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- EMDB-12632: Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound b... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-12632
タイトルMammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S.
マップデータ
試料
  • 複合体: Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S.
    • タンパク質・ペプチド: x 79種
    • RNA: x 5種
  • リガンド: x 4種
キーワードInhibitor 80S Termination Complex Blasticidin S Translation NMD / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


Protein hydroxylation / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / Formation of a pool of free 40S subunits / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / Translation initiation complex formation / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex ...Protein hydroxylation / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / Formation of a pool of free 40S subunits / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) / Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) / Translation initiation complex formation / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Ribosomal scanning and start codon recognition / translation termination factor activity / Translesion synthesis by REV1 / Recognition of DNA damage by PCNA-containing replication complex / Translesion Synthesis by POLH / Downregulation of ERBB4 signaling / Spry regulation of FGF signaling / Downregulation of ERBB2:ERBB3 signaling / NOD1/2 Signaling Pathway / APC/C:Cdc20 mediated degradation of Cyclin B / APC-Cdc20 mediated degradation of Nek2A / EGFR downregulation / TCF dependent signaling in response to WNT / NRIF signals cell death from the nucleus / p75NTR recruits signalling complexes / NF-kB is activated and signals survival / Activated NOTCH1 Transmits Signal to the Nucleus / Downregulation of TGF-beta receptor signaling / TGF-beta receptor signaling in EMT (epithelial to mesenchymal transition) / Downregulation of SMAD2/3:SMAD4 transcriptional activity / SMAD2/SMAD3:SMAD4 heterotrimer regulates transcription / Senescence-Associated Secretory Phenotype (SASP) / Regulation of innate immune responses to cytosolic DNA / activated TAK1 mediates p38 MAPK activation / JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1 / Regulation of FZD by ubiquitination / N-glycan trimming in the ER and Calnexin/Calreticulin cycle / Regulation of TNFR1 signaling / TNFR1-induced NF-kappa-B signaling pathway / Translesion synthesis by POLK / Translesion synthesis by POLI / Regulation of necroptotic cell death / HDR through Homologous Recombination (HRR) / Josephin domain DUBs / Recruitment and ATM-mediated phosphorylation of repair and signaling proteins at DNA double strand breaks / Processing of DNA double-strand break ends / Formation of Incision Complex in GG-NER / Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER / Dual Incision in GG-NER / Fanconi Anemia Pathway / Regulation of TP53 Activity through Phosphorylation / Regulation of TP53 Degradation / Regulation of TP53 Activity through Methylation / Negative regulation of MET activity / PTK6 Regulates RTKs and Their Effectors AKT1 and DOK1 / Downregulation of ERBB2 signaling / E3 ubiquitin ligases ubiquitinate target proteins / Regulation of PTEN localization / ER Quality Control Compartment (ERQC) / Regulation of expression of SLITs and ROBOs / Interferon alpha/beta signaling / Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) / Activation of IRF3, IRF7 mediated by TBK1, IKKε (IKBKE) / IKK complex recruitment mediated by RIP1 / IRAK2 mediated activation of TAK1 complex / TRAF6-mediated induction of TAK1 complex within TLR4 complex / Alpha-protein kinase 1 signaling pathway / RAS processing / Pexophagy / Negative regulation of FLT3 / IRAK2 mediated activation of TAK1 complex upon TLR7/8 or 9 stimulation / Regulation of NF-kappa B signaling / Regulation of TBK1, IKKε (IKBKE)-mediated activation of IRF3, IRF7 / Regulation of pyruvate metabolism / SCF-beta-TrCP mediated degradation of Emi1 / Termination of translesion DNA synthesis / MAP3K8 (TPL2)-dependent MAPK1/3 activation / Ovarian tumor domain proteases / Cyclin D associated events in G1 / Negative regulators of DDX58/IFIH1 signaling / Regulation of BACH1 activity / Negative regulation of FGFR1 signaling / Negative regulation of FGFR2 signaling / Negative regulation of FGFR3 signaling / Negative regulation of FGFR4 signaling / Negative regulation of MAPK pathway / Synthesis of active ubiquitin: roles of E1 and E2 enzymes / Inactivation of CSF3 (G-CSF) signaling / Iron uptake and transport / Deactivation of the beta-catenin transactivating complex / Metalloprotease DUBs / Formation of TC-NER Pre-Incision Complex / Dual incision in TC-NER / Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER / Major pathway of rRNA processing in the nucleolus and cytosol / GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit / cytoplasmic translational termination / Autodegradation of Cdh1 by Cdh1:APC/C / APC/C:Cdc20 mediated degradation of Securin / APC/C:Cdh1 mediated degradation of Cdc20 and other APC/C:Cdh1 targeted proteins in late mitosis/early G1
類似検索 - 分子機能
Peptide chain release factor eRF1/aRF1 / eRF1, domain 1 / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 1/Pelota-like / eRF1 domain 3 / eRF1, domain 2 superfamily / eRF1 domain 1 / eRF1 domain 3 / eRF1_1 ...Peptide chain release factor eRF1/aRF1 / eRF1, domain 1 / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 2 / eRF1 domain 1/Pelota-like / eRF1 domain 3 / eRF1, domain 2 superfamily / eRF1 domain 1 / eRF1 domain 3 / eRF1_1 / 60s Acidic ribosomal protein / 60S acidic ribosomal protein P0 / : / Ribosomal protein L6, N-terminal / Ribosomal protein L6, N-terminal domain / Ubiquitin-like protein FUBI / Ribosomal protein L30e / Ribosomal protein L2, archaeal-type / Ribosomal protein L28e / Ribosomal L15/L27a, N-terminal / 50S ribosomal protein L10, insertion domain superfamily / Ribosomal protein L23 / Ribosomal L28e/Mak16 / Ribosomal L28e protein family / 60S ribosomal protein L10P, insertion domain / Insertion domain in 60S ribosomal protein L10P / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / metallochaperone-like domain / TRASH domain / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S21e signature. / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / : / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein L29e / Ribosomal L29e protein family / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / S27a-like superfamily / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein L27e, conserved site / Ribosomal protein L27e signature. / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein L10e, conserved site / Ribosomal protein L10e signature. / Ribosomal protein L19, eukaryotic / Ribosomal protein L10e / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / 60S ribosomal protein L18a/ L20, eukaryotes / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein L19/L19e conserved site / Ribosomal protein L19e signature. / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein L24e, conserved site / Ribosomal protein L24e signature. / Ribosomal protein L5 eukaryotic, C-terminal / Ribosomal L18 C-terminal region / : / Ribosomal protein L34e, conserved site / Ribosomal protein L34e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein L30e signature 1. / Ribosomal protein L6e signature. / 50S ribosomal protein L18Ae/60S ribosomal protein L20 and L18a / Ribosomal protein 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal proteins 50S-L18Ae/60S-L20/60S-L18A / Ribosomal protein L23/L25, N-terminal / Ribosomal protein L23, N-terminal domain / Eukaryotic Ribosomal Protein L27, KOW domain / Ribosomal protein L30e signature 2. / Ribosomal protein L27e / Ribosomal protein L27e superfamily / Ribosomal L27e protein family / Ribosomal protein L30e, conserved site / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein L39e, conserved site / Ribosomal protein L39e signature. / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein L35Ae, conserved site / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / Ribosomal protein L35Ae signature. / Ribosomal protein L34Ae / Ribosomal protein L34e / 60S ribosomal protein L19
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein eL24 / Small ribosomal subunit protein eS32 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein eL20 / Small ribosomal subunit protein eS10 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 ...Large ribosomal subunit protein eL24 / Small ribosomal subunit protein eS32 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Large ribosomal subunit protein eL20 / Small ribosomal subunit protein eS10 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein RACK1 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein eL33 / Small ribosomal subunit protein eS12 / Large ribosomal subunit protein eL29 / Large ribosomal subunit protein eL21 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein eL6 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein eL14 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Large ribosomal subunit protein eL15 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS25 / Large ribosomal subunit protein eL30 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein eL39 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein eL27 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein eL32 / Large ribosomal subunit protein eL28 / Large ribosomal subunit protein eL34 / Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / Small ribosomal subunit protein eS21 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein eL19 / Small ribosomal subunit protein eS17 / 40S ribosomal protein S26 / Large ribosomal subunit protein eL37
類似検索 - 構成要素
生物種Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.1 Å
データ登録者Powers KT / Yadav SKN
資金援助 英国, 1件
OrganizationGrant number国
Wellcome Trust210701/Z/18/Z 英国
引用ジャーナル: Nucleic Acids Res / 年: 2021
タイトル: Blasticidin S inhibits mammalian translation and enhances production of protein encoded by nonsense mRNA.
著者: Kyle T Powers / Flint Stevenson-Jones / Sathish K N Yadav / Beate Amthor / Joshua C Bufton / Ufuk Borucu / Dakang Shen / Jonas P Becker / Daria Lavysh / Matthias W Hentze / Andreas E Kulozik ...著者: Kyle T Powers / Flint Stevenson-Jones / Sathish K N Yadav / Beate Amthor / Joshua C Bufton / Ufuk Borucu / Dakang Shen / Jonas P Becker / Daria Lavysh / Matthias W Hentze / Andreas E Kulozik / Gabriele Neu-Yilik / Christiane Schaffitzel /
要旨: Deciphering translation is of paramount importance for the understanding of many diseases, and antibiotics played a pivotal role in this endeavour. Blasticidin S (BlaS) targets translation by binding ...Deciphering translation is of paramount importance for the understanding of many diseases, and antibiotics played a pivotal role in this endeavour. Blasticidin S (BlaS) targets translation by binding to the peptidyl transferase center of the large ribosomal subunit. Using biochemical, structural and cellular approaches, we show here that BlaS inhibits both translation elongation and termination in Mammalia. Bound to mammalian terminating ribosomes, BlaS distorts the 3'CCA tail of the P-site tRNA to a larger extent than previously reported for bacterial ribosomes, thus delaying both, peptide bond formation and peptidyl-tRNA hydrolysis. While BlaS does not inhibit stop codon recognition by the eukaryotic release factor 1 (eRF1), it interferes with eRF1's accommodation into the peptidyl transferase center and subsequent peptide release. In human cells, BlaS inhibits nonsense-mediated mRNA decay and, at subinhibitory concentrations, modulates translation dynamics at premature termination codons leading to enhanced protein production.
履歴
登録2021年3月16日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年7月7日-
マップ公開2021年7月7日-
更新2024年11月6日-
現状2024年11月6日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.014
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.014
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-7nwh
  • 表面レベル: 0.014
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_12632.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_12632.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 103 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.35 Å/pix.
x 300 pix.
= 405. Å		1.35 Å/pix.
x 300 pix.
= 405. Å		1.35 Å/pix.
x 300 pix.
= 405. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.35 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.014 / ムービー #1: 0.014
最小 - 最大-0.05001754 - 0.083289854
平均 (標準偏差)0.0010518832 (±0.005058572)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ300300300
Spacing300300300
セルA=B=C: 405.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.351.351.35
M x/y/z300300300
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z405.000405.000405.000
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS300300300
D min/max/mean-0.0500.0830.001

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_12632_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: #2

ファイルemd_12632_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_12632_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound b...

全体名称: Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S.
要素
  • 複合体: Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S.
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L8
    • タンパク質・ペプチド: uL4
    • タンパク質・ペプチド: eL31
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: S29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L32
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: eL29
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: eL33
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27a
    • タンパク質・ペプチド: uL30
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: Epididymis tissue sperm binding protein Li 3a
    • タンパク質・ペプチド: L7a
    • タンパク質・ペプチド: uL29
    • タンパク質・ペプチド: S7
    • RNA: mRNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
    • タンパク質・ペプチド: L9
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L10
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L37
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: eRF3a
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L11
    • タンパク質・ペプチド: L38
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: eL39
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN EL40
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 60s ribosomal protein l41
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein uS15
    • タンパク質・ペプチド: 60S RIBOSOMAL PROTEIN UL13
    • タンパク質・ペプチド: eL42
    • タンパク質・ペプチド: uS11
    • タンパク質・ペプチド: uL22
    • タンパク質・ペプチド: ribosomal protein eL43
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS19
    • タンパク質・ペプチド: eL18
    • タンパク質・ペプチド: eL28
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: 60S acidic ribosomal protein P0
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L18a
    • タンパク質・ペプチド: uL12
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS13
    • タンパク質・ペプチド: eL21
    • タンパク質・ペプチド: eS19
    • タンパク質・ペプチド: L22
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S20
    • タンパク質・ペプチド: eL14
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L24-like protein
    • RNA: 28S Ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S15a
    • タンパク質・ペプチド: uL23
    • RNA: 5S Ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein uS12
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L26
    • RNA: 5.8S Ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27
    • RNA: 18S Ribosomal RNA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S25
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L27a
    • タンパク質・ペプチド: 40S_SA_C domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: uL3
    • タンパク質・ペプチド: eL30
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER
  • リガンド: BLASTICIDIN S

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超分子 #1: Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound b...

超分子名称: Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S.
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#84
詳細: Rabbit reticulocyte lysate derived (in vitro transcription-FLAG affinity purified) ribosomal complex.
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 3.8 MDa

+
分子 #1: 60S ribosomal protein L8

分子名称: 60S ribosomal protein L8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.129809 KDa
配列文字列: MGRVIRGQRK GAGSVFRAHV KHRKGAARLR AVDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VVFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFVY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKTRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV ...文字列:
MGRVIRGQRK GAGSVFRAHV KHRKGAARLR AVDFAERHGY IKGIVKDIIH DPGRGAPLAK VVFRDPYRFK KRTELFIAAE GIHTGQFVY CGKKAQLNIG NVLPVGTMPE GTIVCCLEEK PGDRGKLARA SGNYATVISH NPETKKTRVK LPSGSKKVIS S ANRAVVGV VAGGGRIDKP ILKAGRAYHK YKAKRNCWPR VRGVAMNPVE HPFGGGNHQH IGKPSTIRRD APAGRKVGLI AA RRTGRLR GT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #2: uL4

分子名称: uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 42.825609 KDa
配列文字列: MACARPLISV YSEKGESSGK NVTLPAVFKA PIRPDIVNFV HTNLRKNNRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNTTQ KRYAICSALA ASALPALVMS KGHRIEEVPE LPLVVEDKVE G YKKTKEAV ...文字列:
MACARPLISV YSEKGESSGK NVTLPAVFKA PIRPDIVNFV HTNLRKNNRQ PYAVSELAGH QTSAESWGTG RAVARIPRVR GGGTHRSGQ GAFGNMCRGG RMFAPTKTWR RWHRRVNTTQ KRYAICSALA ASALPALVMS KGHRIEEVPE LPLVVEDKVE G YKKTKEAV LLLKKLKAWN DIKKVYASQR MRAGKGKMRN RRRIQRRGPC VIYNEDNGIV KAFRNIPGIT LLNVTKLNIL KL APGGHVG RFCIWTESAF RKLDDLYGTW RKAASLKSNY NLPMHKMLNT DLSRILKSPE IQRALRAPRK KIHRRVLKKN PLK NLRIML KLNPYAKTMR RNTILRQARN HKLRVERAAA ALAAKSDPKE APAKKKPVVG KK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #3: eL31

分子名称: eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.76689 KDa
配列文字列:
MNEVVTREYT INIHKRIHGV GFKKRAPRAL KEIRKFAMKE MGTPDVRIDT RLNKAVWAKG IRNVPYRIRV RLSRKRNEDE DSPNKLYTL VTYVPVTTFK NLQTVNVDE

+
分子 #4: 40S ribosomal protein S3

分子名称: 40S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 31.146607 KDa
配列文字列: MSARRRRRRA AFRRRAEPFI PISVREPLPF LSAARGGKMA VQISKKRKFV ADGIFKAELN EFLTRELAED GYSGVEVRVT PTRTEIIIL ATRTQNVLGE KGRRIRELTA VVQKRFGFPE GSVELYAEKV ATRGLCAIAQ AESLRYKLLG GLAVRRACYG V LRFIMESG ...文字列:
MSARRRRRRA AFRRRAEPFI PISVREPLPF LSAARGGKMA VQISKKRKFV ADGIFKAELN EFLTRELAED GYSGVEVRVT PTRTEIIIL ATRTQNVLGE KGRRIRELTA VVQKRFGFPE GSVELYAEKV ATRGLCAIAQ AESLRYKLLG GLAVRRACYG V LRFIMESG AKGCEVVVSG KLRGQRAKSM KFVDGLMIHS GDPVNYYVDT AVRHVLLRQG VLGIKVKIML PWDPSGKIGP KK PLPDHVS IVEPKDEILP TTPISEQKGG KPEPPAMPQP VPTA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #5: S29

分子名称: S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.690821 KDa
配列文字列:
MGHQQLYWSH PRKFGQGSRS CRVCSNRHGL IRKYGLNMCR QCFRQYAKDI GFIKLD

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L5

分子名称: 60S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.350633 KDa
配列文字列: GFVKVVKNKA YFKRYQVKFR RRREGKTDYY ARKRLVIQDK NKYNTPKYRM IVRVTNRDII CQIAYARIEG DMIVCAAYAH ELPKYGVKV GLTNYAAAYC TGLLLARRLL NRFGMDKIYE GQVEVTGDEY NVESIDGQPG AFTCYLDAGL ARTTTGNKVF G ALKGAVDG ...文字列:
GFVKVVKNKA YFKRYQVKFR RRREGKTDYY ARKRLVIQDK NKYNTPKYRM IVRVTNRDII CQIAYARIEG DMIVCAAYAH ELPKYGVKV GLTNYAAAYC TGLLLARRLL NRFGMDKIYE GQVEVTGDEY NVESIDGQPG AFTCYLDAGL ARTTTGNKVF G ALKGAVDG GLSIPHSTKR FPGYDSESKE FNAEVHRKHI MGQNVADYMR YLMEEDEDAY KKQFSQYIKN NVTPDMMEEM YK KAHAAIR ENPVYEKKPK REVKKKRWNR PKMSLAQKKD RVAQKKASFL RAQERAAES

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #7: Ribosomal protein L32

分子名称: Ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.153217 KDa
配列文字列:
MAALRPLVKP KIVKKRTKKF IRHQSDRYVK IKRNWRKPRG IDNRVRRRFK GQILMPNIGY GSNKKTKHML PSGFRKFLVH NVKELEVLL MCNKSYCAEI AHNVSSKNRK AIVERAAQLA IRVTNPNARL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL32

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 29.654869 KDa
配列文字列: MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I QIDLETGK ...文字列:
MARGPKKHLK RVAAPKHWML DKLTGVFAPR PSTGPHKLRE CLPLIIFLRN RLKYALTGDE VKKICMQRFI KIDGKVRTDI TYPAGFMDV ISIDKTGENF RLIYDTKGRF AVHRITPEEA KYKLCKVRKI FVGTKGIPHL VTHDARTIRY PDPLIKVNDT I QIDLETGK ITDFIKFDTG NLCMVTGGAN LGRIGVITNR ERHPGSFDVV HVKDANGNSF ATRLSNIFVI GKGNKPWISL PR GKGIRLT IAEERDKRLA AKQSSG

+
分子 #9: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.498884 KDa
配列文字列:
MQLFVRAQEL HTLEVTGRET VAQIKAHVAS LEGIAPEDQV VLLAGTPLED EATLGQCGVE ALSTLEVAGR MLGGKVHGSL ARVGKVRGQ TLKVAKQEKK KKRTGRAKRR MQYNRRFVNV VPTFGKKKGP NANS

UniProtKB: Ubiquitin-like FUBI-ribosomal protein eS30 fusion protein

+
分子 #10: eL29

分子名称: eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.931625 KDa
配列文字列: MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGLKKMQAN NAKAMAARAE AIKALVKPKE VKPTIPKGV SRKLHRLAYI AHPKLGRRAR ARIARGLRLS RPQTKAKAKT EPQIKGKVKA QIKAQAQAQI KSKGKGKAQA E TKPKAQAE ...文字列:
MAKSKNHTTH NQSRKWHRNG IKKPRSQRYE SLKGVDPKFL RNMRFAKKHN KKGLKKMQAN NAKAMAARAE AIKALVKPKE VKPTIPKGV SRKLHRLAYI AHPKLGRRAR ARIARGLRLS RPQTKAKAKT EPQIKGKVKA QIKAQAQAQI KSKGKGKAQA E TKPKAQAE TKPKAQAQAK PKAQAQGKPK AQAQGKPKAQ AQAKPKAQAQ AKPKAQAQTK PKAQATPA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL29

+
分子 #11: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 33.028336 KDa
配列文字列: MAGEKAPAAK PDATKKSPAK KADHARGKAK KKTLAEKKPK KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKRE KVLATVTKPV GGDKNGGTRV VKLRKMPRYY PTEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR H RGKRVVFL ...文字列:
MAGEKAPAAK PDATKKSPAK KADHARGKAK KKTLAEKKPK KGKPHCSRNP VLVRGIGRYS RSAMYSRKAL YKRKYAAPKS RIERKKKRE KVLATVTKPV GGDKNGGTRV VKLRKMPRYY PTEDVPRKLL SHGKKPFSQH VRKLRASITP GTILIILTGR H RGKRVVFL KQLSSGLLLV TGPLSLNRVP LRRTHQKFVI ATSTKIDISG VKIPKHLTDA YFKKKKLRKP RHQEGEIFDT EK EKYEITE QRKVDQKAVD SQILPKIKAV PQLQGYLRSV FALTNGVYPH KLVF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL6

+
分子 #12: eL33

分子名称: eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.580809 KDa
配列文字列:
MSGRLWCKAI FAGYKRGLRN QREHTALLKI EGVYARDETE FYLGKRCAYV YKAKNNTVTP GGKPNKTRVI WGKVTRAHGN SGMVRAKFR SNLPAKAIGH RIRVMLYPSR I

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL33

+
分子 #13: Ribosomal protein S5

分子名称: Ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.913453 KDa
配列文字列: MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT ...文字列:
MTEWETAAPA VAETPDIKLF GKWSTDDVQI NDISLQDYIA VKEKYAKYLP HSAGRYAAKR FRKAQCPIVE RLTNSMMMHG RNNGKKLMT VRIVKHAFEI IHLLTGENPL QVLVNAIINS GPREDSTRIG RAGTVRRQAV DVSPLRRVNQ AIWLLCTGAR E AAFRNIKT IAECLADELI NAAKGSSNSY AIKKKDELER VAKSNR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S27a

分子名称: 40S ribosomal protein S27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.98644 KDa
配列文字列:
KSYTTPKKNK HKRKKVKLAV LKYYKVDENG KISRLRRECP SDECGAGVFM ASHFDRHYCG KCCLTYCF

UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein

+
分子 #15: uL30

分子名称: uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 29.51425 KDa
配列文字列: LFANNIREKK KVPAVPETLK KKRRNFAELK IKRLRKKFAQ KMLRKARRKL IYEKAKHYHK EYRQMYRTEI RMARMARKAG NFYVPAEPK LAFVIRIRGI NGVSPKVRKV LQLLRLRQIF NGTFVKLNKA SINMLRIVEP YIAWGYPNLK SVNELIYKRG Y GKINKKRI ...文字列:
LFANNIREKK KVPAVPETLK KKRRNFAELK IKRLRKKFAQ KMLRKARRKL IYEKAKHYHK EYRQMYRTEI RMARMARKAG NFYVPAEPK LAFVIRIRGI NGVSPKVRKV LQLLRLRQIF NGTFVKLNKA SINMLRIVEP YIAWGYPNLK SVNELIYKRG Y GKINKKRI ALTDNTLIAR SLGKYNIICM EDLIHEIYTV GKHFKEANNF LWPFKLSSPR GGMKKKTTHF VEGGDAGNRE DQ INRLIRR MN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #16: 60S ribosomal protein L34

分子名称: 60S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.210088 KDa
配列文字列:
LPGRCLEAAT MVQRLTYRRR LSYNTASNKT RLSRTPGNRI VYLYTKKVGK APKSACGVCP GRLRGVRAVR PKVLMRLSKT KKHVSRAYG GSMCAKCVRD RIKRAFLIEE QKIVVKVLKA QAQSQKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL34

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S3a

分子名称: 40S ribosomal protein S3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 29.94201 KDa
配列文字列: MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM ...文字列:
MAVGKNKRLT KGGKKGAKKK VVDPFSKKDW YDVKAPAMFN IRNIGKTLVT RTQGTKIASD GLKGRVFEVS LADLQNDEVA FRKFKLITE DVQGKNCLTN FHGMDLTRDK MCSMVKKWQT MIEAHVDVKT TDGYLLRLFC VGFTKKRNNQ IRKTSYAQHQ Q VRQIRKKM MEIMTREVQT NDLKEVVNKL IPDSIGKDIE KACQSIYPLH DVFVRKVKML KKPKFELGKL MELHGEGGSS GK AAGDETG AKVERADGYE PPVQESV

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 30.201631 KDa
配列文字列: MLFRGASEAV GSLKMKLNIS FPATGCQKLI EVDDERKLRT FYEKRMATEV AADALGEEWK GYVVRISGGN DKQGFPMKQG VLTHGRVRL LLSKGHSCYR PRRTGERKRK SVRGCIVDAN LSVLNLVIVK KGEKDIPGLT DTTVPRRLGP KRASRIRKLF N LSKEDDVR ...文字列:
MLFRGASEAV GSLKMKLNIS FPATGCQKLI EVDDERKLRT FYEKRMATEV AADALGEEWK GYVVRISGGN DKQGFPMKQG VLTHGRVRL LLSKGHSCYR PRRTGERKRK SVRGCIVDAN LSVLNLVIVK KGEKDIPGLT DTTVPRRLGP KRASRIRKLF N LSKEDDVR QYVVRKPLNK EGKKPRTKAP KIQRLVTPRV LQHKRRRIAL KKQRTKKNKE EAAEYAKLLA KRMKEAKEKR QE QIAKRRR LSSLRASTSK SESSQK

+
分子 #19: Epididymis tissue sperm binding protein Li 3a

分子名称: Epididymis tissue sperm binding protein Li 3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.800305 KDa
配列文字列: MTEQMTLRGT LKGHNGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSSDNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTVQDESHSE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC ...文字列:
MTEQMTLRGT LKGHNGWVTQ IATTPQFPDM ILSASRDKTI IMWKLTRDET NYGIPQRALR GHSHFVSDVV ISSDGQFALS GSWDGTLRL WDLTTGTTTR RFVGHTKDVL SVAFSSDNRQ IVSGSRDKTI KLWNTLGVCK YTVQDESHSE WVSCVRFSPN S SNPIIVSC GWDKLVKVWN LANCKLKTNH IGHTGYLNTV TVSPDGSLCA SGGKDGQAML WDLNEGKHLY TLDGGDIINA LC FSPNRYW LCAATGPSIK IWDLEGKIIV DELKQEVIST SSKAEPPQCT SLAWSADGQT LFAGYTDNLV RVWQVTI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein RACK1

+
分子 #20: L7a

分子名称: L7a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.61175 KDa
配列文字列: MKVVNPLFEK RPKNFGIGQD IQPKRDLTRF VKWPRYIRLQ RQRAILYKRL KVPPAINQFT QVLDRQTATQ LLKLAHKYRP ETKQEKKQR LLARAEKKAA GKGDVPTKRP PVLRAGVNTV TTLVENKKAQ LVVIAHDVDP IELVVFLPAL CRKMGVPYCI L KGKARLGR ...文字列:
MKVVNPLFEK RPKNFGIGQD IQPKRDLTRF VKWPRYIRLQ RQRAILYKRL KVPPAINQFT QVLDRQTATQ LLKLAHKYRP ETKQEKKQR LLARAEKKAA GKGDVPTKRP PVLRAGVNTV TTLVENKKAQ LVVIAHDVDP IELVVFLPAL CRKMGVPYCI L KGKARLGR LVHRKTCTTV AFTQVNSEDK GALAKLVEAI RTNYNDRYDE IRRHWGGNVL GPKSVARIAK LEKAKAKELA TK LG

+
分子 #21: uL29

分子名称: uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.566599 KDa
配列文字列:
MAKIKARDLR GKKKEELLKQ LDDLKVELSQ LRVAKVTGGA ASKLSKIRVV RKSIARVLTV INQTQKENLR KFYKGKKYKP LDLRPKKTR AMRRRLNKHE ESLKTKKQQR KERLYPLRKY AVKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #22: S7

分子名称: S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.847582 KDa
配列文字列: MSAKIVKPNG EKPDEFESGI SQALLELEMN SDLKAQLREL NITAAKEIEV GGGRKAIIIF VPVPQLKSFQ KIQVRLVREL EKKFSGKHV VFIAQRRILP KPTRKSRTKN KQKRPRSRTL TAVHDAILED LVFPSEIVGK RIRVKLDGSR LIKVHLDKAQ Q NNVEHKVE ...文字列:
MSAKIVKPNG EKPDEFESGI SQALLELEMN SDLKAQLREL NITAAKEIEV GGGRKAIIIF VPVPQLKSFQ KIQVRLVREL EKKFSGKHV VFIAQRRILP KPTRKSRTKN KQKRPRSRTL TAVHDAILED LVFPSEIVGK RIRVKLDGSR LIKVHLDKAQ Q NNVEHKVE TFSGVYKKLT GKDVNFEFPE FQL

+
分子 #24: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.480186 KDa
配列文字列:
MPLAKDLLHP SPEEEKRKHK KKRLVQSPNS YFMDVKCPGC YKITTVFSHA QTVVLCVGCS TVLCQPTGGK ARLTEGCSFR RKQH

+
分子 #25: L9

分子名称: L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.627215 KDa
配列文字列: MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK ...文字列:
MKTILSNQTV DIPENVDISL KGRTVIVKGP RGTLRRDFNH INVELSLLGK KKKRLRVDKW WGNRKELATV RTICSHVQNM IKGVTLGFR YKMRSVYAHF PINVVIQENG SLVEIRNFLG EKYIRRVRMR PGVACSVSQA QKDELVLEGN DIELVSNSAA L IQQATTVK NKDIRKFLDG IYVSEKGTVQ QA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #26: 60S ribosomal protein L36

分子名称: 60S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.317796 KDa
配列文字列:
AAATALRYPM AVGLNKGHKV TKNVSKPRHS RRRGRLTKHT KFVRDMIREV CGFAPYERRA MELLKVSKDK RALKFIKKRV GTHIRAKRK REELSSVLAA MRKAAAKD

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.263387 KDa
配列文字列: MGISRDNWHK RRKTGGKRKP YHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTVRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CIVLIDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKIQKKY DERKKNAKIS S LLEEQFQQ ...文字列:
MGISRDNWHK RRKTGGKRKP YHKKRKYELG RPAANTKIGP RRIHTVRVRG GNKKYRALRL DVGNFSWGSE CCTRKTRIID VVYNASNNE LVRTKTLVKN CIVLIDSTPY RQWYESHYAL PLGRKKGAKL TPEEEEILNK KRSKKIQKKY DERKKNAKIS S LLEEQFQQ GKLLACIASR PGQCGRADGY VLEGKELEFY LRKIKARKGK

+
分子 #28: Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1

分子名称: Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 49.092742 KDa
配列文字列: MADDPSAADR NVEIWKIKKL IKSLEAARGN GTSMISLIIP PKDQISRVAK MLADEFGTAS NIKSRVNRLS VLGAITSVQQ RLKLYNKVP PNGLVVYCGT IVTEEGKEKK VNIDFEPFKP INTSLYLCDN KFHTEALTAL LSDDSKFGFI VIDGSGALFG T LQGNTREV ...文字列:
MADDPSAADR NVEIWKIKKL IKSLEAARGN GTSMISLIIP PKDQISRVAK MLADEFGTAS NIKSRVNRLS VLGAITSVQQ RLKLYNKVP PNGLVVYCGT IVTEEGKEKK VNIDFEPFKP INTSLYLCDN KFHTEALTAL LSDDSKFGFI VIDGSGALFG T LQGNTREV LHKFTVDLPK KHGRGGQSAL RFARLRMEKR HNYVRKVAET AVQLFISGDK VNVAGLVLAG SADFKTELSQ SD MFDQRLQ SKVLKLVDIS YGGENGFNQA IELSTEVLSN VKFIQEKKLI GRYFDEISQD TGKYCFGVED TLKALEMGAV EIL IVYENL DIMRYVLHCQ GTEEEKILYL TPEQEKDKSH FTDKETGQEH ELIESMPLLE WFANNYKKFG ATLEIVTDKS QEGS QFVKG FGGIGGILRY RVDFQGMEYQ GGDDEFFDLD DY

UniProtKB: Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1

+
分子 #29: 60S ribosomal protein L10

分子名称: 60S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.643057 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDAK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCG HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKSC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSIR TKLQNKEHVV EALRRAKFKF P GRQKIHIS ...文字列:
MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDAK IRIFDLGRKK AKVDEFPLCG HMVSDEYEQL SSEALEAARI CANKYMVKSC GKDGFHIRV RLHPFHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGAF GKPQGTVARV HIGQVIMSIR TKLQNKEHVV EALRRAKFKF P GRQKIHIS KKWGFTKFNA DEFEDMVAEK RLIPDGCGVK YIPNRGPLDK WRALHS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #30: Ribosomal protein L37

分子名称: Ribosomal protein L37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 11.111032 KDa
配列文字列:
MTKGTSSFGK RRNKTHTLCR RCGSKAYHLQ KSTCGKCGYP AKRKRKYNWS AKAKRRNTTG TGRMRHLKIV YRRFRHGFRE GTTPKPKRA AVAASSSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL37

+
分子 #31: 40S ribosomal protein S9

分子名称: 40S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 22.65559 KDa
配列文字列: MPVARSWVCR KTYVTPRRPF EKSRLDQELK LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPRR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKIEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFIV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG ...文字列:
MPVARSWVCR KTYVTPRRPF EKSRLDQELK LIGEYGLRNK REVWRVKFTL AKIRKAAREL LTLDEKDPRR LFEGNALLRR LVRIGVLDE GKMKLDYILG LKIEDFLERR LQTQVFKLGL AKSIHHARVL IRQRHIRVRK QVVNIPSFIV RLDSQKHIDF S LRSPYGGG RPGRVKRKNA KKGQGGAGAG EDEEED

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #32: eRF3a

分子名称: eRF3a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 48.0565 KDa
配列文字列: APKKEHVNVV FIGHVDAGKS TIGGQIMYLT GMVDKRTLEK YEREAKEKNR ETWYLSWALD TNQEERDKGK TVEVGRAYFE TEKKHFTIL DAPGHKSFVP NMIGGASQAD LAVLVISARK GEFETGFEKG GQTREHAMLA KTAGVKHLIV LINKMDDPTV N WSNERYEE ...文字列:
APKKEHVNVV FIGHVDAGKS TIGGQIMYLT GMVDKRTLEK YEREAKEKNR ETWYLSWALD TNQEERDKGK TVEVGRAYFE TEKKHFTIL DAPGHKSFVP NMIGGASQAD LAVLVISARK GEFETGFEKG GQTREHAMLA KTAGVKHLIV LINKMDDPTV N WSNERYEE CKEKLVPFLK KVGFNPKKDI HFMPCSGLTG ANLKEQSDFC PWYIGLPFIP YLDNLPNFNR SVDGPIRLPI VD KYKDMGT VVLGKLESGS ICKGQQLVMM PNKHNVEVLG ILSDDVETDT VAPGENLKIR LKGIEEEEIL PGFILCDPNN LCH SGRTFD AQIVIIEHKS IICPGYNAVL HIHTCIEEVE ITALICLVDK KSGEKSKTRP RFVKQDQVCI ARLRTAGTIC LETF KDFPQ MGRFTLRDEG KTIAIGKVLK LVP

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L11

分子名称: 60S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 20.086191 KDa
配列文字列:
QDQGEKENPM RELRIRKLCL NICVGESGDR LTRAAKVLEQ LTGQTPVFSK ARYTVRSFGI RRNEKIAVHC TVRGAKAEEI LEKGLKVRE YELRKNNFSD TGNFGFGIQE HIDLGIKYDP SIGIYGLDFY VVLGRPGFSI ADKKRRTGCI GAKHRISKEE A MRWFQQKY DGIILPGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #34: L38

分子名称: L38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 8.238948 KDa
配列文字列:
MPRKIEEIKD FLLTARRKDA KSVKIKKNKD NVKFKVRCSR YLYTLVITDK EKAEKLKQSL PPGLAVKELK

+
分子 #35: 40S ribosomal protein S10

分子名称: 40S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.422133 KDa
配列文字列:
MLMPKKNRIA IYELLFKEGV MVAKKDVHMP KHPELADKNV PNLHVMKAMQ SLKSRGYVKE QFAWRHFYWY LTNEGIQYLR DYLHLPPEI VPATLRRSRP ETGRPRPKGL EGERPARLTR GEADRDTYRR SAVPSGADKK AEAGAGSATE FQ

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS10

+
分子 #36: 60S ribosomal protein L13

分子名称: 60S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.331723 KDa
配列文字列: MAPSRNGMIL KPHFHKDWQR RVATWFNQPA RKIRRRKARQ ARARRIAPRP AAGPIRPIVR CPTVRYHTKV RAGRGFSLEE LRVAGIHKK VARTIGISVD PRRRNKSTES LQANVQRLKE YRSKLVLFPR KPSAPKKGDS SAEELKLATQ LTGPVMPIRN V FKKEKARV ...文字列:
MAPSRNGMIL KPHFHKDWQR RVATWFNQPA RKIRRRKARQ ARARRIAPRP AAGPIRPIVR CPTVRYHTKV RAGRGFSLEE LRVAGIHKK VARTIGISVD PRRRNKSTES LQANVQRLKE YRSKLVLFPR KPSAPKKGDS SAEELKLATQ LTGPVMPIRN V FKKEKARV ITEEEKNFKA FASLRMARAN ARLFGIRAKR AKEAAEQDVE KKK

+
分子 #37: eL39

分子名称: eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 6.455775 KDa
配列文字列:
MSSHKTFRIK RFLAKKQKQN RPIPQWIWMK TGNKIRYNSK RRHWRRTKLG L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL39

+
分子 #38: 40S ribosomal protein S11

分子名称: 40S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 18.513824 KDa
配列文字列:
MADIQTERAY QKQPTIFQNK KRVLQGETSK EKLPRYYKNI GLGFKTPKEA IEGTYIDKKC PFTGNVSIRG RILSGVVTKM KMQRTIVIR RDYLHYIRKY NRFEKRHKNM SVHLSPCFRD VQIGDIVTVG ECRPLSKTVR FNVLKVTKAA GTKKQFQKF

+
分子 #39: Ribosomal protein L14

分子名称: Ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.870549 KDa
配列文字列: MVFRRFVEVG RVAYVSFGPH AGKLVAIVDV IDQNRALVDG PCTRVRRQAM PFKCMQLTDF ILKFPHSARQ KYVRKAWEKA DINTKWAAT RWAKKIEARE RKAKMTDFDR YKVMKAKKMR NRIIKNEVKK LQRAALLKAS PKKAPVAKGA VAAAAAAAKV P AKKATAAG ...文字列:
MVFRRFVEVG RVAYVSFGPH AGKLVAIVDV IDQNRALVDG PCTRVRRQAM PFKCMQLTDF ILKFPHSARQ KYVRKAWEKA DINTKWAAT RWAKKIEARE RKAKMTDFDR YKVMKAKKMR NRIIKNEVKK LQRAALLKAS PKKAPVAKGA VAAAAAAAKV P AKKATAAG KKAAAQKAPA QKAPAQKAAG QKAAQPPKAQ KGQKPPAQKA PAPKASGKKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL14

+
分子 #40: 60S RIBOSOMAL PROTEIN EL40

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN EL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.69531 KDa
配列文字列:
MQIFVKTLTG KTITLEVEPS DTIENVKAKI QDKEGIPPDQ QRLIFAGKQL EDGLTLSDYN IQKESTLHLV LRLHGGIIEP SLRQLAQKY NCDKMICRKC YARLHPRAVN CRKKKCGHTN NLRPKKKVK

+
分子 #41: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.70907 KDa
配列文字列:
GVMDVNTALQ EVLKTALIHD GLARGIREAA KALDKRQAHL CVLASNCDEP MYVKLVEALC AEHQINLIKV DDNKKLGEWV GLCKIDREG KPRKVVGCSC VVVKDYGKES QAKDVIEEYF KCKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS12

+
分子 #42: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 24.207285 KDa
配列文字列: MGAYKYIQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSALHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQLKFARSLQ SVAEERAGRH CGALRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDPFH KAIRRNPDTQ WITKPVHKHR E MRGLTSAG ...文字列:
MGAYKYIQEL WRKKQSDVMR FLLRVRCWQY RQLSALHRAP RPTRPDKARR LGYKAKQGYV IYRIRVRRGG RKRPVPKGAT YGKPVHHGV NQLKFARSLQ SVAEERAGRH CGALRVLNSY WVGEDSTYKF FEVILIDPFH KAIRRNPDTQ WITKPVHKHR E MRGLTSAG RKSRGLGKGH KFHHTIGGSR RAAWRRRNTL QLHRYR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL15

+
分子 #43: 60s ribosomal protein l41

分子名称: 60s ribosomal protein l41 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 3.473451 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRM RRLKRKRRKM RQRSK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS32

+
分子 #44: ribosomal protein uS15

分子名称: ribosomal protein uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.188309 KDa
配列文字列:
MGRMHAPGKG LSQSALPYRR SVPTWLKLTS DDVKEQIYKL AKKGLTPSQI GVILRDSHGV AQVRFVTGNK ILRILKSKGL APDLPEDLY HLIKKAVAVR KHLERNRKDK DAKFRLILIE SRIHRLARYY KTKRVLPPNW KYESSTASAL V

+
分子 #45: 60S RIBOSOMAL PROTEIN UL13

分子名称: 60S RIBOSOMAL PROTEIN UL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.533299 KDa
配列文字列: MAEGQVLVLD GRGHLLGRLA AIVAKQVLLG RKVVVVRCEG INISGNFYRN KLKYLAFLRK RMNTNPSRGP YHFRAPSRIF WRTVRGMLP HKTKRGQAAL DRLKVFDGIP PPYDKKKRMV VPAALKVVRL KPTRKFAYLG RLAHEVGWKY QAVTATLEEK R KEKAKIHY ...文字列:
MAEGQVLVLD GRGHLLGRLA AIVAKQVLLG RKVVVVRCEG INISGNFYRN KLKYLAFLRK RMNTNPSRGP YHFRAPSRIF WRTVRGMLP HKTKRGQAAL DRLKVFDGIP PPYDKKKRMV VPAALKVVRL KPTRKFAYLG RLAHEVGWKY QAVTATLEEK R KEKAKIHY RKKKQLMRLR KQAEKNVEKK ISKFTDVLKT HGLLV

+
分子 #46: eL42

分子名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.170214 KDa
配列文字列:
MVAVSHGSEE VHSGTAYKLP LLL(UNK)PLSFRA ASAPANMVNV PKTRRTFCKK CGKHQPHKVT QYKKGKDSLY AQGKRR YDR KQSGYGGQTK PIFRKKAKTT KKIVLRLECV EPNCRSKRML AIKRCKHFEL GGDKKRKGQV IQF

+
分子 #47: uS11

分子名称: uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.916512 KDa
配列文字列:
RRRAAMAPRK GKEKKEEQVI SLGPQVAEGE NVFGVCHIFA SFNDTFVHVT DLSGKETICR VTGGMKVKAD RDESSPYAAM LAAQDVAQR CKELGITALH IKLRATGGNR TKTPGPGAQS ALRALARSGM KIGRIEDVTP IPSDSTRRKG GRRGRRL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #48: uL22

分子名称: uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.056182 KDa
配列文字列: MRKALPVSGQ RSPAKMVRYS LDPENPTKSC KSRGSNLRVH FKNTRETAQA IKGMHIRKAT KYLKDVTLKK QCVPFRRYNG GVGRCAQAK QWGWTQGRWP KKSAEFLLHM LKNAESNAEL KGLDVDSLVI EHIQVNKAPK MRRRTYRAHG RINPYMSSPC H IEMILTEK ...文字列:
MRKALPVSGQ RSPAKMVRYS LDPENPTKSC KSRGSNLRVH FKNTRETAQA IKGMHIRKAT KYLKDVTLKK QCVPFRRYNG GVGRCAQAK QWGWTQGRWP KKSAEFLLHM LKNAESNAEL KGLDVDSLVI EHIQVNKAPK MRRRTYRAHG RINPYMSSPC H IEMILTEK EQIVPKPEEE VAQKKKISQK KLKKQKLMAR E

+
分子 #49: ribosomal protein eL43

分子名称: ribosomal protein eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.010391 KDa
配列文字列:
MRIASLPLRA LGLGSGDMAK RTKKVGIVGK YGTRYGASLR KMVKKIEISQ HAKYTCSFCG KTKMKRRAVG IWHCGSCMKT VAGGAWTYN TTSAVTVKSA IRRLKELKDQ

+
分子 #50: 40S ribosomal protein uS19

分子名称: 40S ribosomal protein uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.049182 KDa
配列文字列:
MAEVEQKKKR TFRKFTYRGV DLDQLLDMSY EQLMQLYSAR QRRRLSRGLR RKQHSLLKRL RKAKKEAPPM EKPEVVKTHL RDMIILPEM VGSMVGVYNG KTFNQVEIKP EMIGHYLGEF SITYKPVKHG RPGIGATHSS RFIPLK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #51: eL18

分子名称: eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.699688 KDa
配列文字列:
MGVDIRHNKD RKVRRKEPKS QDIYLRLLVK LYRFLARRTN STFNQVVLKR LFMSRTNRPP LSLSRMIRKM KLPGRENKTA VVVGTVTDD VRVQEVPKLK VCALRVTSRA RSRILKAGGK ILTFDQLALD SPKGRGTVLL SGPRKGREVY RHFGKAPGTP H SHTKPYVR SKGRKFERAR GRRASRGYKN

+
分子 #52: eL28

分子名称: eL28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.783614 KDa
配列文字列:
MSAHLQWMVV RNCSSFLIKR NKQTYSTEPN NLKARNSFRY NGLIHRKTVG VEPAADGKGV VVVMKRRSGQ RKPATSYVRT TINKNARAT LSSIRHMIRK NKYHPDLRMA AIRRASAILR SQKPVMVKRK RTRPTKSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL28

+
分子 #53: Ribosomal protein S16

分子名称: Ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.716932 KDa
配列文字列:
MRGVELVLVL GAMPSKGPLQ SVQVFGRKKT ATAVAHCKRG NGLIKVNGRP LEMIEPRTLQ YKLLEPVLLL GKERFAGVDI RVRVKGGGH VAQIYAIRQS ISKALVAYYQ KYVDEASKKE IKDILIQYDR TLLVADPRRC ESKKFGGPGA RARYQKSYR

+
分子 #54: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 23.535281 KDa
配列文字列: MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLIKDGLI IRKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGIGK RKGTANARM PEKVTWMRRM RILRRLLRRY RESKKIDRHM YHSLYLKVKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRSKTKE ...文字列:
MSMLRLQKRL ASSVLRCGKK KVWLDPNETN EIANANSRQQ IRKLIKDGLI IRKPVTVHSR ARCRKNTLAR RKGRHMGIGK RKGTANARM PEKVTWMRRM RILRRLLRRY RESKKIDRHM YHSLYLKVKG NVFKNKRILM EHIHKLKADK ARKKLLADQA E ARRSKTKE ARKRREERLQ AKKEEIIKTL SKEEETKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL19

+
分子 #55: 60S acidic ribosomal protein P0

分子名称: 60S acidic ribosomal protein P0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 34.380504 KDa
配列文字列: MPREDRATWK SNYFLKIIQL LDDYPKCFIV GADNVGSKQM QQIRMSLRGK AVVLMGKNTM MRKAIRGHLE NNPALEKLLP HIRGNVGFV FTKEDLTEIR DMLLANKVPA AARAGAIAPC EVTVPAQNTG LGPEKTSFFQ ALGITTKISR GTIEILSDVQ L IKTGDKVG ...文字列:
MPREDRATWK SNYFLKIIQL LDDYPKCFIV GADNVGSKQM QQIRMSLRGK AVVLMGKNTM MRKAIRGHLE NNPALEKLLP HIRGNVGFV FTKEDLTEIR DMLLANKVPA AARAGAIAPC EVTVPAQNTG LGPEKTSFFQ ALGITTKISR GTIEILSDVQ L IKTGDKVG ASEATLLNML NISPFSFGLI IQQVFDNGSI YNPEVLDITE DTLHSRFLEG VRNVASVCLQ IGYPTVASVP HS IINGYKR VLALSVETEY TFPLAEKVKA FLADPSAFVA AAPVAAASTA APAAAAAAPA KVEAKEESEE SDEDMGFGLF D

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10

+
分子 #56: 40S ribosomal protein S17

分子名称: 40S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.782648 KDa
配列文字列:
MKSKKELRVQ KGRVRTKTVK KAARVIIEKY YTRLGNDFHT NKRVCEEIAI IPSKKLRNKI AGYVTHLMKR IQRGPVRGIS IKLQEEERE RRDNYVPEVS ALDQEIIEVD PDTKEMLKLL DFGSLSNLQV TQPTVGMNFK TPRGAV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS17

+
分子 #57: 60S ribosomal protein L18a

分子名称: 60S ribosomal protein L18a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 20.827561 KDa
配列文字列:
MKASGTLREY KVVGRCLPTP KCRTPPLYRM RIFAPNHVVA KSRFWYFVSQ LKKMKKSSGE IVYCGQVFEK SPLRVKNFGI WLRYDSRSG THNMYREYRD LTTAGAVTQC YRDMGARHRA RAHSIQIMKV EEIAASKCRR PAVKQFHDSK IKFPLPHRVL R RQHKPRFT TKRPNTFF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL20

+
分子 #58: uL12

分子名称: uL12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 21.426787 KDa
配列文字列: MAFRYSARRR PRCNSLRSSR IRVHPTPGAS TMPPKFDPNE IKVVYLRCTG GEVGATSALA PKIGPLGLSP KKVGDDIAKA TGDWKGLRI TVKLTIQNRQ AQIEVVPSAS ALIIKALKEP PRDRKKQKNI KHSGNITFDE IVNIARQMRH RSLARELSGT I KEILGTAQ ...文字列:
MAFRYSARRR PRCNSLRSSR IRVHPTPGAS TMPPKFDPNE IKVVYLRCTG GEVGATSALA PKIGPLGLSP KKVGDDIAKA TGDWKGLRI TVKLTIQNRQ AQIEVVPSAS ALIIKALKEP PRDRKKQKNI KHSGNITFDE IVNIARQMRH RSLARELSGT I KEILGTAQ SVGCNVDGRH PHDIIDDINS GAVECPAS

+
分子 #59: 40S ribosomal protein uS13

分子名称: 40S ribosomal protein uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.759777 KDa
配列文字列:
MSLVIPEKFQ HILRVLNTNI DGRRKIAFAI TAIKGVGRRY AHVVLRKADI DLTKRAGELT EDEVERVITI MQNPRQYKIP DWFLNRQKD VKDGKYSQVL ANGLDNKLRE DLERLKKIRA HRGLRHFWGL RVRGQHTKTT GRRGRTVGVS KKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #60: eL21

分子名称: eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 18.609988 KDa
配列文字列:
MTNTKGKRRG TRYMFSRPFR KHGVVPLATY MRIYKKGDIV DIKGMGTVQK GMPHKCYHGK TGRVYNVTQH AVGIVVNKQV KGKILAKRI NVRIEHIKHS KSRDSFLKRV KENDQKKKEA KEKGTWVQLK RQPAPPREAH FVRTNGKEPE LLEPIPYEFM A

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL21

+
分子 #61: eS19

分子名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.10664 KDa
配列文字列:
MPGVTVKDVN QQEFVRALAA FLKKSGKLKV PEWVDTVKLA KHKELAPYDE NWFYTRAAST ARHLYLRGGA GVGSMTKIYG GRQRNGVMP SHFSRGSKSV ARRVLQALEG LKMVEKDQDG GRKLTPQGQR DLDRIAGQVA AAKKKH

+
分子 #62: L22

分子名称: L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.798989 KDa
配列文字列:
MAPVKKLVAK GGKKKKQLLK FTLDCTHPVE DGIMDAANFE QFLQERIKVN GKAGNLGGGV VSLERSKSKI TVTSEVPFSK RYLKYLTKK YLKKNNLRDW LRVVANTKES YELRYFQINQ DEEEEEDED

+
分子 #63: 40S ribosomal protein S20

分子名称: 40S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.268555 KDa
配列文字列:
AFKDTGKAPV EQEVAIHRIR ITLTSRNVKS LEKVCADLIR GAKEKNLKVK GPVRMPTKTL RITTRKTPCG EGSKTWDRFQ MRIHKRLID LHSPSEIVKQ ITSISIEPGV EVEVTIADA

+
分子 #64: eL14

分子名称: eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 14.10362 KDa
配列文字列:
MSGAKFRISL GLPVGAVINC ADNTGAKNLY IISVKGIKGR LNRLPAAGVG DMVMATVKKG KPELRKKVHP AVVIRQRKSY RRKDGVFLY FEDNAGVIVN NKGEMKGSAI TGPVAKECAD LWPRIASNAG SIA

+
分子 #65: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 9.124389 KDa
配列文字列:
MQNDAGEFVD LYVPRKCSAS NRIIGAKDHA SIQMNVAEVD KVTGRFNGQF KTYAICGAIR RMGESDDSIL RLAKADGIVS KNF

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS21

+
分子 #66: 60S ribosomal protein L24-like protein

分子名称: 60S ribosomal protein L24-like protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.538256 KDa
配列文字列:
MKVELCSFSG YKIYPGHGRR YARTDGKVFQ FLNAKCESAF LSKRNPRQIN WTVLYRRKHK KGQSEEIQKK RTRRAVKFQR AITGASLAD IMAKRNQKPE VRKAQREQAI RAAKEAKKAK QASKKTAMAA AKEKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL24

+
分子 #68: Ribosomal protein S15a

分子名称: Ribosomal protein S15a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.778584 KDa
配列文字列:
MHEASLAATM VRMNVLADAL KSINNAEKRG KRQVLIRPCS KVIVRFLTVM MKHGYIGEFE IIDDHRAGKI VVNLTGRLNK CGVISPRFD VQLKDLEKWQ NNLLPSRQFG FIVLTTSAGI MDHEEARRKH TGGKILGFFF

+
分子 #69: uL23

分子名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.768246 KDa
配列文字列:
MAPKAKKEAP APPKVEAKAK ALKAKKAVLK GVHSHKKKKI RTSPTFRRPK TLRLRRQPKY PRKSAPRRNK LDHYAIIKFP LTTESAMKK IEDNNTLVFI VDVKANKHQI KQAVKKLYDI DVAKVNTLIR PDGEKKAYVR LAPDYDALDV ANKIGII

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #71: 40S ribosomal protein uS12

分子名称: 40S ribosomal protein uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.757587 KDa
配列文字列:
MGKCRGLRTA RKLRSHRRDQ KWHDKQYKKA HLGTALKANP FGGASHAKGI VLEKVGVEAK QPNSAIRKCV RVQLIKNGKK ITAFVPNDG CLNFIEENDE VLVAGFGRKG HAVGDIPGVR FKVVKVANVS LLALYKGKKE RPR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #72: Ribosomal protein L26

分子名称: Ribosomal protein L26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.891787 KDa
配列文字列:
MKFNPFVTSD RSKNRKRHFN APSHIRRKIM SSPLSKELRQ KYNVRSMPIR KDDEVQVVRG HYKGQQIGKV VQVYRKKYVI YIERVQREK ANGTTVHVGI HPSKVVITRL KLDKDRKKIL ERKAKSRQVG KEKGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #74: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 17.007125 KDa
配列文字列:
MNDTVTIRTR KFMTNRLLQR KQMVIDVLHP GKATVPKTEI REKLAKMYKT TPDVIFVFGF RTHFGGGKTT GFGMIYDSLD YAKKNEPKH RLARHGLYEK KKTSRKQRKE RKNRMKKVRG TAKANVGAGK KEVSWRWITA EGVKILQ

+
分子 #75: 60S ribosomal protein L27

分子名称: 60S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 75 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 15.835831 KDa
配列文字列:
MGKFMKPGKV VLVLAGRYSG RKAVIVKNID DGTSDRPYSH ALVAGIDRYP RKVTAAMGKK KIAKRSKIKS FVKVYNYNHL MPTRYSVDI PLDKTVVNKD VFRDPALKRK ARREAKVKFE ERYKTGKNKW FFQKLRF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL27

+
分子 #77: 40S ribosomal protein S25

分子名称: 40S ribosomal protein S25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 77 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.450798 KDa
配列文字列:
KDDKKKKDAG KSAKKDKDPV NKSGGKAKKK KWSKGKVRDK LNNLVLFDKA TYDKLCKEVP NYKLITPAVV SERLKIRGSL ARAALQELL SKGLIKLVSK HRAQVIYTRN TKGGDAPAAG EDA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS25

+
分子 #78: 60S ribosomal protein L27a

分子名称: 60S ribosomal protein L27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 78 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 16.489363 KDa
配列文字列:
PSRLRKTRKL RGHVSHGHGR IGKHRKHPGG RGNAGGMHHH RINFDKYHPG YFGKVGMRHY HLKRNQSFCP TVNLDKLWTL VSEQTRVNA AKNKTGAAPI IDVVRSGYYK VLGKGKLPKQ PVIVKAKFFS RRAEEKIKGV GGACVLVA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #79: 40S_SA_C domain-containing protein

分子名称: 40S_SA_C domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 32.958016 KDa
配列文字列: MSGALDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYIYK RKSDGIYIIN LKRTWEKLLL AARAIVAIEN PADVSVISSR NTGQRAVLK FAAATGATPI AGRFTPGTFT NQIQTAFREP RLLVVTDPRA DHQPLTEASY VNLPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGA ...文字列:
MSGALDVLQM KEEDVLKFLA AGTHLGGTNL DFQMEQYIYK RKSDGIYIIN LKRTWEKLLL AARAIVAIEN PADVSVISSR NTGQRAVLK FAAATGATPI AGRFTPGTFT NQIQTAFREP RLLVVTDPRA DHQPLTEASY VNLPTIALCN TDSPLRYVDI A IPCNNKGA HSVGLMWWML AREVLRMRGT ISREHPWEVM PDLYFYRDPE EIEKEEQAAA EKAVTKEEFQ GEWTAPAPEF TA TQPEVAD WSEGVQVPSV PIQQFPTEDW SAQPATEDWS AAPTAQATEW VGTTTEWS

+
分子 #80: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 13.147561 KDa
配列文字列:
MTKKRRNNGR AKKGRGHVQP IRCTNCARCV PKDKAIKKFV IRNIVEAAAV RDISEASVFD AYVLPKLYVK LHYCVSCAIH SKVVRNRSR EARKDRTPPP RFRPAVSVAL STADMVGA

UniProtKB: 40S ribosomal protein S26

+
分子 #81: uL3

分子名称: uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 45.976781 KDa
配列文字列: SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR ...文字列:
SHRKFSAPRH GSLGFLPRKR SSRHRGKVKS FPKDDPSKPV HLTAFLGYKA GMTHIVREVD RPGSKVNKKE VVEAVTIVET PPMVVVGIV GYVETPRGLR TFKTVFAEHI SDECKRRFYK NWHKSKKKAF TKYCKKWQDD AGKRQLDKDF SSMKKYCQVI R VLAHTQMR LLPLRQKKAH LMEIQVNGGT VAEKLDWARE RLEQQVPVSQ VFGQDEMIDV IGVTKGKGYK GVTSRWHTKK LP RKTHRGL RKVACIGAWH PARVAFSVAR AGQKGYHHRT EINKKIYKIG QGYLIKDGKL IKNNASTDYD LSDKSINPLG GFV HYGEVT NDFVMLKGCV VGTKKRVLTL RKSLLVQTKR RALEKIDLKF IDTTSKFGHG RFQTVEEKKA FMGPLKKDRI AKEE GA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #82: eL30

分子名称: eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 12.807065 KDa
配列文字列:
MVAAKKTKKS LESINSRLQL VMKSGKYVLG YKQSLKMIRQ GKAKLVILAN NCPALRKSEI EYYAMLAKTG VHHYSGNNIE LGTACGKYY RVCTLSIIDP GDSDIIRSMP EQTGEK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein eL30

+
分子 #83: 40S ribosomal protein S2

分子名称: 40S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 27.995727 KDa
配列文字列: MADDAGAAGG PGGLGARGGK AEDKEWLPVT KLGRLVKDMK IKSLEEIYLF SLPIKESEII DFFLGASLKD EVLKIMPVQK QTRAGQRTR FKAFVAIGDY NGHVGLGVKC SKEVATAIRG AIILAKLSIV PVRRGYWGNK IGKPHTVPCK VTGRCGSVLV R LIPAPRGT ...文字列:
MADDAGAAGG PGGLGARGGK AEDKEWLPVT KLGRLVKDMK IKSLEEIYLF SLPIKESEII DFFLGASLKD EVLKIMPVQK QTRAGQRTR FKAFVAIGDY NGHVGLGVKC SKEVATAIRG AIILAKLSIV PVRRGYWGNK IGKPHTVPCK VTGRCGSVLV R LIPAPRGT GIVSAPVPKK LLMMAGIDDC YTSARGCTAT LGNFAKATFD AISKTYSYLT PDLWKETVFT KSPYQEFTDH LV KTHTRVS VQRTQAPAVA TT

+
分子 #84: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 7.836005 KDa
配列文字列:
MDTSHVQPIK LARVTKVLGR TGSQGQCTQV RVEFMDDTSR SIIRNVKGPV REGDVLTLLE SEREARRLR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #23: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 23 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 4.753857 KDa
配列文字列:
UCAAAGUUUG AGCUC

+
分子 #67: 28S Ribosomal RNA

分子名称: 28S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 67 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 1.19969525 MDa
配列文字列: CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ...文字列:
CGCGACCUCA GAUCAGACGU GGCGACCCGC UGAAUUUAAG CAUAUUAGUC AGCGGAGGAA AAGAAACUAA CCAGGAUUCC CUCAGUAAC GGCGAGUGAA CAGGGAAGAG CCCAGCGCCG AAUCCCCGCC CCGCGGCGGG GCGCGGGAAA UGUGGCGUAC G GAAGACCC ACUCCCCGGC GCCGACACAC AGGGGGCCCA AGUCCUUCUG AUCGAGGCCC AGCCCGUGGA CGGUGUGAGG CC GGUAGCG GCCCCCGGCG CGCCGGGCCC GGGUCUUCCC GGAGUCGGGU UGCUUGGGAA UGCAGCCCAA AGCGGGUGGU AAA CUCCAU CUAAGGCUAA AUACCGGCAC GAGACCGAUA GUCAACAAGU ACCGUAAGGG AAAGUUGAAA AGAACUUUGA AGAG AGAGU UCAAGAGGGC GUGAAACCGU UAAGAGGUAA ACGGGUGGGG UCCGCGCAGU CCGCCCGGAG GAUUCAACCC GGCGG CGCG GUCCGGCCGU GCCGGCGGAC AGGCGGAUCU ACCCCGCUCC CACACACACA CAGUCGGCGG GGGACCGCCC CCCGGC CGG CGACCGGCCG CCGCCGGGCG CAUUUCCACC GCGGCGGUGC GCCGCGACCG GCUCCGGGAC GGCUGGGAAG GCCCCGG CG GGGAAGGUGG CCCGGGGGAC ACACACACAC CCCGGGUGUU ACAGCCCCGC CCCGGCAGCA GCAGCUCGCC GAAUCCCG G GGCCGAGGGA GCGAGACCCG UGCGCCGCGC UCUCCCCCCU CGGGGGGGCC ACACACACAC AGGGCCACCC CUCCCACGG CGCGACCGCU ACACACACAC AGGGGCGGAC UGUCACCAGU GCGCCCCGGG CGGGUCGCGC CGUCGGGCCC GGGACACACA CACAGGGCC ACACACGCGU CCCCCACACA CACACAGCGA GCGCACGGGG UCGGCGGCGA UGUCGGCUAC CCACCCGACC C GUCUUGAA ACACGGACCA AGGAGUCUAA CACGUGCGCG AGUCGGGGGC UACAACGAAA GCCGCCGUGG CGCAAUGAAG GU GAAGGCC GGCGGCGCGC CGCCGGCCAC GAGGUGGGAU CCCGAGGCCU UCCAGUCCGC CGAGGGCGCA CCACCGGCCC GUC UCGCCC GCCGCGCCGG GGAGGUGGAG CACGAGCGCA CGUGUUAGGA CCCGAAAGAU GGUGAACUAU GCCUGGGCAG GGCG AAGCC AGAGGAAACU CUGGUGGAGG UCCGUAGCGG UCCUGACGUG CGAAUCGGUC GUCCGACCUG GGUAUAGGGG CGAAA GACU AAUCGAACCA UCUAGUAGCU GGUUCCCUCC AAAGUUUCCC UCAGGAUAGC UGGCGCUCUC ACACACACAC ACGCAG UUU UAUCCGGUAA AGCGAAUGAU UAGAGGUCUU GGGGCCGAAA CGAUCUCAAC CUAUUCUCAA ACUUUAAAUG GGUAAGA AG CCCGGCUCGC UGGUGUGGAG CCGGGCGUGG AAUGCGAGUG CCUAGUGGGC CACUUUUGGU AAGCAGAACU GGCGCUGC G GGAUGAACCG AACGCCGGGU UAAGGCGCCC GAUGCCGACG CUCAUCAGAC CCCAGAAAAG GUGUUGGUUG AUAUAGACA GCAGGAUGGU GGCCAUGGAA GUCGGAAUCC GCUAAGGAGU GUGUAACAAC UCACCUGCCG AAUCAACUAG CCCUGAAAAU GGAUGGCGC UGGAGCGUCG GGCCCAUACC CGGCCGUCGC UGGCAGUCGG CAGAGCGAGA AAGAGAGUGG ACACACACAC A CGCGGACG CUACGCCGCG ACGAGUAGGA GGGCCGCUGC GGUGAGCCUU GAAGCCUAGG GCGCGGGCCC GGGUGGAGCC GC CGCAGGU GCAGAUCUUG GUGGUAGUAG CAAAUAUUCA AACGAGAACU UUGAAGGCCG AAGUGGAGAA GGGUUCCAUG UGA ACAGCA GUUGAACAUG GGUCAGUCGG UCCUGAGAGA UGGGCGAGCG CCGUUCCGAA GGGACGGGCG AUGGCCUCCG UUGC CCUCA GCCGAUCGAA AGGGAGUCGG GUUCAGAUCC CCGAAUCCGG AGUGGCGGAG AUGGGCGCCG CGAGGCGUCC AGUGC GGUA ACGCGACCGA UCCCGGAGAA GCCGGCGGGA GCCCCGGGGA GAGUUCUCUU UUCUUUGUGA AGGGCAGGGC GCCCUG GAA UGGGUUCGCC CCGAGAGAGG GGCCCGUGCC UUGGAAAGCG UCGCGGUUCC GGCGGCGUCC GGUGAGCUCU CGCUGGC CC UUGAAAAUCC GGGGGAGAGG GUGUAAAUCU CGCGCCGGGC CGUACCCAUA UCCGCAGCAG GUCUCCAAGG UGAACAGC C UCUGGCAUGU UGGAACAAUG UAGGUAAGGG AAGUCGGCAA GCCGGAUCCG UAACUUCGGG AUAAGGAUUG GCUCUAAGG GCUGACACAC ACACAGCAGC CGACUUAGAA CUGGUGCGGA CCAGGGGAAU CCGACUGUUU AAUUAAAACA AAGCAUCGCG AAGGCCCGC GGCGGGUGUU GACGCGAUGU GAUUUCUGCC CAGUGCUCUG AAUGUCAAAG UGAAGAAAUU CAAUGAAGCG C GGGUAAAC GGCGGGAGUA ACUAUGACUC UCUUAAGGUA GCCAAAUGCC UCGUCAUCUA AUUAGUGACG CGCAUGAAUG GA UGAACGA GAUUCCCACU GUCCCUACCU ACUAUCCAGC GAAACCACAG CCAAGGGAAC GGGCUUGGCG GAAUCAGCGG GGA AAGAAG ACCCUGUUGA GCUUGACUCU AGUCUGGCAC GGUGAAGAGA CACACACACA CAGUUUUUUC ACUGACCCGG UGAG GCGGG GGGGCGAGCC ACACAGGGCU CUCGCUUCUG GCGCCAAGCG CCCGGCCGGC CGGGCGCGAC CCGCUCCGGG GACAG UGCC AGGUGGGGAG UUUGACUGGG GCGGUACACC UGUCAAACGG UAACGCAGGU GUCCUAAGGC GAGCUCAGGG AGGACA GAA ACCUCCCGUG GAGCAGAAGG GCAAAAGCUC GCUUGAUCUU GAUUUUCAGU ACGAAUACAG ACCGUGAAAG CGGGGCC UC ACGAUCCUUC UGACCUUUUG GGUUUUAAGC AGGAGGUGUC AGAAAAGUUA CCACAGGGAU AACUGGCUUG UGGCGGCC A AGCGUUCAUA GCGACGUCGC UUUUUGAUCC UUCGAUGUCG GCUCUUCCUA UCAUUGUGAA GCAGAAUUCA CCAAGCGUU GGAUUGUUCA CCCACUAAUA GGGAACGUGA GCUGGGUUUA GACCGUCGUG AGACAGGUUA GUUUUACCCU ACUGAUGAUG UGUUGUUGC CAUGGUAAUC CUGCUCAGUA CGAGAGGAAC CGCAGGUUCA GACAUUUGGU GUAUGUGCUU GGCUGAGGAG C CAAUGGGG CGAAGCUACC AUCUGUGGGA UUAUGACUGA ACGCCUCUAA GUCAGAAUCC CGCCCAGGCG GAACGAUAAC AC GCGCCGA CGAGCCUCGG UUGGCCUCGG AUAGCCGGUC CCCCGCACAC ACACACACGG GGUCCGGUGC GGAGAGCCCU UCG UCCCGG GAAACGGGGA CCGGCCGGAA AGGGGGCCGC CCUCUCGCCC GUCACGCACC GCACGUUCGU GGGGAACCUG GCGC UAAAC CAUUCGUAGA CGACCUGCUU CUGGGUCGGG GUUUCGUACG UAGCAGAGCA GCUACACAGC UGCGAUCUAU UGAAA GUCA GCCCUCGACA CAAGGGUUUG U

+
分子 #70: 5S Ribosomal RNA

分子名称: 5S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 70 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 38.691914 KDa
配列文字列:
GUCUACGGCC AUACCACCCU GAACGCGCCC GAUCUCGUCU GAUCUCGGAA GCUAAGCAGG GUCGGGCCUG GUUAGUACUU GGAUGGGAG ACCGCCUGGG AAUACCGGGU GCUGUAGGCU U

GENBANK: GENBANK: 4CXE_4

+
分子 #73: 5.8S Ribosomal RNA

分子名称: 5.8S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 73 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 48.545672 KDa
配列文字列:
CGACUCUUAG CGGUGGAUCA CUCGGCUCGU GCGUCGAUGA AGAACGCAGC UAGCUGCGAG AAUUAAUGUG AAUUGCAGGU UGAUCAUCG ACACUUCGAA CGCACUUGCG GCCCCGGGUU CCUCCCGGGG CUACGCCUGU CUGAGCGUCG CU

+
分子 #76: 18S Ribosomal RNA

分子名称: 18S Ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 76 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Oryctolagus cuniculus (ウサギ)
分子量理論値: 573.842125 KDa
配列文字列: UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GACACACACA UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC ...文字列:
UACCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGCAUAUGC UUGUCUCAAA GAUUAAGCCA UGCAUGUCUA AGUACGCACG GCCGGUACAG UGAAACUGC GAAUGGCUCA UUAAAUCAGU UAUGGUUCCU UUGGUCGCUC GACACACACA UACUUGGAUA ACUGUGGUAA U UCUAGAGC UAAUACAUGC CGACGGGCGC UGACCCCCUU CGCGGGGGGG AUGCGUGCAU UUAUCAGACA CACACACAUG GU GACUCUA GAUAACCUCG GGCCGAUCGC ACGCCCACAC AGGCGGCGAC GACCCAUUCG AACGUCUGCC CUAUCAACUU UCG AUGGUA GUCGCCGUGC CUACCAUGGU GACCACGGGU GACGGGGAAU CAGGGUUCGA UUCCGGAGAG GGAGCCUGAG AAAC GGCUA CCACAUCCAA GGAAGGCAGC AGGCGCGCAA AUUACCCACU CCCGACCCGG GGAGGUAGUG ACGAAAAAUA ACAAU ACAG GACUCUUUCG AGGCCCUGUA AUUGGAAUGA GUCCACUUUA AAUCCUUUAA CGAGGAUCCA UUGGAGGGCA AGUCUG GUG CCAGCAGCCG CGGUAAUUCC AGCUCCAAUA GCGUAUAUUA AAGUUGCUGC AGUUAAAAAG CUCGUAGUUG GAUCUUG GG AGCGGACACA CACACACCGU CCCCACACAC UGCACAUCGG CGCCACACAC ACACAGGCCC GAAGCGUUUA CUUUGAAA A AAUUAGAGUG UUCAAAGCAG GCCACACACG CCUGGAUACC GCAGCUAGGA AUAAUGGAAU AGGACCGCGG UUCUAUUUU GUUGGUUUUC GGAACUGAGG CCAUGAUUAA GAGGGACGGC CGGGGGCAUU CGUAUUGCGC CGCUAGAGGU GAAAUUCUUG GACCGGCGC AAGACGGACC AGAGCGAAAG CAUUUGCCAA GAAUGUUUUC AUUAAUCAAG AACGAAAGUC GGAGGUUCGA A GACGAUCA GAUACCGUCG UAGUUCCGAC CAUAAACGAU GCCGACUGGC GAUGCGGCGG CGUUAUUCCC AUGACCCGCC GG GCAGCUU CCGGGAAACC AAAGUCUUUG GGUUCCGGGG GGAGUAUGGU UGCAAAGCUG AAACUUAAAG GAAUUGACGG AAG GGCACC ACCAGGAGUG GAGCCUGCGG CUUAAUUUGA CUCAACACGG GAAACCUCAC CCGGCCCGGA CACGGACAGG AUUG ACAGA UUGAUAGCUC UUUCUCGAUU CCGUGGGUGG UGGUGCAUGG CCGUUCUUAG UUGGUGGAGC GAUUUGUCUG GUUAA UUCC GAUAACGAAC GAGACUCUGG CAUGCUAACU AGUUACGCGA CCCACACACG GUCGGCGUAC ACAAACUUCU UAGAGG GAC AAGUGGCGUU CAGCCACCCG AGAUUGAGCA AUAACAGGUC UGUGAUGCCC UUAGAUGUCC GGGGCUGCAC GCGCGCU AC ACUGACUGGC UCAGCGUGUG CCUACCCUAC GCCGGCAGGC GCGGGUAACC CGUUGAACCC CAUUCGUGAU GGGGAUCG G GGAUUGCAAU UAUUCCCCAU GAACGAGGAA UUCCCAGUAA GUGCGGGUCA UAAGCUUGCG UUGAUUAAGU CCCUGCCCU UUGUACACAC CGCCCGUCGC UACUACCGAU UGGAUGGUUU AGUGAGGCCC UCGGAUCGGC CCCGCCGGGG UACACACACA GCCCUGGCG GAGCGCUGAG AAGACGGUCG AACUUGACUA UCUAGAGGAA GUAAAAGUCG UAACAAGGUU UCCGUAGGUG A ACCUGCGG AAGGAUCAUU A

+
分子 #85: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 85 / コピー数: 8 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #86: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 86 / コピー数: 281 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #87: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 87 / コピー数: 1 / 式: GCP
分子量理論値: 521.208 Da
Chemical component information

ChemComp-G2P:
PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / GMPCPP / GMP-CPP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

+
分子 #88: BLASTICIDIN S

分子名称: BLASTICIDIN S / タイプ: ligand / ID: 88 / コピー数: 1 / 式: BLS
分子量理論値: 422.439 Da
Chemical component information

ChemComp-BLS:
BLASTICIDIN S / ブラストサイジンS / 抗生剤*YM

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.63 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
詳細: 50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 30 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 70 % / チャンバー内温度: 288.15 K / 装置: LEICA EM GP
詳細: 30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time..
詳細165nM (OD260nm~10.5)

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TALOS ARCTICA
詳細Collected in super-resolution mode (0.675A pixel size)
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 3500 / 平均露光時間: 8.0 sec. / 平均電子線量: 41.92 e/Å2
電子線加速電圧: 200 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 100.0 µm / 最大 デフォーカス（補正後）: 2.0 µm / 最小 デフォーカス（補正後）: 0.4 µm / 倍率（補正後）: 79000 / 照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Talos Arctica / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 730463
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.1 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 18937
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD
最終 3次元分類クラス数: 5 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

5lzt


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
得られたモデル

PDB-7nwh:
Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S.

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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