LYR protein domain / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 6 / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 6 / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / Complex 1 protein (LYR family) / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit V3 ...NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit V3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
類似検索 - 構成要素
生物種Sus scrofa (ブタ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.5 Å
データ登録者Zheng W / Zhu J / Zhang K
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)1R35GM142959 米国
引用ジャーナル: Nature / 年: 2024
タイトル: High-resolution in situ structures of mammalian respiratory supercomplexes.
著者: Wan Zheng / Pengxin Chai / Jiapeng Zhu / Kai Zhang /
要旨: Mitochondria play a pivotal part in ATP energy production through oxidative phosphorylation, which occurs within the inner membrane through a series of respiratory complexes. Despite extensive in ...Mitochondria play a pivotal part in ATP energy production through oxidative phosphorylation, which occurs within the inner membrane through a series of respiratory complexes. Despite extensive in vitro structural studies, determining the atomic details of their molecular mechanisms in physiological states remains a major challenge, primarily because of loss of the native environment during purification. Here we directly image porcine mitochondria using an in situ cryo-electron microscopy approach. This enables us to determine the structures of various high-order assemblies of respiratory supercomplexes in their native states. We identify four main supercomplex organizations: IIIIIV, IIIIIV, IIIIIV and IIIIIV, which potentially expand into higher-order arrays on the inner membranes. These diverse supercomplexes are largely formed by 'protein-lipids-protein' interactions, which in turn have a substantial impact on the local geometry of the surrounding membranes. Our in situ structures also capture numerous reactive intermediates within these respiratory supercomplexes, shedding light on the dynamic processes of the ubiquinone/ubiquinol exchange mechanism in complex I and the Q-cycle in complex III. Structural comparison of supercomplexes from mitochondria treated under different conditions indicates a possible correlation between conformational states of complexes I and III, probably in response to environmental changes. By preserving the native membrane environment, our approach enables structural studies of mitochondrial respiratory supercomplexes in reaction at high resolution across multiple scales, from atomic-level details to the broader subcellular context.
履歴
登録2023年10月2日-
ヘッダ(付随情報) 公開2024年6月19日-
マップ公開2024年6月19日-
更新2024年6月19日-
現状2024年6月19日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_42168.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_42168.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈In-situ complex I with Q10intermediate-II
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.39 Å/pix.
x 320 pix.
= 444.8 Å		1.39 Å/pix.
x 320 pix.
= 444.8 Å		1.39 Å/pix.
x 320 pix.
= 444.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.39 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.15
最小 - 最大-0.27181423 - 0.9244005
平均 (標準偏差)0.00060142734 (±0.020145336)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 444.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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ハーフマップ: In-situ complex I with Q10intermediate-II

ファイルemd_42168_half_map_1.map
注釈In-situ complex I with Q10intermediate-II
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: In-situ complex I with Q10intermediate-II

ファイルemd_42168_half_map_2.map
注釈In-situ complex I with Q10intermediate-II
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : In-situ cryo-EM structure of respiratory supercomplex by directly...

全体名称: In-situ cryo-EM structure of respiratory supercomplex by directly imaging mitochondria
要素
  • 複合体: In-situ cryo-EM structure of respiratory supercomplex by directly imaging mitochondria
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit AB1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 isoform X1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 [Sus scrofa]
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER鉄・硫黄クラスター
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDEフラビンモノヌクレオチド
  • リガンド: POTASSIUM IONカリウム
  • リガンド: UBIQUINONE-10ユビキノン
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
  • リガンド: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATEグアノシン三リン酸
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate
  • リガンド: MYRISTIC ACIDミリスチン酸

+
超分子 #1: In-situ cryo-EM structure of respiratory supercomplex by directly...

超分子名称: In-situ cryo-EM structure of respiratory supercomplex by directly imaging mitochondria
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#44
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)

+
分子 #1: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 13.026458 KDa
配列文字列:
(FME)NIMLTLLTN VTLASLLVLI AFWLPQLNAY SEKTSPYECG FDPMGSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLP WAS QTNNLKTMLT MALFLLILLA ASLAYEWTQK GLEWAE

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

+
分子 #2: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 28.228912 KDa
配列文字列: MRNVSTQVPV SAHRPSRFGQ RPRIPGALQR TDRRGCLKAE AEMAALAASG LLRPILALRS SMGAAVQVRF VHPSAATDSP SSSQPAVSQ AGAVVSKPTT LRGEYVVAKL DDLVNWARRS SLWPMTFGLA CCAVEMMHMA APRYDMDRFG VVFRASPRQS D VMIVAGTL ...文字列:
MRNVSTQVPV SAHRPSRFGQ RPRIPGALQR TDRRGCLKAE AEMAALAASG LLRPILALRS SMGAAVQVRF VHPSAATDSP SSSQPAVSQ AGAVVSKPTT LRGEYVVAKL DDLVNWARRS SLWPMTFGLA CCAVEMMHMA APRYDMDRFG VVFRASPRQS D VMIVAGTL TNKMAPALRK VYDQMPEPRY VVSMGSCANG GGYYHYSYSV VRGCDRIVPV DIYVPGCPPT AEALLYGILQ LQ RKIKREK RLRIWYRR

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial

+
分子 #3: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 30.154318 KDa
配列文字列: MAAAAAARGC WRGLVGPAAV ARVSGRPSVL LLPVRKESAA ADTRPTIRPR NDVVHKQLSA FGQYVAEILP KYVQQVQVSC FNELEIFIH PDGVIPVLTF LRDHTNAQFK SLADLTAVDV PTRQNRFEIV YNLLSLRFNS QIRVKTYTDE LTPIESSVTV Y KAANWYER ...文字列:
MAAAAAARGC WRGLVGPAAV ARVSGRPSVL LLPVRKESAA ADTRPTIRPR NDVVHKQLSA FGQYVAEILP KYVQQVQVSC FNELEIFIH PDGVIPVLTF LRDHTNAQFK SLADLTAVDV PTRQNRFEIV YNLLSLRFNS QIRVKTYTDE LTPIESSVTV Y KAANWYER EIWDMFGVFF ANHPDLRRIL TGYGFEGHPF RKDFPLSGYV ELRYDDEVKR VVAEPVELAQ EFRKFDLNSP WE AFPAYRQ PPEDLKLEAG DKKPETK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial

+
分子 #4: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 54.168074 KDa
配列文字列: MAALRALCSL RGVAAQVLRP GAGARLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQFGGA VMYPTKETAH WKPPPWNGNY YWPNYFPLLS DVDPPKDTL VSNLTLNFGP QHPAAHGVLR LVMELSGEMV RKCDPHIGLL HRGTEKLIEY KTYLQALPYF DRLDYVSMMC N EQAYSLAV ...文字列:
MAALRALCSL RGVAAQVLRP GAGARLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQFGGA VMYPTKETAH WKPPPWNGNY YWPNYFPLLS DVDPPKDTL VSNLTLNFGP QHPAAHGVLR LVMELSGEMV RKCDPHIGLL HRGTEKLIEY KTYLQALPYF DRLDYVSMMC N EQAYSLAV EKLLNIQPPP RAQWIRVLFG EITRLLNHIM AVTTHALDIG AMTPFFWMFE EREKMFEFYE RVSGARMHAA YI RPGGVHQ DLPLGLLDDI YEFSKNFSFR IDELEEMLTN NRIWRNRTVD IGVVTAEDAL NYGFSGVMLR GSGIQWDLRK TQP YDVYDQ VEFDVPIGSR GDCYDRYLCR VEEMRQSLRI ISQCLNKMPP GEIKVDDAKV SPPKRAEMKT SMESLIHHFK LYTE GYQVP PGATYTAIEA PKGEFGVYLV SDGSSRPYRC KIKAPGFAHL AGLDKMSKGH MLADVVAIIG TQDIVFGEVD R

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial

+
分子 #5: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 27.439533 KDa
配列文字列: MFLTAALRAR ATGFTAQWGR HVRNLHKTAV QNGAGGALFV HRDTPENNPD TPFDFTPENY KRIEAIVKNY PEGHKAAAVL PVLDLAQRQ NGWLPISAMN KVAEILQVPP MRVYEVATFY TMYNRKPVGK YHIQVCTTTP CMLRNSDSIL EAIQKKLGIK V GETTPDKL ...文字列:
MFLTAALRAR ATGFTAQWGR HVRNLHKTAV QNGAGGALFV HRDTPENNPD TPFDFTPENY KRIEAIVKNY PEGHKAAAVL PVLDLAQRQ NGWLPISAMN KVAEILQVPP MRVYEVATFY TMYNRKPVGK YHIQVCTTTP CMLRNSDSIL EAIQKKLGIK V GETTPDKL FTLIEVECLG ACVNAPMVQI NDNYYEDLTP KDIEEIIDEL KAGKIPKPGP RSGRFSCEPA GGLTSLTEPP KG PGFGVQA GL

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial

+
分子 #6: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 50.637766 KDa
配列文字列: MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN ...文字列:
MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG SGYDFDVFVV RGAGAYICGE ETALIESIEG KQGKPRLKPP FPADVGVFGC PT TVANVET VAVSPTICRR GGAWFASFGR ERNSGTKLFN ISGHVNHPCT VEEEMSVPLK ELIEKHAGGV IGGWDNLLAV IPG GSSTPL IPKSVCETVL MDFDALVQAQ TGLGTAAVIV MDRSTDIVKA IARLIEFYKH ESCGQCTPCR EGVDWMNKVM ARFV KGDAR PAEIDSLWEI SKQIEGHTIC ALGDGAAWPV QGLIRHFRPE LEERMQQFAL QHQARQAAS

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

+
分子 #7: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 79.627398 KDa
配列文字列: MLRIPVTRAL IGLSKSPKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKS KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL ...文字列:
MLRIPVTRAL IGLSKSPKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKS KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL VKTIMTRCIQ CTRCIRFASE IAGVDDLGTT GRGNDMQVGT YIEKMFMSEL SGNIIDICPV GALTSKPYAF TA RPWETRK TESIDVMDAV GSNIVVSTRT GEVMRILPRM HEDINEEWIS DKTRFAYDGL KRQRLTQPMI RNEKGLLTYT TWE DALSRV AGMLQSFQGN DVAAIAGGLV DAEALVALKD LLNRVDSDSL CTEEVFPTAG AGTDLRSNYL LNTTIAGVEE ADVI LLVGT NPRFEAPLFN ARIRKSWLHN DLKVALIGSP VDLTYRYDHL GDSPKILQDI ASGNHPFSQI LKEAKKPMVV LGSSA LQRS DGTAILAAVS NIAQNIRLSS GVTGDWKVMN ILHRIASQVA ALDLGYKPGV EAIRKNPPKV LFLLGADGGC ITRQDL PKD CFIIYQGHHG DVGAPMADVI LPGAAYTEKS ATYVNTEGRA QQTKVAVTPP GLAREDWKII RALSEIAGMT LPYDTLD QV RSRLEEVSPN LVRYDDVEGA NYFQQANELS KLVNQQLLAD PLVPPQLTIK DFYMTDSISR ASQTMAKCVK AVTEGIQA V EEPSIC

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial

+
分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 35.619434 KDa
配列文字列: (FME)FMINILSLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQLRKGPNVV GPYGLLQPIA DALKLVTKEP LRPGTSSISM FIIAPI LGL SLALTMWVPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLM NG ...文字列:
(FME)FMINILSLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQLRKGPNVV GPYGLLQPIA DALKLVTKEP LRPGTSSISM FIIAPI LGL SLALTMWVPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLM NG SYTLSTLITT QEHIWMIFTS WPLAMMWFIS TLAETNRAPF DLTEGESELV SGFNVEYAAG PFAMFFMAEY ANIIMMNA F TAILFLGASH DPHTPELYTI NFVLKTLALT ITFLWIRASY PRFRYDQLMH LLWKSFLPLT LALCMWHISL PIMTASIPP QS

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

+
分子 #9: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 27.135039 KDa
配列文字列: MEASQECRLR LSVDRPPPHG KERQRFKMRC LSTPMLLRAL AQAQAAHAGH PSARTLHSSA VAATYKFVNM REPSMDMKSV TDRAAQTLL WTELVRGLGM TLSYLFREPA TINYPFEKGP LSPRFRGEHA LRRYPSGEER CIACKLCEAV CPAQAITIEA E PRADGSRR ...文字列:
MEASQECRLR LSVDRPPPHG KERQRFKMRC LSTPMLLRAL AQAQAAHAGH PSARTLHSSA VAATYKFVNM REPSMDMKSV TDRAAQTLL WTELVRGLGM TLSYLFREPA TINYPFEKGP LSPRFRGEHA LRRYPSGEER CIACKLCEAV CPAQAITIEA E PRADGSRR TTRYDIDMTK CIYCGFCQEA CPVDAIVEGP NFEFSTETHE ELLYNKEKLL NNGDKWEAEI AANIQADYLY R

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 19.049342 KDa
配列文字列:
(FME)TMYIAFILS TIFVIGFVGF SSKPSPIYGG LGLIVSGGVG CGIVLNFGGS FLGLMVFLIY LGGMLVVFGY TTAMAT EMY PEVWVSNKTV FGAFVSGLMM EFCMVYYALK EEEVEIIFKF NGLGDWVIYD TGDSGFFSEE AMGIAALYSY GTWLVIV TG WSLLIGVVVI MEITRGN

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 10.855263 KDa
配列文字列:
(FME)PLVYMNIIM AFAIALAGLL MYRSHLMSSL LCLEGMMLSL FIMSTLIILN THFTLANMMP IILLVFAACE AALGLS LLV MVSNTYGTDY VQNLNLLQC

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 68.723508 KDa
配列文字列: (FME)NPFASLTLT TLIILTIPIM MSNSNIYKTN LYPNYVKTTV SYAFTLSLVP LLMFMHTGQE MIISNWHWMT LQTVEL SLS FKMDYFSVMF IPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPFINRFFK YLVLFLITMM ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW ...文字列:
(FME)NPFASLTLT TLIILTIPIM MSNSNIYKTN LYPNYVKTTV SYAFTLSLVP LLMFMHTGQE MIISNWHWMT LQTVEL SLS FKMDYFSVMF IPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPFINRFFK YLVLFLITMM ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW HGRTDANTAA LQAILYNRIG DIGFVLSMAW FLTHSNAWDL QQIFMLNNEC PNMPLIGLLL AAAGKSAQFG LHPWLPSA M EGPTPVSALL HSSTMVVAGV FLLIRFYPLM ETNKLVQTMT LCLGAITTLF TALCAITQND IKKIVAFSTS SQLGLMMVT IGINQPHLAF LHICMHAFFK AMLFMCSGSI IHSLNDEQDI RKMGGLYKAM PFTTTALIIG SLALTGMPYL TGFYSKDLII EAVNMSYTN AWALLMTLIA TSLTAAYSTR IIFFAFLGKP RFPPLVLINE NNPLLINSIK RLLIGSIFAG FIISNNIPPM T VPNTTMPL YMKMTALIVT IMGFMLALEL NNTTYYLKFK YPSQTYKFSN MLGYYPSIMH RLPTYHNLSM SQKSASSLLD LI WLETILP KTTSFIQMKM SIMVSNQKGL IKLYFLSFLI TIMISMTLFN YHE

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 51.887395 KDa
配列文字列: (FME)LKIIIPTTM LLPMTWMSKH NMIWINATVH SLLISLISLS LLNQLGENSL NFSLTFFSDS LSAPLLVLTT WLLPLM LMA SQSHLSKETT TRKKLYITML ILLQLFLIMT FTATELILFY ILFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAG SL ...文字列:
(FME)LKIIIPTTM LLPMTWMSKH NMIWINATVH SLLISLISLS LLNQLGENSL NFSLTFFSDS LSAPLLVLTT WLLPLM LMA SQSHLSKETT TRKKLYITML ILLQLFLIMT FTATELILFY ILFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAG SL PLLVALVYIQ NTTGSLNFLI IHYWSHPLSN SWSNIFMWLA CIMAFMVKMP LYGLHLWLPK AHVEAPIAGS MVLAAVLL K LGGYGMMRIT TILNPLTNYM AYPFLMLSMW GMIMTSSICL RQTDLKSLIA YSSVSHMALV IVAIMIQTPW SFMGATALM IAHGLTSSML FCLANTNYER VHSRTMILAR GLQTLLPLMA TWWLMASLTN LALPPSINLI GELFIITASF SWSNITIILM GMNMMITAL YSLYMLITTQ RGKYTHHINN IKASFTRENA LMALHILPLL LLTLNPKMIL GPLY

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

+
分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: NADH:ユビキノン還元酵素 (水素イオン輸送型)
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 39.105512 KDa
配列文字列: (FME)NPIIYTTLI MTVMSGTMLV MISSHWLLIW IGFEMNLLAM IPVLMKNFNP RATEAATKYF LTQATASMML MMAIII NLL YSGQWTITKM FNPVAMTMMT MALAMKLGLS PFHFWVPEVT QGISLQAGLL LLTWQKLAPL SVLCQISQSI NPNLMLT MA ...文字列:
(FME)NPIIYTTLI MTVMSGTMLV MISSHWLLIW IGFEMNLLAM IPVLMKNFNP RATEAATKYF LTQATASMML MMAIII NLL YSGQWTITKM FNPVAMTMMT MALAMKLGLS PFHFWVPEVT QGISLQAGLL LLTWQKLAPL SVLCQISQSI NPNLMLT MA MLSILIGGWG GLNQTQLRKI MAYSSIAHMG WMTAVLPYNT TMTILNLLIY ITMTLAMFML LIHSSATTTL SLSHTWNK M PVITSLMMVT LLSMGGLPPL SGFMPKWMII QEMTKNESII MPTLMAMTAL LNLYFYMRLA YSSSLTMFPS TNNMKMKWQ FEHTKQMKLL PTMIVLSTLV LPMTPALSSL N

UniProtKB: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

+
分子 #15: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 40.476082 KDa
配列文字列: MALRLLRLAP ASASAVPRGL GAVAQRVGGI HTGAPCRLQY GPLAFVLGER TTRKLTETSK VITVDGNICS GKGRLAREIA EKLGLRHFP EAGIHYADST TGDGKPLDVQ LSGNCSLEKF YDDPKSNDGN SYRLQSWLYA SRLLQYADAL EHLLSTGQGV V LERSIYSD ...文字列:
MALRLLRLAP ASASAVPRGL GAVAQRVGGI HTGAPCRLQY GPLAFVLGER TTRKLTETSK VITVDGNICS GKGRLAREIA EKLGLRHFP EAGIHYADST TGDGKPLDVQ LSGNCSLEKF YDDPKSNDGN SYRLQSWLYA SRLLQYADAL EHLLSTGQGV V LERSIYSD FVFLEAMYRQ GFIRKQCVEH YNEVKKVTAC EYLPPHVVVY VDVPVPEIQS RIQKKGNPHE MKITAAYLQD IE NAYKKTF LPEMSEKCEV LQYSAREAED AEKVVEDIEY LKCDKGPWPD QDDRTFHRLR MLVQNKLEVL NYTTIPVYLP EIT IGAHQS DRVFQKFTEL PGRKYSPGYN EDVGDKWIWL K

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial

+
分子 #16: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 42.606324 KDa
配列文字列: MAAAVHPRVV RAVPMSRSCL AAVATSVSYG PPQRQLHHAL IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IVPYRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMEWN GKDKDSIRKV VEHSNVVINL VGREWETKNF DFEDVFVKIP HAIAQVSKEA G VEKLIHIS ...文字列:
MAAAVHPRVV RAVPMSRSCL AAVATSVSYG PPQRQLHHAL IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYVV NHLGRMGSQV IVPYRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMEWN GKDKDSIRKV VEHSNVVINL VGREWETKNF DFEDVFVKIP HAIAQVSKEA G VEKLIHIS HLNADIKSPS RYLRSKAVGE KEVRAAFPEA TIIKPSDIFG REDRFLNYFA SMRWFGGVPL ISLGKETVKQ PV YIVDVSK GIINAIKDPD AKGKTFAFVG PNRYLLFDLV QYIFAVAYRP FLPYPLPHFA YRWVGRLFEV SPFEPWTTRD KVE RVHMSD MTLPHLPGLE DLGIQATPLE LKAIEVLRRH RTYRWLTSEM EDVKPAKTVN I

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial

+
分子 #17: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 19.746514 KDa
配列文字列:
MAAVSMSVAL KQALWGRRAA AVGAVSVSKV PTRLLSTSTW RLAQDQTQDT QLIAVDEKLD ITTLTGVPEE HIKTRKVRIF VPARNNMQS GVNNTKKWKM EFDTRERWEN PLMGWSSTAD PLSNLVLTFS TKEDAVAFAE KNGWSFDVEE RKVPKPKSKS Y GANFSWNK RTRVSTK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 13.34895 KDa
配列文字列:
MAAVTFLRLL GRSGAGARNL LGGSRCFGVR TSPTGEKVTH TGQAYDDGDY RRVRFSDRQK EVNENFAIDL IAEQPVSEVG SRVISCDGG GGALGHPRVY INLDKETKTG TCGYCGLQFR QPHH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial

+
分子 #19: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 11.099798 KDa
配列文字列:
MAAAAASRGI RAKLGLREIR IHLCQRSPGS QGVRDFIEKR YVELKKANPD LPILIRECSD VQPKLWARYA FGQEKNVSLN NFSADQVTR TLENVLSGKA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

+
分子 #20: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit AB1

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit AB1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 17.338211 KDa
配列文字列:
MAARVLCACV RRLPAAFAPL PRIPTVVAAR PLSTTLFPTG AQARSRALQP ALVLAQAPSG VTQLCRRYSD APPLTLEAIK DRVLYVLKL YDKIDPEKLS VNSHFMKDLG LDSLDQVEII MAMEDEFGFE IPDIDAEKLM CPQEIVDYIA DKKDVYE

UniProtKB: Acyl carrier protein

+
分子 #21: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 isof...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 isoform X1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 13.32159 KDa
配列文字列:
MAGLLKKTTG LVGLAVCETP HERLKILYTK ILDVLGQIPK NAAYRKYTEQ ITNEKLGMVK AEPDVKKLEE QLQGGQIEEV ILQAENELS LARKMLRWKP WEPLVEEPPA NQWKWPI

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5

+
分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 14.953313 KDa
配列文字列:
MAASGLPRAA AAAGTSVKPI FSRDMNEAKR RVRELYRAWY REVPNTVHLF QLDISVKQGR DKVREMFMKN AHVTDPRVVD LLVIKGKME LEETINVWKQ RTHIMRFFHE TEAPRPTDFL SKFYVGHDP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6

+
分子 #23: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 20.064096 KDa
配列文字列:
MPGIVELPTL EDLKVQEVKV SSSVLKAAAH HYGAQCDKPN KEFMLCRWEE KDPRRCLEEG KLVNQCALDF FRQIKRHCAE PFTEYWTCI DYSGLQLFRH CRKQQAKFDE CVLDKLGWVR PDLGELSKVT KVKTDRPLPE NPYHSRARPE PNPEAEGDLK P AKHGSRLF FWTM

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 14.686894 KDa
配列文字列:
MAKTLLHKYS DIPEGTECHR KAYASTSIGG ATGLIVSAYS IALKPPASFL EGVARTGRYT FTSAAIGAIF GLTSCISAQV REKPDDPLN YFIGGCAGGL TLGARTRSYG IGAAACAYMG LTAALVKMGQ LEGWQVFAEP KV

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11

+
分子 #25: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 16.911611 KDa
配列文字列:
MAASKVKQDM PPPGGYGPID YKRNLPRRGL SGYSMFAVGI GTLLFGYWSM MKWNRERRRL QIEDFEARIA LMPLFQAEKD RRVLQMLRE NLEEEAIIMK DVPDWKVGES VFHTTRWVTP MMGELYGLRT NEEILSATYG FIWYT

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13

+
分子 #26: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 8.034373 KDa
配列文字列:
MWFEILPGIA VMAACLFIPG MATAHIHKFT NGGKEKRVAH FSYQWNLMER DRCISGVNRY HVTKGLENID

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 1

+
分子 #27: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 9.225567 KDa
配列文字列:
MAGRIASFLK NAWAKEPVLV ASFAIGGLAI ILPSLSPYTN YAIRINRATP YNYPVPLRDD GNMPDVPSHP QDPQGPSLEW LKNL

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3

+
分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 8.664053 KDa
配列文字列:
MAASALFRPF SKLLSSARLP SGSSARSKFY IREPPHGSPD WLKVGLTLGT SVFLWIYLIK QHKEDVLEYK RRNGLE

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C1, mitochondrial

+
分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 14.353692 KDa
配列文字列:
(ACE)MTMMSGRPG RVPLQFLPNE ARSLPPPKLT DPRLVYMGFL GYCSGLIDNA IRRRPVVSAG LHRQLLYVTS FVFFGY YLL KRQDYMYALR DHDMFAYVKS HPEDFPEKDK KTYGEILEEF HPVR

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

+
分子 #30: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5
タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 12.506591 KDa
配列文字列:
MPFFDVQKRL GLDLDRWMTI QSAEQPHKIP GRCHAFEKEW IECAHGIGGI RAEKECKIEF DDFVECLLRQ KTMKRLSAIK RQRDKLIKE GKYTPPPHHL GKEDPRP

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5

+
分子 #31: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 [Sus ...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1 [Sus scrofa]
タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 15.371934 KDa
配列文字列:
MAAAILKLEE TRGGGEKCDK NQGVKGRRFM ISRSHPSLRA GPANGRSRGH SFRRRWWLGS PLPLVVGVVV GSEAAAFMMN VLQIVRDHW VHILVPVGFV FGCYLDRRSD EKLTAFRNKS LLFKRELRPN EEVTWK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1

+
分子 #32: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mit...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 17.384729 KDa
配列文字列:
MAAGVLGLCA RRLLAAAATR GLPAARVRWE SGSSRAVIAP SALVGKRPPE PTIRLQEDPD PEDENLYEKN PDSHGYDKDP IVDLWNMRV VFFFGFSIVL VLGSTFVAYL PDYRMQEWAR REAERLVKYR EANGLPLMES NCFDPNKIQL PEDED

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial

+
分子 #33: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 21.587006 KDa
配列文字列: MAAMSLLQRA SVTAVATLSR SRLGTRFGFG GFLTHGFPKT GAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDRRFLKL MRFYILLTGI PVAIGITLV NVFIGEAELA DIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFYDGP EKNYEKTMAI LQIEAEKAEL RLKELEVRRL M RARGDGPW ...文字列:
MAAMSLLQRA SVTAVATLSR SRLGTRFGFG GFLTHGFPKT GAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDRRFLKL MRFYILLTGI PVAIGITLV NVFIGEAELA DIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFYDGP EKNYEKTMAI LQIEAEKAEL RLKELEVRRL M RARGDGPW YQYPTIDKAL IDHSPKTTPD N

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial

+
分子 #34: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 15.645212 KDa
配列文字列:
M(SAC)GYTPDEKL RLQQLRELRR RWLKDQELSP REPVLPPRRV WPMEQFWNKF LQDGAPWKNV IYKTYRHSIF AVTHVL IPV WIIHYYLKYH VTAKPYTVVE RKPRIFPGDT ILETGEVIPL MKEFPDQHH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6

+
分子 #35: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 11.939366 KDa
配列文字列:
MSPLQRLAPF TRVGGRFLRG RGAGVAGGGG VRHAGGGVHI EPRYRQFPQL TRSQLIQAEF FSATMWFWIL WRFWHDSDAV LGHFPYPDP SQWTDEELGI LPDDED

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial

+
分子 #36: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3
タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 11.128515 KDa
配列文字列:
MAHGHGHEHG HSKMELPDYK QWKIEGTPLE TVQEKLAARG LRDPWGRNEA WRYSGGFANN VSFVGALLKG FKWGFAAFVV AVGAEYYLE SQNKDKKHH

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3

+
分子 #37: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 21.658447 KDa
配列文字列:
MASAKAGVLG VRWLQRAARK VVPLGARTAS HVTKDMFPGP YPKTPEERAA AAKKYNMRVE DYEPYPDDGM GYGDYPKLPD RSQQERDPW YDWDHPDLRL NWGEPIHWDL DMYIRNRVDT SPTPVSWNTM CKHLSGFVAF MLFMFWVGEI YPSYQPVGPK Q YPYNDLYL ERGGDPTKEP EPVVHYEI

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial

+
分子 #38: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 15.11735 KDa
配列文字列:
MSFPKYKPSR LATLPATLDP AEYDISPETR KAQAERLAIR SRLKREYLLQ YNDPNRLGVI EDPALIRWTY ARSANIYPNF RPTPKTSLL GALFGIGPLF FWYYVFKTDR DKKEKLIQEG KLDQTFNISY

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4

+
分子 #39: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 21.864906 KDa
配列文字列:
MAFSAPAAYL THQQKVLRLY KRALRHLESW CVHRDKYRYF ACLMRARFDE HKNEKDMVKA TQLLRQAEEE FWYGQHPQPY IFPESPGGT SYERYECYKV PEWCLDDWHP SEKAMYPDYF AKREQWKRLR RESWEREVKQ LQEETPPGGP RTEALPPARK E GDLPPLWW HIVTRPRERP M

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9

+
分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 16.487887 KDa
配列文字列:
MGAHLARRYL GDASKEPDPL RMPTFPPDYG FPERKEREMV ATQQEMNDAQ LMLQQRDYCA HYLIQLLKCK RDSFPNFLAC KHEQHDWDY CEHLDYVKRM KEFERERRLL QRKKRREQRE AEMARGQGPG EVAPEMAL

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7

+
分子 #41: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 20.944768 KDa
配列文字列:
MPDSWDKDVY PEPPRRTPAP APQTSLPNPV TYLTKIFDLL VDRPVTLARE FIEQQHAKNR YYYYHREFRR VPDITECEEK DILCMFEAE MQWRRDYKVD QEIVNIIQER LKACQQREGE SYRQNCAKEL EQFTQVSKAF QDRYSDLGAH YSARKCLAKQ K QRMLAERK AAKEAAAA

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10

+
分子 #42: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 17.162439 KDa
配列文字列:
MELVQVLRRG LQQVSGHGGL RGYLRVLFRA NDVRVGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG RDTFWDVDGS MVPPEWHRW LHCMTDDPPT TKPPTARKYI WTNHKFNVSG TPQQYVPYST TRKKIQEWVP PSTPYK

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

+
分子 #43: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 12.674627 KDa
配列文字列:
M(ACE)ASATRVIQ LLRNWASGRD LQAKLQLRYQ EISKRTQPPP KLPVGPSHKL SNNYYCTRDG RREAMPPSIV MSSQKV LAS GKPAESSAVA ETEKKAVTPA PPIKRWELSK DQPYL

UniProtKB: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7

+
分子 #44: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 3, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sus scrofa (ブタ)
分子量理論値: 48.217836 KDa
配列文字列: MAASLLLRQG RARALKTVLL EGGVFRGLAP AVSLSAESGR NEKERPPNPK KQSPPKNVVA AQEGGTPLAT PAAPELSQQL SSPTSPPAA ARPGGTLAPP NPGDSTLFTD RGRPRFPSRK TLVEFPRKVL SPFSQQGSDS AATQASRGRA GDATSSSSSS S SSDSESDD ...文字列:
MAASLLLRQG RARALKTVLL EGGVFRGLAP AVSLSAESGR NEKERPPNPK KQSPPKNVVA AQEGGTPLAT PAAPELSQQL SSPTSPPAA ARPGGTLAPP NPGDSTLFTD RGRPRFPSRK TLVEFPRKVL SPFSQQGSDS AATQASRGRA GDATSSSSSS S SSDSESDD EEEGDGSEAV RPVKSTSPGG SPKAEAPRSL AGGAPQTGVP AEARPGPQQP HPDLAAAERP RQAKGKGGSG AP EDRRAPK AAAPGSRGGP GAARQSETPS QKIPRSEEAD AESQKPPEVK TSLPDPTKSG LSTAPRGGPA SAEPAATPAG ARL PATPLE TGERPLGERV PEPGGQVASP LFSRAPLGGQ AAEGVAEAKG ELLEGRPLVQ GPKAVPDGQD EGAEKKALRP EEEA GIAGD AAPGTAGRDA TQEPTPAAAA AEPFDNSTYR NLQHHEYSTY TFLDLNVELS KFRMPQPSSG RQSPRH

UniProtKB: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit V3

+
分子 #45: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄 / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #46: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 6 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM / ホスファチジルコリン

+
分子 #47: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / 鉄・硫黄クラスター

+
分子 #48: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN / フラビンモノヌクレオチド

+
分子 #49: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 1 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #50: UBIQUINONE-10

分子名称: UBIQUINONE-10 / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / 式: U10
分子量理論値: 863.343 Da
Chemical component information

ChemComp-U10:
UBIQUINONE-10 / 2-(3,7,11,15,19,23,27,31,35,39-デカメチルテトラコンタ-2,6,10,14,18,22,(以下略) / ユビキノン

+
分子 #51: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 3 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM / Cardiolipin

+
分子 #52: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine

分子名称: 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 4 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da
Chemical component information

ChemComp-3PE:
1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine / DSPE / リン脂質*YM / ホスファチジルエタノールアミン

+
分子 #53: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE

分子名称: GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 1 / 式: GTP
分子量理論値: 523.18 Da
Chemical component information

ChemComp-GTP:
GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / GTP, エネルギー貯蔵分子*YM / グアノシン三リン酸

+
分子 #54: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 1 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #55: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH / ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸

+
分子 #56: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #57: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butan...

分子名称: ~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 2 / 式: EHZ
分子量理論値: 584.703 Da
Chemical component information

ChemComp-EHZ:
~{S}-[2-[3-[[(2~{R})-3,3-dimethyl-2-oxidanyl-4-phosphonooxy-butanoyl]amino]propanoylamino]ethyl] (3~{S})-3-oxidanyltetradecanethioate

+
分子 #58: MYRISTIC ACID

分子名称: MYRISTIC ACID / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 1 / 式: MYR
分子量理論値: 228.371 Da
Chemical component information

ChemComp-MYR:
MYRISTIC ACID / ミリスチン酸 / ミリスチン酸

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.0 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.3 µm
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 50.0 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: NONE
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.5 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 45000

+
万見について

-
お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る