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-基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-23894 | |||||||||
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タイトル | Paired helical tau filament extracted from GSS Patient brain tissue | tau filament from Gerstmann Straussler Scheinker disease | PHF Tau | |||||||||
マップデータ | ||||||||||
試料 |
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キーワード | tau filament / GSS / PrP-CAA / amyloid fibril / Alzheimer disease / PROTEIN FIBRIL | |||||||||
機能・相同性 | Activation of AMPK downstream of NMDARs / PKR-mediated signaling / Isoform Tau-F of Microtubule-associated protein tau 機能・相同性情報 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | らせん対称体再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å | |||||||||
データ登録者 | Hoq MR | |||||||||
資金援助 | 米国, 1件
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引用 | ジャーナル: Acta Neuropathol / 年: 2021 タイトル: Structure of Tau filaments in Prion protein amyloidoses. 著者: Grace I Hallinan / Md Rejaul Hoq / Manali Ghosh / Frank S Vago / Anllely Fernandez / Holly J Garringer / Ruben Vidal / Wen Jiang / Bernardino Ghetti / 要旨: In human neurodegenerative diseases associated with the intracellular aggregation of Tau protein, the ordered cores of Tau filaments adopt distinct folds. Here, we analyze Tau filaments isolated from ...In human neurodegenerative diseases associated with the intracellular aggregation of Tau protein, the ordered cores of Tau filaments adopt distinct folds. Here, we analyze Tau filaments isolated from the brain of individuals affected by Prion-Protein cerebral amyloid angiopathy (PrP-CAA) with a nonsense mutation in the PRNP gene that leads to early termination of translation of PrP (Q160Ter or Q160X), and Gerstmann-Sträussler-Scheinker (GSS) disease, with a missense mutation in the PRNP gene that leads to an amino acid substitution at residue 198 (F198S) of PrP. The clinical and neuropathologic phenotypes associated with these two mutations in PRNP are different; however, the neuropathologic analyses of these two genetic variants have consistently shown the presence of numerous neurofibrillary tangles (NFTs) made of filamentous Tau aggregates in neurons. We report that Tau filaments in PrP-CAA (Q160X) and GSS (F198S) are composed of 3-repeat and 4-repeat Tau isoforms, having a striking similarity to NFTs in Alzheimer disease (AD). In PrP-CAA (Q160X), Tau filaments are made of both paired helical filaments (PHFs) and straight filaments (SFs), while in GSS (F198S), only PHFs were found. Mass spectrometry analyses of Tau filaments extracted from PrP-CAA (Q160X) and GSS (F198S) brains show the presence of post-translational modifications that are comparable to those seen in Tau aggregates from AD. Cryo-EM analysis reveals that the atomic models of the Tau filaments obtained from PrP-CAA (Q160X) and GSS (F198S) are identical to those of the Tau filaments from AD, and are therefore distinct from those of Pick disease, chronic traumatic encephalopathy, and corticobasal degeneration. Our data support the hypothesis that in the presence of extracellular amyloid deposits and regardless of the primary amino acid sequence of the amyloid protein, similar molecular mechanisms are at play in the formation of identical Tau filaments. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
ムービー |
ムービービューア |
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構造ビューア | EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol |
添付画像 |
-ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | emd_23894.map.gz | 29.4 MB | EMDBマップデータ形式 | |
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ヘッダ (付随情報) | emd-23894-v30.xml emd-23894.xml | 9.4 KB 9.4 KB | 表示 表示 | EMDBヘッダ |
FSC (解像度算出) | emd_23894_fsc.xml | 14.6 KB | 表示 | FSCデータファイル |
画像 | emd_23894.png | 110.4 KB | ||
Filedesc metadata | emd-23894.cif.gz | 5 KB | ||
アーカイブディレクトリ | http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-23894 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-23894 | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | emd_23894_validation.pdf.gz | 512.6 KB | 表示 | EMDB検証レポート |
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文書・詳細版 | emd_23894_full_validation.pdf.gz | 512.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | emd_23894_validation.xml.gz | 12.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | emd_23894_validation.cif.gz | 16.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-23894 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/validation_reports/EMD-23894 | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
EMDBのページ | EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource |
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「今月の分子」の関連する項目 |
-マップ
ファイル | ダウンロード / ファイル: emd_23894.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.078 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-試料の構成要素
-全体 : SF filament extracted from PrP-CAA Patient brain tissue
全体 | 名称: SF filament extracted from PrP-CAA Patient brain tissue |
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要素 |
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-超分子 #1: SF filament extracted from PrP-CAA Patient brain tissue
超分子 | 名称: SF filament extracted from PrP-CAA Patient brain tissue タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 79 kDa/nm |
-分子 #1: Isoform Tau-F of Microtubule-associated protein tau
分子 | 名称: Isoform Tau-F of Microtubule-associated protein tau / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 10 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: Homo sapiens (ヒト) |
分子量 | 理論値: 45.919871 KDa |
配列 | 文字列: MAEPRQEFEV MEDHAGTYGL GDRKDQGGYT MHQDQEGDTD AGLKESPLQT PTEDGSEEPG SETSDAKSTP TAEDVTAPLV DEGAPGKQA AAQPHTEIPE GTTAEEAGIG DTPSLEDEAA GHVTQARMVS KSKDGTGSDD KKAKGADGKT KIATPRGAAP P GQKGQANA ...文字列: MAEPRQEFEV MEDHAGTYGL GDRKDQGGYT MHQDQEGDTD AGLKESPLQT PTEDGSEEPG SETSDAKSTP TAEDVTAPLV DEGAPGKQA AAQPHTEIPE GTTAEEAGIG DTPSLEDEAA GHVTQARMVS KSKDGTGSDD KKAKGADGKT KIATPRGAAP P GQKGQANA TRIPAKTPPA PKTPPSSGEP PKSGDRSGYS SPGSPGTPGS RSRTPSLPTP PTREPKKVAV VRTPPKSPSS AK SRLQTAP VPMPDLKNVK SKIGSTENLK HQPGGGKVQI INKKLDLSNV QSKCGSKDNI KHVPGGGSVQ IVYKPVDLSK VTS KCGSLG NIHHKPGGGQ VEVKSEKLDF KDRVQSKIGS LDNITHVPGG GNKKIETHKL TFRENAKAKT DHGAEIVYKS PVVS GDTSP RHLSNVSSTG SIDMVDSPQL ATLADEVSAS LAKQGL UniProtKB: Isoform Tau-F of Microtubule-associated protein tau |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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解析 | らせん対称体再構成法 |
試料の集合状態 | filament |
-試料調製
緩衝液 | pH: 7.4 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-電子顕微鏡法
顕微鏡 | TFS KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 実像数: 2004 / 平均電子線量: 1.07 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |