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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-10612 | ||||||||||||
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タイトル | Cryo-EM map of DDB1:DCAF1:Vpr:Cullin4:Roc1 State 2 | ||||||||||||
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生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 7.8 Å | ||||||||||||
![]() | Krupp F / Banchenko S / Buerger J / Mielke T / Spahn CMT / Schwefel D | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Cryo-EM map of DDB1:DCAF1:Vpr:Cullin4:Roc1 State 2 著者: Krupp F / Banchenko S / Buerger J / Mielke T / Spahn CMT / Schwefel D | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 9.2 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 8.1 KB 8.1 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 74.1 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 1.25 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Cryo-EM map of DDB1:DCAF:Vpr State 1
全体 | 名称: Cryo-EM map of DDB1:DCAF:Vpr State 1 |
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要素 |
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-超分子 #1: Cryo-EM map of DDB1:DCAF:Vpr State 1
超分子 | 名称: Cryo-EM map of DDB1:DCAF:Vpr State 1 / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
組換発現 | 生物種: ![]() ![]() |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
緩衝液 | pH: 7.8 |
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凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI POLARA 300 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 50.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
最終 再構成 | 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 7.8 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.07) / 使用した粒子像数: 29118 |
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初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD |