+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Cryo-EM structure of the pancreatic ATP-sensitive potassium channel in the apo form with Kir6.2-CTD in the down conformation | |||||||||
![]() | ||||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | KATP channel / SUR1 / Kir6.2 / ATP / sulfonylurea receptor / potassium transport / metabolic sensor / trafficking defects / MEMBRANE PROTEIN | |||||||||
機能・相同性 | ![]() Regulation of insulin secretion / ATP sensitive Potassium channels / ABC-family proteins mediated transport / response to resveratrol / ATP-activated inward rectifier potassium channel activity / inward rectifying potassium channel / cell body fiber / sulfonylurea receptor activity / ventricular cardiac muscle tissue development / CAMKK-AMPK signaling cascade ...Regulation of insulin secretion / ATP sensitive Potassium channels / ABC-family proteins mediated transport / response to resveratrol / ATP-activated inward rectifier potassium channel activity / inward rectifying potassium channel / cell body fiber / sulfonylurea receptor activity / ventricular cardiac muscle tissue development / CAMKK-AMPK signaling cascade / voltage-gated monoatomic ion channel activity involved in regulation of presynaptic membrane potential / inward rectifier potassium channel activity / ATPase-coupled monoatomic cation transmembrane transporter activity / regulation of monoatomic ion transmembrane transport / nervous system process / inorganic cation transmembrane transport / ankyrin binding / action potential / response to ATP / Ion homeostasis / response to testosterone / voltage-gated potassium channel activity / potassium channel activity / potassium ion import across plasma membrane / regulation of insulin secretion / intercalated disc / axolemma / negative regulation of insulin secretion / ABC-type transporter activity / potassium ion transmembrane transport / T-tubule / heat shock protein binding / acrosomal vesicle / response to ischemia / regulation of membrane potential / determination of adult lifespan / cellular response to glucose stimulus / positive regulation of protein localization to plasma membrane / potassium ion transport / sarcolemma / cellular response to nicotine / glucose metabolic process / response to estradiol / nuclear envelope / presynaptic membrane / cellular response to tumor necrosis factor / transmembrane transporter binding / response to hypoxia / endosome / response to xenobiotic stimulus / neuronal cell body / glutamatergic synapse / apoptotic process / ATP hydrolysis activity / ATP binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 | |||||||||
![]() | Shyng SL / Sung MW / Driggers CM | |||||||||
資金援助 | ![]()
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: Mechanism of pharmacochaperoning in a mammalian K channel revealed by cryo-EM. 著者: Gregory M Martin / Min Woo Sung / Zhongying Yang / Laura M Innes / Balamurugan Kandasamy / Larry L David / Craig Yoshioka / Show-Ling Shyng / ![]() 要旨: ATP-sensitive potassium (K) channels composed of a pore-forming Kir6.2 potassium channel and a regulatory ABC transporter sulfonylurea receptor 1 (SUR1) regulate insulin secretion in pancreatic β- ...ATP-sensitive potassium (K) channels composed of a pore-forming Kir6.2 potassium channel and a regulatory ABC transporter sulfonylurea receptor 1 (SUR1) regulate insulin secretion in pancreatic β-cells to maintain glucose homeostasis. Mutations that impair channel folding or assembly prevent cell surface expression and cause congenital hyperinsulinism. Structurally diverse K inhibitors are known to act as pharmacochaperones to correct mutant channel expression, but the mechanism is unknown. Here, we compare cryoEM structures of a mammalian K channel bound to pharmacochaperones glibenclamide, repaglinide, and carbamazepine. We found all three drugs bind within a common pocket in SUR1. Further, we found the N-terminus of Kir6.2 inserted within the central cavity of the SUR1 ABC core, adjacent the drug binding pocket. The findings reveal a common mechanism by which diverse compounds stabilize the Kir6.2 N-terminus within SUR1's ABC core, allowing it to act as a firm 'handle' for the assembly of metastable mutant SUR1-Kir6.2 complexes. | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 1.9 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.4 KB 14.4 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 113.5 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4.2 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 457.4 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 456.9 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 4.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 4.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 7uqrMC ![]() 7tysC ![]() 7tytC ![]() 7u1eC ![]() 7u1qC ![]() 7u1sC ![]() 7u24C ![]() 7u2xC ![]() 7u6yC ![]() 7u7mC ![]() 7uaaC C: 同じ文献を引用 ( M: このマップから作成された原子モデル |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|---|
「今月の分子」の関連する項目 |
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.826 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-
試料の構成要素
-全体 : KATP-ATP-CTDup
全体 | 名称: KATP-ATP-CTDup |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: KATP-ATP-CTDup
超分子 | 名称: KATP-ATP-CTDup / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#2 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-超分子 #2: Kir6.2
超分子 | 名称: Kir6.2 / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1 / 詳細: Adenovirus-based infection of INS-1 cells |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-超分子 #3: SUR1
超分子 | 名称: SUR1 / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2 / 詳細: Adenovirus-based infection of INS-1 cells |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
---|---|
凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 40.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 2.6 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 1.0 µm |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
-
画像解析
初期モデル | モデルのタイプ: EMDB MAP EMDB ID: |
---|---|
初期 角度割当 | タイプ: COMMON LINE |
最終 角度割当 | タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION |
-原子モデル構築 1
初期モデル |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
得られたモデル | ![]() PDB-7uqr: |