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- EMDB-11254: Complex I inhibited by rotenone, open2 -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-11254
タイトルComplex I inhibited by rotenone, open2
マップデータ
試料
  • 複合体: Complex I inhibited by rotenone, open2
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
  • リガンド: x 14種
機能・相同性
機能・相同性情報


NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / NADH dehydrogenase activity / apoptotic mitochondrial changes / : / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / electron transport coupled proton transport / acyl binding / acyl carrier activity / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity ...NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating) / NADH dehydrogenase activity / apoptotic mitochondrial changes / : / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / electron transport coupled proton transport / acyl binding / acyl carrier activity / NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity / ATP synthesis coupled electron transport / : / membrane => GO:0016020 / ATP metabolic process / respiratory electron transport chain / reactive oxygen species metabolic process / FAD binding / regulation of mitochondrial membrane potential / electron transport chain / mitochondrial intermembrane space / 2 iron, 2 sulfur cluster binding / circadian rhythm / NAD binding / FMN binding / 4 iron, 4 sulfur cluster binding / response to oxidative stress / mitochondrial inner membrane / oxidoreductase activity / mitochondrial matrix / protein-containing complex binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Activator of Hsp90 ATPase homologue 1-like / Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein / : / FAD-binding domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / FAD binding domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 ...Activator of Hsp90 ATPase homologue 1-like / Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein / : / FAD-binding domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, ESSS subunit / ESSS subunit of NADH:ubiquinone oxidoreductase (complex I) / FAD binding domain / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, metazoa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, animal type / NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, NDUC2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit b14.5b (NDUFC2) / NADH dehydrogenase 1, beta subcomplex, subunit 6 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB6/B17 subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase chain 4, N-terminal / NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain 2 / NADH dehydrogenase subunit 2, C-terminal / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / : / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, amino terminus / NADH dehydrogenase subunit 2 C-terminus / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFB5/SGDH subunit / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8 / NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit (CI-ASHI or NDUFB8) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B14.5a (Complex I-B14.5a) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase subunit 5, C-terminal / NADH dehydrogenase subunit 5 C-terminus / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B12 subunit family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, NDUFS5-15kDa / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7, NDUB7 / NADH-ubiquinone oxidoreductase B18 subunit (NDUFB7) / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NDUFB9, LYR domain / NADH:ubiquinone oxidoreductase, iron-sulphur subunit 5 / NDUFA6, LYR domain / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4-like superfamily / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 2 / Deoxynucleoside kinase domain / Deoxynucleoside kinase / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase ubiquinone Fe-S protein 4, mitochondrial / START-like domain superfamily / ETC complex I subunit conserved region / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 6 / NADH-quinone oxidoreductase, chain G, C-terminal / NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit G, C-terminal / SLBB domain / : / NADH dehydrogenase [ubiquinone] (complex I), alpha subcomplex, subunit 8 / NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5 subgroup / NADH-quinone oxidoreductase, chain M/4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/K / Complex 1 LYR protein domain / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminal / NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 N-terminus / Complex 1 protein (LYR family) / NADH-quinone oxidoreductase, chain 5-like / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L/Mnh complex subunit C1-like / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase chain 4L / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 3. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 2. / NADH ubiquinone oxidoreductase, F subunit / NADH dehydrogenase, subunit C / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit, conserved site / Respiratory chain NADH dehydrogenase 30 Kd subunit signature. / NADH:ubiquinone oxidoreductase / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 75 Kd subunit signature 1. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 75kDa subunit, conserved site / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit / NADH:ubiquinone oxidoreductase, 30kDa subunit superfamily / Respiratory-chain NADH dehydrogenase, 30 Kd subunit / NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit / Proton-conducting membrane transporter / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH-ubiquinone oxidoreductase-G iron-sulfur binding region / NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 3 superfamily / NADH-ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase, chain 3 / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 1. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1 signature 2. / Respiratory-chain NADH dehydrogenase 51 Kd subunit signature 1. / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H / NADH dehydrogenase / NAD-dependent epimerase/dehydratase / NAD dependent epimerase/dehydratase family / NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit G, iron-sulphur binding / His(Cys)3-ligated-type [4Fe-4S] domain profile. / CHCH / CHCH domain
類似検索 - ドメイン・相同性
NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / PFC0360w protein / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial ...NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / PFC0360w protein / Acyl carrier protein / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 3 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 / NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 / Flavoprotein/dehydrogenase / NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 / NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Ovis aries (ヒツジ) / Sheep (ヒツジ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.8 Å
データ登録者Kampjut D / Sazanov LA
資金援助European Union, 2件
OrganizationGrant number国
European Commission665385European Union
European Commission653706European Union
引用ジャーナル: Science / 年: 2020
タイトル: The coupling mechanism of mammalian respiratory complex I.
著者: Domen Kampjut / Leonid A Sazanov /
要旨: Mitochondrial complex I couples NADH:ubiquinone oxidoreduction to proton pumping by an unknown mechanism. Here, we present cryo-electron microscopy structures of ovine complex I in five different ...Mitochondrial complex I couples NADH:ubiquinone oxidoreduction to proton pumping by an unknown mechanism. Here, we present cryo-electron microscopy structures of ovine complex I in five different conditions, including turnover, at resolutions up to 2.3 to 2.5 angstroms. Resolved water molecules allowed us to experimentally define the proton translocation pathways. Quinone binds at three positions along the quinone cavity, as does the inhibitor rotenone that also binds within subunit ND4. Dramatic conformational changes around the quinone cavity couple the redox reaction to proton translocation during open-to-closed state transitions of the enzyme. In the induced deactive state, the open conformation is arrested by the ND6 subunit. We propose a detailed molecular coupling mechanism of complex I, which is an unexpected combination of conformational changes and electrostatic interactions.
履歴
登録2020年6月30日-
ヘッダ(付随情報) 公開2020年10月7日-
マップ公開2020年10月7日-
更新2020年11月11日-
現状2020年11月11日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.07
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.07
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6zkm
  • 表面レベル: 0.07
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_11254.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_11254.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 31 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸X (Sec.)Y (Row.)Z (Col.)
1.06 Å/pix.
x 163 pix.
= 172.943 Å		1.06 Å/pix.
x 181 pix.
= 192.041 Å		1.06 Å/pix.
x 275 pix.
= 291.775 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

これらの図は立方格子座標系で作成されたものです

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.061 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.055 / ムービー #1: 0.07
最小 - 最大-0.20632355 - 0.49418962
平均 (標準偏差)0.0029781878 (±0.03317936)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ181275163
Spacing163181275
セルA: 172.943 Å / B: 192.041 Å / C: 291.775 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0611.0611.061
M x/y/z163181275
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z172.943192.041291.775
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ163181275
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS275181163
D min/max/mean-0.2060.4940.003

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Complex I inhibited by rotenone, open2

全体名称: Complex I inhibited by rotenone, open2
要素
  • 複合体: Complex I inhibited by rotenone, open2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, PSST subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, TYKY subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4
    • タンパク質・ペプチド: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B14.7 subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B5
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, PDSW subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B13 subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B14.5a subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S5
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A3
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B3
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B16.6 subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, B17 subunit
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B7
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9
    • タンパク質・ペプチド: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2
    • タンパク質・ペプチド: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, ESSS subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, KFYI subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, MNLL subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial complex I, MWFE subunit
  • リガンド: IRON/SULFUR CLUSTER
  • リガンド: FLAVIN MONONUCLEOTIDE
  • リガンド: 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE
  • リガンド: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER
  • リガンド: POTASSIUM ION
  • リガンド: (2R,6aS,12aS)-8,9-dimethoxy-2-(prop-1-en-2-yl)-1,2,12,12a-tetrahydrofuro[2',3':7,8][1]benzopyrano[2,3-c][1]benzopyran-6(6aH)-one
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE
  • リガンド: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE
  • リガンド: CARDIOLIPIN
  • リガンド: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
  • リガンド: ADENOSINE MONOPHOSPHATE
  • リガンド: MYRISTIC ACID

+
超分子 #1: Complex I inhibited by rotenone, open2

超分子名称: Complex I inhibited by rotenone, open2 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#44
由来(天然)生物種: Ovis aries (ヒツジ)
分子量実験値: 1 MDa

+
分子 #1: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH dehydrogenase
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 50.68775 KDa
配列文字列: MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN ...文字列:
MLAARRLLGG SLPARVSVRF SGDTTAPKKT SFGSLKDEDR IFTNLYGRHD WRLKGAQSRG DWYKTKEILL KGPDWILGEV KTSGLRGRG GAGFPTGLKW SFMNKPSDGR PKYLVVNADE GEPGTCKDRE IIRHDPHKLV EGCLVGGRAM GARAAYIYIR G EFYNEASN LQVAIREAYE AGLIGKNACG SGYDFDVFVV RGAGAYICGE ETALIESIEG KQGKPRLKPP FPADVGVFGC PT TVANVET VAVSPTICRR GGAWFASFGR ERNSGTKLFN ISGHVNNPCT VEEEMSVPLK ELIEKHAGGV TGGWDNLLAV IPG GSSTPL IPKSVCETVL MDFDALIQAQ TGLGTAAVIV MDRSTDIVKA IARLIEFYKH ESCGQCTPCR EGVDWMNKVM ARFV RGDAR PAEIDSLWEI SKQIEGHTIC ALGDGAAWPV QGLIRHFRPE LEERMQRFAQ QHQARQAAS

+
分子 #2: Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 24 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 27.373551 KDa
配列文字列: MPVLQYEHLE ECIRWGKHIR NLHKTAVQNG AGGALFVHRD TPKNNPETPF DFTPENYKRI EAIVKNYPEG HKAAAVLPVL DLAQRQNGW LPISAMNKVA EILQVPPMRV YEVATFYTMY NRKPVGKYHI QVCTTTPCML RNSDSILEAI QKKLGIKVGE T TPDKLFTL ...文字列:
MPVLQYEHLE ECIRWGKHIR NLHKTAVQNG AGGALFVHRD TPKNNPETPF DFTPENYKRI EAIVKNYPEG HKAAAVLPVL DLAQRQNGW LPISAMNKVA EILQVPPMRV YEVATFYTMY NRKPVGKYHI QVCTTTPCML RNSDSILEAI QKKLGIKVGE T TPDKLFTL IEVECLGACV NAPMVQINDN YYEDLTPKDI EEIIDELKAG KIPKPGPRSG RFSCEPAGGL TSLTEPPKGP GF GVQAGL

+
分子 #3: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 79.519297 KDa
配列文字列: MLRIPVRKAL VGLSKSSKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKT KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL ...文字列:
MLRIPVRKAL VGLSKSSKGC VRTTATAASN LIEVFVDGQS VMVEPGTTVL QACEKVGMQI PRFCYHERLS VAGNCRMCLV EIEKAPKVV AACAMPVMKG WNILTNSEKT KKAREGVMEF LLANHPLDCP ICDQGGECDL QDQSMMFGSD RSRFLEGKRA V EDKNIGPL VKTIMTRCIQ CTRCIRFASE IAGVDDLGTT GRGNDMQVGT YIEKMFMSEL SGNIIDICPV GALTSKPYAF TA RPWETRK TESIDVMDAV GSNIVVSTRT GEVMRILPRM HEDINEEWIS DKTRFAYDGL KRQRLTEPMV RNEKGLLTHT TWE DALSRV AGMLQSCQGN DVAAIAGGLV DAEALIALKD LLNRVDSDTL CTEEVFPTAG AGTDLRSNYL LNTTIAGVEE ADVV LLVGT NPRFEAPLFN ARIRKSWLHN DLKVALIGSP VDLTYRYDHL GDSPKILQDI ASGSHPFSQV LQEAKKPMVV LGSSA LQRN DGAAILAAVS NIAQKIRTSS GVTGDWKVMN ILHRIASQVA ALDLGYKPGV EAIRKNPPKM LFLLGADGGC VTRQDL PKD CFIVYQGHHG DVGAPIADVI LPGAAYTEKS ATYVNTEGRA QQTKVAVMPP GLAREDWKII RALSEIAGMT LPYDTLD QV RNRLEEVSPN LVRYDDVEGA NYFQQASELS KLVNQQLLAD PLVPPQLTIK DFYMTDSISR ASQTMAKCVK AVTEGAHA V EEPSIC

+
分子 #4: Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 49 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 52.661453 KDa
配列文字列: MAALRALRRL RGAAAQVLRP GAGARLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQYGGA VMYPTKETAH WKPPPWNDVD PPKDTLVSNL TLNFGPQHP AAHGVLRLVM ELSGEMVRKC DPHIGLLH(2MR)G TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSLAVE KL ...文字列:
MAALRALRRL RGAAAQVLRP GAGARLPIQP SRGARQWQPD VEWAEQYGGA VMYPTKETAH WKPPPWNDVD PPKDTLVSNL TLNFGPQHP AAHGVLRLVM ELSGEMVRKC DPHIGLLH(2MR)G TEKLIEYKTY LQALPYFDRL DYVSMMCNEQ AYSLAVE KL LNIQPPPRAQ WIRVLFGEIT RLLNHIMAVT THALDIGAMT PFFWMFEERE KMFEFYERVS GARMHAAYVR PGGVHQDL P LGLMDDIYEF SKNFSLRIDE LEEMLTNNRI WRNRTVDIGV VTAEDALNYG FSGVMLRGSG IQWDLRKTQP YDVYDQVEF DVPIGSRGDC YDRYLCRVEE MRQSIRIISQ CLNKMPPGEI KVDDAKVSPP KRAEMKTSME SLIHHFKLYT EGYQVPPGAT YTAIEAPKG EFGVYLVSDG SSRPYRCKIK APGFAHLAGL DKMSKGHMLA DVVAIIGTQD IVFGEVDR

+
分子 #5: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 30.38457 KDa
配列文字列: PVKMAAAAAR GCWQRLVGSA APARVAGRPS VLLLPVRRES ASADTRPTVR PRNDVAHKQL SAFGEYVAEI LPKYVQQVQV SCFSELEIC IHPDGVIPVL TFLRDHSNAQ FKSLADLTAV DIPTRQNRFE IVYNLLSLRF NSRIRVKTYT DELTPVESSV S VYKAANWY ...文字列:
PVKMAAAAAR GCWQRLVGSA APARVAGRPS VLLLPVRRES ASADTRPTVR PRNDVAHKQL SAFGEYVAEI LPKYVQQVQV SCFSELEIC IHPDGVIPVL TFLRDHSNAQ FKSLADLTAV DIPTRQNRFE IVYNLLSLRF NSRIRVKTYT DELTPVESSV S VYKAANWY EREIWDMFGV FFANHPDLRR ILTDYGFEGH PFRKDFPLSG YVELRYDDEV KRVVAEPVEL AQEFRKFDLN SP WEAFPAY RQPPESLKLE AGDKKPEAK

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分子 #6: Mitochondrial complex I, PSST subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, PSST subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 24.6229 KDa
配列文字列: MLPLKFPGRG GAAPRLFHPI LAVRSGMGAA LQVRGVHSSM AADSPSSTQP AVSQARAVVP KPAALPSSRG EYVVAKLDDL INWARRSSL WPMTFGLACC AVEMMHMAAP RYDMDRFGVV FRASPRQSDV MIVAGTLTNK MAPALRKVYD QMPEPRYVVS M GSCANGGG ...文字列:
MLPLKFPGRG GAAPRLFHPI LAVRSGMGAA LQVRGVHSSM AADSPSSTQP AVSQARAVVP KPAALPSSRG EYVVAKLDDL INWARRSSL WPMTFGLACC AVEMMHMAAP RYDMDRFGVV FRASPRQSDV MIVAGTLTNK MAPALRKVYD QMPEPRYVVS M GSCANGGG YYHYSYSVVR GCDRIVPVDI YVPGCPPTAE ALLYGILQLQ KKIKREKRLR IWYRR

+
分子 #7: Mitochondrial complex I, TYKY subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, TYKY subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 24.496121 KDa
配列文字列: MRKPKMRCLT MPVLLRALAQ AQAARAGHAS GRGLHSSAVA ATYKYVNLRE PSMDMKSVTD RAAQTLLWTE LIRGLGMTLS YLFREPATI NYPFEKGPLS PRFRGEHALR RYPSGEERCI ACKLCEAVCP AQAITIEAEP RADGSRRTTR YDIDMTKCIY C GFCQEACP ...文字列:
MRKPKMRCLT MPVLLRALAQ AQAARAGHAS GRGLHSSAVA ATYKYVNLRE PSMDMKSVTD RAAQTLLWTE LIRGLGMTLS YLFREPATI NYPFEKGPLS PRFRGEHALR RYPSGEERCI ACKLCEAVCP AQAITIEAEP RADGSRRTTR YDIDMTKCIY C GFCQEACP VDAIVEGPNF EFSTETHEEL LYNKEKLLNN GDKWEAEIAA NIQADYLYR

+
分子 #8: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 13.10652 KDa
配列文字列:
MNLMITLLTN FTLATLLVTI AFWLPQLNVY SEKTSPYECG FDPMGSARLP FSMKFFLVAI TFLLFDLEIA LLLPLPWASQ TTNLNTMLT MALLLIFLLA VSLAYEWTQK GLEWTE

+
分子 #9: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 35.884902 KDa
配列文字列: MFMINVLTLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQFRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSISM FILAPILALT LALTMWIPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLMNGS F TLSTLIIT ...文字列:
MFMINVLTLI IPILLAVAFL TLVERKVLGY MQFRKGPNVV GPYGLLQPIA DAIKLFIKEP LRPATSSISM FILAPILALT LALTMWIPL PMPYPLINMN LGVLFMLAMS SLAVYSILWS GWASNSKYAL IGALRAVAQT ISYEVTLAII LLSVLLMNGS F TLSTLIIT QEQVWLIFPA WPLAMMWFIS TLAETNRAPF DLTEGESELV SGFNVEYAAG PFALFFMAEY ANIIMMNIFT TT LFLGAFH NPYMPELYTI NFTIKSLLLS ITFLWIRASY PRFRYDQLMH LLWKNFLPLT LALCMWHVSL PILLSSIPPQ T

+
分子 #10: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 19.126619 KDa
配列文字列:
MMTYIVFILS IIFVMGFVGF SSKPSPIYGG LGLIVSGGVG CGIVLNFGGS FLGLMVFLIY LGGMMVVFGY TTAMATEQYP EVWVSNKVV LGTFITGLLM EFLMVYYVLK DKEVEIVFKF NGMGDWVIYD TGDSGFFSEE AMGIAALYSY GTWLVIVTGW S LLIGVVVI MEITRGN

+
分子 #11: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4L / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 10.868237 KDa
配列文字列:
(FME)SLVYMNIMM AFTVSLTGLL MYRSHLMSSL LCLEGMMLSL FILATLMILN SHFTLASMMP IILLVFAACE AALGLS LLV MVSNTYGTDY VQNLNLLQC

+
分子 #12: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 68.438906 KDa
配列文字列: (FME)NLFSSLTLV TLILLTMPIA AINFNTHKFT NYPLYVKTTI SCAFITSMIP TMMFIHTGQE MIISNWHWLT IQTLKL SLS FKMDFFSMMF VPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPNINQFFK YLLLFLITML ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW ...文字列:
(FME)NLFSSLTLV TLILLTMPIA AINFNTHKFT NYPLYVKTTI SCAFITSMIP TMMFIHTGQE MIISNWHWLT IQTLKL SLS FKMDFFSMMF VPVALFVTWS IMEFSMWYMH SDPNINQFFK YLLLFLITML ILVTANNLFQ LFIGWEGVGI MSFLLIG WW YGRTDANTAA LQAILYNRIG DIGFILAMAW FLINLNTWDL QQIFMLNPND SNLPLMGLIL AATGKSAQFG LHPWLPSA M EGPTPVSALL HSSTMVVAGI FLLIRFYPLT ENNKFGQSIM LCLGAMTTLF TAMCALTQND IKKIIAFSTS SQLGLMMVT IGINQPHLAF LHICTHAFFK AMLFMCSGSI IHSLNDEQDI RKMGGLFKAM PFTTTALIIG SLALTGMPFL TGFYSKDLII ESANTSYTN AWALLMTLVA TSFTAIYSTR IIFFALLGQP RFPTLININE NNPFLINSIK RLLIGSLFAG FIISNNIPPM T IPQMTMPH YLKMTALTVT ILGFILALEI SNTTHYLKFN YPSNTFKFSN LLGYYPTIMH RLTPYMNLTM SQKSASSLLD LI WLETILP KTISLAQMKM STTITSQKGL IKLYFLSFLI TILISTTLLN FHE

+
分子 #13: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 52.086742 KDa
配列文字列: (FME)LKYIIPTMM LMPLTWLSKN SMIWINTTLH SLLISLTSLL LLNQFGDNSL NFSLTFFSDS LSTPLLILTM WLLPLM LMA SQHHLSKENL ARKKLFISML ILLQLFLIMT FTATELIFFY IMFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAG SL ...文字列:
(FME)LKYIIPTMM LMPLTWLSKN SMIWINTTLH SLLISLTSLL LLNQFGDNSL NFSLTFFSDS LSTPLLILTM WLLPLM LMA SQHHLSKENL ARKKLFISML ILLQLFLIMT FTATELIFFY IMFEATLVPT LIIITRWGNQ TERLNAGLYF LFYTLAG SL PLLVALIYIQ NTMGSLNFLI LQYWVQPMPN SWSNTFMWLA CMMAFMVKMP LYGLHLWLPK AHVEAPIAGS MVLAAILL K LGGYGMMRIT LLLNPITDFM AYPFIMLSLW GMIMTSSICL RQTDLKSLIA YSSVSHMALV IVAILIQTPW SYMGATALM IAHGLTSSML FCLANSNYER VHSRTMILAR GLQTLLPLMA AWWLLASLTN LALPPSINLI GELFVVMSTF SWSNITIILM GLNMVITAL YSLYMLITTQ RGKHTHHINN ILPSFTRENA LMSLHMLPLL LLSLNPKIIL GPLY

+
分子 #14: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2

分子名称: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: NADH:ubiquinone reductase (H+-translocating)
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 39.149805 KDa
配列文字列: MNPIILIIIL MTVMLGTIIV MISTHWLLIW IGFEMNMLAI IPIMMKKHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAIIINLMF SGQWTVMKL FNPMASMLMT MALAMKLGMA PFHFWVPEVT QGIPLSSGLI LLTWQKLAPM SVLYQILPSI NLDLILTLSI L SITIGGWG ...文字列:
MNPIILIIIL MTVMLGTIIV MISTHWLLIW IGFEMNMLAI IPIMMKKHNP RATEASTKYF LTQSTASMLL MMAIIINLMF SGQWTVMKL FNPMASMLMT MALAMKLGMA PFHFWVPEVT QGIPLSSGLI LLTWQKLAPM SVLYQILPSI NLDLILTLSI L SITIGGWG GLNQTQLRKI MAYSSIAHMG WMTAVLLYNP TMTLLNLIIY IIMTSTMFTL FMANSTTTTL SLSHTWNKAP IM TILVLIT LLSMGGLPPL SGFMPKWMII QEMTKNDSII LPTLMAITAL LNLYFYMRLT YSTALTMFPS TNNMKMKWQF PTT KRMTLL PTMTVLSTML LPLTPILSIL E

+
分子 #15: Mitochondrial complex I, B14.7 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B14.7 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 14.784009 KDa
配列文字列:
M(AYA)KTLLHQYW DIPEGTECHR KTYAATSIGG ASGLVVSAYS VALKTPTSFL EGVARTGRYT FTAAAIGAIF GLTSCI SAQ VREKPDDPLN YLIGGCAGGL TLGARTRSYG IGAAACAYMG LTAALVKMGQ LEGWKVFAEP KV

+
分子 #16: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B5

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 21.614201 KDa
配列文字列: MAAMSLLHRA SVSAVVALSG RRLGTRLGFG GFLTRDFPKT VAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDKRFLKL LRFYILLTGI PVVIGITLI NVFIGEAELA EIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFFDAP EKNYERTMAI LQIESEKAEL RLKELEVRRL M RAKGDGPW ...文字列:
MAAMSLLHRA SVSAVVALSG RRLGTRLGFG GFLTRDFPKT VAPVRHSGDH GKRLFIIKPS GFYDKRFLKL LRFYILLTGI PVVIGITLI NVFIGEAELA EIPEGYVPEH WEYFKHPISR WIARTFFDAP EKNYERTMAI LQIESEKAEL RLKELEVRRL M RAKGDGPW FQYPTIDKAL IDHSPKATPD N

+
分子 #17: Acyl carrier protein

分子名称: Acyl carrier protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 17.608199 KDa
配列文字列:
VEVKDFYTTN YQTAVSFSPL GPMPSMALMA VSLSGANVPK SGGRPEESRV PVLTQRKVPG RVTPLCRQYS DAPPLTLEGI KDRVLYVLK LYDKIDPEKL SVNSHFMKDL GLDSLDQVEI IMAMEDEFGF EIPDIDAEKL MCPQEIVDYI ADKKDVYE

+
分子 #18: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 20.139209 KDa
配列文字列:
MPGIVELPSL EDLKVQEVKV SSSVLKAAAH HYGAQCDKPN KEFMLCRWEE KDPRRCLEEG KLVNQCALEF FRQIKRHCAE PFTEYWTCI DYSGLQLFRR CRKEQAQFDK CVLDKLGWVR PDLGELSKVT KVKTDRPLPE NPYHSRARPE PNPEVEGDLK P ARHGSRLF FWTM

+
分子 #19: Mitochondrial complex I, PDSW subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, PDSW subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 20.880752 KDa
配列文字列:
PDSWDKDVYP EPPRRTPAPS PQTSLPNPIT YLTKAFDLLV DRPVTLVREF IERQHAKNKY YYYHREFRRV PDITECHEKD VLCMFEAEM QWKRDYKVDQ EIVNIIQERL KACQQREGES HRQNCAKELQ QFTQVVKAYQ DRYHDLGAHY SARKCLAKQK Q RMLAERKA TKEAAAA

+
分子 #20: Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 10 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 11.916529 KDa
配列文字列:
MAASLLLRQG RPGTLKTVLL EAGVFRGLAP AVSLSAESGK NEKGLPPNPK KQSPPKKPAS AAPTEPFDNT TYKNLQHHDY STYTFLDLN LDLSKFRMPQ PSSGRESPRH

+
分子 #21: Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, 13 kDa subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 13.457175 KDa
配列文字列:
MAAAVTFLRL LGRGGAVTRG LPGGARCFGV RTSPTGEKVT HTGQVYDDED YRRVRFVGRQ KEVNENFAID LIAEQPVSQV GSRVISCDG GGGALGHPRV YINLDKETKT GTCGYCGLQF RQQHH

+
分子 #22: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 19.381994 KDa
配列文字列:
MSVALRQALW GRRVGTVAAV SVSKVSTRSL STSTWRLAQD QTRDTQLITV DEKLDITTLT GVPEEHIKTR KARIFVPARN NMQSGVNNT KKWKMEFDTR ERWENPLMGW ASTADPLSNL VLTFSTKEDA IAFAEKNGWS YDVEERKVPK PKSKSYGANF S WNKRTRVS TK

+
分子 #23: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 43.02559 KDa
配列文字列: MAAAVHLRVV RVLPMSRSSV PALAASVFHS PPQRQLHHAV IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYLV NHLGRMGSQV IVPYRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMDWN GRDKDSIRRA VEHSNVVINL VGREWETKNF DFEDVFVKIP QAIAQVSKEA G VEKFIHIS ...文字列:
MAAAVHLRVV RVLPMSRSSV PALAASVFHS PPQRQLHHAV IPHGKGGRSS VSGIVATVFG ATGFLGRYLV NHLGRMGSQV IVPYRCEPY DTMHLRPMGD LGQIIFMDWN GRDKDSIRRA VEHSNVVINL VGREWETKNF DFEDVFVKIP QAIAQVSKEA G VEKFIHIS HLNADIKSSS KYLRNKAVGE KEVRETFPEA TIIKPADIFG REDRFLNYFA NIRWFGGVPL ISLGKKTVKQ PV YIVDVTK GIINAIKDPD ARGKTFAFVG PNRYLLFDLV QYVFAVAHRP FLPYPMPHFA YRWIGRLFEI SPFEPWTTRD KVE RIHTTD RTLPHLPGLE DLGVQATPLE LKAIEVLRRH RTYRWLSSEI EDVQPAKTVP ASGP

+
分子 #24: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 11.097824 KDa
配列文字列:
MAAAAAIRGV RGKLGLREIR IHLCQRSPGS QGVRDFIEKR YVELKKANPD LPILIRECSD VQPKLWARYA FGQEKNVSLN NFSADQVTR ALENVLSSKA

+
分子 #25: Mitochondrial complex I, B13 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B13 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 13.287505 KDa
配列文字列:
MAGLLKKTTG LVGLAVCETP HERLKILYTK ILDVLGHIPK NAAYRKYTEQ ITNEKLSIVK AEPDVKKLEE QLQGGQIEEV ILQAENELS LARKMIQWKP WEPLVEEPPA SQWKWPI

+
分子 #26: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 16.302812 KDa
配列文字列:
NGVELGSDFL SKMAASGLRQ AAVAASTSVK PIFSRDMNEA KRRVRELYRA WYREVPNTVH LFQLDISVKQ GRDKVREMFK KNAHVTDPR VVDLLVIKGK MELEETINVW KQRTHVMRFF HETEAPRPKD FLSKFYVGHD P

+
分子 #27: Mitochondrial complex I, B14.5a subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B14.5a subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 12.701613 KDa
配列文字列:
KM(AYA)SATRLIQ GLRNWASGRD LQAKLQLRYQ EISKRTQPPP KLPVGPSHRL SNNYYCARDG RREAMPPSIV MSSQKV LVA GKPAESSAVA ASEKKAVSPA PPIKRWELSQ DEPYL

+
分子 #28: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 17.115508 KDa
配列文字列:
MELLQVLKRG LQQVSGHGGL RGYLRVLFRA NDVRVGTLVG EDKYGNKYYE DNKQFFGRHR WVIYTTEMNG KNTFWDVDGS MVPPEWHRW LHCMTDDPPT VKPPTARKFI WTNHKFNLSG TPQQYVPYST TRKKIQEWVP PSTPYK

+
分子 #29: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mi...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 40.557148 KDa
配列文字列: MALRFLRLVP ASAASRGLAA VPPRVGGIHT SVQRKLQYGP LAYILGEKTT KKMTENSKLI TVDGNICSGK (SEP)KLAKE VAE KLGLKHFPEA GIHYADSTTG DGKPLPVRFS GNCSLEKFYD DPKSNDGNSY RLQAWLYASR LLQYADALEH LLSTGQG VV ...文字列:
MALRFLRLVP ASAASRGLAA VPPRVGGIHT SVQRKLQYGP LAYILGEKTT KKMTENSKLI TVDGNICSGK (SEP)KLAKE VAE KLGLKHFPEA GIHYADSTTG DGKPLPVRFS GNCSLEKFYD DPKSNDGNSY RLQAWLYASR LLQYADALEH LLSTGQG VV LERSIYSDFV FLEAMYRQGF IRKQCVDHYN QVKKVTVCEY LPPHVVIYVD VPVSEVQSRI QKKGNPHEMK ITSAYLQD I ENVYKGTFLP EMSEKCEVLQ YSAWEAEDAE KVVEDIQYLK YDKGPWLDQD DRKLHNLRML VQDKLEVLNY TSIPVFLPE VTIGAHQSDR VFQEFTELPG RKYRAGYNED VGDKWIWLK

+
分子 #30: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S5

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 12.605594 KDa
配列文字列:
MPFFDVQKKL GVDLDHWMTI QSAEQPHRIP ARCHAFEKEW IECAHGIGSI RAEKECKIEF EDFRECLLRQ KTMKRLNAIK RQRDKLIKE GKYTPPPHHS GQEDLRP

+
分子 #31: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A3

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 9.325851 KDa
配列文字列:
MAPRVAAFLK NVWAKEPVLV ASFAIAGLAV ILPTLSPYTK YSLMINRATP YNYPVPLRDD GNMPDVPSHP QDPQGPSLEW LKRL

+
分子 #32: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B3

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 11.146679 KDa
配列文字列:
MAHGHGHEHG PSKMELPDYK QWKIEGTPLE TVQEKLAARG LRDPWGRNEA WRYMGGFANN VSFVGALLKG FKWGFAAFVV AVGAEYYLE SQKKDKKHH

+
分子 #33: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 14.431655 KDa
配列文字列:
VTMMTGRQAR APLQFLPDEA RSLPPPKLTD PRLAYIGFLG YCSGLIDNAI RRRPVLSAGL HRQFLYITSF VFVGYYLLKR QDYMYAVRD HDMFSYIKSH PEDFPEKDKK TYREVFEEFH PVR

+
分子 #34: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 15.236375 KDa
配列文字列:
KMSFPKYEPS RLASLPTTLD PAEYDISSET RKAQAERLAI RSRLKREYQL QYNDPSRRGV VEDPALIRWT CARSANVYPN FRPNTKTSL LGALFGIGPL IFWYYVFKTD RDRKEKLIQE GKLDRTFNIS Y

+
分子 #35: Mitochondrial complex I, B16.6 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B16.6 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 16.766461 KDa
配列文字列:
MAASKVKQDM PPVGGYGPID YKRNLPRRGL SGYSMFAVGI GALLFGYWSM MRWNRERRRL QIEDFEARIA LMPLLQAEKD RRVLQMLRE NLEEEATIMK DVPGWKVGES VFHTTRWVTP MMGELYGLRT GEEILSSTYG FIWYT

+
分子 #36: Mitochondrial complex I, B17 subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, B17 subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 15.565126 KDa
配列文字列:
MSGYTPDEKL RLQQLRELRR RWLKDQELSP REPVLPPRRV SPVERFWNKF LQDGALWKNV IYKTYRHSIF AFTHVLIPVW IIHYYLKYH VTTKPYTIVE KKPRIFPGDT ILETGEVIPP MKEFPDQHH

+
分子 #37: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B7

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 16.413807 KDa
配列文字列:
MGAHLARRYL GDASVEPEPL RMPTFPPDYG FPERKEREMV ATQQEMNDAQ LVLQQRDYCA HYLIRFLKCK RDSFPNFLAC KHEQHDWDY CEHLDYVKRM KEFERERRLL QRKKRREQRE ADMAKGLGPG EVAPEVAL

+
分子 #38: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 21.77991 KDa
配列文字列:
MAFLPSAAYL THQQKVLQLY KRALRHLESR CVHRDKYRYF ACLLRARFDE HKNEKDMVKA TQLLREAEKE FWHGQHPQPY IFPESPGGT SYERYECYKV PEWCLDDWHP SEKAMYPDYF AKREQWKKLR RESWEREVKQ LQEETPVGGP RTEALPPARK Q GDLPPLWW HIVTRPRERP M

+
分子 #39: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2

分子名称: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 12.22677 KDa
配列文字列:
MAGMSALKRL APFAHVGGHL FRGRCARAVG AGGVRRAGGG AHIEPRYRQF PQLTRSQVIQ AEFFSATMWF WILWRFWHDS DAVLGHFPY PDPSQWTDEE LGIPPDDED

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分子 #40: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mito...

分子名称: NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial
タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 21.752602 KDa
配列文字列:
MAAARAGVLG IRWLQKAARN VVPLGARTAS HITKDMLPGP YPKTPEERAA AAKKYNMRVE DYEPYPDDGM GYGDYPKLPD RSQQERDPW YDWDHPDLRL NWGEPMHWDL DMYIRNRVDT SPTPVNWNLM CKHLFGFVAF MLFMFWVGET YPTYQPVGPK Q YPYNNLYL ERGGDPNKEP EPVVHYEI

+
分子 #41: Mitochondrial complex I, ESSS subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, ESSS subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 17.41066 KDa
配列文字列:
MAAGMLGLCG RRLLAVAATR GLPAASVRWE SSSSRAVIAP STLAGKRPSE PTLRWQEDPE PEDENLYEKN PDSHGYDKDP AVDVWNMRV VFFFGFSIVL VLGSTFVAYL PDYRMQEWAR REAERLVKYR EAHGLPLMES NCFDPSKIQL PEDED

+
分子 #42: Mitochondrial complex I, KFYI subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, KFYI subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 8.802174 KDa
配列文字列:
MAPSAFLRPF WKLLAPARFP SVSSSRSKFY IQEPPHGSPN WLKVGLTLGT SAFLWIYLIK QHNEDVLEYK RRNGLE

+
分子 #43: Mitochondrial complex I, MNLL subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, MNLL subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 7.075305 KDa
配列文字列:
MMNLLQVVRD HWIHVLVPVG FVFGYYLDRK NDEKLAAFRN KSLLYKRELK PQEEVTWK

+
分子 #44: Mitochondrial complex I, MWFE subunit

分子名称: Mitochondrial complex I, MWFE subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Sheep (ヒツジ)
分子量理論値: 8.211519 KDa
配列文字列:
MWFEVLPGIA VMGVCLFIPG MATARIHRFS NGGREKRVAH YSYQWYLMER DRRVSGVNRY YVSKGLENID

+
分子 #45: IRON/SULFUR CLUSTER

分子名称: IRON/SULFUR CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 45 / コピー数: 6 / 式: SF4
分子量理論値: 351.64 Da
Chemical component information

ChemComp-FS1:
IRON/SULFUR CLUSTER / 一硫化鉄

+
分子 #46: FLAVIN MONONUCLEOTIDE

分子名称: FLAVIN MONONUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 1 / 式: FMN
分子量理論値: 456.344 Da
Chemical component information

ChemComp-FMN:
FLAVIN MONONUCLEOTIDE / FMN

+
分子 #47: 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE

分子名称: 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 1 / 式: NAI
分子量理論値: 665.441 Da
Chemical component information

ChemComp-NAI:
1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE / NADH

+
分子 #48: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

分子名称: FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 2 / 式: FES
分子量理論値: 175.82 Da
Chemical component information

ChemComp-FES:
FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER

+
分子 #49: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 1 / 式: K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #50: (2R,6aS,12aS)-8,9-dimethoxy-2-(prop-1-en-2-yl)-1,2,12,12a-tetrahy...

分子名称: (2R,6aS,12aS)-8,9-dimethoxy-2-(prop-1-en-2-yl)-1,2,12,12a-tetrahydrofuro[2',3':7,8][1]benzopyrano[2,3-c][1]benzopyran-6(6aH)-one
タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 3 / 式: 970
分子量理論値: 394.417 Da
Chemical component information

ChemComp-970:
(2R,6aS,12aS)-8,9-dimethoxy-2-(prop-1-en-2-yl)-1,2,12,12a-tetrahydrofuro[2',3':7,8][1]benzopyrano[2,3-c][1]benzopyran-6(6aH)-one / ロテノン

+
分子 #51: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOETHANOLAMINE / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 9 / 式: 3PE
分子量理論値: 748.065 Da

+
分子 #52: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE

分子名称: 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / タイプ: ligand / ID: 52 / コピー数: 6 / 式: PC1
分子量理論値: 790.145 Da
Chemical component information

ChemComp-PC1:
1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE / リン脂質*YM

+
分子 #53: CARDIOLIPIN

分子名称: CARDIOLIPIN / タイプ: ligand / ID: 53 / コピー数: 6 / 式: CDL
分子量理論値: 1.464043 KDa
Chemical component information

ChemComp-CDL:
CARDIOLIPIN / リン脂質*YM

+
分子 #54: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-b...

分子名称: S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate
タイプ: ligand / ID: 54 / コピー数: 2 / 式: ZMP
分子量理論値: 568.704 Da
Chemical component information

ChemComp-ZMP:
S-[2-({N-[(2S)-2-hydroxy-3,3-dimethyl-4-(phosphonooxy)butanoyl]-beta-alanyl}amino)ethyl] tetradecanethioate

+
分子 #55: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 55 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #56: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE

分子名称: NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE
タイプ: ligand / ID: 56 / コピー数: 1 / 式: NDP
分子量理論値: 745.421 Da
Chemical component information

ChemComp-NDP:
NADPH DIHYDRO-NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE / NADPH

+
分子 #57: ADENOSINE MONOPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 1 / 式: AMP
分子量理論値: 347.221 Da
Chemical component information

ChemComp-AMP:
ADENOSINE MONOPHOSPHATE / AMP / AMP*YM

+
分子 #58: MYRISTIC ACID

分子名称: MYRISTIC ACID / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 1 / 式: MYR
分子量理論値: 228.371 Da
Chemical component information

ChemComp-MYR:
MYRISTIC ACID / ミリスチン酸

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度3 mg/mL
緩衝液pH: 7.4
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / 平均電子線量: 100.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

CTF補正ソフトウェア - 名称: CTFFIND (ver. 4.15)
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

5lnk

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0) / 使用した粒子像数: 61945
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

5lnk

精密化空間: REAL / プロトコル: FLEXIBLE FIT / 温度因子: 50 / 当てはまり具合の基準: Correlation coefficient
得られたモデル

PDB-6zkm:
Complex I inhibited by rotenone, open2

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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