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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-21563 | |||||||||||||||||||||
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タイトル | DNA-free CST monomer | |||||||||||||||||||||
![]() | DNA-free CST monomer, C1 refined, sharpened | |||||||||||||||||||||
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生物種 | ![]() | |||||||||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 6.3 Å | |||||||||||||||||||||
![]() | Lim C / Barbour AT / Zaug AJ / Goodrich KJ / McKay AE / Wuttke DS / Cech TR | |||||||||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: The structure of human CST reveals a decameric assembly bound to telomeric DNA. 著者: Ci Ji Lim / Alexandra T Barbour / Arthur J Zaug / Karen J Goodrich / Allison E McKay / Deborah S Wuttke / Thomas R Cech / ![]() 要旨: The CTC1-STN1-TEN1 (CST) complex is essential for telomere maintenance and resolution of stalled replication forks genome-wide. Here, we report the 3.0-angstrom cryo-electron microscopy structure of ...The CTC1-STN1-TEN1 (CST) complex is essential for telomere maintenance and resolution of stalled replication forks genome-wide. Here, we report the 3.0-angstrom cryo-electron microscopy structure of human CST bound to telomeric single-stranded DNA (ssDNA), which assembles as a decameric supercomplex. The atomic model of the 134-kilodalton CTC1 subunit, built almost entirely de novo, reveals the overall architecture of CST and the DNA-binding anchor site. The carboxyl-terminal domain of STN1 interacts with CTC1 at two separate docking sites, allowing allosteric mediation of CST decamer assembly. Furthermore, ssDNA appears to staple two monomers to nucleate decamer assembly. CTC1 has stronger structural similarity to Replication Protein A than the expected similarity to yeast Cdc13. The decameric structure suggests that CST can organize ssDNA analogously to the nucleosome's organization of double-stranded DNA. | |||||||||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 59.8 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.2 KB 14.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 11.9 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 46.9 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 78.3 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 77.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 494 B | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | DNA-free CST monomer, C1 refined, sharpened | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.11 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Heterotrimeric complex of human CST complex without DNA
全体 | 名称: Heterotrimeric complex of human CST complex without DNA |
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要素 |
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-超分子 #1: Heterotrimeric complex of human CST complex without DNA
超分子 | 名称: Heterotrimeric complex of human CST complex without DNA タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() |
分子量 | 実験値: 200 KDa |
-分子 #1: Homo sapien CTC1
分子 | 名称: Homo sapien CTC1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / 詳細: 2xFLAG-CTCC1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MDYKDDDDKD YKDDDDKAAG RAQVPSSEQA WLEDAQVFIQ KTLCPAVKEP NVQLTPLVID CVKTVWLSQG RNQGSTLPLS YSFVSVQDLK THQRLPCCSH LSWSSSAYQA WAQEAGPNGN PLPREQLLLL GTLTDLSADL EQECRNGSLY VRDNTGVLSC ELIDLDLSWL ...文字列: MDYKDDDDKD YKDDDDKAAG RAQVPSSEQA WLEDAQVFIQ KTLCPAVKEP NVQLTPLVID CVKTVWLSQG RNQGSTLPLS YSFVSVQDLK THQRLPCCSH LSWSSSAYQA WAQEAGPNGN PLPREQLLLL GTLTDLSADL EQECRNGSLY VRDNTGVLSC ELIDLDLSWL GHLFLFPRWS YLPPARWNSS GEGHLELWDA PVPVFPLTIS PGPVTPIPVL YPESASCLLR LRNKLRGVQR NLAGSLVRLS ALVKSKQKAY FILSLGRSHP AVTHVSIIVQ VPAQLVWHRA LRPGTAYVLT ELRVSKIRGQ RQHVWMTSQS SRLLLLKPEC VQELELELEG PLLEADPKPL PMPSNSEDKK DPESLVRYSR LLSYSGAVTG VLNEPAGLYE LDGQLGLCLA YQQFRGLRRV MRPGVCLQLQ DVHLLQSVGG GTRRPVLAPC LRGAVLLQSF SRQKPGAHSS RQAYGASLYE QLVWERQLGL PLYLWATKAL EELACKLCPH VLRHHQFLQH SSPGSPSLGL QLLAPTLDLL APPGSPVRNA HNEILEEPHH CPLQKYTRLQ TPSSFPTLAT LKEEGQRKAW ASFDPKALLP LPEASYLPSC QLNRRLAWSW LCLLPSAFCP AQVLLGVLVA SSHKGCLQLR DQSGSLPCLL LAKHSQPLSD PRLIGCLVRA ERFQLIVERD VRSSFPSWKE LSMPGFIQKQ QARVYVQFFL ADALILPVPR PCLHSATPST PQTDPTGPEG PHLGQSRLFL LCHKEALMKR NFCVPPGASP EVPKPALSFY VLGSWLGGTQ RKEGTGWGLP EPQGNDDNDQ KVHLIFFGSS VRWFEFLHPG QVYRLVAPGP ATPMLFEKDG SSCISRRPLE LAGCASCLTV QDNWTLELES SQDIQDVLDA NKSLPESSLT DLLSDNFTDS LVSFSAEILS RTLCEPLVAS LWMKLGNTGA MRRCVKLTVA LETAECEFPP HLDVYIEDPH LPPSLGLLPG ARVHFSQLEK RVSRSHNVYC CFRSSTYVQV LSFPPETTIS VPLPHIYLAE LLQGGQSPFQ ATASCHIVSV FSLQLFWVCA YCTSICRQGK CTRLGSTCPT QTAISQAIIR LLVEDGTAEA VVTCRNHHVA AALGLCPREW ASLLDFVQVP GRVVLQFAGP GAQLESSARV DEPMTMFLWT LCTSPSVLRP IVLSFELERK PSKIVPLEPP RLQRFQCGEL PFLTHVNPRL RLSCLSIRES EYSSSLGILA SSC |
-分子 #2: Homo sapien STN1
分子 | 名称: Homo sapien STN1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / 詳細: 6xHIS-STN1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MHHHHHHQPG SSRCEEETPS LLWGLDPVFL AFAKLYIRDI LDMKESRQVP GVFLYNGHPI KQVDVLGTVI GVRERDAFYS YGVDDSTGVI NCICWKKLNT ESVSAAPSAA RELSLTSQLK KLQETIEQKT KIEIGDTIRV RGSIRTYREE REIHATTYYK VDDPVWNIQI ...文字列: MHHHHHHQPG SSRCEEETPS LLWGLDPVFL AFAKLYIRDI LDMKESRQVP GVFLYNGHPI KQVDVLGTVI GVRERDAFYS YGVDDSTGVI NCICWKKLNT ESVSAAPSAA RELSLTSQLK KLQETIEQKT KIEIGDTIRV RGSIRTYREE REIHATTYYK VDDPVWNIQI ARMLELPTIY RKVYDQPFHS SALEKEEALS NPGALDLPSL TSLLSEKAKE FLMENRVQSF YQQELEMVES LLSLANQPVI HSASSDQVNF KKDTTSKAIH SIFKNAIQLL QEKGLVFQKD DGFDNLYYVT REDKDLHRKI HRIIQQDCQK PNHMEKGCHF LHILACARLS IRPGLSEAVL QQVLELLEDQ SDIVSTMEHY YTAF |
-分子 #3: Homo sapien TEN1
分子 | 名称: Homo sapien TEN1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / 詳細: 6xHIS-TEN1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() |
配列 | 文字列: MSYYHHHHHH DYDIPTTENL YFQGAMGSMS QLVVDICKLN QVLLNLNERS KEIFTNSSRR FRVVAQLLDI QPYDDEENEG FLCKLIVGNL PDFHAQILDD VAHFTQVKNV RLELYVSESL YRSTFDINCS NRTPELYDAV DLTVAIWNNG FINIKCEVID IEILNLEEVN ...文字列: MSYYHHHHHH DYDIPTTENL YFQGAMGSMS QLVVDICKLN QVLLNLNERS KEIFTNSSRR FRVVAQLLDI QPYDDEENEG FLCKLIVGNL PDFHAQILDD VAHFTQVKNV RLELYVSESL YRSTFDINCS NRTPELYDAV DLTVAIWNNG FINIKCEVID IEILNLEEVN QLREFIASPM GQEFLQLSNS TGDYSQPNT |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.5 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TECNAI ARCTICA |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) 平均電子線量: 53.6 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company |