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- EMDB-13112: Cryo-EM structure of the 6 hpf zebrafish embryo 80S ribosome -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-13112
タイトルCryo-EM structure of the 6 hpf zebrafish embryo 80S ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: 80S ribosome from 6 hpf zebrafish embryos
    • RNA: x 4種
    • タンパク質・ペプチド: x 73種
  • リガンド: x 2種
キーワードtranslation / embryo / zebrafish / maternal / ribosome
機能・相同性
機能・相同性情報


optokinetic behavior / regulation of mRNA cis splicing, via spliceosome / Translesion synthesis by REV1 / Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex / Translesion Synthesis by POLH / Downregulation of ERBB4 signaling / Spry regulation of FGF signaling / Downregulation of ERBB2:ERBB3 signaling / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 ...optokinetic behavior / regulation of mRNA cis splicing, via spliceosome / Translesion synthesis by REV1 / Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex / Translesion Synthesis by POLH / Downregulation of ERBB4 signaling / Spry regulation of FGF signaling / Downregulation of ERBB2:ERBB3 signaling / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / EGFR downregulation / SCF(Skp2)-mediated degradation of p27/p21 / NF-kB is activated and signals survival / Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus / Downregulation of TGF-beta receptor signaling / TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition) / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / RMTs methylate histone arginines / AUF1 (hnRNP D0) binds and destabilizes mRNA / Asymmetric localization of PCP proteins / Degradation of AXIN / Degradation of DVL / N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle / TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway / Hedgehog ligand biogenesis / GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome / TNFR1-mediated ceramide production / Hedgehog 'on' state / Translesion synthesis by POLI / Termination of translesion DNA synthesis / Negative regulation of MAPK pathway / Regulation of necroptotic cell death / MAPK6/MAPK4 signaling / UCH proteinases / Josephin domain DUBs / Metalloprotease DUBs / Formation of TC-NER Pre-Incision Complex / Dual incision in TC-NER / Negative regulation of MET activity / Assembly of the pre-replicative complex / CDK-mediated phosphorylation and removal of Cdc6 / Formation of a pool of free 40S subunits / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Ribosomal scanning and start codon recognition / Ubiquitin-dependent degradation of Cyclin D / PTK6 Regulates RTKs and Their Effectors AKT1 and DOK1 / FBXL7 down-regulates AURKA during mitotic entry and in early mitosis / Downregulation of ERBB2 signaling / E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins / Protein methylation / RUNX1 regulates transcription of genes involved in differentiation of HSCs / Regulation of RUNX2 expression and activity / Regulation of PTEN localization / Regulation of PTEN stability and activity / ER Quality Control Compartment (ERQC) / Regulation of signaling by CBL / Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) / Protein hydroxylation / KEAP1-NFE2L2 pathway / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / GSK3B and BTRC:CUL1-mediated-degradation of NFE2L2 / Regulation of pyruvate metabolism / Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA / Deactivation of the beta-catenin transactivating complex / PINK1-PRKN Mediated Mitophagy / Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes / Regulation of RUNX3 expression and activity / mTORC1-mediated signalling / Regulation of FZD by ubiquitination / brain segmentation / p75NTR recruits signalling complexes / Autodegradation of the E3 ubiquitin ligase COP1 / G2/M Checkpoints / Interleukin-1 signaling / nucleate erythrocyte maturation / ABC-family proteins mediated transport / Regulation of TNFR1 signaling / Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation / NOD1/2 Signaling Pathway / convergent extension involved in gastrulation / Ovarian tumor domain proteases / Ub-specific processing proteases / DNA Damage Recognition in GG-NER / Formation of Incision Complex in GG-NER / Neddylation / Oxidative Stress Induced Senescence / Oncogene Induced Senescence / Regulation of TP53 Degradation / Stabilization of p53 / The role of GTSE1 in G2/M progression after G2 checkpoint / convergent extension involved in axis elongation / embryonic retina morphogenesis in camera-type eye / primitive hemopoiesis / Aggrephagy / hemoglobin biosynthetic process / chordate embryonic development / embryonic brain development
類似検索 - 分子機能
40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L28e ...40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein SA, C-terminal domain / 40S ribosomal protein SA C-terminus / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / Ribosomal protein L28e / Ribosomal protein L23 / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / metallochaperone-like domain / TRASH domain / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein L13e, conserved site / Ribosomal protein L13e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein L22e / Ribosomal protein L22e superfamily / Ribosomal L22e protein family / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Ribosomal protein L10e / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein L38e / Ribosomal protein L38e superfamily / Ribosomal L38e protein family / : / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein L44e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein L13e / Ribosomal protein L13e / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S17e, conserved site / : / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal protein L44e / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein L44 / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / Ribosomal protein L30e signature 1. / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal L40e family / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / Ribosomal protein L23/L25, N-terminal / : / Ribosomal protein L23, N-terminal domain / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal_L40e / Ribosomal protein L40e / Ribosomal protein L40e superfamily / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e / Ribosomal Protein L6, KOW domain / Ribosomal protein L18/L18-A/B/e, conserved site / Ribosomal protein L18e signature. / Ribosomal protein L30e signature 2.
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein eS19 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL28 / 60S ribosomal protein L37a / Large ribosomal subunit protein eL14 / Small ribosomal subunit protein uS12 / 40S ribosomal protein S24 / Large ribosomal subunit protein eL22 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein RACK1 ...Small ribosomal subunit protein eS19 / Large ribosomal subunit protein eL24 / Large ribosomal subunit protein eL28 / 60S ribosomal protein L37a / Large ribosomal subunit protein eL14 / Small ribosomal subunit protein uS12 / 40S ribosomal protein S24 / Large ribosomal subunit protein eL22 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Large ribosomal subunit protein eL42 / Small ribosomal subunit protein eS7 / Small ribosomal subunit protein eS8 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Large ribosomal subunit protein uL13 / 60S ribosomal protein L32 / Large ribosomal subunit protein eL31 / Ubiquitin-ribosomal protein eL40 fusion protein / 40S ribosomal protein S27 / Large ribosomal subunit protein eL6 / Small ribosomal subunit protein eS17 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein eS4 / Ribosomal protein L18 / 60S ribosomal protein L29 / Large ribosomal subunit protein eL38 / Large ribosomal subunit protein eL33 / 40S ribosomal protein S6 / Ribosomal protein L15 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Ribosomal protein L5b / Large ribosomal subunit protein uL5 / Ribosomal protein L37 / 60S ribosomal protein L21 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Small ribosomal subunit protein uS4 / 40S ribosomal protein S26 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein eS25 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Ribosomal protein S14 / Small ribosomal subunit protein eS1 / 60S ribosomal protein L7a / FAU ubiquitin-like and ribosomal protein S30 fusion a / Large ribosomal subunit protein uL14 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein eL36 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Ribosomal protein L26 / Ribosomal protein S10 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Small ribosomal subunit protein eS21 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein eL27 / Large ribosomal subunit protein uL16 / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / Ribosomal protein L4 / Large ribosomal subunit protein eL20 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein eL13
類似検索 - 構成要素
生物種Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.4 Å
データ登録者Leesch F / Lorenzo-Orts L
資金援助 オーストリア, スイス, 5件
OrganizationGrant number国
Austrian Research Promotion AgencyFFG-852936 オーストリア
Austrian Science FundSTART Projekt Y 1031-B28 オーストリア
Austrian Science FundSFB RNA-Deco F 80 オーストリア
Swiss National Science FoundationP2GEP3_191204 スイス
European Molecular Biology Organization (EMBO)ALTF 1165-2019
引用ジャーナル: Nature / 年: 2023
タイトル: A molecular network of conserved factors keeps ribosomes dormant in the egg.
著者: Friederike Leesch / Laura Lorenzo-Orts / Carina Pribitzer / Irina Grishkovskaya / Josef Roehsner / Anastasia Chugunova / Manuel Matzinger / Elisabeth Roitinger / Katarina Belačić / Susanne ...著者: Friederike Leesch / Laura Lorenzo-Orts / Carina Pribitzer / Irina Grishkovskaya / Josef Roehsner / Anastasia Chugunova / Manuel Matzinger / Elisabeth Roitinger / Katarina Belačić / Susanne Kandolf / Tzi-Yang Lin / Karl Mechtler / Anton Meinhart / David Haselbach / Andrea Pauli /
要旨: Ribosomes are produced in large quantities during oogenesis and are stored in the egg. However, the egg and early embryo are translationally repressed. Here, using mass spectrometry and cryo-electron ...Ribosomes are produced in large quantities during oogenesis and are stored in the egg. However, the egg and early embryo are translationally repressed. Here, using mass spectrometry and cryo-electron microscopy analyses of ribosomes isolated from zebrafish (Danio rerio) and Xenopus laevis eggs and embryos, we provide molecular evidence that ribosomes transition from a dormant state to an active state during the first hours of embryogenesis. Dormant ribosomes are associated with four conserved factors that form two modules, consisting of Habp4-eEF2 and death associated protein 1b (Dap1b) or Dap in complex with eIF5a. Both modules occupy functionally important sites and act together to stabilize ribosomes and repress translation. Dap1b (also known as Dapl1 in mammals) is a newly discovered translational inhibitor that stably inserts into the polypeptide exit tunnel. Addition of recombinant zebrafish Dap1b protein is sufficient to block translation and reconstitute the dormant egg ribosome state in a mammalian translation extract in vitro. Thus, a developmentally programmed, conserved ribosome state has a key role in ribosome storage and translational repression in the egg.
履歴
登録2021年6月24日-
ヘッダ(付随情報) 公開2022年7月13日-
マップ公開2022年7月13日-
更新2024年11月13日-
現状2024年11月13日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

添付画像

emd_13112.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_13112.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 421.9 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.06 Å/pix.
x 480 pix.
= 508.8 Å		1.06 Å/pix.
x 480 pix.
= 508.8 Å		1.06 Å/pix.
x 480 pix.
= 508.8 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.06 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.7
最小 - 最大-0.7206569 - 10.815329
平均 (標準偏差)0.06813067 (±0.24730621)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ480480480
Spacing480480480
セルA=B=C: 508.8 Å
α=β=γ: 90.0 °

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : 80S ribosome from 6 hpf zebrafish embryos

全体名称: 80S ribosome from 6 hpf zebrafish embryos
要素
  • 複合体: 80S ribosome from 6 hpf zebrafish embryos
    • RNA: 18S rRNA
    • RNA: 28S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • RNA: 5.8S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SA
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L5b
    • タンパク質・ペプチド: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4, X isoform
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L7
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L7a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L9
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13a
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S14
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L23a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23
    • タンパク質・ペプチド: ATPase H+ transporting V0 subunit e1
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L31
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L38
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L39
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L40
    • タンパク質・ペプチド: Rpl41
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36a
    • タンパク質・ペプチド: Zgc:171772
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L28
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: 80S ribosome from 6 hpf zebrafish embryos

超分子名称: 80S ribosome from 6 hpf zebrafish embryos / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#77
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ) / 組織: 6 hpf embryos

+
分子 #1: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 625.9685 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAAUAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAAGUCUA AGUGCACACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGAUCGCUC CACCCGGUUA CUUGGAUAAC UGUGGCAAUU C CAGAGCUA ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAAUAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAAGUCUA AGUGCACACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGAUCGCUC CACCCGGUUA CUUGGAUAAC UGUGGCAAUU C CAGAGCUA AUACAUGCCA ACGAGCGCCG ACCUGGGCCG CCCUUCUCCC CUCGGGGCGG GGGGUGGGUA CCCGGGGACG CG UGCAUUU AUCAGAUCCA AAACCCAUGC GGGUGCGCGG GCGGUGGAGA GGGGGGCCUC GCGCCUACCC GCCGCCGUCC GCC CCCGGC CUCGCUUUGG UGACUCUAGA UAACCUCGGG CCGAUCGCGC GCCCUCGCGG CGGCGACGGU UCAUUCGAAU GUCU GCCCU AUCAACUUUC GAUGGUAGGU CCGUCGCCUA CCAUGGUGAC CACGGGUGAC GGGGAAUCAG GGUUCGAUUC CGGAG AGGG AGCCUGAGAA ACGGCUACCA CAUCCAAGGA AGGCAGCAGG CGCGCAAAUU ACCCAUUUCC GACACGGAGA GGUAGU GAC GAAAAAUAAC AAUGCAGGUC UCUUUCGAGG CCCUGCAAUU GGAAUGAGUG CAUCCCAAAC CCAUGGGCGA GGACCCA UU GGAGGGCAAG UCUGGUGCCA GCAGCCGCGG UAAUUCCAGC UCCAAUAGCG UAUGCUAACG UUGCUGCAGU UAAAAAGC U CGUAGUUGGA UCUCGGGGAC CGGGCCGCGC GGUCCGCCGC GAGGCGAGCC ACCGCCGGUC CCGGACCCCC AGGCCUCCC GGCGCCCCCC GGAUGCCCUU GACUGGGUGU CCUCGGCUUG GGGCCCGGAG CGUUUACUUU GAAAAAAUUA GAGUGUUCAA GGCAGGGCC GGCACCGCGC CCCAUUGAAU ACCCCAGCUA GGAAUAAUGG AAUAGGACCC CGGUUCUAUU UUCUGUGGGU U UCCGGAAC CCGGGGCCAU GAUCGAGAGG GACGGCCGGG GGCAUUCGUA UUGCGCCGCU AGAGGUGAAA UUCUUGGACC GG CGCAAGA CGGACCGGAG CGAAAGCGUU UGCCAAGAAC GUUUUCAUUA AUCAAGAACG AAAGUCGGAG GUUCGAAGAC GAU CAGAUA CCGUCGUAGU UCCGACCGUA AACGAUGCCG ACCCGCGAUC CGGCGGCGUU UAUUCCCAUG ACCCGCCGGG CAGC GUUGC GGGAAACCAC GAGUCUCUGG GCUCCGGGGG GAGUAUGGUU GCAAAGCUGA AACUUAAAGG AAUUGACGGA AGGGC ACCA CCAGGAGUGG AGCCUGCGGC UUAAUUUGAC UCAACACGGG GAACCUCACC CGGCCCGGAC ACGGAAAGGA UUGACA GAU UGACGGCUCU UUCUCGAUUC UGUGGGUGGU GGUGCAUGGC CGUUCGUAGU UGGUGGAGCG AUUUGUCUGG UUGAUUC CG AUAACGAACG AGACUCUGGC AUGCUAACUA GUUACGCGGC CCCGCGCGGU CGGCGUCUGC AACUUCUUAG AGGGACAA G UGGCGUUCAG CCACGCGAGA CUGAGCAAUA ACAGGUCUGU GAUGCCCUUA GAUGUCCGGG GCUGCACGCG CGCCACAAU GGGCGGAUCA ACGUGUGCCU ACCCUGCGCC GACAGGCGCG GGUAACCCGU UGAACCCCGC CCGUGAUGGG GACCGGGGAU UGAAACUAU UUCCCGAGAA CGAGGAAUUC CCAGUAAGCG CAGGUCAUCA GCUUGCGUUG AUUAAGUCCC UGCCCUUUGU A CACACCGC CCGUCGCUAC UACCGAUUGA GCGGCUCAGU GAGGUCCUCG GAUCGGCCCC GCCCGGGGCU CCCUUACCGG GG GCCCUGG UGGAGCGCCG AGAAGACGAU CGAACUCGGU CGUUUAGAGG AAGUAAAAGU CGUAACAAGG UUUCCGUAGG UGA ACCUGC GGAAGGAUCA UUA

GENBANK: GENBANK: LR812041.1

+
分子 #2: 28S rRNA

分子名称: 28S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 1.382249125 MDa
配列文字列: CACGACCUCA GCUCAGACGA GAAGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUACUA AGCGGAGGAA AAGAAACCAA CCGGGAUUCC CCCAGUAGC GGCGAGCGAA GAGGGAAAAG UCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCUCUGCCGA GGGCGAGGGA CCUGUGGCGU A CGGAGGGC ...文字列:
CACGACCUCA GCUCAGACGA GAAGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUACUA AGCGGAGGAA AAGAAACCAA CCGGGAUUCC CCCAGUAGC GGCGAGCGAA GAGGGAAAAG UCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCUCUGCCGA GGGCGAGGGA CCUGUGGCGU A CGGAGGGC CGCCUCUCUC GGCGCGGGCC GGGGGGCCAA AGUCCUUCUG AUGGAGGCUU AGCCCGCGGA CGGUGUGAGG CC GGUGUCG GCCCCCGCCC CGCCGGGGUG CGGUUCCUCC CGGAGUCGGG UUGUUUGGGA AUGCAGCCCA AAGCGGGUGG UAA ACUCCA UCUAAGGCUA AAUACCGGCA CGAGACCGAU AGCGGACAAG UACCGUGAGG GAAAGUUGAA AAGAACUUUG AAGA GAGAG UUCAACAGGG CGUGAAACCG UUAAGAGGUA AACGGGUGGG GACCGCACCG UCCGCCCGGU GGAUUCAGCC CGGCG GGGC GGGGUCGGCC CGUCCGGUGC GCGCUCCCUU CGCUCCCUCA UUCCUGGGGG UGGCGCGGGG GGUUGACGCC CGGGCG AAG GCUCGGCCGC CGCCGGGUGC AUUUCCGCCG CGGUGGAGCG CCGCGACCGG CUCCGGUUCG GCUUGGAAGG GUCAGGG GG CGAAGGUGGC CCGUCGGUUC AGGCCGUCGG GCUUUACAGC GCCCUCCCGC CCCGACUUCG CCGCUUGCUC UCCGGGGC C GCGGGUGAGU GUCCUCCGCG CCCUCUCUGC CCUCCCUCCC UGUGGGGGGA GGUGCGGGGA CGGGGUCCCC CGCCCCCGG CGUGGCGCGA CAGGGGUGGA CUGUCCUCAG UCCGCCCACG GCUGCGCCGC GCCGCCCAGG GCGGGGAUCC GACCCACGUU CGGGCGCCC GAGGUCCGCG GCGACGCCGG CCUCCCACCC GACCCGUCUU GAAACACGGA CCAAGGAGUC CAACGCGCGC G CGAGUCAG AGGGUGGCUC GCGAGCCCCU GCGGCGCAAU GAAGGUGAGA ACGGGGGUCU CCCCCGGGUG GGAUCCCCCC GC CCCGGCG GGGGGCGCAC CACCGGCCCG CCUCGCGACC CUCCGGGGGG CAGGUGGAGU UGGAGCGCGC GCGAUGGCAC CCG AAAGAU GGUGAACUAU GCCUGGGCAG GGCGAAGCCA GGGGAAACUC UGGUGGAGGC CCGCCGCGGU CCUGACGUGC AAAU CGGUC GUCCGACCUG GGCAUAGGGG CGAAAGACUA AUCGAACCAU CUAGUAGCUG GUUCCCUCCG AAGUUUCCCU CAGGA UAGC UGGCGCUCGC CGAUCAAGCA GUUUUAUCCG GUAAAGCCAA UGACUAGAGG CCUUGGGGCC GAAACGGCCU CAACCU AUU CUCAAACUUU AAAUGGGUAA GAGGCCCGGC UCGCUGGCGC UGGAGCCGGG CGUGGAAUGC GACGCGCCUA GUGGGCC AU UUUUGGUAAG CAGAACUGGU GCUGCGGGAU GAACCGAACG CCGGGUUAAG GCGCCCGAUG CCGACGCUCA UCAGACCC C AUAAAAGGUG UUGGUUGAUA UAGACAGCAG GACGGUGGCC AUGGAAGUCG GCACCCGCCA AGGAGUGUGU AACAACUCA CCUGCCGAAU CAACUAGCCC UGAAAAUGGA UGGCGCUGGA GCGUCGGGCC CAUACCCGGC CGUCGACGGC ACAAGGGACA CGCGAGCGG UCGCGCGCGC UGCAAGCCUC GACGAGUAGG AGGGCCGCCG CGGUGGCGCC GAAGCCCAGG GCGCGGGCCC G GGUGGAGC CGCCGCGGGC GCAGAUCUUG GUGGUAGUAG CAAAUAUUCA AACGAGAGCU UUGAAGGCCG AAGUGGAGAA GG GUUCCAU GUGAACAGCA GUUGAACAUG GGUGAGCCGG UCCUAAGGGA CGGGCCUACG CCGUUCGGAG GGGAGGGGCG AUG GCCUCU GUCGCCCCCG CUCGACCGAA AGGGAGUCGG GUCCAGAUCC CCGAGCCCGG AGCGGCGGAG ACGGGCGCCG CGAG GCGCC CAGUGCGGUG ACGCAAACGA ACCCGGAGAU GCCGGCGGGU GCCCCGGGAA AGAGUUCUCU UUUCUUUGUG AAGGG CAGG GCGCCCUGGA ACGGGUUCGC CCCGAGAGAG GGGCCCGCGC CCUGGAAAGC GCCGCGCUUC UGGCGGCGUC CGGUGA GCU CUCGUCGGCC CUUGAAAAUC CGGGGGAGAA GGUGUAAAUC UCGCGCCGGG CCGUACCCAU AUCCGCAGCA GGUCUCC AA GGUGAACAGC CUCUGGCGUG UUGGAACAAG GCAGAGUAAG GGAAGUCGGC AAGUCAGAUC CGUAACUUCG GGAUAAGG A UUGGCUCUAA GGGCUGAGCC GGUCGGGCUG AGGUGCGAAG CGGGCCUGGG CCCGAGCCGC GACUGGGGGA GCGGCCGCC CCGAGGUGCC CUGACCCCCG UUCCCGAGCC GCGGGGGUGC GCGCGCGGUG GCGCGCGGUC CCUCUCUCCC CCCGCCGCGU CCGCCUCGG GCCUUUUUGC GGUCUCGACU CCCCCCGACU CUUCCCCUCC GCCCUUUCCC CGUCCGCGGG GGUCGGGCGG G GGGGUCUC GGAGGAGGGG GGGUGGAGAG GCCGUGGGGA GGAAAGGGGU GGUUCGUGGC GUCGGGGGGC AACGGGAGGG UC CUCGCCU GCCGCGCGAU GCCUCCGCUG GCCGGGGCCC GCGGGGGGCG GGAUGCGCAG CGGUUGGCGG CGGCGACCCU GGG CGCGCG CCGCGCCCUU CCCGCGGAUC UCCGCAGCUA CGGCCCCGCG CCGGGGCCCG CGUCCGCGCG UGCGCCCCCC UCCG GGGGA GUGGCGCGCG GCCUCGGCUC CCCCCGGUGC GGGCGCCUCG GCCGGCGGCU AGCAGCCAGC UUAGAACUGU CGCGG ACCA GGGGAAUCCG ACUGUUUAAU UAAAACAAAG CAUCGCGAAG GCCCUCGGCG GGUGUUGACG CGAUGUGAUU UCUGCC CAG UGCUCUGAAU GUCAAAGUGA AGAAAUUCAA CGAAGCGCGG GUAAACGGCG GGAGUAACUA UGACUCUCUU AAGGUAG CC AAAUGCCUCG UCAUCUAAUU AGUGACGCGC AUGAAUGGAU GAACGAGAUU CCCACUGUCC CUACCUGCUA UCUAGCGA A ACCACAGCCA AGGGAACGGG CUUGGCAGAA UCAGCGGGGA AAGAAGACCC UGUUGAGCUU GACUCUAGUC UGGCCCUGU GAAGAGACAU GAGGGGUGUA GAAUAAGUGG GAGGCCCCCG GGCUUCCCGG GCCGGCCGCC GGUGAAAUAC CACUACUCUU AUCGUUUCC UCACUUACCC GGUGAGGCGG GGAAGCCGGG CGUCCCCCGG CGGGGGCCGC CCCUGCUUCU GGCGUCAAGC G CCCCGGGG CCGUGCGGGG GGUGGGGGCA ACCCCCCUUC CCCUCCCGGC CGCCGACCGG GGCGCGACCC GCCCCGGGGA CA GCGUCAG GUGGGGAGUU UGACUGGGGC GGUACACCUG UCAAACGGUA ACGCAGGUGU CCUAAGGCGA GCUCAGGGGG GAC AGAAAC CUCCCGUAGA GCAGAAGGGC AAAAGCUCGC UUGAUCUUGA UUUUCAGUAU GAGUACGGAC CGCGAAAGCG GGGC CUCAC GAUCCUUCCG GCUUUUGGGG UUUUAAGCGG GAGGUGUCAG AAAAGUUACC ACAGGGAUAA CUGGCUUGUG GCGGC CAAG CGUUCAUAGC GACGUCGCUU UUUGAUCCUU CGAUGUCGGC UCUUCCUAUC AUUGUGAAGC AGAAUUCACC AAGCGU UGG AUUGUUCACC CACUAACAGG GAACGUGAGC UGGGUUUAGA CCGUCGUGAG ACAGGUUAGU UUUACCCUAC UGAUGUG AG CCGUUGUUGC AAUAGUAAUC CCGCUCAGUA CGAGAGGAAC CGCGGGUUCA GACAUUUGGU UCGUGCGCUU GGCUGAGG A GCCACUGGCG CGAAGCCACC AUCUGCGGGA UUAUGACUGA ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCUAAAAG CAACGAUAC AGCAGCGCCG UCGGAUCUCC GAUAGGCCCC GGGUAACCGG GAAGCCCCUC UCCGGGGGGG CCCCCGGCGC GGAGAGCCAU UCGUGACAG GAACCGGGGG CGCGGCUAGA ACGAGCGCCG CCCCCUCUUC CAGUGACGCA CCGCAUGUUU GUGGGGAACC C GGUGCUUA AAUGACUCGU AGACGACCUG AUUCUGGGUC GGGGUGUCGU GCGUGGCAGA GCAGCUCUGU UGCUGCGAUC CA UUGAAAG UCAGCCCUCG AUCCAAGUUU UG

GENBANK: GENBANK: AL935186.22

+
分子 #3: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 38.739027 KDa
配列文字列:
GCUUACGGCC AUACCACCCU GGAAAUGCCC GAUCUCAUCU GAACUCGGAA GUAAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCAGGU GCUGUAAGCU A

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+
分子 #4: 5.8S rRNA

分子名称: 5.8S rRNA / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 50.823137 KDa
配列文字列:
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+
分子 #5: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 28.131973 KDa
配列文字列: MGRVIRGQRK GAGSVFKAHV KHRKGAAKLR HIDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VMFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFIY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKSRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV ...文字列:
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UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #6: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 34.043191 KDa
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MSGGLDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYVYK RKSDGVYIIN LKKTWEKLLL AARAIVAIEN PADVCVISSR NTGQRAVLK FASATGSTTF AGRFTPGTFT NQIQAAFREP RLLIVTDPRA DHQPLTEASY VNIPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGP HSVGLMWWML AREVLRMRGT ISREHPWEVM PDLYFYRDPE EIEKEEQAAA EKAVGKEEFQ GEWTAPVPDF NQ PEVADWS EGVQVPSVPI QQFPAGIEAP GKPAPAEVYA EDWSAQPATE DWSAAPTAQA GDWGGATADW S

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #7: Ribosomal protein L3

分子名称: Ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 46.358297 KDa
配列文字列: MSHRKFSAPR HGSLGFLPRK RCKRHRGKVK SFPKDDPSKP VHLTAFLGYK AGMTHIVREV DRPGSKVNKK EVVEAVTVVE TPPMIVVGV VGYVMTPRGL RSFKTIFAEH ISDECKRRFY KNWYKSKKKA FTKYCKRWQD EEGKKQLEKD FSSMKKYCQI I RIIAHTQM ...文字列:
MSHRKFSAPR HGSLGFLPRK RCKRHRGKVK SFPKDDPSKP VHLTAFLGYK AGMTHIVREV DRPGSKVNKK EVVEAVTVVE TPPMIVVGV VGYVMTPRGL RSFKTIFAEH ISDECKRRFY KNWYKSKKKA FTKYCKRWQD EEGKKQLEKD FSSMKKYCQI I RIIAHTQM RLLPHRQKKS HLMEIQLNGG TISDKVDWAR EKLEQSIPIA NVFSQDEMID VIGVTKGHGC KGVTSRWHTK KL PRKTHRG LRKVACIGAW HPARVAFSVA RAGQKGYHHR TEINKKIYKI GVGYHNKDGK LVKNNASTDY DLSNKSINPL GGF VHYGEV TNDFLMLKGC VVGTKKRVLT LRKSLLVQTS RRAQEKIDLK FIDTTSKFGH GRFQTIEEKK NFMGPLKKDR LAKE EMA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 30.256352 KDa
配列文字列: MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK IVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNLGKTLVT RTQGTRIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLVTE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRTNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM ...文字列:
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UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #9: Ribosomal protein L4

分子名称: Ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 42.644477 KDa
配列文字列: MACARPLISV YSEKGETSGK NVVMPAVFRA PIRPDIVNFV HTNMRKNKRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNVNQ KRYAMCSALA ASALPSLVMA KGHRIEEIPE VPLVVDDKVE G YKKTKEAV ...文字列:
MACARPLISV YSEKGETSGK NVVMPAVFRA PIRPDIVNFV HTNMRKNKRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNVNQ KRYAMCSALA ASALPSLVMA KGHRIEEIPE VPLVVDDKVE G YKKTKEAV LLLKKLKAWN DIKKVYASQR MRAGKGKMRN RRRIQRKGPC IIYNEDNGVT RAFRNIPGIT LQSVSRLDLL KL APGGHIG RFCIWTEGAF RKLDDLYGTW RKASTLKVDY NLPMHKMSIT DLNRIIKSEE VQKAIRPANR KINRRVFKKN PLK NLRVMM KLNPYAKTAR RRAIMAHNPD VKAKMLKPKK KRVVKKTKAK KAEATPAQA

UniProtKB: Ribosomal protein L4

+
分子 #10: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 30.342279 KDa
配列文字列: MADDAGGRGG FRGGFGTGGR GRGRGRGRGR GRGRGARGGK SEDKEWVPVT KLGRLVKDMK IKSLEEIYLY SLPIKESEII DFFLGSALK DEVLKIMPVQ KQTRAGQRTR FKAFVAIGDY NGHVGLGVKC SKEVATAIRG AIILAKLSII PVRRGYWGNK I GKPHTVPC ...文字列:
MADDAGGRGG FRGGFGTGGR GRGRGRGRGR GRGRGARGGK SEDKEWVPVT KLGRLVKDMK IKSLEEIYLY SLPIKESEII DFFLGSALK DEVLKIMPVQ KQTRAGQRTR FKAFVAIGDY NGHVGLGVKC SKEVATAIRG AIILAKLSII PVRRGYWGNK I GKPHTVPC KVTGRCGSVL VRLIPAPRGT GIVSAPVPKK LLMMAGIDDC YTSARGCTAT LGNFAKATFD AISKTYSYLT PD LWKETVF TKSPYQEFTD HLAKTHTRVS VQRTQGALPQ GTS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #11: Ribosomal protein L5b

分子名称: Ribosomal protein L5b / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 34.118434 KDa
配列文字列: MGFVKVVKNK SYFKRYQVKF RRRREGKTDY FARKRLVIQD KNKYNTPKYR MIVRFSNRDI VCQIAYAKIE GDMIVCAAYS HELPKYGIS VGLTNYAAAY CTGLLLARRL LNKFGLDKVY DGQVEITGDE FNVESIDGQP GAFTCYLDAG LARTTTGNKV F GALKGAVD ...文字列:
MGFVKVVKNK SYFKRYQVKF RRRREGKTDY FARKRLVIQD KNKYNTPKYR MIVRFSNRDI VCQIAYAKIE GDMIVCAAYS HELPKYGIS VGLTNYAAAY CTGLLLARRL LNKFGLDKVY DGQVEITGDE FNVESIDGQP GAFTCYLDAG LARTTTGNKV F GALKGAVD GGLSIPHSTK RFPGYDVESK EFNAEVHRKH ILGLNIAEYM RLLMEEDEEC YKKQFSRFIK NGVTADSMEE MY KKAHAAI RENPVHEKKP KREVKKKRWN RAKLTLAQRK DRVAQKKASF LRAQAAEED

UniProtKB: Ribosomal protein L5b

+
分子 #12: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase

分子名称: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 26.879502 KDa
配列文字列: MAVQISKKRK FVSDGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGGVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV ...文字列:
MAVQISKKRK FVSDGIFKAE LNEFLTRELA EDGYSGVEVR VTPTRTEIII LATRTQNVLG EKGRRIRELT AVVQKRFGFP EGGVELYAE KVATRGLCAI AQAESLRYKL LGGLAVRRAC YGVLRFIMES GAKGCEVVVS GKLRGQRAKS MKFVDGLMIH S GDPVNYYV DTAVRHVLLR QGVLGIKVKI MLPWDPSGKI GPKKPLPDHV SIVEPKEEVL STTPVSEQKG AKPEVPVMPQ GT PVPTA

UniProtKB: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 30.61851 KDa
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MAEGDKKKVA RKHGSRNPEL VRGIGRYSRS AMFARRAMYK RKTKAPVTKV EKKIKEKKVK QKSKNPTTAI KTVGGDKNGG TRVVKLRKM PRYYPTEDVR RKLRSHGIKA FSQHRRKLRK TITPGTVLIM LTGRHRGKRV VFLKQLDSGL LLVTGPLAIN R VPLRRAHQ KFCIATNTKV DISGMKIPRT LTDSYFKKKK LRKPKHQEGE IFDTEKEKYQ LTEQRKADQK AVDSQLLPLI KK VPQLRGY LRSMFSLSNG VYPHKLVF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL6

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S4, X isoform

分子名称: 40S ribosomal protein S4, X isoform / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 29.746068 KDa
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MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPTGFMDV VSIEKTGENF RLIYDVKGRF TVHRITNEEA KYKLCKVRKI LIGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I RIDLDTGK ITDFIKFETG NMCMVTGGAN LGRIGVITNR EKHPGSFDVV HVKDSIGNSF ATRLSNIFVI GKGNKPWVSL PR GKGVRLT IAEERDKRLA AKQSSS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS4

+
分子 #15: Ribosomal protein L7

分子名称: Ribosomal protein L7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 28.505924 KDa
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MAGETKKKIP SVPESLLKRR QRFAAIRAVR LKKAKADKKA SKVTRKLIFK RAEAYHKEYK QLYRREIRMS RMARKAGNYY VPAEPKLAF VIRIRGINGV SPKVRKVLQL LRLRQIFNGV FVKLNKASIN MLRIAEPYIA WGYPNLKSVR ELIYKRGFGK I KKQRIALT DNSLIEKTLG QCGIICIEDL IHEIYTVGKN FKAANNFLWP FKLSSPRGGM NKKTTHFVEG GDAGNREDQI NR LVRRMN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #16: Ribosomal protein S5

分子名称: Ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 22.9094 KDa
配列文字列: MAEDWEAAPA VAETPEIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSSGRYAAKR FRKAQCPIVE RVTNSMMMHG RNNGKKLLT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QILVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT ...文字列:
MAEDWEAAPA VAETPEIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSSGRYAAKR FRKAQCPIVE RVTNSMMMHG RNNGKKLLT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QILVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT IAECLADELI NAAKGSSNSY AIKKKDELER VAKSNR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #17: 60S ribosomal protein L7a

分子名称: 60S ribosomal protein L7a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 30.07768 KDa
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MPKGKKGKGK KVAPAPSVAK KHEVKKVVNP LFEKRPKNFG IGQDIQPKRD LTRFVKWPRY VRLQRQRAIL YKRLKVPPAI NQFTQALDR QTATQLFKLA HKYRPETKHE KKQRLLARAE QKAAGKGDTP TKRPPVLRAG VNTVTTLVES KKAQLVVIAH D VDPIELVV FLPALCRKMG VPYCIVKGKA RLGRLVHRKT CTSIAFTQTN PEDKAALAKL VEAIKTNYND RYEEIRRHWG GN VLGPKST ARIAKLEKAK AKELATKLG

UniProtKB: 60S ribosomal protein L7a

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 28.778922 KDa
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MKLNISFPAT GCQKLIEVDD ERKLRIFYEK RMATEVAADS LGDEWKGYVV RISGGNDKQG FPMKQGVLTH GRVRLLLSKG HSCYRPRRT GERKRKSVRG CIVDANLSVL NLVIVRKGEK DIPGLTDSTV PRRLGPKRAS RIRKLFNLSK EDDVRQYVVR R PLTKEGKK PRTKAPKIQR LVTPRVLQHK RRRIALKRQR TLKNKEAAAE YTKLLAKRMK EAKEKRQEQI AKRRRLSSLR AS TSKSESS QK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S6

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L9

分子名称: 60S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 21.689256 KDa
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MKTILSNQTV DIPDNVTVSL KGRTVTVKGP RGVLRREFNH INLELSLLGK KQKKLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQESG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR QGVACAVSAA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVV EAES

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #20: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 22.293119 KDa
配列文字列: MFSTSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELHITAAKE IEVGGSRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTNVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD SSRLIKVHLD K AQQNNVEH ...文字列:
MFSTSAKIVK PNGEKPDEFE SGISQALLEL EMNSDLKAQL RELHITAAKE IEVGGSRKAI IIFVPVPQLK SFQKIQVRLV RELEKKFSG KHVVFIAQRR ILPKPTRKSR TKNKQKRPRS RTLTNVHDAI LEDLVFPSEI VGKRIRVKLD SSRLIKVHLD K AQQNNVEH KVETFAGVYK KLTGKDVIFE FPEFQL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS7

+
分子 #21: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 24.664143 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDPK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCA HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKTC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSVR TKAQNKEHVI EALRRAKFKF P GRQKIHVS ...文字列:
MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDPK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCA HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKTC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSVR TKAQNKEHVI EALRRAKFKF P GRQKIHVS KKYGFTKFNT CDFDNMLAEK RLIPDGCGVK YIPSRGPLSR WKALHAN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #22: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 24.151434 KDa
配列文字列: MGISRDNWHK RRRTGGKRKP VHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTIRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CVVLVDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKVQKKF TLRRKTAKIS P LLEEQFLQ ...文字列:
MGISRDNWHK RRRTGGKRKP VHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTIRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CVVLVDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKVQKKF TLRRKTAKIS P LLEEQFLQ GKLLACISSR PGQCGRADGY VLEGKELEFY LRKIKAKKGK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS8

+
分子 #23: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 20.415695 KDa
配列文字列:
MADQSEKKEN PMRELRIRKL CLNICVGESG DRLTRAAKVL EQLTGQTPVF SKARYTVRSF GIRRNEKIAV HCTVRGAKAE EILEKGLKV REYELRKNNF SDTGNFGFGI QEHIDLGIKY DPSIGIYGLD FYVVLGRPGF SIADKKRKTG RIGAKHRIRK E EAMRWFQQ KYDGIILPGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 22.515379 KDa
配列文字列: MPVAKTWVCS KTYVTPRRPF EKSRLDQELR LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPKR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKVEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFVV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG ...文字列:
MPVAKTWVCS KTYVTPRRPF EKSRLDQELR LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPKR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKVEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFVV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG RPGRVKRKNA KKAQGGGGGG DDEEED

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #25: Ribosomal protein S10

分子名称: Ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 18.919795 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHLA KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSCGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DFLHLPPEI VPATLRRQTR PETARPRPKG LEGERPARLA RGEGDRDAYR RSAAQPGADK KAEAGAGAAT EFQFRGGFGR G RGQQPQ

UniProtKB: Ribosomal protein S10

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 24.426879 KDa
配列文字列: MAPSRNGMIL NPHFHKDWQK RVRTWFNQPA RKIRRRKARQ AKARRIAPRP VSGPLRPVVR CPTIRYHTKV RAGRGFTLEE LKAAGINKK VARTIGISVD SRRRNRSTES LQANVQRLKE YRTKLIIFPR KAAKPKKGDS TEEELKMATQ LTGPVMPIKK V HKKEKARV ...文字列:
MAPSRNGMIL NPHFHKDWQK RVRTWFNQPA RKIRRRKARQ AKARRIAPRP VSGPLRPVVR CPTIRYHTKV RAGRGFTLEE LKAAGINKK VARTIGISVD SRRRNRSTES LQANVQRLKE YRTKLIIFPR KAAKPKKGDS TEEELKMATQ LTGPVMPIKK V HKKEKARV ISEDEKNFKA FASLRMARAN ARLFGIRAKR AKEAAEQDVE KKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL13

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 18.444666 KDa
配列文字列:
MADTQNERAY QKQPTIFQNK KRVLAVEGSG KEKLPRYHRN VGLGFKTPRE AIDGTYIDKK CPFTGNVSIR GRILSGVVTK MKMQRTIVI RRDYLHYIRK YNRFEKRHKN MSVHLSPCFR DVTVGDIVTV GECRPLSKTV RFNVLKVTKA AGAKKQFQKF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #28: 60S ribosomal protein L14

分子名称: 60S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 16.166252 KDa
配列文字列:
MVFKRFVEIG RVAFIAFGPH EGKLVAIVDV IDQNRALVDG PCTGVKRQAL PFKCLQLTDY VIKVPHSARQ KYVRRAWEKA EISKKWEES SWAKKIEARK KRAAMSDFDR YKVSKAKKMR NKIIRHEMKK LQKAAAQKKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14

+
分子 #29: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 24.124232 KDa
配列文字列: MGAYKYMQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSSLHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQIKFARSLQ SVAEERAGRH CGGLRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDTFH KAIRRNPDTQ WITKAVHKHR E MRGLTSAG ...文字列:
MGAYKYMQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSSLHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQIKFARSLQ SVAEERAGRH CGGLRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDTFH KAIRRNPDTQ WITKAVHKHR E MRGLTSAG KKSRGLGKGH KFHLTIGGSR RAAWKRRNTL QLHRYR

UniProtKB: Ribosomal protein L15

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S13

分子名称: 40S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 17.23134 KDa
配列文字列:
MGRMHAPGKG LSQSALPYRR SVPTWLKLTS DDVKEQIFKL AKKGLTPSQI GVILRDSHGV AQVRFVTGNK ILRILKSKGL APDLPEDLY HLIKKAVAVR KHLERNRKDK DAKFRLILVE SRIHRLARYY KTRRVLAPNW KYESSTASAL VA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #31: 60S ribosomal protein L13a

分子名称: 60S ribosomal protein L13a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 23.731516 KDa
配列文字列: MADRFNKVLI IDGRGHLLGR LSAIVAKQVL LGHKIVVVRC EGINISGNFY RNKLKYLAFL RKRMNTNPSR GPYHFRAPSR IFWRTVRGM LPHKTKRGQA ALDRLKVFDG IPPPYDKRKR MVVPAALKIV RLKPTRKFAL LGRLAHEVGW KYQAITATLE E KRKEKAKL ...文字列:
MADRFNKVLI IDGRGHLLGR LSAIVAKQVL LGHKIVVVRC EGINISGNFY RNKLKYLAFL RKRMNTNPSR GPYHFRAPSR IFWRTVRGM LPHKTKRGQA ALDRLKVFDG IPPPYDKRKR MVVPAALKIV RLKPTRKFAL LGRLAHEVGW KYQAITATLE E KRKEKAKL RYSKKKVEMK LTKQAEKNVE SKIAVYTDVL KKYGVLV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #32: Ribosomal protein S14

分子名称: Ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 16.274757 KDa
配列文字列:
MAPRKGKEKK EEQVISLGPQ VAEGENVFGV CHIFASFNDT FVHVTDLSGK ETICRVTGGM KVKADRDESS PYAAMLAAQD VAQKCKELG ITALHIKLRA TGGNRTKTPG PGAQSALRAL ARSGMKIGRI EDVTPIPSDS TRRKGGRRGR RL

UniProtKB: Ribosomal protein S14

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L17

分子名称: 60S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 21.476158 KDa
配列文字列:
MVRYSLDPEN PTKSCKSRGS NLRVHFKNTR ETAQAIKGMH IRKANKYLKD VIVKHQCVPF RRYNGGVGRC AQAKQHDWTQ GRWPKKSAE FLLHMLKNAE SNAELKGLDV DSLVIEHIQV NKAPKMRRRT YRAHGRINPY MSSPCHIEMI LTEKEQIVPK P EEEVSQKK KVSQKKLKKQ KLMARE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #34: 40S ribosomal protein S15

分子名称: 40S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 17.040109 KDa
配列文字列:
MADTEQKKKR TFRKFTYRGV DLDQLLDMSY EQLMQLYSAR QRRRLNRGLR RKQQSLLKRL RKAKKEAPPM EKPEVVKTHL RDMVILPEM VGSMVGVYNG KTFNQVEIKP EMIGHYLGEF SITYKPVKHG RPGIGATHSS RFIPLK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #35: Ribosomal protein L18

分子名称: Ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 21.04501 KDa
配列文字列:
MGVDIRHNKD RKVHRKEPKS QDIYLRLLVK LYRFLSRRSD APFNKVILRR LFMSKTNRPP LALSRLIRKM KLPGRENLTA VVVGTITDD VRIQNIPKLK VCALKVTDRA RSRILKAGGQ IMTFDQLALT SPRGRGTVLL SGPRKGRQVY RHFGKAPGTP H SHTKPYVR SKGRKFERAR GRRH

UniProtKB: Ribosomal protein L18

+
分子 #36: Ribosomal protein S16

分子名称: Ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 16.387312 KDa
配列文字列:
MPAKGPLQSV QVFGRKKTAT AVAHCKRGNG LIKVNGRPLE MIEPVTLQYK LLEPLLLLGK ERFAGVDIRV RVKGGGHVAQ VYAIRQAIS KALVAYYQKY VDEASKKEIK DILIQYDRTL LVADPRRCES KKFGGPGARA RYQKSYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #37: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 23.522225 KDa
配列文字列: MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLVKDGLI IKKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGVGK RKGTANARM PEKLCWMRRM RILRRLLRRY REAKKIDRHM YHSLYLRAKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRTKTRE ...文字列:
MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLVKDGLI IKKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGVGK RKGTANARM PEKLCWMRRM RILRRLLRRY REAKKIDRHM YHSLYLRAKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRTKTRE ARKRREERQQ AKKEEIIKTL SKEDETKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL19

+
分子 #38: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.481043 KDa
配列文字列:
MGRVRTKTVK KAARVIIEKY YTRLGNDFHT NKRVCEEIAI IPSKKLRNKI AGYVTHLMKR IQRGPVRGIS IKLQEEERER RDNYVPEVS ALDQEIIEVD TDTKEMLKLL DFGSLSNLQV TQPPVGMNFK TPRGV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #39: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 20.725533 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRLLPSV KNPAPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LRKMKKASGE IVYCGLVFEK SPLKVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTSGAVTQC YRDMGARHRA RAHAIQIMKV QVIAANKCRR PAIKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL20

+
分子 #40: 40S ribosomal protein S18

分子名称: 40S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 17.772777 KDa
配列文字列:
MSLVIPEKFQ HILRVLNTNI DGRRKIAFAI TAIKGVGRRY AHVVLRKADI DLNKRAGELT EDEVERVVTI MQNPRQYKIP DWFLNRQKD IKDGKYSQVL ANGLDNKLRE DLERLKKIRA HRGLRHFWGL RVRGQHTKTT GRRGRTVGVS KKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #41: 60S ribosomal protein L21

分子名称: 60S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 18.574945 KDa
配列文字列:
MTNTRGKRRG TRYMFARPFR KHGPIPLSTY MRIYKKGDIV DIKGTGTIQK GMPHKCYHGK TGRVYNVTQH AVGIIVNKQV KGKILAKRI NVRIEHIKHS KSRDSFLQRV KENEKKKVEA KKEGTWIELK RQPAAPRPAH FVSTKNNKPQ LLEPIPYEFM A

UniProtKB: 60S ribosomal protein L21

+
分子 #42: 40S ribosomal protein S19

分子名称: 40S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.971671 KDa
配列文字列:
MPGGVTVKDV NQQEFVRALA AFLKKSGKLK VPDWVDIVKL AKHKELAPCD ENWFYIRAAS TVRHLYLRGG VGVGSMTKIY GGRKRNGVC PSHFSVGSKN VARKVLQALE GLKMVEKDPN GGRRLTPQGT RDLDRIAGQV AAASKKV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS19

+
分子 #43: Ribosomal protein L22

分子名称: Ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 16.316792 KDa
配列文字列:
MRFFSSSFLP KLSAMAPIKK QVTKGGKKKK QVLKFTLDCT HPVEDGIMDA ANFEQFLQER IKVNGKAGNL GGGVVSIERS KSKITVTSE VPFSKRYLKY LTKKYLKKNN LRDWLRVVAN TKESYELRYF QINQDEEEED ED

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL22

+
分子 #44: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 13.315674 KDa
配列文字列:
MAFKDTGKAP VEAEVAIHRI RITLTSRNVK SLEKVCADLI RGAKEKSLKV KGPVRMPTKT LRITTRKTPC GEGSKTWDRF QMRIHKRLI DLHSPSEIVK QITSISIEPG VEVEVTIADA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #45: 60S ribosomal protein L23

分子名称: 60S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 14.908505 KDa
配列文字列:
MSKRGRGGSS GAKFRISLGL PVGAVINCAD NTGAKNLYII SVKGIKGRLN RLPSAGVGDM VMATVKKGKP ELRKKVHPAV VIRQRKSYR RKDGVFLYFE DNAGVIVNNK GEMKGSAITG PVAKECADLW PRIASNAGSI A

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #46: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 8.915166 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQINIAEVD RVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGEADDSLL RLAKTDSIVA K

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS21

+
分子 #47: 60S ribosomal protein L24

分子名称: 60S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 17.929113 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARIDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEVSKK RTRRAVKFQR AITGASLAE ILAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QATKKQTTQS SKAPAKSAQK QKIAKPMKVS APRVGGKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL24

+
分子 #48: 40S ribosomal protein S15a

分子名称: 40S ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 14.865555 KDa
配列文字列:
MVRMNVLADA LKSINNAEKR GKRQVLLRPC SKVIVRFLTV MMKHGYIGEF EIIDDHRAGK IVVNLTGRLN KCGVISPRFD VQLKDLEKW QNNLLPSRQF GFIVLTTSAG IMDHEEARRK HTGGKILGFF F

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #49: Ribosomal protein L23a

分子名称: Ribosomal protein L23a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 17.686102 KDa
配列文字列:
MAPKAKKEAV PAKTEAKSKA LKAKKAVLKG VHSQKKKKIR TTPTFHRPKT LRLRRQPKYP RKSAPRRNKL DHYAIIKFPL TTESAMKKI EDNNTLVFIV DVKANKHQIK HAVKKLYDID VAKVNTLIRP DGEKKAYVRL APDYDALDVA NKIGII

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #50: 40S ribosomal protein S23

分子名称: 40S ribosomal protein S23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.885717 KDa
配列文字列:
MGKCRGLRTA RKLRNHRREQ KWHDKQYKKA HLGTALKANP FGGASHAKGI VLEKVGVEAK QPNSAIRKCV RVQLIKNGKK ITAFVPNDG CLNFIEENDE VLVAGFGRKG HAVGDIPGVR FKVVKVANVS LLALYKGKKE RPRS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #51: ATPase H+ transporting V0 subunit e1

分子名称: ATPase H+ transporting V0 subunit e1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 17.387506 KDa
配列文字列:
MKLNTFVTSS RRKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQDI KEKGKYKEET IEKMQE

UniProtKB: Ribosomal protein L26

+
分子 #52: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.383306 KDa
配列文字列:
MNDTVTVRTR KFMTNRLLQR KQMIVDVLHP GKATVPKTEI REKLAKMYKT TPDVVFVFGF KTQFGGGKTT GFGMIYDSLD YAKKNEPKY RLQRHGLYEK KKTSRKQRKE RKNRMKKVRG IKKASVGASG KKK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S24

+
分子 #53: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.819896 KDa
配列文字列:
MGKFMKPGKV VMVLAGRYAG RKAVIVKNID DGTADRPYSH ALVAGIDRYP RKVTATMGKK KIAKRSKIKA FVKVFNYNHL MPTRYSVDI PLDKTVVNKD VFRDPALKRK ARREAKVKFE ERYKTGKNKW FFQKLRF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL27

+
分子 #54: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 13.894333 KDa
配列文字列:
MPPKDSKQKK DAGKSKKDKD PVNKSGGKAK KKKWSKGKVR DKLNNLVLFD KATYDKLYKE VPNYKLITPA VVSERLKIRG SLARAALQE LLGKGLIKLV SKHRAQVIYT RNTKGTDEAA PEKEA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS25

+
分子 #55: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 16.62149 KDa
配列文字列:
MPTKKSKTRK LRGHVSHGHG RVGKHRKHPG GRGNAGGLHH HRINFDKYHP GYFGKVGMRH YHLKRNTTFC PTINLDKLWT LVSEQTRVN YSQKPDGPAP IIDVVRAGYF KVLGKGKLPK QPVIVKAKFF SRRAEEKIKG VGGACVLTA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #56: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 13.053496 KDa
配列文字列:
MTKKRRNNGR AKKGRGHVQP IRCTNCARCV PKDKAIKKFV IRNIVEAAAV RDISEASVFD SYVLPKLYVK LHYCVSCAIH SKVVRNRSR EARKDRTPPP RFRPTGGAPR APPKPM

UniProtKB: 40S ribosomal protein S26

+
分子 #57: 60S ribosomal protein L29

分子名称: 60S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 7.596919 KDa
配列文字列:
MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGAKTIARK EASK

UniProtKB: 60S ribosomal protein L29

+
分子 #58: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 9.550239 KDa
配列文字列:
MPLAKDLLHP TPEEERRRHK KKRLVQSPNS YFMDVKCPGC YKITTVFSHA QTVVLCVGCS TVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RKQH

UniProtKB: 40S ribosomal protein S27

+
分子 #59: 60S ribosomal protein L30

分子名称: 60S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 13.004215 KDa
配列文字列:
MVAAKKTKKS LESINSRLQL VMKSGKYVLG YKQSQKMIRQ GKAKLVILAN NCPALRKSEI EYYAMLAKTG VHHYSGNNIE LGTACGKYY RVCTLAIIDP GDSDIIRSMP DQQQGGEK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL30

+
分子 #60: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 7.838026 KDa
配列文字列:
MDASRVQPIK LARVTKVLGR TGSQGQCTQV RVEFMDDSNR SIIRNVKGPV REGDVLTLLE SEREARRLR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #61: 60S ribosomal protein L31

分子名称: 60S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 14.369771 KDa
配列文字列:
MAPKKGEKKK GRSAINEVVT REYTINIHKR IHGISFKRRA PRALKEIRKF AVKEMGTPDV RIDTRLNKAV WAKGVRNVPY RMRVRLSRK RNEDEDSPNK LYTLVTYVPV TTYKGLQTVN VDEN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL31

+
分子 #62: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 6.692794 KDa
配列文字列:
MGHQQLYWSH PRKYGQGSRS CRVCSNRHGL IRKYGLNMCR QCFRQYAKDI GFVKLD

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #63: Ribosomal protein L32

分子名称: Ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.851852 KDa
配列文字列:
MAALRPLTKP KIVKKRTKKF IRHQSDRYVK IRANWRKPRG IDNRVRRRFK GQMLMPNIGY GSNRKTKHML PSGFKKFLVH NVKELEVLM MSNKSHCAEI AHNVSSKNRK LIVERAAQLA IKVTNPNARL RSEENE

UniProtKB: 60S ribosomal protein L32

+
分子 #64: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 14.651978 KDa
配列文字列:
MQLFLRAQSL HTLEVSGNET VRDIKAHVEA LEGVCVEDQL LLLSGAPLQD DSTLLNCGIT EFCTLEVSGR LLGGKVHGSL ARAGKVRGQ TPKVDKQEKK KKKTGRAKRR IQYNRRFVNV VPTFGKKKGP NANS

UniProtKB: FAU ubiquitin-like and ribosomal protein S30 fusion a

+
分子 #65: 60S ribosomal protein L35a

分子名称: 60S ribosomal protein L35a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 12.50383 KDa
配列文字列:
MPGRLWSKAI FAGYKRGLRN QREHTALLKL EGVYNRGEVD FYLGKRCAYV YKAKKKTATP GGKPNKTRVI WGKVTRAHGN SGMVRAKFK SNLPAKAIGH RIRVMLYPSR V

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL33

+
分子 #66: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 13.401077 KDa
配列文字列:
MVQRLTYRRR LSYNTASNKT RLSRTPGNRI VYLYTKKTGK SPKSACGICP GRLRGIRAVR PQVLMRLSKT KKHVSRAYGG SMCAKCVRD RIKRAFLIEE QKIVVKVLKA QAQTQKSK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL34

+
分子 #67: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1

分子名称: Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 35.161703 KDa
配列文字列: MTEQMTVRGT LKGHSGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSADNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTIQDDSHTE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC ...文字列:
MTEQMTVRGT LKGHSGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSADNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTIQDDSHTE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC GWDKMVKVWN LANCKLKTNH IGHTGYLNTV TVSPDGSLCA SGGKDGQAML WDLNEGKHLY TLDGGDTINA LC FSPNRYW LCAATGPSIK IWDLEGKIIV DELRQDIITT NSKAEPPQCT SLAWSADGQT LFAGYTDNLI RVWQVTIGTR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein RACK1

+
分子 #68: 60S ribosomal protein L35

分子名称: 60S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 14.47053 KDa
配列文字列:
MAKIKARDLR GKKKEELLKQ LDDLKVELSQ LRVAKVTGGA ASKLSKIRVV RKSIARVLTV INQTQKENLR KFYKGKKYKP LDLRPKKTR AIRRQLTKHE ENLMTKKMQR KSRLYSIRKF AVKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #69: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 12.216753 KDa
配列文字列:
MVVRYPMAVG LNKGHKVTKN VSKPKHSRRR GRLTKHAKFA RDLIREVCGF APYERRAMEL LKVSKDKRAL KFIKKRVGTH IRAKRKREE LSNTLAAMRK AAAKKE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL36

+
分子 #70: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 11.074016 KDa
配列文字列:
MTKGTSSFGK RRNKTHTLCR RCGSKAYHLQ KSTCGKCGYP AKRKRKYNWS AKAKRRSTTG TGRMRHMKVV FRRFRNGFRE GTVPKPRRA AVAASSSS

UniProtKB: Ribosomal protein L37

+
分子 #71: 60S ribosomal protein L38

分子名称: 60S ribosomal protein L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 8.238948 KDa
配列文字列:
MPRKIEEIKD FLLTARRKDA KSVKIKKNKD NVKFKVRCSR YLYTLVITDK EKAEKLKQSL PPGLAVKELK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL38

+
分子 #72: Ribosomal protein L39

分子名称: Ribosomal protein L39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 6.279562 KDa
配列文字列:
ASHKTFRIKR FLAKKQKQNR PIPQWIRMKT GNKIRYNSKR RHWRRTKLGL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL39

+
分子 #73: 60S ribosomal protein L40

分子名称: 60S ribosomal protein L40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 14.786446 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DTIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGRTLSDYN IQKESTLHLV LRLRGGIIEP SLRQLAQKY NCEKMICRKC YARLHPRAVN CRKKKCGHTN NLRPKKKLK

UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eL40 fusion protein

+
分子 #74: Rpl41

分子名称: Rpl41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

+
分子 #75: 60S ribosomal protein L36a

分子名称: 60S ribosomal protein L36a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 12.565102 KDa
配列文字列:
MVNVPKTRRT YCKKCKKHQP HKVTQYKKGK DSLYAQGKRR YDRKQSGYGG QTKPIFRKKA KTTKKIVLRL ECVEPNCRSK RMLAIKRCK HFELGGDKKR KGQVIQF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL42

+
分子 #76: Zgc:171772

分子名称: Zgc:171772 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 76 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 10.229295 KDa
配列文字列:
MAKRTKKVGI VGKYGTRYGA SLRKMVKKIE ISQHAKYTCS FCGKTKMKRK AVGIWHCGSC MKTVAGGAWS YNTTSAVTVK SAIKRLKEL KDQ

UniProtKB: 60S ribosomal protein L37a

+
分子 #77: 60S ribosomal protein L28

分子名称: 60S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Danio rerio (ゼブラフィッシュ)
分子量理論値: 15.661467 KDa
配列文字列:
MASPHLQWMV IRNSSSFLIK RNKQTYSTEP NNLKARNAFR FNGLIHRKTI GIEPAADGKG VVVVLKKRSG QRKPASSYGK ITINKNSRA TLASVRNIIR KNKYRRDLRM AALRRVSAIL SSQKPVVVRK KRSRAPKSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL28

+
分子 #78: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 78 / コピー数: 203 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #79: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 79 / コピー数: 7 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
構成要素:
濃度式名称
20.0 mMHEPESHEPES
100.0 mMKClpotassium chloride
5.0 mMMg(OAc)2magnesium acetate
1.0 mMDTTdithiothreitol
20.0 mMNH4Clammonium chloride
グリッドモデル: Quantifoil R3.5/1 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 60 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 70 % / 装置: LEICA EM GP

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 11860 / 平均電子線量: 48.3 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 1285670
初期モデルモデルのタイプ: NONE
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 2.14) / 詳細: composite map of separately refined subunits / 使用した粒子像数: 775288
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 2.14)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC (ver. 2.14)
最終 3次元分類クラス数: 3 / ソフトウェア - 名称: cryoSPARC

-
原子モデル構築 1

精密化プロトコル: OTHER
得られたモデル

PDB-7oyb:
Cryo-EM structure of the 6 hpf zebrafish embryo 80S ribosome

+
万見について

-
お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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