+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16 (fMIP16) | |||||||||
![]() | In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16 | |||||||||
![]() |
| |||||||||
![]() | microtubule associated protein / STRUCTURAL PROTEIN | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | サブトモグラム平均法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 27.0 Å | |||||||||
![]() | Chakraborty S / Mahamid J / Martinez-Sanchez A / Baumeister W | |||||||||
資金援助 | 1件
| |||||||||
![]() | ![]() タイトル: In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16 (fMIP16) 著者: Chakraborty S / Mahamid J / Martinez-Sanchez A / Baumeister W | |||||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
添付画像 |
---|
-
ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 2.1 MB | ![]() | |
---|---|---|---|---|
ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 14.5 KB 14.5 KB | 表示 表示 | ![]() |
FSC (解像度算出) | ![]() | 4.7 KB | 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 9.3 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 4 KB | ||
その他 | ![]() ![]() | 6 MB 6 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 836 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 835.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10.5 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 13.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
---|
-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
投影像・断面図 | 画像のコントロール
画像は Spider により作成 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 2.129 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
|
-添付データ
-ハーフマップ: In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16
ファイル | emd_15468_half_map_1.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16
ファイル | emd_15468_half_map_2.map | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
注釈 | In situ subtomogram average of floating microtubule inner protein 16 | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
-全体 : fMIP16 from human induced pluripotent stem cells derived neuronal...
全体 | 名称: fMIP16 from human induced pluripotent stem cells derived neuronal microtubules |
---|---|
要素 |
|
-超分子 #1: fMIP16 from human induced pluripotent stem cells derived neuronal...
超分子 | 名称: fMIP16 from human induced pluripotent stem cells derived neuronal microtubules タイプ: cell / ID: 1 / 親要素: 0 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | サブトモグラム平均法 |
試料の集合状態 | cell |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.2 |
---|---|
グリッド | モデル: Quantifoil / 材質: GOLD / メッシュ: 200 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 30 sec. |
凍結 | 凍結剤: ETHANE-PROPANE / チャンバー内湿度: 70 % / チャンバー内温度: 310 K / 装置: LEICA EM GP |
詳細 | Frozen hydrated human induced pluripotent stem cells derived neurons |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
温度 | 最低: 77.0 K |
特殊光学系 | 位相板: VOLTA PHASE PLATE / エネルギーフィルター - 名称: GIF Quantum LS / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 検出モード: COUNTING / 平均電子線量: 2.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 4.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 2.5 µm / 倍率(公称値): 64000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |